More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_00840 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_00840  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  100 
 
 		 451 aa  895    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2590  extracellular solute-binding protein family 1  58.08 
 
 		 464 aa  473  1e-132  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1291  extracellular solute-binding protein family 1  35.89 
 
 		 470 aa  295  8e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5441  extracellular solute-binding protein family 1  36.59 
 
 		 452 aa  281  2e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1218  extracellular solute-binding protein family 1  30.51 
 
 		 444 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1306  extracellular solute-binding protein family 1  30.02 
 
 		 445 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1243  extracellular solute-binding protein  28.14 
 
 		 444 aa  166  5.9999999999999996e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4454  extracellular solute-binding protein family 1  27.95 
 
 		 466 aa  153  5.9999999999999996e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0184  extracellular solute-binding protein family 1  26.49 
 
 		 450 aa  145  1e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6971  extracellular solute-binding protein family 1  27.07 
 
 		 431 aa  145  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.487837  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2415  extracellular solute-binding protein family 1  25.88 
 
 		 433 aa  144  3e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1490  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  29.59 
 
 		 442 aa  140  3e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.095095  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01480  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.57 
 
 		 435 aa  140  4.999999999999999e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2783  extracellular solute-binding protein family 1  25.43 
 
 		 431 aa  129  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1492  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  27.64 
 
 		 441 aa  124  4e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2983  extracellular solute-binding protein family 1  25.31 
 
 		 425 aa  122  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4612  extracellular solute-binding protein family 1  24.68 
 
 		 437 aa  118  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3365  extracellular solute-binding protein family 1  27.44 
 
 		 455 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.079846  hitchhiker  0.00220666 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1025  extracellular solute-binding protein family 1  23.71 
 
 		 444 aa  105  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000399953  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1360  extracellular solute-binding protein  24.94 
 
 		 478 aa  99.8  9e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.937812  normal  0.278157 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4017  extracellular solute-binding protein  25.19 
 
 		 435 aa  94.4  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20520  extracellular solute-binding protein family 1  24.3 
 
 		 417 aa  91.7  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.561553  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0621  extracellular solute-binding protein  24.75 
 
 		 427 aa  90.1  7e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.178997  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1126  extracellular solute-binding protein family 1  27.25 
 
 		 433 aa  86.3  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.162135  hitchhiker  0.000581091 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.35 
 
 		 426 aa  84.7  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3941  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  24.84 
 
 		 436 aa  84.3  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.487085  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0238  extracellular solute-binding protein family 1  23.4 
 
 		 423 aa  84  0.000000000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4425  extracellular solute-binding protein family 1  26.08 
 
 		 446 aa  83.6  0.000000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.446855  normal  0.265456 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1619  putative sugar-binding lipoprotein  26.58 
 
 		 434 aa  82  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.195944  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06560  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.26 
 
 		 453 aa  82  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1094  extracellular solute-binding protein  26.84 
 
 		 434 aa  82  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.161365  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0556  ABC transporter, solute-binding protein  25.41 
 
 		 461 aa  82  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.526712  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0540  ABC transporter, substrate-binding protein  25.41 
 
 		 461 aa  81.6  0.00000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0434  extracellular solute-binding protein  22.83 
 
 		 452 aa  82  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.396307 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1248  extracellular solute-binding protein family 1  25.7 
 
 		 414 aa  82  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.494424  normal  0.639356 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0296  hypothetical protein  24.62 
 
 		 439 aa  81.3  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7906  extracellular solute-binding protein family 1  25.49 
 
 		 420 aa  80.5  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.819994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3183  extracellular solute-binding protein family 1  25.34 
 
 		 411 aa  80.1  0.00000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.641192  normal  0.908857 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3483  extracellular solute-binding protein  24.09 
 
 		 417 aa  80.1  0.00000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  26.44 
 
 		 431 aa  80.1  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01550  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.19 
 
 		 438 aa  79.7  0.0000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0944  extracellular solute-binding protein  23.02 
 
 		 422 aa  78.6  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.544942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3651  hypothetical protein  24.52 
 
 		 437 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.943877  normal  0.0762923 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2391  extracellular solute-binding protein family 1  24.47 
 
 		 422 aa  79  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.436445  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0614  extracellular solute-binding protein family 1  19.6 
 
 		 435 aa  77.8  0.0000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3155  extracellular solute-binding protein family 1  22.57 
 
 		 434 aa  77.8  0.0000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3304  extracellular solute-binding protein family 1  22.93 
 
 		 431 aa  77.4  0.0000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5673  extracellular solute-binding protein family 1  26.65 
 
 		 435 aa  77.4  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0285739  normal  0.0925972 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5736  ABC transporter, substrate-binding protein  23.35 
 
 		 410 aa  77  0.0000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.214535  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1874  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  28.49 
 
