258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_4612 on replicon NC_011881
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011881  Achl_4612  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 437 aa  895    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0184  extracellular solute-binding protein family 1  40.4 
 
 		 450 aa  343  4e-93  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01480  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  41.58 
 
 		 435 aa  332  1e-89  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2415  extracellular solute-binding protein family 1  39.49 
 
 		 433 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1243  extracellular solute-binding protein  35.56 
 
 		 444 aa  301  1e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2783  extracellular solute-binding protein family 1  37.88 
 
 		 431 aa  276  5e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2983  extracellular solute-binding protein family 1  38.82 
 
 		 425 aa  273  4.0000000000000004e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6971  extracellular solute-binding protein family 1  37.47 
 
 		 431 aa  270  2.9999999999999997e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.487837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5441  extracellular solute-binding protein family 1  24.8 
 
 		 452 aa  134  3e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1306  extracellular solute-binding protein family 1  27.53 
 
 		 445 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1291  extracellular solute-binding protein family 1  25.43 
 
 		 470 aa  130  3e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1218  extracellular solute-binding protein family 1  26.49 
 
 		 444 aa  124  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1490  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  25.87 
 
 		 442 aa  119  9.999999999999999e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.095095  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2590  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 464 aa  111  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0072  sugar ABC transporter periplasmic protein  57.3 
 
 		 99 aa  110  7.000000000000001e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3365  extracellular solute-binding protein family 1  26.33 
 
 		 455 aa  107  3e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.079846  hitchhiker  0.00220666 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00840  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.16 
 
 		 451 aa  102  2e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1492  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  23.8 
 
 		 441 aa  98.6  2e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1360  extracellular solute-binding protein  23.87 
 
 		 478 aa  85.5  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.937812  normal  0.278157 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1094  extracellular solute-binding protein  26.38 
 
 		 434 aa  82.8  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.161365  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2404  extracellular solute-binding protein family 1  26.06 
 
 		 424 aa  77.8  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000132449  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3052  extracellular solute-binding protein family 1  27.33 
 
 		 427 aa  77.8  0.0000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.854825  normal  0.208902 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20520  extracellular solute-binding protein family 1  23 
 
 		 417 aa  75.9  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.561553  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1685  extracellular solute-binding protein family 1  29.07 
 
 		 434 aa  76.3  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0238  extracellular solute-binding protein family 1  22.52 
 
 		 423 aa  75.9  0.000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3651  hypothetical protein  26.49 
 
 		 437 aa  75.5  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.943877  normal  0.0762923 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11540  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.93 
 
 		 428 aa  75.5  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0159385 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5487  extracellular solute-binding protein  26.16 
 
 		 419 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000866815 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1110  extracellular solute-binding protein  24.43 
 
 		 411 aa  73.9  0.000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0139598  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5201  extracellular solute-binding protein  25.5 
 
 		 420 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5658  extracellular solute-binding protein  25.5 
 
 		 420 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0866592  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4577  extracellular solute-binding protein  25.5 
 
 		 419 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00216886 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2391  extracellular solute-binding protein family 1  25.86 
 
 		 422 aa  73.2  0.000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.436445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4932  extracellular solute-binding protein  25.5 
 
 		 419 aa  73.2  0.000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0556288 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5137  extracellular solute-binding protein  26.61 
 
 		 433 aa  72.8  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.319423  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3941  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  25.33 
 
 		 436 aa  72  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.487085  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4586  extracellular solute-binding protein family 1  26.71 
 
 		 417 aa  72  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.947174 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2659  extracellular solute-binding protein family 1  30.06 
 
 		 495 aa  71.2  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3251  extracellular solute-binding protein family 1  25.93 
 
 		 427 aa  71.2  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3196  extracellular solute-binding protein  25.17 
 
 		 419 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.461238  normal  0.154514 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0434  extracellular solute-binding protein  25.36 
 
 		 452 aa  69.7  0.00000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.396307 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2049  extracellular solute-binding protein  32.47 
 
 		 435 aa  70.1  0.00000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2170  extracellular solute-binding protein family 1  30.95 
 
 		 428 aa  69.3  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4568  extracellular solute-binding protein family 1  29.59 
 
 		 410 aa  68.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.267408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4880  extracellular solute-binding protein  25.63 
 
 		 412 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3285  extracellular solute-binding protein  25.63 
 
 		 412 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8236  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  25.64 
 
 		 434 aa  68.2  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.953199  normal  0.764848 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5736  ABC transporter, substrate-binding protein  25.75 
 
 		 410 aa  68.2  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.214535  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1126  extracellular solute-binding protein family 1  23.5 
 
 		 433 aa  67.8  0.0000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.162135  hitchhiker  0.000581091 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3534  extracellular solute-binding protein family 1  23.01 
 
