More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_2553 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_2553  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 
432 aa  882    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.964139  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3685  extracellular solute-binding protein  68.69 
 
 
432 aa  625  1e-178  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0323  family 1 extracellular solute-binding protein  66.59 
 
 
432 aa  601  1.0000000000000001e-171  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4213  extracellular solute-binding protein family 1  65.95 
 
 
426 aa  575  1.0000000000000001e-163  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.215316  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4174  extracellular solute-binding protein family 1  65.95 
 
 
426 aa  575  1.0000000000000001e-163  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2417  transcriptional regulator, ABC transporter  62.65 
 
 
421 aa  539  9.999999999999999e-153  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0335393 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1604  extracellular solute-binding protein  51.9 
 
 
425 aa  469  1.0000000000000001e-131  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01821  solute-binding family 1 protein  44.79 
 
 
434 aa  381  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0108  twin-arginine translocation pathway signal  44.06 
 
 
435 aa  360  2e-98  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.77402 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0152  putative sugar-binding protein  44.25 
 
 
436 aa  352  7e-96  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0687  extracellular solute-binding protein  33.99 
 
 
407 aa  254  2.0000000000000002e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.376534  normal  0.15795 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0116  extracellular solute-binding protein  32.67 
 
 
420 aa  208  2e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0118  extracellular solute-binding protein  32.67 
 
 
420 aa  208  2e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0284  extracellular solute-binding protein family 1  32.32 
 
 
414 aa  205  1e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0523  extracellular solute-binding protein  35.29 
 
 
416 aa  200  3.9999999999999996e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5002  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  31.36 
 
 
426 aa  189  7e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.287585  normal  0.158884 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1187  extracellular solute-binding protein  29.4 
 
 
426 aa  187  5e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.118326  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0192  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  28.75 
 
 
463 aa  181  2e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.245721  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1080  extracellular solute-binding protein  29.86 
 
 
426 aa  179  9e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00103993 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2114  extracellular solute-binding protein family 1  29.05 
 
 
428 aa  171  2e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3075  sugar ABC transporter periplasmic sugar-binding protein  31.82 
 
 
431 aa  168  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.111769 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2013  extracellular solute-binding protein family 1  28.37 
 
 
423 aa  166  5e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.991542  normal  0.0817819 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2254  extracellular solute-binding protein family 1  27.84 
 
 
432 aa  159  7e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.534892  hitchhiker  0.00235651 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14790  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.81 
 
 
424 aa  158  2e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.718562  normal  0.0502834 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4557  extracellular solute-binding protein  28.87 
 
 
412 aa  142  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302395  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3393  extracellular solute-binding protein family 1  28.61 
 
 
412 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.205631 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3121  extracellular solute-binding protein family 1  28.61 
 
 
412 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  26.7 
 
 
399 aa  129  8.000000000000001e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10950  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.86 
 
 
423 aa  125  2e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.575293  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  26.18 
 
 
411 aa  123  6e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  25.87 
 
 
429 aa  117  3e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  23.23 
 
 
424 aa  116  6.9999999999999995e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19770  extracellular solute-binding protein family 1  26.19 
 
 
423 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  27.15 
 
 
430 aa  113  7.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4057  extracellular solute-binding protein  24.67 
 
 
410 aa  112  9e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2683  extracellular solute-binding protein family 1  23.9 
 
 
446 aa  110  3e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0403  extracellular solute-binding protein family 1  24.94 
 
 
426 aa  111  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.512139  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00880  ABC transporter sugar binding protein  26.73 
 
 
440 aa  109  9.000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106592  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1941  sugar ABC transporter, sugar-binding protein, putative  25 
 
 
434 aa  109  1e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  24.68 
 
 
411 aa  107  5e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  26.51 
 
 
431 aa  107  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2364  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  29.53 
 
 
416 aa  106  8e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128582  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  26.36 
 
 
435 aa  105  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0420  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  24.46 
 
 
410 aa  104  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  24.04 
 
 
411 aa  105  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7208  extracellular solute-binding protein family 1  24.23 
 
 
410 aa  105  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0354  extracellular solute-binding protein  26.25 
 
 
419 aa  104  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.188589  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1550  extracellular solute-binding protein  23.04 
 
 
430 aa  104  3e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  26.9 
 
 
424 aa  104  3e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1607  ABC transporter sugar-binding protein  23.04 
 
 
430 aa  104  3e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3983  extracellular solute-binding protein family 1  26.34 
 
