140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_2574 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2574  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 395 aa  806    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.577743 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0862  extracellular solute-binding protein family 1  37.14 
 
 		 397 aa  270  2.9999999999999997e-71  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1813  extracellular solute-binding protein family 1  30.41 
 
 		 411 aa  196  4.0000000000000005e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2520  extracellular solute-binding protein family 1  29.89 
 
 		 452 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.420378 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4502  extracellular solute-binding protein family 1  30.83 
 
 		 427 aa  166  5.9999999999999996e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1824  extracellular solute-binding protein family 1  29.14 
 
 		 449 aa  161  2e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3304  extracellular solute-binding protein family 1  25.13 
 
 		 431 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3155  extracellular solute-binding protein family 1  24.35 
 
 		 434 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0882  extracellular solute-binding protein family 1  23.94 
 
 		 419 aa  130  4.0000000000000003e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.632389 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3494  extracellular solute-binding protein  27.54 
 
 		 414 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0194042 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3264  extracellular solute-binding protein  26.02 
 
 		 416 aa  125  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.591163 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1808  extracellular solute-binding protein family 1  24.94 
 
 		 414 aa  125  2e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1303  extracellular solute-binding protein  26.6 
 
 		 432 aa  120  3e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.313179  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1862  extracellular solute-binding protein  27.38 
 
 		 430 aa  120  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.144249  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26610  carbohydrate-binding protein  26.53 
 
 		 425 aa  117  3.9999999999999997e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0168  extracellular solute-binding protein family 1  24.78 
 
 		 412 aa  110  6e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3657  sugar ABC transporter, substrate-binding protein  23.88 
 
 		 423 aa  108  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0818  extracellular solute-binding protein  23.6 
 
 		 415 aa  108  1e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7939  ABC transporter (substrate-binding protein)  26.01 
 
 		 428 aa  109  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.50295  normal  0.560439 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2380  extracellular solute-binding protein family 1  23.91 
 
 		 415 aa  107  4e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1174  extracellular solute-binding protein  22.37 
 
 		 455 aa  107  4e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273661  normal  0.401546 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0803  extracellular solute-binding protein  22.59 
 
 		 435 aa  105  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0208  extracellular solute-binding protein family 1  26.04 
 
 		 454 aa  103  6e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1924  extracellular solute-binding protein  26.35 
 
 		 415 aa  103  6e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.121968  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0905  extracellular solute-binding protein  22.81 
 
 		 412 aa  99  1e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2416  extracellular solute-binding protein  24.75 
 
 		 417 aa  95.9  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.230559  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2306  extracellular solute-binding protein family 1  22.9 
 
 		 432 aa  90.1  5e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.432824  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1257  extracellular solute-binding protein  23.66 
 
 		 467 aa  89.4  1e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0523  extracellular solute-binding protein  23.74 
 
 		 418 aa  87.4  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1956  sugar ABC transporter extracellular solute-binding family 1 protein  23.61 
 
 		 417 aa  87  5e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.318288  normal  0.222736 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1053  extracellular solute-binding protein  25.95 
 
 		 428 aa  76.3  0.0000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00219882  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1292  glucose ABC transporter, periplasmic glucose-binding protein, putative  25.8 
 
 		 428 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.927491  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1150  extracellular solute-binding protein  24.54 
 
 		 417 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0392592  normal  0.752071 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1695  extracellular solute-binding protein  23.06 
 
 		 420 aa  75.5  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.157617 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4370  extracellular solute-binding protein  24.27 
 
 		 433 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.878399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1939  putative sugar ABC transporter binding protein subunit  22.85 
 
 		 420 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1015  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  26.44 
 
 		 428 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3689  extracellular solute-binding protein  23.3 
 
 		 416 aa  74.3  0.000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4209  extracellular solute-binding protein  25.51 
 
 		 428 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1013  extracellular solute-binding protein  26.63 
 
 		 428 aa  73.6  0.000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22980  putative binding protein component of ABC sugar transporter  22.85 
 
 		 420 aa  73.6  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.16871 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0628  extracellular solute-binding protein  24.84 
 
 		 415 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.224261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2342  extracellular solute-binding protein  23.46 
 
 		 477 aa  72.4  0.00000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.936887  normal  0.0125511 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2112  extracellular solute-binding protein  22.91 
 
 		 473 aa  70.9  0.00000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3451  ABC sugar (maltose) transporter, periplasmic ligand binding protein  24.84 
 
 		 415 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000113592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0083  extracellular solute-binding protein family 1  21.6 
 
 		 429 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1113  extracellular solute-binding protein  24.5 
 
 		 431 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.561117 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1619  putative sugar-binding lipoprotein  25.61 
 
 		 434 aa  68.6  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.195944  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0092  extracellular solute-binding protein  23.23 
 
 		 425 aa  67.8  0.0000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1097  extracellular solute-binding protein  22.31 
 
 		 416 aa  67  0.0000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000486653  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1028  extracellular solute-binding protein family 1  24.73 
 
