219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3573 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_3573  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
414 aa  843    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0138682  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3170  extracellular solute-binding protein  64.54 
 
 
414 aa  534  1e-150  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0693  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  62.53 
 
 
421 aa  528  1e-149  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0998966  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3817  extracellular solute-binding protein  62.04 
 
 
421 aa  528  1e-149  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.284829  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3935  extracellular solute-binding protein  55.4 
 
 
420 aa  471  1e-132  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0774395  normal  0.611638 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3491  extracellular solute-binding protein family 1  55.61 
 
 
419 aa  457  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1482  extracellular solute-binding protein family 1  54.13 
 
 
420 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.340124  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1378  extracellular solute-binding protein family 1  55.58 
 
 
420 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3786  extracellular solute-binding protein family 1  55.28 
 
 
419 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0092  extracellular solute-binding protein  51.29 
 
 
425 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1695  extracellular solute-binding protein  49.39 
 
 
420 aa  403  1e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.157617 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4349  extracellular solute-binding protein  47.48 
 
 
415 aa  387  1e-106  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000381076  hitchhiker  0.000997313 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3404  extracellular solute-binding protein  46.1 
 
 
413 aa  382  1e-105  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1956  sugar ABC transporter extracellular solute-binding family 1 protein  45.48 
 
 
417 aa  381  1e-104  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.318288  normal  0.222736 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2416  extracellular solute-binding protein  46.19 
 
 
417 aa  368  1e-101  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.230559  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1150  extracellular solute-binding protein  48.6 
 
 
417 aa  358  9e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0392592  normal  0.752071 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0083  extracellular solute-binding protein family 1  45.15 
 
 
429 aa  354  2e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29280  sugar ABC transport system, periplasmic substrate-binding protein  41.56 
 
 
388 aa  352  5.9999999999999994e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1097  extracellular solute-binding protein  45.84 
 
 
416 aa  349  5e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000486653  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3689  extracellular solute-binding protein  44.53 
 
 
416 aa  343  2.9999999999999997e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1939  putative sugar ABC transporter binding protein subunit  45.6 
 
 
420 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1090  extracellular solute-binding protein  43.03 
 
 
417 aa  339  4e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22980  putative binding protein component of ABC sugar transporter  45.07 
 
 
420 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.16871 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0523  extracellular solute-binding protein  44.8 
 
 
418 aa  336  5e-91  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1113  extracellular solute-binding protein  42.36 
 
 
431 aa  333  4e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.561117 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1292  glucose ABC transporter, periplasmic glucose-binding protein, putative  42.18 
 
 
428 aa  332  6e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.927491  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4278  extracellular solute-binding protein  40.54 
 
 
442 aa  330  4e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1013  extracellular solute-binding protein  43.67 
 
 
428 aa  320  3e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4370  extracellular solute-binding protein  41.85 
 
 
433 aa  317  2e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.878399  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4209  extracellular solute-binding protein  42.68 
 
 
428 aa  315  8e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1015  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  42.93 
 
 
428 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1053  extracellular solute-binding protein  42.68 
 
 
428 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00219882  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0860  extracellular solute-binding protein family 1  42 
 
 
415 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0321479  normal  0.15183 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2191  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  41.67 
 
 
415 aa  309  5e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.537651  hitchhiker  0.00669154 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0628  extracellular solute-binding protein  44.04 
 
 
415 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.224261  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3451  ABC sugar (maltose) transporter, periplasmic ligand binding protein  43 
 
 
415 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000113592  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6328  extracellular solute-binding protein  42.68 
 
 
415 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.634634 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1028  extracellular solute-binding protein family 1  43.48 
 
 
415 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00732462  normal  0.0899654 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0840  extracellular solute-binding protein  43.46 
 
 
415 aa  300  4e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.961003  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2129  maltose ABC transporter, periplasmic maltose-binding protein  43.04 
 
 
415 aa  299  6e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.700761  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3086  maltose ABC transporter, periplasmic maltose-binding protein  43.04 
 
 
415 aa  299  6e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0828  extracellular solute-binding protein  43.46 
 
 
415 aa  299  6e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00532301  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0782  carbohydrate ABC transporter periplasmic binding protein  43.04 
 
 
415 aa  299  6e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0847512  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2615  carbohydrate ABC transporter periplasmic binding protein  43.04 
 
 
415 aa  299  6e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.813067  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2998  carbohydrate ABC transporter periplasmic binding protein  43.04 
 
 
415 aa  299  6e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3052  carbohydrate ABC transporter periplasmic binding protein  43.04 
 
 
415 aa  299  6e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1998  carbohydrate ABC transporter periplasmic binding protein  43.04 
 
 
415 aa  299  6e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2430  extracellular solute-binding protein  42.41 
 
 
415 aa  298  1e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.682399  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4071  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  42.67 
 
 
415 aa  296  5e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00185695  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0489  extracellular solute-binding protein  42.93 
 
