183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0862 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_0862  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 397 aa  811    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2574  extracellular solute-binding protein family 1  37.14 
 
 		 395 aa  270  2.9999999999999997e-71  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.577743 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1813  extracellular solute-binding protein family 1  35.23 
 
 		 411 aa  203  5e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2520  extracellular solute-binding protein family 1  34.53 
 
 		 452 aa  202  8e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.420378 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1824  extracellular solute-binding protein family 1  32.23 
 
 		 449 aa  189  5e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4502  extracellular solute-binding protein family 1  32.21 
 
 		 427 aa  187  3e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1808  extracellular solute-binding protein family 1  28.99 
 
 		 414 aa  154  2e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3494  extracellular solute-binding protein  28.41 
 
 		 414 aa  154  2e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0194042 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3264  extracellular solute-binding protein  27.02 
 
 		 416 aa  146  8.000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.591163 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3304  extracellular solute-binding protein family 1  27.16 
 
 		 431 aa  143  6e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1303  extracellular solute-binding protein  29.75 
 
 		 432 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.313179  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3155  extracellular solute-binding protein family 1  27.8 
 
 		 434 aa  139  7e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1174  extracellular solute-binding protein  27.06 
 
 		 455 aa  139  1e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273661  normal  0.401546 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0168  extracellular solute-binding protein family 1  28.49 
 
 		 412 aa  136  6.0000000000000005e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0803  extracellular solute-binding protein  26.08 
 
 		 435 aa  135  9.999999999999999e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0882  extracellular solute-binding protein family 1  27.43 
 
 		 419 aa  132  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.632389 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0818  extracellular solute-binding protein  28.98 
 
 		 415 aa  131  3e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0208  extracellular solute-binding protein family 1  26.96 
 
 		 454 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2380  extracellular solute-binding protein family 1  27.08 
 
 		 415 aa  128  2.0000000000000002e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7939  ABC transporter (substrate-binding protein)  25 
 
 		 428 aa  127  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.50295  normal  0.560439 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2306  extracellular solute-binding protein family 1  28.45 
 
 		 432 aa  127  5e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.432824  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26610  carbohydrate-binding protein  26.63 
 
 		 425 aa  119  6e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1924  extracellular solute-binding protein  28.75 
 
 		 415 aa  119  9.999999999999999e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.121968  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22980  putative binding protein component of ABC sugar transporter  27.16 
 
 		 420 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.16871 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1939  putative sugar ABC transporter binding protein subunit  26.87 
 
 		 420 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3657  sugar ABC transporter, substrate-binding protein  24.61 
 
 		 423 aa  114  3e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1150  extracellular solute-binding protein  26.87 
 
 		 417 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0392592  normal  0.752071 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1862  extracellular solute-binding protein  25.57 
 
 		 430 aa  108  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.144249  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1292  glucose ABC transporter, periplasmic glucose-binding protein, putative  26.74 
 
 		 428 aa  107  4e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.927491  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0905  extracellular solute-binding protein  25.2 
 
 		 412 aa  101  2e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2416  extracellular solute-binding protein  26.45 
 
 		 417 aa  96.3  9e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.230559  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1113  extracellular solute-binding protein  26.11 
 
 		 431 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.561117 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0523  extracellular solute-binding protein  25.75 
 
 		 418 aa  95.9  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1956  sugar ABC transporter extracellular solute-binding family 1 protein  25 
 
 		 417 aa  95.1  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.318288  normal  0.222736 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1053  extracellular solute-binding protein  26.03 
 
 		 428 aa  94  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00219882  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1015  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  26.03 
 
 		 428 aa  93.6  6e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4370  extracellular solute-binding protein  25.51 
 
 		 433 aa  93.2  7e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.878399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1013  extracellular solute-binding protein  25.71 
 
 		 428 aa  93.2  8e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1695  extracellular solute-binding protein  26.12 
 
 		 420 aa  92  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.157617 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1257  extracellular solute-binding protein  25.83 
 
 		 467 aa  90.9  3e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2430  extracellular solute-binding protein  24.61 
 
 		 415 aa  90.9  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.682399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0489  extracellular solute-binding protein  25.08 
 
 		 415 aa  89.4  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0816838  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0968  extracellular solute-binding protein  25.08 
 
 		 415 aa  89.4  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.278189  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0929  extracellular solute-binding protein  25.08 
 
 		 415 aa  89.4  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4071  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  24.76 
 
 		 415 aa  87.8  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00185695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3491  extracellular solute-binding protein family 1  25.96 
 
 		 419 aa  87.8  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1378  extracellular solute-binding protein family 1  25.96 
 
 		 420 aa  87.4  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3404  extracellular solute-binding protein  26.65 
 
 		 413 aa  87.4  4e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0092  extracellular solute-binding protein  26.45 
 
 		 425 aa  86.7  7e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3786  extracellular solute-binding protein family 1  25.64 
 
 		 419 aa  85.9  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1482  extracellular solute-binding protein family 1  25.64 
 
