More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0882 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0882  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
412 aa  847    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.297168  normal  0.673205 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3454  extracellular solute-binding protein  47.74 
 
 
418 aa  389  1e-107  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.00000480069  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2337  extracellular solute-binding protein family 1  47.85 
 
 
411 aa  362  9e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.836128  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2098  extracellular solute-binding protein family 1  47.59 
 
 
411 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.072788 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2399  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  47.33 
 
 
411 aa  356  5e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.791953  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2083  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  45.31 
 
 
412 aa  345  6e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.206037  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1110  extracellular solute-binding protein  42.93 
 
 
411 aa  345  7e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0139598  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1728  extracellular solute-binding protein  46.33 
 
 
411 aa  342  5.999999999999999e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00458236  normal  0.504509 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5435  extracellular solute-binding protein  43.26 
 
 
414 aa  341  2e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.207139 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5887  extracellular solute-binding protein family 1  43.77 
 
 
412 aa  339  7e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4321  extracellular solute-binding protein  45.05 
 
 
409 aa  338  9.999999999999999e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.739189 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2416  extracellular solute-binding protein  40.33 
 
 
417 aa  287  2e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.230559  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1956  sugar ABC transporter extracellular solute-binding family 1 protein  39.21 
 
 
417 aa  275  1.0000000000000001e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.318288  normal  0.222736 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4349  extracellular solute-binding protein  38.6 
 
 
415 aa  269  5.9999999999999995e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000381076  hitchhiker  0.000997313 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0083  extracellular solute-binding protein family 1  37.97 
 
 
429 aa  266  5e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1097  extracellular solute-binding protein  39.08 
 
 
416 aa  261  1e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000486653  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1695  extracellular solute-binding protein  37.44 
 
 
420 aa  262  1e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.157617 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4568  extracellular solute-binding protein family 1  36.98 
 
 
410 aa  257  3e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.267408  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6357  extracellular solute-binding protein family 1  36.95 
 
 
410 aa  254  3e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3689  extracellular solute-binding protein  38.24 
 
 
416 aa  248  2e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3404  extracellular solute-binding protein  35.41 
 
 
413 aa  246  6e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0092  extracellular solute-binding protein  36.48 
 
 
425 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3935  extracellular solute-binding protein  37.76 
 
 
420 aa  242  9e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0774395  normal  0.611638 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1150  extracellular solute-binding protein  38.4 
 
 
417 aa  241  1e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0392592  normal  0.752071 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1482  extracellular solute-binding protein family 1  38.59 
 
 
420 aa  238  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.340124  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3817  extracellular solute-binding protein  37.88 
 
 
421 aa  236  4e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.284829  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0860  extracellular solute-binding protein family 1  37.19 
 
 
415 aa  236  4e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0321479  normal  0.15183 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3170  extracellular solute-binding protein  39.88 
 
 
414 aa  236  5.0000000000000005e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0693  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  38.16 
 
 
421 aa  236  6e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0998966  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3786  extracellular solute-binding protein family 1  38.42 
 
 
419 aa  236  8e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3491  extracellular solute-binding protein family 1  38.42 
 
 
419 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1378  extracellular solute-binding protein family 1  38.03 
 
 
420 aa  233  3e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3573  extracellular solute-binding protein  39.5 
 
 
414 aa  229  5e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0138682  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22980  putative binding protein component of ABC sugar transporter  35.84 
 
 
420 aa  228  2e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.16871 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1939  putative sugar ABC transporter binding protein subunit  35.58 
 
 
420 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2191  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  36.86 
 
 
415 aa  224  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.537651  hitchhiker  0.00669154 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3451  ABC sugar (maltose) transporter, periplasmic ligand binding protein  38.48 
 
 
415 aa  224  3e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000113592  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0628  extracellular solute-binding protein  37.84 
 
 
415 aa  224  3e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.224261  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6328  extracellular solute-binding protein  37.4 
 
 
415 aa  223  4e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.634634 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9200  ABC-type sugar transport system periplasmic component  34.73 
 
 
374 aa  223  4e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1028  extracellular solute-binding protein family 1  37.59 
 
 
415 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00732462  normal  0.0899654 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0523  extracellular solute-binding protein  34.99 
 
 
418 aa  220  3.9999999999999997e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2430  extracellular solute-binding protein  37.96 
 
 
415 aa  219  7e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.682399  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1090  extracellular solute-binding protein  35.71 
 
 
417 aa  218  2e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2284  sugar ABC transporter extracellular solute-binding family 1 protein  32.99 
 
 
410 aa  218  2e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.61221  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0929  extracellular solute-binding protein  36.95 
 
 
415 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2129  maltose ABC transporter, periplasmic maltose-binding protein  36.84 
 
 
415 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.700761  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3086  maltose ABC transporter, periplasmic maltose-binding protein  36.84 
 
 
415 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0489  extracellular solute-binding protein  36.95 
 
