246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1482 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_3786  extracellular solute-binding protein family 1  96.9 
 
 
419 aa  823    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1482  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 
420 aa  848    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.340124  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1378  extracellular solute-binding protein family 1  98.33 
 
 
420 aa  836    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3491  extracellular solute-binding protein family 1  95.95 
 
 
419 aa  814    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3817  extracellular solute-binding protein  60.05 
 
 
421 aa  519  1e-146  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.284829  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0693  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  59.57 
 
 
421 aa  515  1.0000000000000001e-145  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0998966  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3170  extracellular solute-binding protein  60 
 
 
414 aa  503  1e-141  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3935  extracellular solute-binding protein  53.21 
 
 
420 aa  450  1e-125  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0774395  normal  0.611638 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3573  extracellular solute-binding protein  56.61 
 
 
414 aa  449  1e-125  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0138682  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3404  extracellular solute-binding protein  48.47 
 
 
413 aa  381  1e-104  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1695  extracellular solute-binding protein  48.32 
 
 
420 aa  379  1e-104  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.157617 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0092  extracellular solute-binding protein  48.72 
 
 
425 aa  367  1e-100  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4349  extracellular solute-binding protein  45.32 
 
 
415 aa  362  5.0000000000000005e-99  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000381076  hitchhiker  0.000997313 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1956  sugar ABC transporter extracellular solute-binding family 1 protein  44.77 
 
 
417 aa  347  2e-94  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.318288  normal  0.222736 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2416  extracellular solute-binding protein  42.89 
 
 
417 aa  338  9.999999999999999e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.230559  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29280  sugar ABC transport system, periplasmic substrate-binding protein  40.7 
 
 
388 aa  335  1e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1097  extracellular solute-binding protein  44.6 
 
 
416 aa  331  2e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000486653  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3451  ABC sugar (maltose) transporter, periplasmic ligand binding protein  48.23 
 
 
415 aa  330  3e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000113592  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1028  extracellular solute-binding protein family 1  47.98 
 
 
415 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00732462  normal  0.0899654 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0628  extracellular solute-binding protein  47.33 
 
 
415 aa  327  3e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.224261  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1090  extracellular solute-binding protein  42.75 
 
 
417 aa  326  4.0000000000000003e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4278  extracellular solute-binding protein  39.76 
 
 
442 aa  326  5e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0860  extracellular solute-binding protein family 1  44.12 
 
 
415 aa  324  2e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0321479  normal  0.15183 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6328  extracellular solute-binding protein  45.38 
 
 
415 aa  324  2e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.634634 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3689  extracellular solute-binding protein  44.47 
 
 
416 aa  322  6e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2191  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  43.65 
 
 
415 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.537651  hitchhiker  0.00669154 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0083  extracellular solute-binding protein family 1  43.07 
 
 
429 aa  320  3e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0523  extracellular solute-binding protein  43.83 
 
 
418 aa  318  1e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0840  extracellular solute-binding protein  47.34 
 
 
415 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.961003  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0828  extracellular solute-binding protein  47.61 
 
 
415 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00532301  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0489  extracellular solute-binding protein  47.34 
 
 
415 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0816838  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0968  extracellular solute-binding protein  47.34 
 
 
415 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.278189  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0929  extracellular solute-binding protein  47.34 
 
 
415 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4071  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  47.07 
 
 
415 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00185695  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1553  maltose ABC transporter, periplasmic maltose-binding protein  46.54 
 
 
415 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0365178  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2129  maltose ABC transporter, periplasmic maltose-binding protein  46.28 
 
 
415 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.700761  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3086  maltose ABC transporter, periplasmic maltose-binding protein  46.28 
 
 
415 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0782  carbohydrate ABC transporter periplasmic binding protein  46.28 
 
 
415 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0847512  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2615  carbohydrate ABC transporter periplasmic binding protein  46.28 
 
 
415 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.813067  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2998  carbohydrate ABC transporter periplasmic binding protein  46.28 
 
 
415 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3052  carbohydrate ABC transporter periplasmic binding protein  46.28 
 
 
415 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1998  carbohydrate ABC transporter periplasmic binding protein  46.28 
 
 
415 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2430  extracellular solute-binding protein  46.54 
 
 
415 aa  310  4e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.682399  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1939  putative sugar ABC transporter binding protein subunit  44.95 
 
 
420 aa  306  3e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1292  glucose ABC transporter, periplasmic glucose-binding protein, putative  41.72 
 
 
428 aa  305  8.000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.927491  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1113  extracellular solute-binding protein  43.39 
 
 
431 aa  303  5.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.561117 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22980  putative binding protein component of ABC sugar transporter  44.15 
 
 
420 aa  302  6.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.16871 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1150  extracellular solute-binding protein  42.68 
 
 
417 aa  302  7.000000000000001e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0392592  normal  0.752071 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4209  extracellular solute-binding protein  44.12 
 
 
428 aa  297  3e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1013  extracellular solute-binding protein  43.14 
 
