188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3402 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3402  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 451 aa  931    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000236647  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0437  extracellular solute-binding protein family 1  34.34 
 
 		 424 aa  216  5e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000010114  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2081  extracellular solute-binding protein family 1  32.68 
 
 		 434 aa  194  4e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.159947  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1126  extracellular solute-binding protein  29.42 
 
 		 432 aa  174  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.190587  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3326  extracellular solute-binding protein  32.11 
 
 		 453 aa  170  4e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00000398294  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1199  extracellular solute-binding protein family 1  29.14 
 
 		 432 aa  169  7e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000829014 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3119  extracellular solute-binding protein family 1  32.35 
 
 		 428 aa  166  8e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3128  extracellular solute-binding protein family 1  30.25 
 
 		 450 aa  160  4e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0477771 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2537  extracellular solute-binding protein family 1  26.52 
 
 		 450 aa  154  4e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.272028  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4006  extracellular solute-binding protein family 1  32.02 
 
 		 428 aa  152  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05230  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.63 
 
 		 450 aa  152  1e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.808581  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4335  extracellular solute-binding protein family 1  31.76 
 
 		 428 aa  150  6e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000444207 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1049  extracellular solute-binding protein family 1  29.7 
 
 		 437 aa  147  3e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.340866 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2036  extracellular solute-binding protein family 1  27.63 
 
 		 439 aa  145  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.182591  normal  0.899466 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3578  extracellular solute-binding protein  30.89 
 
 		 428 aa  145  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.608798  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3131  extracellular solute-binding protein family 1  26.24 
 
 		 422 aa  144  5e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00803878 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0780  extracellular solute-binding protein  27.54 
 
 		 436 aa  139  1e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3329  extracellular solute-binding protein  26.19 
 
 		 431 aa  139  1e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0332045  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2460  extracellular solute-binding protein family 1  28.12 
 
 		 441 aa  135  1.9999999999999998e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.372805  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0895  extracellular solute-binding protein family 1  28.75 
 
 		 436 aa  135  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.441999 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1702  sugar-binding protein  30.98 
 
 		 442 aa  130  6e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.981171  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3329  extracellular solute-binding protein  28.46 
 
 		 428 aa  128  3e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.955635  normal  0.757839 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0499  extracellular solute-binding protein family 1  26.03 
 
 		 434 aa  120  4.9999999999999996e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000057577 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29730  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.82 
 
 		 434 aa  120  4.9999999999999996e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3369  extracellular solute-binding protein family 1  24.7 
 
 		 430 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4051  extracellular solute-binding protein family 1  27.42 
 
 		 434 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0825  extracellular solute-binding protein family 1  25.71 
 
 		 429 aa  116  1.0000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1688  oligogalacturonide ABC transporter, periplasmic oligogalacturonide-binding protein  26.68 
 
 		 430 aa  115  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0550228  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2648  oligogalacturonide ABC transporter periplasmic oligogalacturonide-binding protein  26.68 
 
 		 430 aa  115  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.316005  normal  0.159215 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1798  extracellular solute-binding protein  26.68 
 
 		 430 aa  115  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.763472  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3324  extracellular solute-binding protein  29.63 
 
 		 427 aa  114  3e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000420771  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0970  extracellular solute-binding protein family 1  23.08 
 
 		 428 aa  114  4.0000000000000004e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153801  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4040  extracellular solute-binding protein family 1  28.64 
 
 		 434 aa  114  5e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3557  extracellular solute-binding protein family 1  24.88 
 
 		 458 aa  113  7.000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2197  extracellular solute-binding protein family 1  27.58 
 
 		 429 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.700843  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0919  extracellular solute-binding protein family 1  24.33 
 
 		 441 aa  112  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5580  ABC transporter/Periplasmic pectin oligomer binding protein  24.64 
 
 		 427 aa  111  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3124  extracellular solute-binding protein family 1  26.63 
 
 		 429 aa  110  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0621948 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4050  extracellular solute-binding protein family 1  27.42 
 
 		 433 aa  110  7.000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1904  extracellular solute-binding protein family 1  26.15 
 
 		 429 aa  110  8.000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.172949  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3899  extracellular solute-binding protein family 1  24.07 
 
 		 435 aa  109  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03450  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.97 
 
 		 416 aa  109  1e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.355174 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2376  extracellular solute-binding protein family 1  26.39 
 
 		 438 aa  108  1e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1966  extracellular solute-binding protein family 1  24.35 
 
 		 430 aa  107  3e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.810983  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3292  extracellular solute-binding protein  27.68 
 
 		 428 aa  107  4e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.309737 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0777  extracellular solute-binding protein  26.12 
 
 		 428 aa  107  4e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0589  extracellular solute-binding protein family 1  26.18 
 
 		 452 aa  107  6e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.289831  normal  0.0417818 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4015  extracellular solute-binding protein family 1  25.06 
 