 
415 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0816838  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0968  extracellular solute-binding protein  36.95 
 
 
415 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.278189  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0782  carbohydrate ABC transporter periplasmic binding protein  36.84 
 
 
415 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0847512  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2615  carbohydrate ABC transporter periplasmic binding protein  36.84 
 
 
415 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.813067  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2998  carbohydrate ABC transporter periplasmic binding protein  36.84 
 
 
415 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3052  carbohydrate ABC transporter periplasmic binding protein  36.84 
 
 
415 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1998  carbohydrate ABC transporter periplasmic binding protein  36.84 
 
 
415 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1553  maltose ABC transporter, periplasmic maltose-binding protein  36.58 
 
 
415 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0365178  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4071  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  35.63 
 
 
415 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00185695  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0840  extracellular solute-binding protein  36.7 
 
 
415 aa  212  1e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.961003  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1292  glucose ABC transporter, periplasmic glucose-binding protein, putative  36.03 
 
 
428 aa  210  3e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.927491  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1113  extracellular solute-binding protein  35.68 
 
 
431 aa  210  4e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.561117 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0828  extracellular solute-binding protein  36.21 
 
 
415 aa  208  1e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00532301  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1013  extracellular solute-binding protein  34.89 
 
 
428 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4370  extracellular solute-binding protein  34.95 
 
 
433 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.878399  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1015  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  34.73 
 
 
428 aa  197  3e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1053  extracellular solute-binding protein  34.53 
 
 
428 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00219882  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6972  extracellular solute-binding protein  35.79 
 
 
402 aa  192  8e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.780279  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4209  extracellular solute-binding protein  34.15 
 
 
428 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1515  extracellular solute-binding protein  35.73 
 
 
425 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6314  extracellular solute-binding protein  35.73 
 
 
425 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.619662 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3155  extracellular solute-binding protein family 1  33.43 
 
 
434 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3304  extracellular solute-binding protein family 1  32.74 
 
 
431 aa  176  5e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29280  sugar ABC transport system, periplasmic substrate-binding protein  29.73 
 
 
388 aa  166  8e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001061  ABC-type sugar transport system component  29.43 
 
 
414 aa  160  3e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4278  extracellular solute-binding protein  29.2 
 
 
442 aa  159  1e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1174  extracellular solute-binding protein  30.47 
 
 
455 aa  157  4e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273661  normal  0.401546 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1303  extracellular solute-binding protein  31.21 
 
 
432 aa  156  8e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.313179  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0818  extracellular solute-binding protein  29.11 
 
 
415 aa  155  1e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1808  extracellular solute-binding protein family 1  29.12 
 
 
414 aa  155  2e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0803  extracellular solute-binding protein  30.47 
 
 
435 aa  154  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0208  extracellular solute-binding protein family 1  29.38 
 
 
454 aa  150  3e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3494  extracellular solute-binding protein  32.62 
 
 
414 aa  151  3e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0194042 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1924  extracellular solute-binding protein  28.4 
 
 
415 aa  147  4.0000000000000006e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.121968  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2306  extracellular solute-binding protein family 1  29.2 
 
 
432 aa  144  2e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.432824  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2380  extracellular solute-binding protein family 1  29.71 
 
 
415 aa  144  3e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3657  sugar ABC transporter, substrate-binding protein  28.79 
 
 
423 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0168  extracellular solute-binding protein family 1  29.68 
 
 
412 aa  142  9.999999999999999e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3264  extracellular solute-binding protein  30.77 
 
 
416 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.591163 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2283  extracellular solute-binding protein  26.05 
 
 
456 aa  137  4e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0462772  hitchhiker  0.0000190717 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7939  ABC transporter (substrate-binding protein)  31.04 
 
 
428 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.50295  normal  0.560439 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26610  carbohydrate-binding protein  28.66 
 
 
425 aa  128  2.0000000000000002e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0905  extracellular solute-binding protein  28.19 
 
 
412 aa  128  2.0000000000000002e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1862  extracellular solute-binding protein  26.22 
 
 
430 aa  125  1e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.144249  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0882  extracellular solute-binding protein family 1  26.44 
 
 
419 aa  108  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.632389 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2391  extracellular solute-binding protein family 1  26.84 
 
 
422 aa  92  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.436445  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1257  extracellular solute-binding protein  25.27 
 
 
467 aa  83.6  0.000000000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3910  extracellular solute-binding protein family 1  27.17 
 
 
412 aa  80.9  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.198843 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4159  extracellular solute-binding protein  28.32 
 
 
421 aa  78.6  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.119299  normal  0.873951 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5736  ABC transporter, substrate-binding protein  24.82 
 
 
410 aa  77.8  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.214535  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2112  extracellular solute-binding protein  23.63 
 
 
473 aa  78.2  0.0000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13140  extracellular solute-binding protein family 1  25.46 
 
 
424 aa  77.4  0.0000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>