 
428 aa  290  3e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1053  extracellular solute-binding protein  43.38 
 
 
428 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00219882  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1015  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  43.38 
 
 
428 aa  288  2e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6972  extracellular solute-binding protein  41.07 
 
 
402 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.780279  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4370  extracellular solute-binding protein  40.65 
 
 
433 aa  282  9e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.878399  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1515  extracellular solute-binding protein  39.36 
 
 
425 aa  278  1e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6314  extracellular solute-binding protein  39.36 
 
 
425 aa  278  1e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.619662 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5435  extracellular solute-binding protein  42.74 
 
 
414 aa  247  2e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.207139 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4321  extracellular solute-binding protein  39.24 
 
 
409 aa  245  8e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.739189 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2283  extracellular solute-binding protein  33.42 
 
 
456 aa  245  9.999999999999999e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0462772  hitchhiker  0.0000190717 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1110  extracellular solute-binding protein  39.06 
 
 
411 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0139598  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001061  ABC-type sugar transport system component  31.81 
 
 
414 aa  244  1.9999999999999999e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2083  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  40.22 
 
 
412 aa  243  3e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.206037  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2284  sugar ABC transporter extracellular solute-binding family 1 protein  32.08 
 
 
410 aa  241  1e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.61221  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5887  extracellular solute-binding protein family 1  39.95 
 
 
412 aa  241  2e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0882  extracellular solute-binding protein  38.59 
 
 
412 aa  228  2e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.297168  normal  0.673205 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6357  extracellular solute-binding protein family 1  38.06 
 
 
410 aa  225  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4568  extracellular solute-binding protein family 1  37.74 
 
 
410 aa  219  6e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.267408  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3454  extracellular solute-binding protein  35.68 
 
 
418 aa  209  7e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.00000480069  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2399  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  37.1 
 
 
411 aa  204  2e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.791953  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2337  extracellular solute-binding protein family 1  36.42 
 
 
411 aa  203  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.836128  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2098  extracellular solute-binding protein family 1  36.71 
 
 
411 aa  203  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.072788 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1728  extracellular solute-binding protein  35.84 
 
 
411 aa  194  2e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00458236  normal  0.504509 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3304  extracellular solute-binding protein family 1  34.38 
 
 
431 aa  186  9e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3155  extracellular solute-binding protein family 1  33.42 
 
 
434 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2306  extracellular solute-binding protein family 1  31.59 
 
 
432 aa  185  2.0000000000000003e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.432824  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0803  extracellular solute-binding protein  30.89 
 
 
435 aa  181  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0208  extracellular solute-binding protein family 1  33.07 
 
 
454 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1174  extracellular solute-binding protein  31.82 
 
 
455 aa  177  3e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273661  normal  0.401546 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9200  ABC-type sugar transport system periplasmic component  33.25 
 
 
374 aa  170  4e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0818  extracellular solute-binding protein  31.47 
 
 
415 aa  170  5e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1862  extracellular solute-binding protein  31.83 
 
 
430 aa  163  6e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.144249  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1924  extracellular solute-binding protein  29.4 
 
 
415 aa  163  6e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.121968  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1808  extracellular solute-binding protein family 1  31.2 
 
 
414 aa  160  3e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3494  extracellular solute-binding protein  30.51 
 
 
414 aa  151  2e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0194042 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1303  extracellular solute-binding protein  30.5 
 
 
432 aa  149  8e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.313179  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7939  ABC transporter (substrate-binding protein)  33.53 
 
 
428 aa  147  5e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.50295  normal  0.560439 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3264  extracellular solute-binding protein  30.16 
 
 
416 aa  145  1e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.591163 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0905  extracellular solute-binding protein  31.5 
 
 
412 aa  144  2e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2380  extracellular solute-binding protein family 1  28.64 
 
 
415 aa  144  2e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26610  carbohydrate-binding protein  28.84 
 
 
425 aa  138  2e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0168  extracellular solute-binding protein family 1  29.38 
 
 
412 aa  127  4.0000000000000003e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3657  sugar ABC transporter, substrate-binding protein  27.78 
 
 
423 aa  125  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2112  extracellular solute-binding protein  31.1 
 
 
473 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0882  extracellular solute-binding protein family 1  28.31 
 
 
419 aa  117  3.9999999999999997e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.632389 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2342  extracellular solute-binding protein  32.05 
 
 
477 aa  116  6e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.936887  normal  0.0125511 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1257  extracellular solute-binding protein  31.01 
 
 
467 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1813  extracellular solute-binding protein family 1  25.9 
 
 
411 aa  90.1  7e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0862  extracellular solute-binding protein family 1  25.64 
 
 
397 aa  85.5  0.000000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2391  extracellular solute-binding protein family 1  27.15 
 
 
422 aa  84  0.000000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.436445  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2659  extracellular solute-binding protein family 1  31.03 
 
 
495 aa  83.2  0.000000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>