 		 428 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.946152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3784  extracellular solute-binding protein family 1  28.12 
 
 		 430 aa  105  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2037  extracellular solute-binding protein family 1  26.49 
 
 		 430 aa  105  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0806  extracellular solute-binding protein family 1  22.74 
 
 		 437 aa  105  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0510551 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0897  extracellular solute-binding protein family 1  24.31 
 
 		 446 aa  102  1e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0316444  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0697  extracellular solute-binding protein family 1  25.7 
 
 		 433 aa  101  2e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4344  extracellular solute-binding protein family 1  23.8 
 
 		 428 aa  102  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0302279  hitchhiker  0.00000351134 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05420  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.63 
 
 		 438 aa  101  3e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0143899  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2647  extracellular solute-binding protein family 1  26.33 
 
 		 446 aa  98.6  2e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.890591  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29740  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.36 
 
 		 437 aa  95.1  2e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2102  extracellular solute-binding protein family 1  22.41 
 
 		 439 aa  92.8  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0619  extracellular solute-binding protein  25.41 
 
 		 463 aa  90.9  4e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000037115  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2395  extracellular solute-binding protein family 1  23.74 
 
 		 451 aa  89.7  9e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0381  extracellular solute-binding protein family 1  25.23 
 
 		 421 aa  85.1  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0793  extracellular solute-binding protein family 1  22.99 
 
 		 442 aa  84  0.000000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0145438 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1534  extracellular solute-binding protein family 1  24.05 
 
 		 436 aa  82  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.191711  decreased coverage  0.00957964 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2571  extracellular solute-binding protein  28.72 
 
 		 417 aa  81.3  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  32.56 
 
 		 430 aa  79.7  0.0000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0719  extracellular solute-binding protein family 1  23.2 
 
 		 413 aa  79.3  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0236757  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1899  extracellular solute-binding protein, putative  24.88 
 
 		 416 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.41529  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1634  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  24.88 
 
 		 416 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0529  extracellular solute-binding protein  25.2 
 
 		 464 aa  77.8  0.0000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.361956  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2267  extracellular solute-binding protein family 1  24.03 
 
 		 445 aa  74.7  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00064551 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  30.41 
 
 		 420 aa  73.6  0.000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4688  extracellular solute-binding protein family 1  25.95 
 
 		 418 aa  72.8  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2731  extracellular solute-binding protein family 1  21.24 
 
 		 454 aa  71.6  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0183  extracellular solute-binding protein family 1  27.54 
 
 		 429 aa  71.2  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  23.41 
 
 		 424 aa  71.6  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0374  extracellular solute-binding protein family 1  25.32 
 
 		 458 aa  71.6  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0240532 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  27.71 
 
 		 414 aa  70.5  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4632  extracellular solute-binding protein  24.7 
 
 		 419 aa  69.7  0.00000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.448727  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7906  extracellular solute-binding protein family 1  24.12 
 
 		 420 aa  69.3  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.819994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0291  extracellular solute-binding protein  26.87 
 
 		 449 aa  67.8  0.0000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2164  extracellular solute-binding protein family 1  26.57 
 
 		 435 aa  65.5  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0558  extracellular solute-binding protein family 1  22.29 
 
 		 444 aa  64.3  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1020  extracellular solute-binding protein  24.31 
 
 		 459 aa  64.7  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000124434  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  24.16 
 
 		 427 aa  63.2  0.000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27690  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.21 
 
 		 431 aa  63.5  0.000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.340884 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1655  extracellular solute-binding protein family 1  27.17 
 
 		 425 aa  63.2  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186521  normal  0.186231 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2228  extracellular solute-binding protein family 1  21.98 
 
 		 460 aa  62  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.754729 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2552  extracellular solute-binding protein  23.88 
 
 		 443 aa  62  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000382941 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1371  extracellular solute-binding protein family 1  24.25 
 
 		 438 aa  61.6  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0913  extracellular solute-binding protein family 1  26.45 
 
 		 421 aa  61.6  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0200  extracellular solute-binding protein family 1  26.08 
 
 		 441 aa  61.2  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0998  extracellular solute-binding protein family 1  24.07 
 
 		 451 aa  61.6  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1025  extracellular solute-binding protein family 1  28.7 
 
 		 444 aa  61.2  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000399953  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  26.47 
 
 		 437 aa  60.1  0.00000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  21.79 
 
 		 422 aa  60.1  0.00000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  29.8 
 
 		 407 aa  59.3  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0399  extracellular solute-binding protein family 1  26.51 
 
 		 408 aa  58.9  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000195685  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4621  extracellular solute-binding protein family 1  27.74 
 
 		 413 aa  58.5  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3149  extracellular solute-binding protein  23.83 
 
 		 427 aa  57.8  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29010  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.4 
 
 		 434 aa  57.4  0.0000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>