More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2466 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 
415 aa  845    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0045  extracellular solute-binding protein family 1  71.74 
 
 
414 aa  627  1e-178  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.713374  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2485  extracellular solute-binding protein  47.1 
 
 
415 aa  338  9.999999999999999e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00421769  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2588  extracellular solute-binding protein  42.04 
 
 
419 aa  321  9.999999999999999e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000485668  normal 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.97 
 
 
407 aa  147  3e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0747  extracellular solute-binding protein  28.97 
 
 
433 aa  140  3e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  28.4 
 
 
414 aa  139  6e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  29.57 
 
 
430 aa  139  7e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0803  extracellular solute-binding protein  29.87 
 
 
433 aa  139  1e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.437157  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  31.65 
 
 
426 aa  139  1e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6156  extracellular solute-binding protein family 1  28 
 
 
410 aa  137  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.889741  hitchhiker  0.000305646 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6572  extracellular solute-binding protein family 1  28 
 
 
410 aa  136  7.000000000000001e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00103217  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2614  extracellular solute-binding protein family 1  26.6 
 
 
461 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000017055  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4083  extracellular solute-binding protein family 1  29.43 
 
 
417 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  35.26 
 
 
420 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  28.41 
 
 
423 aa  130  3e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  29.53 
 
 
424 aa  130  5.0000000000000004e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  29.07 
 
 
431 aa  129  9.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  29.4 
 
 
427 aa  129  1.0000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0420  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  28.36 
 
 
410 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  27.73 
 
 
415 aa  124  3e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  28.03 
 
 
435 aa  124  4e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  27.87 
 
 
410 aa  124  4e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4644  extracellular solute-binding protein  29.17 
 
 
409 aa  122  8e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0265502  normal  0.0904039 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  30.93 
 
 
422 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1484  extracellular solute-binding protein  24.94 
 
 
444 aa  120  3e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000980441  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5398  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  26.76 
 
 
403 aa  120  3.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.14652  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3226  Transcriptional regulator  25.89 
 
 
410 aa  119  9e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.101031  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3422  ABC-type sugar transport systems permease component  25.89 
 
 
410 aa  119  9e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0514  extracellular solute-binding protein family 1  27.12 
 
 
426 aa  119  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  29.04 
 
 
429 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4057  extracellular solute-binding protein  26.7 
 
 
410 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1090  extracellular solute-binding protein family 1  31.75 
 
 
436 aa  117  3e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.667729  normal  0.0232634 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2683  extracellular solute-binding protein family 1  28.05 
 
 
446 aa  117  3.9999999999999997e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0075  extracellular solute-binding protein family 1  28.65 
 
 
441 aa  117  3.9999999999999997e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1522  extracellular solute-binding protein family 1  30 
 
 
421 aa  115  1.0000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.569671  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2726  extracellular solute-binding protein  28.61 
 
 
437 aa  115  1.0000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.290956  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21150  carbohydrate-binding protein  27.65 
 
 
428 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.396929  normal  0.174783 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4289  extracellular solute-binding protein family 1  28.4 
 
 
400 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.53848  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0523  extracellular solute-binding protein  26.62 
 
 
416 aa  115  2.0000000000000002e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7208  extracellular solute-binding protein family 1  27.65 
 
 
410 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3771  extracellular solute-binding protein  29.4 
 
 
421 aa  114  3e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0348  extracellular solute-binding protein family 1  29.29 
 
 
419 aa  114  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4267  extracellular solute-binding protein family 1  28.24 
 
 
400 aa  113  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4136  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  27.93 
 
 
400 aa  113  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2758  extracellular solute-binding protein family 1  25.52 
 
 
423 aa  112  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.736779  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0116  extracellular solute-binding protein  25.89 
 
 
420 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0118  extracellular solute-binding protein  25.89 
 
 
420 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  28.57 
 
 
411 aa  112  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00380  extracellular solute-binding protein family 1  29.47 
 
 
422 aa  111  3e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1099  extracellular solute-binding protein  29.62 
 
 
457 aa  110  3e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3983  extracellular solute-binding protein family 1  26.39 
 
 
456 aa  111  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  26.1 
 
 
411 aa  109  8.000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2049  extracellular solute-binding protein family 1  29.39 
 