 		 415 aa  67  0.0000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00732462  normal  0.0899654 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2284  sugar ABC transporter extracellular solute-binding family 1 protein  22.47 
 
 		 410 aa  66.6  0.0000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.61221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2430  extracellular solute-binding protein  23.99 
 
 		 415 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.682399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6328  extracellular solute-binding protein  25.76 
 
 		 415 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.634634 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2008  ABC transporter extracellular solute-binding protein  24.63 
 
 		 408 aa  63.9  0.000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.247518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0828  extracellular solute-binding protein  24.67 
 
 		 415 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00532301  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0860  extracellular solute-binding protein family 1  23.75 
 
 		 415 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0321479  normal  0.15183 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4071  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  23.86 
 
 		 415 aa  62  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00185695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4349  extracellular solute-binding protein  22.19 
 
 		 415 aa  61.6  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000381076  hitchhiker  0.000997313 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001061  ABC-type sugar transport system component  23.47 
 
 		 414 aa  61.2  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3404  extracellular solute-binding protein  21.15 
 
 		 413 aa  61.2  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2659  extracellular solute-binding protein family 1  24.35 
 
 		 495 aa  60.8  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2129  maltose ABC transporter, periplasmic maltose-binding protein  22.65 
 
 		 415 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.700761  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3086  maltose ABC transporter, periplasmic maltose-binding protein  22.65 
 
 		 415 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5736  ABC transporter, substrate-binding protein  23.44 
 
 		 410 aa  60.8  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.214535  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0782  carbohydrate ABC transporter periplasmic binding protein  22.65 
 
 		 415 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0847512  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2615  carbohydrate ABC transporter periplasmic binding protein  22.65 
 
 		 415 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.813067  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2998  carbohydrate ABC transporter periplasmic binding protein  22.65 
 
 		 415 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3052  carbohydrate ABC transporter periplasmic binding protein  22.65 
 
 		 415 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1998  carbohydrate ABC transporter periplasmic binding protein  22.65 
 
 		 415 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1553  maltose ABC transporter, periplasmic maltose-binding protein  22.65 
 
 		 415 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0365178  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29280  sugar ABC transport system, periplasmic substrate-binding protein  26.19 
 
 		 388 aa  60.1  0.00000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0840  extracellular solute-binding protein  24.01 
 
 		 415 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.961003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2191  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  24.46 
 
 		 415 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.537651  hitchhiker  0.00669154 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1110  extracellular solute-binding protein  22.88 
 
 		 411 aa  59.3  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0139598  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0489  extracellular solute-binding protein  23.03 
 
 		 415 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0816838  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0968  extracellular solute-binding protein  23.03 
 
 		 415 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.278189  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1090  extracellular solute-binding protein  21.98 
 
 		 417 aa  59.3  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0929  extracellular solute-binding protein  23.03 
 
 		 415 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1248  extracellular solute-binding protein family 1  25.31 
 
 		 414 aa  58.5  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.494424  normal  0.639356 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5435  extracellular solute-binding protein  24.21 
 
 		 414 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.207139 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1184  ABC transporter, substrate-binding protein  21 
 
 		 413 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.186568  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2818  carbohydrate ABC transporter periplasmic binding protein  21 
 
 		 399 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2391  extracellular solute-binding protein family 1  20.5 
 
 		 422 aa  54.7  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.436445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3600  extracellular solute-binding protein family 1  21.63 
 
 		 425 aa  54.3  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5887  extracellular solute-binding protein family 1  24.09 
 
 		 412 aa  54.3  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2083  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  23.83 
 
 		 412 aa  53.9  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.206037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0090  extracellular solute-binding protein  21.34 
 
 		 441 aa  52.8  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.214251  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3573  extracellular solute-binding protein  21.32 
 
 		 414 aa  52.8  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0138682  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0940  extracellular solute-binding protein family 1  20.93 
 
 		 441 aa  52.8  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.558741 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13140  extracellular solute-binding protein family 1  20.87 
 
 		 424 aa  52  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20520  extracellular solute-binding protein family 1  17.13 
 
 		 417 aa  51.6  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.561553  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3170  extracellular solute-binding protein  21.51 
 
 		 414 aa  50.8  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3817  extracellular solute-binding protein  20.68 
 
 		 421 aa  50.8  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.284829  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1105  extracellular solute-binding protein family 1  28.15 
 
 		 442 aa  50.1  0.00006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.314126  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6972  extracellular solute-binding protein  21.95 
 
 		 402 aa  50.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.780279  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24620  carbohydrate-binding protein  25.29 
 
 		 424 aa  50.1  0.00007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0693  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  21.27 
 
 		 421 aa  50.1  0.00008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0998966  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3251  extracellular solute-binding protein family 1  26.24 
 
 		 428 aa  49.7  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.292164  normal  0.0559218 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4017  extracellular solute-binding protein  20.71 
 
 		 435 aa  48.9  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>