More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6971 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_6971  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 
431 aa  881    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.487837  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2415  extracellular solute-binding protein family 1  64.38 
 
 
433 aa  542  1e-153  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1243  extracellular solute-binding protein  58.03 
 
 
444 aa  517  1.0000000000000001e-145  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0184  extracellular solute-binding protein family 1  58.06 
 
 
450 aa  478  1e-134  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2783  extracellular solute-binding protein family 1  57.25 
 
 
431 aa  476  1e-133  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185157  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01480  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  49.48 
 
 
435 aa  402  1e-111  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2983  extracellular solute-binding protein family 1  46.31 
 
 
425 aa  387  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4612  extracellular solute-binding protein family 1  36.55 
 
 
437 aa  271  2e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1291  extracellular solute-binding protein family 1  30.05 
 
 
470 aa  180  4.999999999999999e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5441  extracellular solute-binding protein family 1  27.76 
 
 
452 aa  157  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1306  extracellular solute-binding protein family 1  26.75 
 
 
445 aa  144  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1218  extracellular solute-binding protein family 1  26.24 
 
 
444 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00840  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.18 
 
 
451 aa  130  4.0000000000000003e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0072  sugar ABC transporter periplasmic protein  54.35 
 
 
99 aa  106  7e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2590  extracellular solute-binding protein family 1  24.38 
 
 
464 aa  100  4e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0200  extracellular solute-binding protein family 1  26.39 
 
 
441 aa  98.6  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1490  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  28.12 
 
 
442 aa  95.9  1e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.095095  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2719  extracellular solute-binding protein family 1  24.18 
 
 
434 aa  95.9  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.233137 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1126  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 
433 aa  94  5e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.162135  hitchhiker  0.000581091 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0403  extracellular solute-binding protein family 1  29.59 
 
 
426 aa  89  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.512139  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5736  ABC transporter, substrate-binding protein  26.92 
 
 
410 aa  87.4  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.214535  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11540  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.17 
 
 
428 aa  87.4  4e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0159385 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4454  extracellular solute-binding protein family 1  25.55 
 
 
466 aa  87  5e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5487  extracellular solute-binding protein  29.28 
 
 
419 aa  86.7  7e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000866815 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4932  extracellular solute-binding protein  29.47 
 
 
419 aa  86.3  9e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0556288 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1492  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  23.65 
 
 
441 aa  86.3  0.000000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5201  extracellular solute-binding protein  29.15 
 
 
420 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5658  extracellular solute-binding protein  29.15 
 
 
420 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0866592  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2072  extracellular solute-binding protein family 1  25.47 
 
 
431 aa  84.3  0.000000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0000000238529  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4577  extracellular solute-binding protein  29.15 
 
 
419 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00216886 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2391  extracellular solute-binding protein family 1  23.85 
 
 
422 aa  83.2  0.000000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.436445  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2008  ABC transporter extracellular solute-binding protein  27.17 
 
 
408 aa  82.4  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.247518  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1094  extracellular solute-binding protein  25.21 
 
 
434 aa  80.9  0.00000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.161365  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3304  extracellular solute-binding protein family 1  25.13 
 
 
431 aa  80.5  0.00000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3196  extracellular solute-binding protein  28.84 
 
 
419 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.461238  normal  0.154514 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4586  extracellular solute-binding protein family 1  26.57 
 
 
417 aa  79.7  0.00000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.947174 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9091  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  26.69 
 
 
422 aa  79.3  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.306335  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1360  extracellular solute-binding protein  25.26 
 
 
478 aa  79.3  0.0000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.937812  normal  0.278157 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27700  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.14 
 
 
426 aa  79  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1025  extracellular solute-binding protein family 1  25.06 
 
 
444 aa  78.6  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000399953  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3155  extracellular solute-binding protein family 1  27.42 
 
 
434 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4751  extracellular solute-binding protein family 1  25.23 
 
 
417 aa  77.8  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.137656  normal  0.378465 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3041  extracellular solute-binding protein  25.68 
 
 
429 aa  76.6  0.0000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.887996  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4057  extracellular solute-binding protein  24.67 
 
 
410 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0621  extracellular solute-binding protein  25.32 
 
 
427 aa  75.9  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.178997  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20520  extracellular solute-binding protein family 1  22.53 
 
 
417 aa  75.9  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.561553  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3365  extracellular solute-binding protein family 1  26.21 
 
 
455 aa  75.5  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.079846  hitchhiker  0.00220666 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4662  extracellular solute-binding protein family 1  25.76 
 
 
417 aa  75.5  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.917353 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1529  extracellular solute-binding protein  25.16 
 