 
438 aa  109  8.000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.266449  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1453  extracellular solute-binding protein  28.53 
 
 
415 aa  108  2e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0104666  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4632  extracellular solute-binding protein  30.32 
 
 
419 aa  108  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.448727  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2574  extracellular solute-binding protein family 1  26.07 
 
 
453 aa  107  3e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6751  extracellular solute-binding protein family 1  28.54 
 
 
441 aa  108  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  30.17 
 
 
428 aa  107  3e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  26.04 
 
 
411 aa  107  4e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0719  extracellular solute-binding protein family 1  26.49 
 
 
413 aa  107  5e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0236757  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2417  transcriptional regulator, ABC transporter  23.68 
 
 
421 aa  106  6e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0335393 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0289  extracellular solute-binding protein  26.41 
 
 
437 aa  106  8e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.00000019091  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5736  ABC transporter, substrate-binding protein  28.83 
 
 
410 aa  105  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.214535  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3944  extracellular solute-binding protein  27.5 
 
 
464 aa  105  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.920276  normal  0.0416082 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0955  extracellular solute-binding protein family 1  28.05 
 
 
437 aa  104  3e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.152307 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1846  extracellular solute-binding protein family 1  28.49 
 
 
425 aa  104  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.169612  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3538  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  26.73 
 
 
406 aa  104  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.385239  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6631  extracellular solute-binding protein family 1  27.84 
 
 
410 aa  104  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.325237 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1055  extracellular solute-binding protein  25.17 
 
 
418 aa  103  4e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.404897  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  27.51 
 
 
424 aa  103  4e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0069  extracellular solute-binding protein family 1  26.91 
 
 
448 aa  103  5e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0698  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  26.04 
 
 
366 aa  103  5e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436581  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2364  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  30.46 
 
 
416 aa  103  6e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128582  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4320  extracellular solute-binding protein family 1  29.75 
 
 
425 aa  102  9e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.811375  hitchhiker  0.00841489 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  27.57 
 
 
411 aa  102  1e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2546  extracellular solute-binding protein  32.21 
 
 
488 aa  102  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.39868  normal  0.139719 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3042  extracellular solute-binding protein  26.15 
 
 
406 aa  102  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0658677  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  27.32 
 
 
411 aa  101  2e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5074  extracellular solute-binding protein family 1  24.75 
 
 
447 aa  102  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0224  extracellular solute-binding protein  25 
 
 
431 aa  102  2e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6664  extracellular solute-binding protein  27.51 
 
 
452 aa  101  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0689323 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5852  extracellular solute-binding protein family 1  27.11 
 
 
419 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4289  extracellular solute-binding protein  25.12 
 
 
466 aa  101  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2834  extracellular solute-binding protein  27.38 
 
 
459 aa  101  3e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.873121  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5687  extracellular solute-binding protein family 1  28.42 
 
 
401 aa  101  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.627079  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2267  extracellular solute-binding protein family 1  27.82 
 
 
445 aa  100  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00064551 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0721  extracellular solute-binding protein  25.61 
 
 
437 aa  101  3e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.540981  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2818  extracellular solute-binding protein  31.46 
 
 
488 aa  100  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.179577  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0753  extracellular solute-binding protein  25.74 
 
 
437 aa  101  3e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2315  extracellular solute-binding protein  26.97 
 
 
455 aa  101  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.271919 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5802  extracellular solute-binding protein family 1  25.26 
 
 
444 aa  100  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0809589 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2611  extracellular solute-binding protein family 1  26.59 
 
 
453 aa  100  6e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.058641  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3465  extracellular solute-binding protein  27.22 
 
 
411 aa  99.8  8e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0690  extracellular solute-binding protein  25.17 
 
 
402 aa  99.8  8e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.678935  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0450  extracellular solute-binding protein  27.32 
 
 
414 aa  99.8  8e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.308403  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6765  extracellular solute-binding protein family 1  26.55 
 
 
419 aa  99.8  9e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.979933  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3957  extracellular solute-binding protein family 1  27.03 
 
 
432 aa  99.4  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6240  ABC transporter substrate binding protein (maltose)  26.91 
 
 
407 aa  99  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0994607  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1941  sugar ABC transporter, sugar-binding protein, putative  25.66 
 
 
434 aa  98.2  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>