277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0998 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_0998  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 451 aa  927    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0996  extracellular solute-binding protein family 1  61.16 
 
 		 455 aa  572  1.0000000000000001e-162  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3409  extracellular solute-binding protein  27.1 
 
 		 451 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000553575  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1025  extracellular solute-binding protein family 1  25.22 
 
 		 444 aa  108  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000399953  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2716  extracellular solute-binding protein family 1  25.72 
 
 		 441 aa  102  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0296  hypothetical protein  29.69 
 
 		 439 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1999  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 468 aa  100  5e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0200  extracellular solute-binding protein family 1  26.76 
 
 		 441 aa  100  5e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20520  extracellular solute-binding protein family 1  24.46 
 
 		 417 aa  98.6  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.561553  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1291  extracellular solute-binding protein family 1  27.62 
 
 		 470 aa  96.3  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0944  extracellular solute-binding protein  30.11 
 
 		 422 aa  94  5e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.544942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4547  extracellular solute-binding protein  25.56 
 
 		 423 aa  93.2  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.909678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3246  extracellular solute-binding protein family 1  26.88 
 
 		 443 aa  90.9  5e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1174  extracellular solute-binding protein  25.25 
 
 		 455 aa  89.4  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273661  normal  0.401546 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3155  extracellular solute-binding protein family 1  28.52 
 
 		 434 aa  88.2  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1133  extracellular solute-binding protein family 1  27.92 
 
 		 451 aa  87.8  4e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0614  extracellular solute-binding protein family 1  25.97 
 
 		 435 aa  86.3  9e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3651  hypothetical protein  27.37 
 
 		 437 aa  86.3  9e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.943877  normal  0.0762923 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3304  extracellular solute-binding protein family 1  28.95 
 
 		 431 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0803  extracellular solute-binding protein  24.15 
 
 		 435 aa  82.8  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1874  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  30.07 
 
 		 427 aa  81.3  0.00000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0756635  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1619  putative sugar-binding lipoprotein  26.88 
 
 		 434 aa  80.9  0.00000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.195944  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1113  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  24.87 
 
 		 419 aa  80.5  0.00000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0203061  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0059  extracellular solute-binding protein  26.77 
 
 		 439 aa  80.9  0.00000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  26.09 
 
 		 422 aa  79.7  0.00000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3941  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  25.83 
 
 		 436 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.487085  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0626  extracellular solute-binding protein  28.08 
 
 		 408 aa  79.3  0.0000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000892518  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2345  extracellular solute-binding protein family 1  26.33 
 
 		 424 aa  79  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.822896  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2696  extracellular solute-binding protein  25.58 
 
 		 420 aa  78.6  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.240659  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0238  extracellular solute-binding protein family 1  24.87 
 
 		 423 aa  77.8  0.0000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0208  extracellular solute-binding protein family 1  25.68 
 
 		 454 aa  77  0.0000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1588  extracellular solute-binding protein  24.86 
 
 		 452 aa  75.5  0.000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27700  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.06 
 
 		 426 aa  75.1  0.000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5027  extracellular solute-binding protein family 1  25.28 
 
 		 434 aa  74.3  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0894368  normal  0.625584 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5608  extracellular solute-binding protein family 1  23.58 
 
 		 427 aa  73.2  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.959607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1301  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  24.49 
 
 		 441 aa  73.2  0.00000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4017  extracellular solute-binding protein  26.34 
 
 		 435 aa  72.8  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3251  extracellular solute-binding protein family 1  25.28 
 
 		 428 aa  72.4  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.292164  normal  0.0559218 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1941  extracellular solute-binding protein family 1  23.16 
 
 		 487 aa  71.6  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.948884  normal  0.342758 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2391  extracellular solute-binding protein family 1  24.49 
 
 		 422 aa  71.2  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.436445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2659  extracellular solute-binding protein family 1  28.57 
 
 		 495 aa  71.6  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3251  extracellular solute-binding protein family 1  24.83 
 
 		 427 aa  71.2  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1184  ABC transporter, substrate-binding protein  25.66 
 
 		 413 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.186568  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2818  carbohydrate ABC transporter periplasmic binding protein  25.66 
 
 		 399 aa  70.1  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6532  extracellular solute-binding protein family 1  23.65 
 
 		 427 aa  70.1  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0178193 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5736  ABC transporter, substrate-binding protein  27.23 
 
 		 410 aa  69.3  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.214535  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13140  extracellular solute-binding protein family 1  23.98 
 
 		 424 aa  68.2  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0434  extracellular solute-binding protein family 1  25.45 
 
 		 444 aa  67.8  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.205913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23430  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.15 
 
 		 435 aa  68.2  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.969599  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2703  extracellular solute-binding protein family 1  25.08 
 
