More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1150 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_1150  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 441 aa  892    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.344094  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0227  extracellular solute-binding protein  56.82 
 
 		 424 aa  468  9.999999999999999e-131  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.998322  normal  0.257108 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15560  extracellular solute-binding protein family 1  49.87 
 
 		 418 aa  421  1e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0228  extracellular solute-binding protein  45.23 
 
 		 435 aa  350  3e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.6533  normal  0.282981 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3428  extracellular solute-binding protein  46.68 
 
 		 425 aa  318  1e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.390518  normal  0.012309 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0232  extracellular solute-binding protein  42.89 
 
 		 425 aa  303  3.0000000000000004e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7039  extracellular solute-binding protein  39.77 
 
 		 428 aa  294  2e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4871  extracellular solute-binding protein family 1  39.95 
 
 		 434 aa  278  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.618682  normal  0.377624 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3847  extracellular solute-binding protein family 1  39.31 
 
 		 421 aa  276  6e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00585532  normal  0.205792 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3299  extracellular solute-binding protein  39.85 
 
 		 421 aa  254  2.0000000000000002e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4148  extracellular solute-binding protein  36.76 
 
 		 426 aa  230  4e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0472509  normal  0.106363 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0904  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  32.08 
 
 		 439 aa  191  2e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00221898  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  31.16 
 
 		 431 aa  120  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0913  extracellular solute-binding protein family 1  28.21 
 
 		 421 aa  112  1.0000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  30.64 
 
 		 435 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  27.85 
 
 		 423 aa  110  5e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  28.69 
 
 		 430 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  25.81 
 
 		 429 aa  99  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1511  extracellular solute-binding protein family 1  25.58 
 
 		 424 aa  96.3  9e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2310  extracellular solute-binding protein family 1  25.24 
 
 		 425 aa  95.9  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000523246  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0144  extracellular solute-binding protein  27.61 
 
 		 403 aa  93.6  6e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.442205  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.3 
 
 		 426 aa  92.4  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4289  extracellular solute-binding protein  24.56 
 
 		 466 aa  89.4  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1269  extracellular solute-binding protein family 1  25.69 
 
 		 412 aa  87.8  3e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  24.83 
 
 		 410 aa  85.1  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1099  extracellular solute-binding protein  24.5 
 
 		 457 aa  82.4  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2267  extracellular solute-binding protein family 1  27.42 
 
 		 445 aa  80.1  0.00000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00064551 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3465  extracellular solute-binding protein  26.33 
 
 		 411 aa  80.1  0.00000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.25 
 
 		 407 aa  79.3  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0729  extracellular solute-binding protein family 1  25.83 
 
 		 443 aa  79  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000254304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2504  extracellular solute-binding protein family 1  26.09 
 
 		 442 aa  79.3  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3183  extracellular solute-binding protein family 1  26.09 
 
 		 411 aa  78.2  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.641192  normal  0.908857 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6904  extracellular solute-binding protein family 1  25.64 
 
 		 404 aa  77.4  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000382644  hitchhiker  0.00751503 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3121  extracellular solute-binding protein family 1  26.49 
 
 		 412 aa  77.8  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5398  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  26.72 
 
 		 403 aa  77.4  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.14652  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4241  extracellular solute-binding protein family 1  26.6 
 
 		 422 aa  77  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0203  extracellular solute-binding protein family 1  25.65 
 
 		 441 aa  77  0.0000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.346278  normal  0.123927 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00380  extracellular solute-binding protein family 1  28.72 
 
 		 422 aa  77  0.0000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  24.49 
 
 		 437 aa  76.3  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1229  extracellular solute-binding protein  24.75 
 
 		 461 aa  75.9  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0257979  normal  0.868479 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0944  extracellular solute-binding protein  25.86 
 
 		 422 aa  76.3  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.544942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0090  extracellular solute-binding protein family 1  24.25 
 
 		 489 aa  76.3  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.271567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0514  extracellular solute-binding protein family 1  25.83 
 
 		 426 aa  75.5  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1331  extracellular solute-binding protein family 1  25.49 
 
 		 464 aa  75.9  0.000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  24.88 
 
 		 424 aa  75.9  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1055  extracellular solute-binding protein  26.24 
 
 		 418 aa  75.1  0.000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.404897  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7906  extracellular solute-binding protein family 1  26.47 
 
 		 420 aa  74.7  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.819994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0183  extracellular solute-binding protein family 1  27.79 
 
 		 429 aa  74.3  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4320  extracellular solute-binding protein family 1  25.51 
 
 		 425 aa  73.9  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.811375  hitchhiker  0.00841489 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3895  extracellular solute-binding protein  25.31 
 
