More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0512 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0512  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 423 aa  870    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00024476  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1679  extracellular solute-binding protein  49.14 
 
 		 426 aa  427  1e-118  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000895921  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4038  extracellular solute-binding protein family 1  25.93 
 
 		 405 aa  119  9.999999999999999e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3075  extracellular solute-binding protein family 1  28.86 
 
 		 423 aa  115  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4148  extracellular solute-binding protein  28.02 
 
 		 426 aa  90.1  7e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0472509  normal  0.106363 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0067  extracellular solute-binding protein family 1  22.88 
 
 		 414 aa  87  6e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.469085  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15560  extracellular solute-binding protein family 1  25.57 
 
 		 418 aa  86.3  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0523  extracellular solute-binding protein  27.44 
 
 		 416 aa  80.5  0.00000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  26.6 
 
 		 411 aa  79.3  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3430  extracellular solute-binding protein family 1  26.4 
 
 		 415 aa  76.3  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5076  extracellular solute-binding protein family 1  24.81 
 
 		 427 aa  76.3  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.340965  normal  0.383073 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  23.72 
 
 		 399 aa  76.3  0.000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  24.92 
 
 		 414 aa  75.5  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0711  extracellular solute-binding protein family 1  24.27 
 
 		 436 aa  74.7  0.000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0514  extracellular solute-binding protein family 1  24.03 
 
 		 426 aa  73.2  0.000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0659  extracellular solute-binding protein family 1  21.57 
 
 		 435 aa  71.6  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1152  extracellular solute-binding protein  23.62 
 
 		 393 aa  71.6  0.00000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0401617  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3675  extracellular solute-binding protein family 1  22.63 
 
 		 435 aa  72  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.616273  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2683  extracellular solute-binding protein family 1  20.95 
 
 		 446 aa  72  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2294  extracellular solute-binding protein family 1  24.13 
 
 		 448 aa  70.9  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6548  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  32.92 
 
 		 490 aa  70.9  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000225542 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1548  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  24.51 
 
 		 438 aa  70.5  0.00000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  unclonable  0.00000392798  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2731  extracellular solute-binding protein family 1  24.63 
 
 		 454 aa  70.5  0.00000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2571  extracellular solute-binding protein  23.57 
 
 		 417 aa  70.5  0.00000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0118  extracellular solute-binding protein  25.51 
 
 		 420 aa  70.1  0.00000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0116  extracellular solute-binding protein  25.51 
 
 		 420 aa  70.1  0.00000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3526  extracellular solute-binding protein family 1  22.14 
 
 		 435 aa  70.1  0.00000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.077506  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0829  extracellular solute-binding protein family 1  23.6 
 
 		 504 aa  69.3  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3394  ABC-type sugar transport systems permease component  27.19 
 
 		 411 aa  69.7  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.498756  normal  0.24931 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0381  extracellular solute-binding protein family 1  22.22 
 
 		 421 aa  68.2  0.0000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1494  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  24.15 
 
 		 438 aa  67.8  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1150  extracellular solute-binding protein  25.57 
 
 		 441 aa  68.2  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.344094  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  22.18 
 
 		 427 aa  67.4  0.0000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  21.62 
 
 		 424 aa  67.4  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3149  extracellular solute-binding protein  24.78 
 
 		 427 aa  67.4  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0238  extracellular solute-binding protein family 1  27.24 
 
 		 423 aa  67  0.0000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4871  extracellular solute-binding protein family 1  25.09 
 
 		 434 aa  67  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.618682  normal  0.377624 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1846  extracellular solute-binding protein family 1  26.91 
 
 		 425 aa  66.6  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.169612  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1702  extracellular solute-binding protein  24.44 
 
 		 422 aa  66.6  0.0000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.57478  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0399  extracellular solute-binding protein family 1  27.06 
 
 		 408 aa  66.6  0.0000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000195685  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0200  extracellular solute-binding protein family 1  25.1 
 
 		 441 aa  66.2  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5356  extracellular solute-binding protein family 1  23.75 
 
 		 428 aa  65.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0798754  normal  0.176605 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  24.82 
 
 		 422 aa  65.5  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0770  extracellular solute-binding protein family 1  23.72 
 
 		 444 aa  65.1  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1524  extracellular solute-binding protein family 1  25.73 
 
 		 439 aa  65.1  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0719  extracellular solute-binding protein family 1  25.14 
 
 		 413 aa  65.1  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0236757  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  25.67 
 
 		 427 aa  65.5  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1885  extracellular solute-binding protein family 1  26.33 
 
 		 419 aa  64.7  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.35457 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1595  extracellular solute-binding protein family 1  26.87 
 
 		 440 aa  63.9  0.000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.780174  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1941  sugar ABC transporter, sugar-binding protein, putative  22.15 
 
