More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_3895 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  93.7 
 
 
411 aa  765    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0698  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  94.03 
 
 
366 aa  686    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436581  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
411 aa  831    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4057  extracellular solute-binding protein  60.62 
 
 
410 aa  476  1e-133  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0420  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  58.04 
 
 
410 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7208  extracellular solute-binding protein family 1  59.06 
 
 
410 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  33.93 
 
 
424 aa  233  6e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16660  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  34.05 
 
 
406 aa  199  1.0000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.613471  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  27.25 
 
 
411 aa  176  6e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0944  extracellular solute-binding protein family 1  29.14 
 
 
433 aa  171  3e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.322748 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  31.44 
 
 
424 aa  169  6e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2365  extracellular solute-binding protein family 1  25.98 
 
 
416 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.618021 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02930  carbohydrate-binding protein  32.55 
 
 
426 aa  146  6e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  29.13 
 
 
414 aa  145  9e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  26.97 
 
 
399 aa  145  1e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6631  extracellular solute-binding protein family 1  29.52 
 
 
410 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.325237 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5687  extracellular solute-binding protein family 1  27.94 
 
 
401 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.627079  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2683  extracellular solute-binding protein family 1  26.24 
 
 
446 aa  141  1.9999999999999998e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0514  extracellular solute-binding protein family 1  25.59 
 
 
426 aa  137  4e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0690  extracellular solute-binding protein  26.77 
 
 
402 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.678935  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  27.81 
 
 
427 aa  134  3e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21150  carbohydrate-binding protein  25.26 
 
 
428 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.396929  normal  0.174783 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6240  ABC transporter substrate binding protein (maltose)  26.98 
 
 
407 aa  132  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0994607  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19770  extracellular solute-binding protein family 1  28.53 
 
 
423 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3775  extracellular solute-binding protein family 1  29.23 
 
 
459 aa  130  6e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.137854  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4644  extracellular solute-binding protein  27.75 
 
 
409 aa  129  9.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0265502  normal  0.0904039 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1020  extracellular solute-binding protein  28.35 
 
 
459 aa  124  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000124434  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3055  extracellular solute-binding protein family 1  27.68 
 
 
449 aa  124  3e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  28.12 
 
 
430 aa  122  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.76 
 
 
407 aa  121  1.9999999999999998e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5476  extracellular solute-binding protein family 1  26.04 
 
 
415 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.487316 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3712  extracellular solute-binding protein family 1  29.29 
 
 
421 aa  121  3e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.411366 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3226  Transcriptional regulator  25.35 
 
 
410 aa  120  3.9999999999999996e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.101031  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3422  ABC-type sugar transport systems permease component  25.35 
 
 
410 aa  120  3.9999999999999996e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3538  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  28.54 
 
 
406 aa  120  6e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.385239  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5213  extracellular solute-binding protein family 1  25.76 
 
 
415 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.506772 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4320  extracellular solute-binding protein family 1  23.96 
 
 
425 aa  117  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.811375  hitchhiker  0.00841489 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1680  extracellular solute-binding protein family 1  28.81 
 
 
430 aa  117  3e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.173253  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2417  transcriptional regulator, ABC transporter  25.8 
 
 
421 aa  117  3e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0335393 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3393  extracellular solute-binding protein family 1  27.05 
 
 
412 aa  117  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.205631 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2170  extracellular solute-binding protein family 1  27.58 
 
 
428 aa  116  6e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  26.14 
 
 
435 aa  116  6e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0118  extracellular solute-binding protein  25.67 
 
 
420 aa  116  6e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  27.06 
 
 
431 aa  116  6.9999999999999995e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.72 
 
 
426 aa  116  7.999999999999999e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2267  extracellular solute-binding protein family 1  30.97 
 
 
445 aa  116  7.999999999999999e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00064551 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2504  extracellular solute-binding protein family 1  27.13 
 
 
442 aa  116  8.999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0116  extracellular solute-binding protein  25.91 
 
 
420 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0385  extracellular solute-binding protein family 1  28.22 
 
 
410 aa  114  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0390662 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  26.54 
 
 
415 aa  114  3e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1846  extracellular solute-binding protein family 1  27.51 
 