 
439 aa  75.1  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0208  extracellular solute-binding protein family 1  26.75 
 
 
454 aa  74.3  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4880  extracellular solute-binding protein  23.76 
 
 
412 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3285  extracellular solute-binding protein  23.76 
 
 
412 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4936  extracellular solute-binding protein family 1  24.75 
 
 
463 aa  73.9  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.105521 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3860  extracellular solute-binding protein family 1  24.75 
 
 
463 aa  73.9  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.952749  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1808  extracellular solute-binding protein family 1  26.28 
 
 
414 aa  73.9  0.000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1939  putative sugar ABC transporter binding protein subunit  27.54 
 
 
420 aa  73.6  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0420  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  24.14 
 
 
410 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7208  extracellular solute-binding protein family 1  24.19 
 
 
410 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0803  extracellular solute-binding protein  25.9 
 
 
435 aa  72.8  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2016  extracellular solute-binding protein  24.93 
 
 
408 aa  72.4  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22980  putative binding protein component of ABC sugar transporter  27.17 
 
 
420 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.16871 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4547  extracellular solute-binding protein  28.76 
 
 
423 aa  71.6  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.909678  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1515  extracellular solute-binding protein  26.15 
 
 
425 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6972  extracellular solute-binding protein  26.15 
 
 
402 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.780279  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6314  extracellular solute-binding protein  26.15 
 
 
425 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.619662 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0296  hypothetical protein  24.5 
 
 
439 aa  71.6  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2351  extracellular solute-binding protein  27.53 
 
 
421 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.576024  normal  0.167209 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6024  extracellular solute-binding protein  23.33 
 
 
412 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0434  extracellular solute-binding protein family 1  25.14 
 
 
444 aa  70.9  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.205913  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1174  extracellular solute-binding protein  24.62 
 
 
455 aa  70.9  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273661  normal  0.401546 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3251  extracellular solute-binding protein family 1  24.15 
 
 
427 aa  70.9  0.00000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3815  extracellular solute-binding protein  24.44 
 
 
440 aa  70.1  0.00000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.725217  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6324  extracellular solute-binding protein  23 
 
 
412 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4267  extracellular solute-binding protein family 1  28.19 
 
 
400 aa  70.1  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0434  extracellular solute-binding protein  25.48 
 
 
452 aa  69.7  0.00000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.396307 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1999  extracellular solute-binding protein family 1  21.86 
 
 
468 aa  69.7  0.00000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1597  extracellular solute-binding protein family 1  26.82 
 
 
456 aa  69.3  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0477  extracellular solute-binding protein family 1  25.19 
 
 
432 aa  68.9  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.838392  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1184  ABC transporter, substrate-binding protein  23.92 
 
 
413 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.186568  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3941  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  23.37 
 
 
436 aa  68.6  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.487085  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2818  carbohydrate ABC transporter periplasmic binding protein  23.92 
 
 
399 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2345  extracellular solute-binding protein family 1  21.6 
 
 
424 aa  68.6  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.822896  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4425  extracellular solute-binding protein family 1  23.16 
 
 
446 aa  68.6  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.446855  normal  0.265456 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6265  extracellular solute-binding protein family 1  23.92 
 
 
443 aa  68.2  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1113  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  22.22 
 
 
419 aa  67.8  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0203061  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  29.55 
 
 
414 aa  68.2  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2380  extracellular solute-binding protein family 1  26.87 
 
 
415 aa  68.2  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5398  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  24.01 
 
 
403 aa  68.2  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.14652  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1150  extracellular solute-binding protein  25.45 
 
 
417 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0392592  normal  0.752071 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4038  extracellular solute-binding protein family 1  21.97 
 
 
405 aa  67.4  0.0000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4984  extracellular solute-binding protein family 1  23.4 
 
 
428 aa  67  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3534  extracellular solute-binding protein family 1  21.67 
 
 
445 aa  67  0.0000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.582574 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2726  extracellular solute-binding protein  27.09 
 
 
437 aa  67  0.0000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.290956  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0614  extracellular solute-binding protein family 1  25.76 
 
 
435 aa  66.6  0.0000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0998  extracellular solute-binding protein family 1  24.75 
 
 
451 aa  66.6  0.0000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2659  extracellular solute-binding protein family 1  24.88 
 
 
495 aa  65.5  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2049  extracellular solute-binding protein  23.76 
 
 
435 aa  65.1  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5027  extracellular solute-binding protein family 1  27.31 
 
 
434 aa  65.1  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0894368  normal  0.625584 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  26.46 
 
 
415 aa  65.5  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2716  extracellular solute-binding protein family 1  25.33 
 
 
441 aa  65.5  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>