More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0747 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_0803  extracellular solute-binding protein  88.45 
 
 
433 aa  775    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.437157  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0747  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
433 aa  876    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  53.96 
 
 
435 aa  423  1e-117  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  52.32 
 
 
431 aa  412  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  48.1 
 
 
430 aa  392  1e-108  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  43.72 
 
 
426 aa  345  8e-94  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0348  extracellular solute-binding protein family 1  47.31 
 
 
419 aa  339  7e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  28.54 
 
 
429 aa  144  2e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1991  extracellular solute-binding protein  30.03 
 
 
455 aa  140  3e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.603432  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  28.97 
 
 
415 aa  140  3e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.96 
 
 
407 aa  129  8.000000000000001e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  25 
 
 
424 aa  127  3e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0984  extracellular solute-binding protein  28.64 
 
 
392 aa  126  7e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000118485  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0966  extracellular solute-binding protein  30.75 
 
 
392 aa  126  9e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000011003  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1229  extracellular solute-binding protein  28.19 
 
 
461 aa  124  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0257979  normal  0.868479 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00880  ABC transporter sugar binding protein  27.51 
 
 
440 aa  124  2e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106592  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3276  extracellular solute-binding protein family 1  26.83 
 
 
420 aa  120  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.147153  normal  0.336546 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1614  extracellular solute-binding protein  27.27 
 
 
391 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000159886  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  27.63 
 
 
427 aa  119  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0514  extracellular solute-binding protein family 1  26.34 
 
 
426 aa  119  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0669  extracellular solute-binding protein  26.37 
 
 
439 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1552  extracellular solute-binding protein  27.02 
 
 
391 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000398035  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3538  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  28.37 
 
 
406 aa  117  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.385239  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  28.21 
 
 
428 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0045  extracellular solute-binding protein family 1  26.65 
 
 
414 aa  115  2.0000000000000002e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.713374  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20470  extracellular solute-binding protein family 1  26.53 
 
 
406 aa  114  3e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000403753  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0213  twin-arginine translocation pathway signal  28.69 
 
 
446 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2582  extracellular solute-binding protein family 1  29.33 
 
 
416 aa  113  8.000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  24.33 
 
 
399 aa  111  2.0000000000000002e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  28.23 
 
 
420 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0781  extracellular solute-binding protein  31.5 
 
 
395 aa  112  2.0000000000000002e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000729506  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21150  carbohydrate-binding protein  26.76 
 
 
428 aa  111  3e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.396929  normal  0.174783 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4563  extracellular solute-binding protein  28.87 
 
 
439 aa  110  4.0000000000000004e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  26.32 
 
 
411 aa  110  5e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  26.32 
 
 
411 aa  110  5e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2683  extracellular solute-binding protein family 1  26.39 
 
 
446 aa  110  7.000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  26.94 
 
 
437 aa  109  8.000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2663  extracellular solute-binding protein family 1  29.71 
 
 
468 aa  108  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0712  extracellular solute-binding protein family 1  28.32 
 
 
397 aa  108  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.518168  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0062  extracellular solute-binding protein  28.28 
 
 
436 aa  108  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1152  extracellular solute-binding protein  32.81 
 
 
393 aa  108  2e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0401617  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  27.65 
 
 
411 aa  108  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3226  Transcriptional regulator  27.85 
 
 
410 aa  108  3e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.101031  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3422  ABC-type sugar transport systems permease component  27.85 
 
 
410 aa  108  3e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1392  extracellular solute-binding protein family 1  26.68 
 
 
445 aa  107  4e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0385  extracellular solute-binding protein family 1  29.62 
 
 
410 aa  107  4e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0390662 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3685  extracellular solute-binding protein  28.49 
 
 
432 aa  105  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4289  extracellular solute-binding protein  25.75 
 
 
466 aa  105  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0403  extracellular solute-binding protein family 1  30.11 
 
 
426 aa  105  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.512139  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0596  extracellular solute-binding protein  30.34 
 
 
390 aa  105  2e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00439649  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2948  extracellular solute-binding protein  28.21 
 
 
448 aa  103  5e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1607  ABC transporter sugar-binding protein  23.39 
 
 
430 aa  103  6e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19770  extracellular solute-binding protein family 1  25.33 
 