 		 445 aa  67.4  0.0000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.582574 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1924  extracellular solute-binding protein  23.14 
 
 		 415 aa  67.4  0.0000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.121968  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1866  extracellular solute-binding protein family 1  31.95 
 
 		 434 aa  67  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4454  extracellular solute-binding protein family 1  22.31 
 
 		 466 aa  67  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6324  extracellular solute-binding protein  25.97 
 
 		 412 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0403  extracellular solute-binding protein family 1  23.44 
 
 		 426 aa  67  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.512139  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6024  extracellular solute-binding protein  26.27 
 
 		 412 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1874  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  23.72 
 
 		 427 aa  66.2  0.000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0756635  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9091  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  31.38 
 
 		 422 aa  65.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.306335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2083  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  25 
 
 		 412 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.206037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1113  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  22.28 
 
 		 419 aa  65.5  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0203061  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0540  ABC transporter, substrate-binding protein  24.09 
 
 		 461 aa  65.1  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2719  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 434 aa  64.7  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.233137 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2716  extracellular solute-binding protein family 1  27.23 
 
 		 441 aa  64.7  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27700  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.36 
 
 		 426 aa  64.3  0.000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0208  extracellular solute-binding protein family 1  24.72 
 
 		 454 aa  64.3  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1485  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  21.73 
 
 		 429 aa  63.5  0.000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6357  extracellular solute-binding protein family 1  27.99 
 
 		 410 aa  63.5  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3304  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 431 aa  63.2  0.000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4632  extracellular solute-binding protein  30.81 
 
 		 419 aa  63.2  0.000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.448727  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0556  ABC transporter, solute-binding protein  23.88 
 
 		 461 aa  62.8  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.526712  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5887  extracellular solute-binding protein family 1  24.87 
 
 		 412 aa  62  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5435  extracellular solute-binding protein  25.17 
 
 		 414 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.207139 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2983  extracellular solute-binding protein  25.21 
 
 		 467 aa  62.4  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.105062 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0621  extracellular solute-binding protein  23.96 
 
 		 427 aa  61.2  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.178997  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4425  extracellular solute-binding protein family 1  24.76 
 
 		 446 aa  61.2  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.446855  normal  0.265456 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2072  extracellular solute-binding protein family 1  24.93 
 
 		 431 aa  60.5  0.00000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0000000238529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1184  ABC transporter, substrate-binding protein  25.53 
 
 		 413 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.186568  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2818  carbohydrate ABC transporter periplasmic binding protein  25.53 
 
 		 399 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2016  extracellular solute-binding protein  23.4 
 
 		 408 aa  60.1  0.00000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5027  extracellular solute-binding protein family 1  27.56 
 
 		 434 aa  58.9  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0894368  normal  0.625584 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4751  extracellular solute-binding protein family 1  25.41 
 
 		 417 aa  59.3  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.137656  normal  0.378465 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4321  extracellular solute-binding protein  26.4 
 
 		 409 aa  59.7  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.739189 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3587  extracellular solute-binding protein family 1  29.76 
 
 		 441 aa  59.7  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.935518  normal  0.988969 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0477  extracellular solute-binding protein family 1  33.33 
 
 		 432 aa  58.9  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.838392  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0434  extracellular solute-binding protein family 1  22.79 
 
 		 444 aa  58.9  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.205913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3124  extracellular solute-binding protein family 1  29.26 
 
 		 429 aa  58.9  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0621948 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1133  extracellular solute-binding protein family 1  23.72 
 
 		 451 aa  58.9  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  25.12 
 
 		 420 aa  58.9  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5349  extracellular solute-binding protein family 1  26.4 
 
 		 406 aa  58.2  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.535832 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2582  extracellular solute-binding protein family 1  22.7 
 
 		 416 aa  57.8  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2327  extracellular solute-binding protein family 1  25.81 
 
 		 424 aa  57.8  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.169538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01550  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.27 
 
 		 438 aa  57.8  0.0000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2731  extracellular solute-binding protein family 1  29.9 
 
 		 454 aa  57.8  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0296  hypothetical protein  24.73 
 
 		 439 aa  57.8  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2351  extracellular solute-binding protein  25.25 
 
 		 421 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.576024  normal  0.167209 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5673  extracellular solute-binding protein family 1  31.65 
 
 		 435 aa  57.4  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0285739  normal  0.0925972 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4936  extracellular solute-binding protein family 1  32 
 
 		 463 aa  57.4  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.105521 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3860  extracellular solute-binding protein family 1  32 
 
 		 463 aa  57.4  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.952749  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2652  extracellular solute-binding protein family 1  24.44 
 
 		 424 aa  57  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.142803  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6765  extracellular solute-binding protein family 1  24.49 
 
 		 419 aa  57.4  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.979933  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>