More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_2049 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_2049  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 
438 aa  902    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.266449  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0340  extracellular solute-binding protein  31.66 
 
 
419 aa  207  4e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0322  extracellular solute-binding protein  31.91 
 
 
419 aa  205  2e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0075  extracellular solute-binding protein family 1  30.57 
 
 
441 aa  197  4.0000000000000005e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0188  extracellular solute-binding protein  30.34 
 
 
420 aa  185  2.0000000000000003e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0270  extracellular solute-binding protein  30.4 
 
 
419 aa  179  1e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.562219  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2418  extracellular solute-binding protein family 1  29.84 
 
 
447 aa  158  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1068  extracellular solute-binding protein  28.43 
 
 
429 aa  156  8e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.501776  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0255  extracellular solute-binding protein family 1  28.54 
 
 
439 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2535  extracellular solute-binding protein family 1  32.09 
 
 
418 aa  140  3e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.105932  normal 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.22 
 
 
407 aa  140  3.9999999999999997e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3386  extracellular solute-binding protein family 1  26.94 
 
 
440 aa  134  3e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1392  extracellular solute-binding protein family 1  26.7 
 
 
445 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0420  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  27.89 
 
 
410 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4057  extracellular solute-binding protein  28.91 
 
 
410 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2057  extracellular solute-binding protein family 1  31.47 
 
 
421 aa  131  3e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.112802  normal  0.296802 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1846  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  29.87 
 
 
442 aa  128  2.0000000000000002e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000328949  hitchhiker  0.000299807 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3270  extracellular solute-binding protein family 1  26.76 
 
 
435 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.543416  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6751  extracellular solute-binding protein family 1  26.7 
 
 
441 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7208  extracellular solute-binding protein family 1  27.13 
 
 
410 aa  126  6e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0770  extracellular solute-binding protein family 1  26.75 
 
 
444 aa  126  8.000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2294  extracellular solute-binding protein family 1  27.73 
 
 
448 aa  123  5e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1638  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.12 
 
 
434 aa  122  9.999999999999999e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000325816  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0224  extracellular solute-binding protein  24.63 
 
 
431 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2845  extracellular solute-binding protein family 1  27.1 
 
 
439 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6664  extracellular solute-binding protein  26.29 
 
 
452 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0689323 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0656  extracellular solute-binding protein family 1  25.28 
 
 
431 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.31335 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0845  extracellular solute-binding protein family 1  25.55 
 
 
435 aa  119  9e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0791  extracellular solute-binding protein family 1  26.96 
 
 
399 aa  119  9.999999999999999e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.418273 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  29.18 
 
 
415 aa  118  1.9999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3226  Transcriptional regulator  27.68 
 
 
410 aa  117  3e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.101031  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2173  extracellular solute-binding protein family 1  27.16 
 
 
445 aa  117  3e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00822083  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3422  ABC-type sugar transport systems permease component  27.68 
 
 
410 aa  117  3e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0631  extracellular solute-binding protein family 1  26.16 
 
 
435 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2195  extracellular solute-binding protein family 1  27.79 
 
 
450 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1508  extracellular solute-binding protein family 1  26.65 
 
 
451 aa  117  5e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.55774  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1881  extracellular solute-binding protein family 1  27.9 
 
 
445 aa  116  6e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000340671  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0721  extracellular solute-binding protein  25.62 
 
 
437 aa  116  6.9999999999999995e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.540981  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  28.32 
 
 
411 aa  116  7.999999999999999e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  28.27 
 
 
411 aa  113  6e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  28.43 
 
 
431 aa  113  7.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1484  extracellular solute-binding protein  27.65 
 
 
444 aa  112  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000980441  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  25 
 
 
423 aa  112  2.0000000000000002e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3276  extracellular solute-binding protein family 1  25.76 
 
 
420 aa  111  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.147153  normal  0.336546 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0475  extracellular solute-binding protein family 1  25.8 
 
 
397 aa  111  3e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0289  extracellular solute-binding protein  26.86 
 