 		 420 aa  85.5  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.340124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0840  extracellular solute-binding protein  23.57 
 
 		 415 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.961003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4209  extracellular solute-binding protein  24.76 
 
 		 428 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0628  extracellular solute-binding protein  24.52 
 
 		 415 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.224261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3689  extracellular solute-binding protein  25.72 
 
 		 416 aa  84  0.000000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2659  extracellular solute-binding protein family 1  24.02 
 
 		 495 aa  84  0.000000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6357  extracellular solute-binding protein family 1  23.92 
 
 		 410 aa  83.6  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4349  extracellular solute-binding protein  25.95 
 
 		 415 aa  83.6  0.000000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000381076  hitchhiker  0.000997313 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0828  extracellular solute-binding protein  23.57 
 
 		 415 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00532301  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1028  extracellular solute-binding protein family 1  25.98 
 
 		 415 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00732462  normal  0.0899654 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3451  ABC sugar (maltose) transporter, periplasmic ligand binding protein  25.68 
 
 		 415 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000113592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5887  extracellular solute-binding protein family 1  24.13 
 
 		 412 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1553  maltose ABC transporter, periplasmic maltose-binding protein  23.58 
 
 		 415 aa  79.7  0.00000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0365178  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0083  extracellular solute-binding protein family 1  23.97 
 
 		 429 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2129  maltose ABC transporter, periplasmic maltose-binding protein  23.58 
 
 		 415 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.700761  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3086  maltose ABC transporter, periplasmic maltose-binding protein  23.58 
 
 		 415 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1097  extracellular solute-binding protein  24.82 
 
 		 416 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000486653  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0782  carbohydrate ABC transporter periplasmic binding protein  23.58 
 
 		 415 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0847512  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3573  extracellular solute-binding protein  24.38 
 
 		 414 aa  78.6  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0138682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2615  carbohydrate ABC transporter periplasmic binding protein  23.58 
 
 		 415 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.813067  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2112  extracellular solute-binding protein  24.3 
 
 		 473 aa  78.2  0.0000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2998  carbohydrate ABC transporter periplasmic binding protein  23.58 
 
 		 415 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3052  carbohydrate ABC transporter periplasmic binding protein  23.58 
 
 		 415 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1998  carbohydrate ABC transporter periplasmic binding protein  23.58 
 
 		 415 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001061  ABC-type sugar transport system component  25.07 
 
 		 414 aa  77.8  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2083  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  24 
 
 		 412 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.206037  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0693  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  25 
 
 		 421 aa  76.3  0.0000000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0998966  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5435  extracellular solute-binding protein  22.61 
 
 		 414 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.207139 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4568  extracellular solute-binding protein family 1  22.9 
 
 		 410 aa  76.3  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.267408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3935  extracellular solute-binding protein  25.5 
 
 		 420 aa  74.3  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0774395  normal  0.611638 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3817  extracellular solute-binding protein  23.92 
 
 		 421 aa  73.9  0.000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.284829  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2345  extracellular solute-binding protein family 1  25.69 
 
 		 424 aa  73.2  0.000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.822896  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2342  extracellular solute-binding protein  23.85 
 
 		 477 aa  72.8  0.00000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.936887  normal  0.0125511 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20520  extracellular solute-binding protein family 1  22.89 
 
 		 417 aa  72.4  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.561553  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1619  putative sugar-binding lipoprotein  23.63 
 
 		 434 aa  71.6  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.195944  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2284  sugar ABC transporter extracellular solute-binding family 1 protein  21.65 
 
 		 410 aa  71.6  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.61221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3170  extracellular solute-binding protein  23.47 
 
 		 414 aa  72  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1529  extracellular solute-binding protein  23.29 
 
 		 439 aa  71.2  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3454  extracellular solute-binding protein  23.35 
 
 		 418 aa  65.1  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.00000480069  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6328  extracellular solute-binding protein  23.16 
 
 		 415 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.634634 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0069  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 448 aa  63.2  0.000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2391  extracellular solute-binding protein family 1  22.12 
 
 		 422 aa  62.4  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.436445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2716  extracellular solute-binding protein family 1  22.61 
 
 		 441 aa  62.4  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1184  ABC transporter, substrate-binding protein  21.84 
 
 		 413 aa  62  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.186568  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0513  extracellular solute-binding protein family 1  24.45 
 
 		 447 aa  62  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.000000038068  hitchhiker  0.000703825 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2818  carbohydrate ABC transporter periplasmic binding protein  21.94 
 
 		 399 aa  62  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5736  ABC transporter, substrate-binding protein  22.86 
 
 		 410 aa  61.6  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.214535  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0860  extracellular solute-binding protein family 1  25.5 
 
 		 415 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0321479  normal  0.15183 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1110  extracellular solute-binding protein  22.52 
 
 		 411 aa  61.2  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0139598  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3251  extracellular solute-binding protein family 1  22.06 
 
 		 427 aa  61.6  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>