 
425 aa  114  4.0000000000000004e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.169612  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0829  extracellular solute-binding protein family 1  27.09 
 
 
504 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1550  extracellular solute-binding protein  22.74 
 
 
430 aa  113  5e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3121  extracellular solute-binding protein family 1  26.23 
 
 
412 aa  113  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2310  extracellular solute-binding protein family 1  24.46 
 
 
425 aa  113  6e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000523246  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4174  extracellular solute-binding protein family 1  23.04 
 
 
426 aa  113  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4213  extracellular solute-binding protein family 1  23.04 
 
 
426 aa  113  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.215316  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1607  ABC transporter sugar-binding protein  22.74 
 
 
430 aa  112  8.000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0803  extracellular solute-binding protein  26.6 
 
 
433 aa  112  9e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.437157  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1090  extracellular solute-binding protein family 1  26.68 
 
 
436 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.667729  normal  0.0232634 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6765  extracellular solute-binding protein family 1  28.49 
 
 
419 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.979933  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6572  extracellular solute-binding protein family 1  26.62 
 
 
410 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00103217  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  24.18 
 
 
429 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5852  extracellular solute-binding protein family 1  27.85 
 
 
419 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3465  extracellular solute-binding protein  29.26 
 
 
411 aa  112  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  26.78 
 
 
410 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2703  extracellular solute-binding protein family 1  26.81 
 
 
450 aa  110  3e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263225  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0348  extracellular solute-binding protein family 1  28.61 
 
 
419 aa  110  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  27.7 
 
 
422 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00880  ABC transporter sugar binding protein  23.08 
 
 
440 aa  110  4.0000000000000004e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106592  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0045  extracellular solute-binding protein family 1  26.15 
 
 
414 aa  110  6e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.713374  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0523  extracellular solute-binding protein  26.64 
 
 
416 aa  109  7.000000000000001e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2420  extracellular solute-binding protein  27.67 
 
 
420 aa  110  7.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.228974 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0747  extracellular solute-binding protein  26.81 
 
 
433 aa  109  9.000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2049  extracellular solute-binding protein family 1  26.89 
 
 
438 aa  109  1e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.266449  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5398  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  25.18 
 
 
403 aa  109  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.14652  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  30.22 
 
 
420 aa  108  1e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6156  extracellular solute-binding protein family 1  25.64 
 
 
410 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.889741  hitchhiker  0.000305646 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  26.33 
 
 
415 aa  108  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9091  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  30.61 
 
 
422 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.306335  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0669  extracellular solute-binding protein  26.91 
 
 
439 aa  107  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0854  extracellular solute-binding protein family 1  28.57 
 
 
398 aa  107  3e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.124504  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4159  extracellular solute-binding protein  29.97 
 
 
421 aa  107  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.119299  normal  0.873951 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4557  extracellular solute-binding protein  26.23 
 
 
412 aa  107  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302395  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3983  extracellular solute-binding protein family 1  24.81 
 
 
456 aa  107  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0354  extracellular solute-binding protein  27.87 
 
 
419 aa  107  4e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.188589  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3042  extracellular solute-binding protein  28.85 
 
 
406 aa  107  5e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0658677  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0062  extracellular solute-binding protein  24.5 
 
 
436 aa  106  7e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3910  extracellular solute-binding protein family 1  29.23 
 
 
412 aa  106  8e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.198843 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2553  extracellular solute-binding protein family 1  22.96 
 
 
432 aa  106  8e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.964139  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1229  extracellular solute-binding protein  27.78 
 
 
461 aa  105  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0257979  normal  0.868479 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0719  extracellular solute-binding protein family 1  26.05 
 
 
413 aa  105  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0236757  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  24.88 
 
 
423 aa  105  1e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25450  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.22 
 
 
430 aa  105  1e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0772443  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  26.05 
 
 
428 aa  105  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2297  extracellular solute-binding protein  24.75 
 
 
416 aa  104  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.33558  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6528  extracellular solute-binding protein family 1  28.82 
 
 
415 aa  104  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0147922 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3988  extracellular solute-binding protein family 1  26.54 
 
 
422 aa  104  3e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3622  extracellular solute-binding protein family 1  29.11 
 
 
412 aa  103  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2364  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  25.72 
 
 
416 aa  103  7e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128582  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>