 
456 aa  103  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6765  extracellular solute-binding protein family 1  25.08 
 
 
419 aa  103  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.979933  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5852  extracellular solute-binding protein family 1  25.39 
 
 
419 aa  102  9e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3538  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  27.14 
 
 
406 aa  100  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.385239  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16660  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.81 
 
 
406 aa  100  4e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.613471  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  23.88 
 
 
427 aa  100  5e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9091  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  23.1 
 
 
422 aa  99  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.306335  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2420  extracellular solute-binding protein  25.15 
 
 
420 aa  97.8  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.228974 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0698  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  24.02 
 
 
366 aa  97.8  3e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436581  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  25.2 
 
 
428 aa  97.8  4e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3553  extracellular solute-binding protein  24.92 
 
 
419 aa  97.4  4e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6090  extracellular solute-binding protein family 1  25.71 
 
 
425 aa  95.9  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  24.79 
 
 
415 aa  95.9  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.23 
 
 
426 aa  95.5  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0747  extracellular solute-binding protein  25.28 
 
 
433 aa  95.5  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1494  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  23.97 
 
 
438 aa  94  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0803  extracellular solute-binding protein  25.48 
 
 
433 aa  94  5e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.437157  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3775  extracellular solute-binding protein family 1  25.46 
 
 
459 aa  93.6  6e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.137854  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6192  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  23.77 
 
 
431 aa  93.2  8e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0222852  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  28.36 
 
 
423 aa  92.8  1e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2726  extracellular solute-binding protein  25.19 
 
 
437 aa  92.8  1e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.290956  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2703  extracellular solute-binding protein family 1  22.85 
 
 
450 aa  90.9  4e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263225  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5698  extracellular solute-binding protein family 1  24.48 
 
 
412 aa  89.7  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.145305  normal  0.141272 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  24.79 
 
 
414 aa  89  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3982  extracellular solute-binding protein family 1  22.59 
 
 
435 aa  88.2  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.71759  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3988  extracellular solute-binding protein family 1  24.3 
 
 
422 aa  88.2  3e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1484  extracellular solute-binding protein  21.87 
 
 
444 aa  87.4  4e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000980441  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4083  extracellular solute-binding protein family 1  23.48 
 
 
417 aa  87.4  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2170  extracellular solute-binding protein family 1  25.84 
 
 
428 aa  87  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1371  extracellular solute-binding protein family 1  26.12 
 
 
438 aa  87  5e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02930  carbohydrate-binding protein  21.48 
 
 
426 aa  86.3  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0045  extracellular solute-binding protein family 1  25.6 
 
 
414 aa  85.9  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.713374  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1017  extracellular solute-binding protein  35.76 
 
 
417 aa  86.3  0.000000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0416471  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0514  extracellular solute-binding protein family 1  23.89 
 
 
426 aa  85.5  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2870  extracellular solute-binding protein  24.68 
 
 
447 aa  85.5  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2603  extracellular solute-binding protein family 1  25.15 
 
 
445 aa  85.5  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0144502  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0944  extracellular solute-binding protein family 1  21.79 
 
 
433 aa  85.5  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.322748 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  31.96 
 
 
407 aa  85.5  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2733  extracellular solute-binding protein family 1  25.84 
 
 
434 aa  85.5  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0602915  normal  0.13145 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3567  ABC transporter substrate binding protein (sorbitol)  26.07 
 
 
439 aa  85.5  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4978  extracellular solute-binding protein family 1  24.1 
 
 
437 aa  84.7  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.346425  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  22.73 
 
 
411 aa  84.7  0.000000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  22.73 
 
 
411 aa  84.7  0.000000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3793  extracellular solute-binding protein  25 
 
 
437 aa  84.3  0.000000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.8374  normal  0.742912 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0450  extracellular solute-binding protein  24.08 
 
 
414 aa  84.3  0.000000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.308403  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0659  extracellular solute-binding protein family 1  23.98 
 
 
425 aa  84  0.000000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.579585  normal  0.728331 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2209  extracellular solute-binding protein family 1  23.28 
 
 
487 aa  84  0.000000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6631  extracellular solute-binding protein family 1  24.23 
 
 
410 aa  83.6  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.325237 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  23.48 
 
 
420 aa  83.6  0.000000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04610  extracellular solute-binding protein family 1  21.74 
 
 
431 aa  83.2  0.000000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>