 		 434 aa  63.9  0.000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04610  extracellular solute-binding protein family 1  22.3 
 
 		 431 aa  63.5  0.000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1585  extracellular solute-binding protein family 1  27.48 
 
 		 442 aa  62.8  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7906  extracellular solute-binding protein family 1  23.75 
 
 		 420 aa  62.4  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.819994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  22.95 
 
 		 414 aa  62  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3251  extracellular solute-binding protein family 1  24.48 
 
 		 427 aa  62  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  23.75 
 
 		 415 aa  62.4  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4017  extracellular solute-binding protein  25.38 
 
 		 435 aa  62  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2049  extracellular solute-binding protein family 1  28.66 
 
 		 438 aa  61.2  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.266449  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0265  extracellular solute-binding protein family 1  27.15 
 
 		 510 aa  61.6  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0777  extracellular solute-binding protein  23.37 
 
 		 428 aa  61.6  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0192  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  23.67 
 
 		 463 aa  60.8  0.00000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.245721  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3292  extracellular solute-binding protein  25.23 
 
 		 428 aa  60.8  0.00000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.309737 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4688  extracellular solute-binding protein family 1  22.8 
 
 		 418 aa  60.8  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2267  extracellular solute-binding protein family 1  24.14 
 
 		 445 aa  60.8  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00064551 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1820  extracellular solute-binding protein  28.8 
 
 		 411 aa  60.8  0.00000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.148067  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4621  extracellular solute-binding protein family 1  25.19 
 
 		 413 aa  60.5  0.00000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2164  extracellular solute-binding protein family 1  24.05 
 
 		 435 aa  59.7  0.00000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2513  extracellular solute-binding protein family 1  25.65 
 
 		 441 aa  59.7  0.00000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2504  extracellular solute-binding protein family 1  23.85 
 
 		 442 aa  59.7  0.00000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  21.7 
 
 		 430 aa  59.7  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2733  extracellular solute-binding protein family 1  27.23 
 
 		 434 aa  59.3  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0602915  normal  0.13145 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00880  ABC transporter sugar binding protein  21.95 
 
 		 440 aa  59.3  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106592  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6192  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  25.31 
 
 		 431 aa  59.3  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0222852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0687  extracellular solute-binding protein  26.21 
 
 		 407 aa  58.9  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.376534  normal  0.15795 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0904  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  28.67 
 
 		 439 aa  58.9  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00221898  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0255  extracellular solute-binding protein family 1  25.87 
 
 		 439 aa  58.5  0.0000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06270  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  20.97 
 
 		 426 aa  58.5  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  26.88 
 
 		 420 aa  58.2  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2037  extracellular solute-binding protein family 1  22.13 
 
 		 430 aa  57.8  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13140  extracellular solute-binding protein family 1  21.25 
 
 		 424 aa  58.2  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0227  extracellular solute-binding protein  29.48 
 
 		 424 aa  57.8  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.998322  normal  0.257108 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2197  extracellular solute-binding protein family 1  23.38 
 
 		 429 aa  57.8  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.700843  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5755  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  25.62 
 
 		 425 aa  57.8  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.428536  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0354  extracellular solute-binding protein  24.59 
 
 		 419 aa  57.8  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.188589  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0183  extracellular solute-binding protein family 1  27.23 
 
 		 429 aa  57.8  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3106  ABC transporter, substrate binding periplasmic component  25 
 
 		 408 aa  57.8  0.0000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3944  extracellular solute-binding protein  25.74 
 
 		 422 aa  57.4  0.0000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.282645 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20470  extracellular solute-binding protein family 1  22.09 
 
 		 406 aa  57  0.0000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000403753  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  26.22 
 
 		 415 aa  57  0.0000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2114  extracellular solute-binding protein family 1  24.3 
 
 		 428 aa  57  0.0000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.85 
 
 		 407 aa  57  0.0000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6024  extracellular solute-binding protein  23.83 
 
 		 412 aa  57  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0598  extracellular solute-binding protein family 1  26.16 
 
 		 446 aa  57  0.0000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.764573  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1899  extracellular solute-binding protein, putative  22.58 
 
 		 416 aa  56.6  0.0000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.41529  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1634  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  22.58 
 
 		 416 aa  56.6  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1924  extracellular solute-binding protein  29.44 
 
 		 415 aa  56.6  0.0000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.121968  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0508  extracellular solute-binding protein family 1  21.91 
 
 		 421 aa  56.6  0.0000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000506303  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2417  transcriptional regulator, ABC transporter  22.58 
 
 		 421 aa  56.6  0.0000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0335393 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3957  extracellular solute-binding protein family 1  24.84 
 
 		 432 aa  56.2  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0291  extracellular solute-binding protein  27.81 
 
 		 449 aa  56.6  0.0000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>