 		 423 aa  67.8  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.830349  normal  0.531916 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2306  extracellular solute-binding protein family 1  22.71 
 
 		 432 aa  67.4  0.0000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.432824  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0891  extracellular solute-binding protein family 1  25.08 
 
 		 438 aa  67  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0493428 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5441  extracellular solute-binding protein family 1  26.04 
 
 		 452 aa  67  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0598  extracellular solute-binding protein family 1  27.16 
 
 		 446 aa  67  0.0000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.764573  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1808  extracellular solute-binding protein family 1  33.08 
 
 		 414 aa  66.6  0.0000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3169  extracellular solute-binding protein family 1  26.71 
 
 		 445 aa  66.6  0.0000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.187022 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01550  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  30.34 
 
 		 438 aa  66.2  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0616  extracellular solute-binding protein family 1  24.21 
 
 		 432 aa  65.9  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  27.7 
 
 		 437 aa  66.2  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1136  extracellular solute-binding protein family 1  23.39 
 
 		 431 aa  65.5  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3600  extracellular solute-binding protein family 1  27.5 
 
 		 425 aa  65.1  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3054  extracellular solute-binding protein family 1  26.49 
 
 		 429 aa  65.5  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0183103 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1529  extracellular solute-binding protein  23.8 
 
 		 439 aa  65.5  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1094  extracellular solute-binding protein  23.54 
 
 		 434 aa  64.3  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.161365  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4984  extracellular solute-binding protein family 1  23.81 
 
 		 428 aa  64.7  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7922  extracellular solute-binding protein family 1  24.66 
 
 		 445 aa  64.3  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1099  extracellular solute-binding protein  23.94 
 
 		 457 aa  64.3  0.000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3350  extracellular solute-binding protein family 1  26.03 
 
 		 461 aa  63.5  0.000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0621  extracellular solute-binding protein  27.44 
 
 		 427 aa  63.5  0.000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.178997  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0069  extracellular solute-binding protein family 1  22.91 
 
 		 448 aa  62.4  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3379  extracellular solute-binding protein  27.64 
 
 		 445 aa  62.8  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1010  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.2 
 
 		 380 aa  62.8  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.283496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2754  extracellular solute-binding protein family 1  24.59 
 
 		 443 aa  62.4  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1105  extracellular solute-binding protein family 1  27.11 
 
 		 442 aa  62  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.314126  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1001  extracellular solute-binding protein family 1  24.71 
 
 		 427 aa  61.2  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.628257  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2572  extracellular solute-binding protein  23.16 
 
 		 414 aa  61.6  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7939  ABC transporter (substrate-binding protein)  24.07 
 
 		 428 aa  61.6  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.50295  normal  0.560439 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3494  extracellular solute-binding protein  25.47 
 
 		 414 aa  61.2  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0194042 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3402  extracellular solute-binding protein  24.07 
 
 		 451 aa  61.6  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000236647  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5201  extracellular solute-binding protein  25.74 
 
 		 420 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6971  extracellular solute-binding protein family 1  24.6 
 
 		 431 aa  60.8  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.487837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1218  extracellular solute-binding protein family 1  28.21 
 
 		 444 aa  60.8  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3052  extracellular solute-binding protein family 1  25.83 
 
 		 427 aa  60.8  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.854825  normal  0.208902 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4577  extracellular solute-binding protein  25.74 
 
 		 419 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00216886 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5658  extracellular solute-binding protein  25.74 
 
 		 420 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0866592  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3914  extracellular solute-binding protein  24.48 
 
 		 457 aa  61.2  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.313486  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4880  extracellular solute-binding protein  25.73 
 
 		 412 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6324  extracellular solute-binding protein  25.1 
 
 		 412 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3285  extracellular solute-binding protein  25.73 
 
 		 412 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6024  extracellular solute-binding protein  25.21 
 
 		 412 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3623  extracellular solute-binding protein family 1  24.03 
 
 		 442 aa  60.5  0.00000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00170169  normal  0.0768086 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4586  extracellular solute-binding protein family 1  25.36 
 
 		 417 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.947174 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0090  extracellular solute-binding protein  26.45 
 
 		 441 aa  60.1  0.00000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.214251  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3207  extracellular solute-binding protein  28.29 
 
 		 467 aa  60.1  0.00000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2415  extracellular solute-binding protein family 1  22.74 
 
 		 433 aa  59.7  0.00000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0905  extracellular solute-binding protein  30.11 
 
 		 412 aa  59.7  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2983  extracellular solute-binding protein  28.29 
 
 		 467 aa  59.3  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.105062 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3264  extracellular solute-binding protein  25.53 
 
 		 416 aa  59.7  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.591163 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0381  extracellular solute-binding protein family 1  26.85 
 
 		 421 aa  59.3  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13200  extracellular solute-binding protein family 1  23.68 
 
 		 424 aa  59.3  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>