 		 427 aa  76.3  0.000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0756635  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0996  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 455 aa  75.9  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2696  extracellular solute-binding protein  20.81 
 
 		 420 aa  74.3  0.000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.240659  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2472  extracellular solute-binding protein  23.56 
 
 		 419 aa  74.3  0.000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.250047 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  25.23 
 
 		 414 aa  73.9  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06270  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.97 
 
 		 426 aa  73.9  0.000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3409  extracellular solute-binding protein  22.62 
 
 		 451 aa  73.9  0.000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000553575  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3251  extracellular solute-binding protein family 1  23.15 
 
 		 427 aa  72  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1301  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  25.36 
 
 		 441 aa  72.4  0.00000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4033  extracellular solute-binding protein  23.22 
 
 		 429 aa  72  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2162  extracellular solute-binding protein family 1  26.38 
 
 		 415 aa  70.9  0.00000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.183799  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2572  extracellular solute-binding protein  23.58 
 
 		 414 aa  70.5  0.00000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8236  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  24.18 
 
 		 434 aa  70.5  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.953199  normal  0.764848 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2719  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 434 aa  70.5  0.00000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.233137 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1999  extracellular solute-binding protein family 1  20.17 
 
 		 468 aa  69.3  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1184  ABC transporter, substrate-binding protein  24.55 
 
 		 413 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.186568  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2659  extracellular solute-binding protein family 1  25.84 
 
 		 495 aa  69.3  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2818  carbohydrate ABC transporter periplasmic binding protein  24.55 
 
 		 399 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0803  extracellular solute-binding protein  24.69 
 
 		 433 aa  68.6  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.437157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0747  extracellular solute-binding protein  24.94 
 
 		 433 aa  68.6  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2818  extracellular solute-binding protein  26.12 
 
 		 488 aa  68.2  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.179577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0385  extracellular solute-binding protein family 1  26.67 
 
 		 410 aa  68.2  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0390662 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0626  extracellular solute-binding protein  21.81 
 
 		 408 aa  68.2  0.0000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000892518  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23430  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.57 
 
 		 435 aa  67.8  0.0000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.969599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2706  extracellular solute-binding protein  24.14 
 
 		 422 aa  67  0.0000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.5087  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0297  extracellular solute-binding protein family 1  26.04 
 
 		 453 aa  67  0.0000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0248346 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2582  extracellular solute-binding protein family 1  25.88 
 
 		 416 aa  67.4  0.0000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0168  extracellular solute-binding protein family 1  21.52 
 
 		 412 aa  67  0.0000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1356  extracellular solute-binding protein  24.82 
 
 		 418 aa  67  0.0000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0142784  normal  0.791743 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1133  extracellular solute-binding protein family 1  21.6 
 
 		 451 aa  66.6  0.0000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1371  extracellular solute-binding protein family 1  25.73 
 
 		 438 aa  66.6  0.0000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2574  extracellular solute-binding protein family 1  24.02 
 
 		 449 aa  65.9  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.316894  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2731  extracellular solute-binding protein family 1  23.48 
 
 		 454 aa  65.5  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1150  extracellular solute-binding protein  27.04 
 
 		 441 aa  65.5  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.344094  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0434  extracellular solute-binding protein family 1  23.91 
 
 		 444 aa  65.1  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.205913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1485  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  20.96 
 
 		 429 aa  65.1  0.000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0449  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  23.36 
 
 		 419 aa  65.1  0.000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1090  extracellular solute-binding protein family 1  22.91 
 
 		 436 aa  64.7  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.667729  normal  0.0232634 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3153  extracellular solute-binding protein  23.35 
 
 		 417 aa  64.7  0.000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000182033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5201  extracellular solute-binding protein  26.27 
 
 		 420 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5658  extracellular solute-binding protein  26.27 
 
 		 420 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0866592  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4577  extracellular solute-binding protein  26.27 
 
 		 419 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00216886 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3657  sugar ABC transporter, substrate-binding protein  23.55 
 
 		 423 aa  63.9  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4880  extracellular solute-binding protein  23.79 
 
 		 412 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3285  extracellular solute-binding protein  23.79 
 
 		 412 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2546  extracellular solute-binding protein  25.75 
 
 		 488 aa  64.3  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.39868  normal  0.139719 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1808  extracellular solute-binding protein family 1  21.3 
 
 		 414 aa  63.9  0.000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3587  extracellular solute-binding protein family 1  25.26 
 
 		 441 aa  63.5  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.935518  normal  0.988969 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4932  extracellular solute-binding protein  26.27 
 
 		 419 aa  63.9  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0556288 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5487  extracellular solute-binding protein  25.97 
 
 		 419 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000866815 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1529  extracellular solute-binding protein  22.58 
 
 		 439 aa  63.9  0.000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>