 
415 aa  296  5e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0816838  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0968  extracellular solute-binding protein  42.93 
 
 
415 aa  296  5e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.278189  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0929  extracellular solute-binding protein  42.93 
 
 
415 aa  295  7e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1553  maltose ABC transporter, periplasmic maltose-binding protein  42.3 
 
 
415 aa  294  2e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0365178  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2284  sugar ABC transporter extracellular solute-binding family 1 protein  35.9 
 
 
410 aa  282  8.000000000000001e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.61221  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1110  extracellular solute-binding protein  37.71 
 
 
411 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0139598  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6972  extracellular solute-binding protein  38.4 
 
 
402 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.780279  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1515  extracellular solute-binding protein  37.41 
 
 
425 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6314  extracellular solute-binding protein  37.41 
 
 
425 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.619662 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5435  extracellular solute-binding protein  39.35 
 
 
414 aa  257  3e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.207139 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001061  ABC-type sugar transport system component  31.67 
 
 
414 aa  249  9e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2283  extracellular solute-binding protein  33.59 
 
 
456 aa  246  6.999999999999999e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0462772  hitchhiker  0.0000190717 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2083  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  38.42 
 
 
412 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.206037  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5887  extracellular solute-binding protein family 1  36.7 
 
 
412 aa  243  6e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4321  extracellular solute-binding protein  41.42 
 
 
409 aa  239  6.999999999999999e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.739189 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2399  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  40.71 
 
 
411 aa  238  2e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.791953  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4568  extracellular solute-binding protein family 1  38.19 
 
 
410 aa  237  3e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.267408  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6357  extracellular solute-binding protein family 1  37.64 
 
 
410 aa  234  3e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0882  extracellular solute-binding protein  39.5 
 
 
412 aa  219  5e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.297168  normal  0.673205 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1728  extracellular solute-binding protein  35.63 
 
 
411 aa  219  7e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00458236  normal  0.504509 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2098  extracellular solute-binding protein family 1  36.95 
 
 
411 aa  219  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.072788 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2337  extracellular solute-binding protein family 1  36.96 
 
 
411 aa  218  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.836128  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3454  extracellular solute-binding protein  36.91 
 
 
418 aa  213  4.9999999999999996e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.00000480069  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9200  ABC-type sugar transport system periplasmic component  32.29 
 
 
374 aa  191  2e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1303  extracellular solute-binding protein  32.43 
 
 
432 aa  177  3e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.313179  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0803  extracellular solute-binding protein  31.48 
 
 
435 aa  176  8e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3155  extracellular solute-binding protein family 1  31.37 
 
 
434 aa  176  8e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3304  extracellular solute-binding protein family 1  30.75 
 
 
431 aa  176  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1174  extracellular solute-binding protein  31.48 
 
 
455 aa  173  3.9999999999999995e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273661  normal  0.401546 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0818  extracellular solute-binding protein  31.35 
 
 
415 aa  171  2e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2380  extracellular solute-binding protein family 1  31.91 
 
 
415 aa  169  8e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2306  extracellular solute-binding protein family 1  31.44 
 
 
432 aa  167  2.9999999999999998e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.432824  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1862  extracellular solute-binding protein  28.54 
 
 
430 aa  166  5e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.144249  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0208  extracellular solute-binding protein family 1  30.6 
 
 
454 aa  163  6e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1924  extracellular solute-binding protein  30.45 
 
 
415 aa  159  6e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.121968  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26610  carbohydrate-binding protein  29.95 
 
 
425 aa  156  6e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3494  extracellular solute-binding protein  34.3 
 
 
414 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0194042 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0168  extracellular solute-binding protein family 1  30.53 
 
 
412 aa  153  5.9999999999999996e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1808  extracellular solute-binding protein family 1  31.23 
 
 
414 aa  151  2e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3264  extracellular solute-binding protein  32.36 
 
 
416 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.591163 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7939  ABC transporter (substrate-binding protein)  31.65 
 
 
428 aa  145  9e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.50295  normal  0.560439 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3657  sugar ABC transporter, substrate-binding protein  29.74 
 
 
423 aa  145  1e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0905  extracellular solute-binding protein  30.45 
 
 
412 aa  137  4e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0882  extracellular solute-binding protein family 1  28.8 
 
 
419 aa  120  4.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.632389 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1813  extracellular solute-binding protein family 1  27.41 
 
 
411 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2520  extracellular solute-binding protein family 1  29.09 
 
 
452 aa  110  5e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.420378 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1824  extracellular solute-binding protein family 1  26.4 
 
 
449 aa  103  7e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1257  extracellular solute-binding protein  26.25 
 
 
467 aa  92  2e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2342  extracellular solute-binding protein  24.93 
 
 
477 aa  88.6  2e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.936887  normal  0.0125511 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2112  extracellular solute-binding protein  24.2 
 
 
473 aa  82.8  0.00000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0862  extracellular solute-binding protein family 1  24.59 
 
 
397 aa  79.7  0.00000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>