 		 433 aa  73.9  0.000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0434  extracellular solute-binding protein  26.74 
 
 		 452 aa  73.6  0.000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.396307 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  26.97 
 
 		 415 aa  73.6  0.000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3842  extracellular solute-binding protein family 1  28.99 
 
 		 429 aa  73.2  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0316121  normal  0.0422385 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0406  extracellular solute-binding protein family 1  24.37 
 
 		 428 aa  72.8  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00219397  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3393  extracellular solute-binding protein family 1  25.41 
 
 		 412 aa  73.2  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.205631 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  24.45 
 
 		 424 aa  72.8  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2611  extracellular solute-binding protein family 1  25.34 
 
 		 453 aa  72.8  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.058641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2315  extracellular solute-binding protein  24.49 
 
 		 455 aa  73.2  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.271919 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6572  extracellular solute-binding protein family 1  24.39 
 
 		 410 aa  72.4  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00103217  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2818  extracellular solute-binding protein  27.04 
 
 		 488 aa  71.6  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.179577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  24.93 
 
 		 420 aa  72  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4267  extracellular solute-binding protein family 1  24 
 
 		 400 aa  71.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6156  extracellular solute-binding protein family 1  23.66 
 
 		 410 aa  70.9  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.889741  hitchhiker  0.000305646 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4883  extracellular solute-binding protein family 1  27.83 
 
 		 436 aa  71.2  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.504344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4557  extracellular solute-binding protein  26.76 
 
 		 412 aa  71.2  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0890  extracellular solute-binding protein  26.17 
 
 		 450 aa  70.9  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.315589  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2622  extracellular solute-binding protein family 1  28.04 
 
 		 437 aa  70.5  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0574924  normal  0.833644 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0298  extracellular solute-binding protein  24.7 
 
 		 486 aa  70.1  0.00000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0803  extracellular solute-binding protein  27.01 
 
 		 433 aa  70.1  0.00000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.437157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3399  extracellular solute-binding protein  27.86 
 
 		 440 aa  69.7  0.00000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0250918  normal  0.750741 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0523  extracellular solute-binding protein  24.32 
 
 		 416 aa  69.3  0.0000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2502  extracellular solute-binding protein family 1  24.44 
 
 		 493 aa  69.3  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0450  extracellular solute-binding protein  27.39 
 
 		 414 aa  69.3  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.308403  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2244  extracellular solute-binding protein family 1  26.28 
 
 		 440 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0958946 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4136  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  24.55 
 
 		 400 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2049  extracellular solute-binding protein family 1  27.23 
 
 		 438 aa  68.6  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.266449  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3422  ABC-type sugar transport systems permease component  24.68 
 
 		 410 aa  68.9  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3226  Transcriptional regulator  24.68 
 
 		 410 aa  68.9  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0385  extracellular solute-binding protein family 1  25.94 
 
 		 410 aa  68.9  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0390662 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2714  extracellular solute-binding protein family 1  28.14 
 
 		 414 aa  68.2  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.36636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4289  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 400 aa  67.8  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.53848  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2546  extracellular solute-binding protein  27.2 
 
 		 488 aa  67.8  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.39868  normal  0.139719 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3712  extracellular solute-binding protein family 1  25.73 
 
 		 421 aa  67.4  0.0000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.411366 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0512  extracellular solute-binding protein  24.81 
 
 		 423 aa  67.4  0.0000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00024476  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2237  extracellular solute-binding protein family 1  25.54 
 
 		 466 aa  67  0.0000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0228  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  28.44 
 
 		 439 aa  67  0.0000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6192  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  23.65 
 
 		 431 aa  67  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0222852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7725  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  24.62 
 
 		 420 aa  66.6  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0126  extracellular solute-binding protein family 1  22.67 
 
 		 477 aa  66.6  0.0000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4083  extracellular solute-binding protein family 1  24.39 
 
 		 417 aa  66.6  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0235  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  28.44 
 
 		 439 aa  65.9  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.61248  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3251  extracellular solute-binding protein family 1  23.28 
 
 		 427 aa  66.2  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1020  extracellular solute-binding protein  23.97 
 
 		 459 aa  66.2  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000124434  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1438  extracellular solute-binding protein  24.39 
 
 		 400 aa  66.2  0.000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000172655  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06270  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.67 
 
 		 426 aa  66.2  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  23.48 
 
 		 427 aa  65.5  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0413  extracellular solute-binding protein  25.25 
 
 		 428 aa  65.5  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1262  extracellular solute-binding protein  23.66 
 
 		 408 aa  65.9  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.953049  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2792  extracellular solute-binding protein family 1  26.68 
 
 		 411 aa  64.7  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.199618 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1170  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 397 aa  64.7  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.441465  normal  0.43389 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>