 
423 aa  103  6e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0027  extracellular solute-binding protein  26.58 
 
 
413 aa  103  6e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000908101  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  26.58 
 
 
414 aa  103  6e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0904  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  25.31 
 
 
439 aa  102  1e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00221898  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18880  carbohydrate-binding protein  26.94 
 
 
460 aa  102  1e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.141989  normal  0.173455 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1453  extracellular solute-binding protein  25.69 
 
 
415 aa  102  1e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0104666  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1550  extracellular solute-binding protein  23.15 
 
 
430 aa  102  2e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3183  extracellular solute-binding protein family 1  28.31 
 
 
411 aa  102  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.641192  normal  0.908857 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0298  extracellular solute-binding protein  26.1 
 
 
486 aa  101  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1511  extracellular solute-binding protein family 1  24.83 
 
 
424 aa  102  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0701  extracellular solute-binding protein family 1  26.05 
 
 
432 aa  101  3e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  25.88 
 
 
411 aa  100  4e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0075  extracellular solute-binding protein family 1  28.75 
 
 
441 aa  100  4e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  27.51 
 
 
424 aa  100  5e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  26.04 
 
 
423 aa  100  6e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1494  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  29.3 
 
 
438 aa  100  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1634  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  27.04 
 
 
416 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  28.53 
 
 
410 aa  99.4  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1680  extracellular solute-binding protein family 1  27.92 
 
 
430 aa  98.6  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.173253  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1899  extracellular solute-binding protein, putative  26.76 
 
 
416 aa  98.2  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.41529  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  30.54 
 
 
419 aa  97.8  3e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.033461  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1331  extracellular solute-binding protein family 1  27.57 
 
 
464 aa  98.2  3e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0854  extracellular solute-binding protein family 1  26.18 
 
 
398 aa  97.8  3e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.124504  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5074  extracellular solute-binding protein family 1  26.51 
 
 
447 aa  97.1  6e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3771  extracellular solute-binding protein  26.34 
 
 
421 aa  96.3  9e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1170  extracellular solute-binding protein family 1  28.36 
 
 
397 aa  96.3  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.441465  normal  0.43389 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  25.31 
 
 
415 aa  96.3  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06270  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.56 
 
 
426 aa  95.5  2e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0323  family 1 extracellular solute-binding protein  26.91 
 
 
432 aa  95.1  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16660  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.61 
 
 
406 aa  95.5  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.613471  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3055  extracellular solute-binding protein family 1  26.43 
 
 
449 aa  95.1  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2297  extracellular solute-binding protein  26.61 
 
 
416 aa  94.7  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.33558  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2726  extracellular solute-binding protein  25.47 
 
 
437 aa  94.7  3e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.290956  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1138  extracellular solute-binding protein family 1  30.93 
 
 
423 aa  94.7  3e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.443513  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1020  extracellular solute-binding protein  26.63 
 
 
459 aa  94.4  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000124434  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1118  extracellular solute-binding protein family 1  27.75 
 
 
400 aa  94  5e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0000000704817  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2553  extracellular solute-binding protein family 1  25.81 
 
 
432 aa  94  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.964139  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2364  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  28.8 
 
 
416 aa  93.6  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128582  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0203  extracellular solute-binding protein family 1  25.68 
 
 
441 aa  93.6  7e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.346278  normal  0.123927 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0719  extracellular solute-binding protein family 1  25.54 
 
 
413 aa  93.6  7e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0236757  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1099  extracellular solute-binding protein  25.82 
 
 
457 aa  93.2  8e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1846  extracellular solute-binding protein family 1  26.46 
 
 
425 aa  93.2  9e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.169612  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5738  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  27.47 
 
 
452 aa  92.8  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.599702  normal  0.0824986 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3121  extracellular solute-binding protein family 1  28.23 
 
 
412 aa  92.8  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5802  extracellular solute-binding protein family 1  23.72 
 
 
444 aa  92  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0809589 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4159  extracellular solute-binding protein  26.5 
 
 
421 aa  92  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.119299  normal  0.873951 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1941  sugar ABC transporter, sugar-binding protein, putative  24.15 
 
 
434 aa  91.3  3e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1522  extracellular solute-binding protein family 1  26.61 
 
 
421 aa  91.3  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.569671  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>