 
437 aa  110  5e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.00000019091  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4001  extracellular solute-binding protein family 1  23.93 
 
 
442 aa  110  6e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.131149  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0955  extracellular solute-binding protein family 1  25.47 
 
 
437 aa  110  6e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.152307 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3527  extracellular solute-binding protein family 1  27.46 
 
 
436 aa  110  6e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0698  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  28.44 
 
 
366 aa  110  7.000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436581  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  27.54 
 
 
430 aa  109  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0061  extracellular solute-binding protein family 1  26.97 
 
 
462 aa  109  1e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3759  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  23.99 
 
 
438 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3826  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  23.99 
 
 
438 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3869  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  23.99 
 
 
438 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3957  extracellular solute-binding protein family 1  26.08 
 
 
432 aa  108  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3732  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  24.39 
 
 
438 aa  108  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03302  glycerol-3-phosphate transporter subunit  24.33 
 
 
438 aa  107  4e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0262  extracellular solute-binding protein family 1  24.33 
 
 
438 aa  107  4e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4767  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  24.33 
 
 
438 aa  107  4e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.552805 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0263  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  24.33 
 
 
438 aa  107  4e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3870  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  24.57 
 
 
438 aa  107  4e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3650  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  24.33 
 
 
438 aa  107  4e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03255  hypothetical protein  24.33 
 
 
438 aa  107  4e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3216  extracellular solute-binding protein  24.62 
 
 
425 aa  106  7e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.949389 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4566  extracellular solute-binding protein  25.29 
 
 
453 aa  106  7e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3931  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  24.09 
 
 
438 aa  106  9e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3928  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  23.75 
 
 
438 aa  106  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  28.66 
 
 
435 aa  105  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  27.21 
 
 
427 aa  104  3e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2244  extracellular solute-binding protein family 1  28.82 
 
 
455 aa  104  3e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.846858 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0045  extracellular solute-binding protein family 1  26.98 
 
 
414 aa  104  3e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.713374  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0125  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  23.64 
 
 
444 aa  104  3e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3748  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  23.75 
 
 
438 aa  103  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1696  extracellular solute-binding protein  24.64 
 
 
436 aa  103  5e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00506774  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2199  hypothetical protein  27.83 
 
 
437 aa  103  7e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2093  glycerol-3-phosphate ABC transporter extracellular solute-binding family 1 protein  26.21 
 
 
435 aa  103  9e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.107678  normal  0.487826 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2227  hypothetical protein  27.83 
 
 
437 aa  102  1e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2485  extracellular solute-binding protein  29.65 
 
 
415 aa  102  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00421769  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6732  extracellular solute-binding protein family 1  26.72 
 
 
425 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.255639  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0256  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  25.18 
 
 
439 aa  102  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3962  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  25.18 
 
 
439 aa  102  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2744  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  24.4 
 
 
441 aa  102  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0476  extracellular solute-binding protein family 1  25.15 
 
 
401 aa  101  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3726  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  24.4 
 
 
441 aa  102  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.268589  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  25.69 
 
 
414 aa  102  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  27.59 
 
 
411 aa  101  2e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4697  extracellular solute-binding protein family 1  27.23 
 
 
442 aa  102  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00367387  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2709  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  23.9 
 
 
441 aa  101  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.73 
 
 
426 aa  101  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3209  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  24.4 
 
 
441 aa  102  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0248662  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1760  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  24.4 
 
 
441 aa  102  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3697  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  24.29 
 
 
441 aa  102  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3755  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  24.29 
 
 
441 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2794  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  24.4 
 
 
441 aa  102  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3856  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  23.92 
 
 
440 aa  102  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.64819 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  27.59 
 
 
411 aa  102  2e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1229  extracellular solute-binding protein  25.33 
 
 
461 aa  100  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0257979  normal  0.868479 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0234  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  24.05 
 
 
439 aa  100  4e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.500336 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12848  sn-glycerol-3-phosphate-binding lipoprotein ugpB  25 
 
 
436 aa  100  5e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000142723  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>