274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1080 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_1187  extracellular solute-binding protein  86.85 
 
 
426 aa  770    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.118326  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1080  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
426 aa  863    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00103993 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2013  extracellular solute-binding protein family 1  65.96 
 
 
423 aa  579  1e-164  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.991542  normal  0.0817819 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5002  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  64.95 
 
 
426 aa  570  1e-161  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.287585  normal  0.158884 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2114  extracellular solute-binding protein family 1  50.73 
 
 
428 aa  425  1e-118  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2254  extracellular solute-binding protein family 1  48.15 
 
 
432 aa  412  1e-114  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.534892  hitchhiker  0.00235651 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14790  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  50.47 
 
 
424 aa  411  1e-113  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.718562  normal  0.0502834 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10950  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  40.85 
 
 
423 aa  298  1e-79  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.575293  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0192  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  32.08 
 
 
463 aa  227  3e-58  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.245721  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2553  extracellular solute-binding protein family 1  30.07 
 
 
432 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.964139  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2417  transcriptional regulator, ABC transporter  30.66 
 
 
421 aa  171  2e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0335393 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3685  extracellular solute-binding protein  26.48 
 
 
432 aa  169  1e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4213  extracellular solute-binding protein family 1  28.11 
 
 
426 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.215316  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4174  extracellular solute-binding protein family 1  28.11 
 
 
426 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0323  family 1 extracellular solute-binding protein  27.63 
 
 
432 aa  155  1e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0687  extracellular solute-binding protein  27.46 
 
 
407 aa  147  3e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.376534  normal  0.15795 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0523  extracellular solute-binding protein  28.62 
 
 
416 aa  139  7.999999999999999e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0118  extracellular solute-binding protein  27.7 
 
 
420 aa  139  1e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0116  extracellular solute-binding protein  27.7 
 
 
420 aa  139  1e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1604  extracellular solute-binding protein  26.44 
 
 
425 aa  136  6.0000000000000005e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01821  solute-binding family 1 protein  25.96 
 
 
434 aa  131  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3075  sugar ABC transporter periplasmic sugar-binding protein  27.71 
 
 
431 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.111769 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0284  extracellular solute-binding protein family 1  28.86 
 
 
414 aa  122  9.999999999999999e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0108  twin-arginine translocation pathway signal  26.25 
 
 
435 aa  121  3e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.77402 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0152  putative sugar-binding protein  27.2 
 
 
436 aa  116  7.999999999999999e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  28.09 
 
 
427 aa  89  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  26.91 
 
 
424 aa  80.1  0.00000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.13 
 
 
426 aa  79.7  0.00000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  25.27 
 
 
429 aa  79  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4159  extracellular solute-binding protein  24.52 
 
 
421 aa  72  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.119299  normal  0.873951 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  28.24 
 
 
435 aa  69.7  0.00000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0213  twin-arginine translocation pathway signal  26.75 
 
 
446 aa  69.7  0.00000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  25.34 
 
 
431 aa  69.7  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0803  extracellular solute-binding protein  27.42 
 
 
433 aa  69.3  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.437157  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21150  carbohydrate-binding protein  26.11 
 
 
428 aa  68.6  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.396929  normal  0.174783 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02930  carbohydrate-binding protein  25.69 
 
 
426 aa  68.2  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1991  extracellular solute-binding protein  26.38 
 
 
455 aa  68.2  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.603432  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  24.44 
 
 
430 aa  67.8  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2308  extracellular solute-binding protein  23.08 
 
 
440 aa  68.2  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000253431  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  24.29 
 
 
415 aa  67.8  0.0000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3622  extracellular solute-binding protein family 1  22.65 
 
 
412 aa  67.4  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0183  extracellular solute-binding protein family 1  23.72 
 
 
429 aa  67  0.0000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0747  extracellular solute-binding protein  26.45 
 
 
433 aa  67  0.0000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0514  extracellular solute-binding protein family 1  24.29 
 
 
426 aa  66.6  0.0000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2683  extracellular solute-binding protein family 1  21.92 
 
 
446 aa  66.6  0.0000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06560  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.46 
 
 
453 aa  66.2  0.0000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1708  extracellular solute-binding protein family 1  23.82 
 
 
458 aa  66.6  0.0000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.190784  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3910  extracellular solute-binding protein family 1  24.35 
 
 
412 aa  66.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.198843 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3775  extracellular solute-binding protein family 1  24.27 
 
 
459 aa  66.2  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.137854  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.83 
 
 
430 aa  65.5  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0399  extracellular solute-binding protein family 1  28.15 
 
 
408 aa  64.7  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000195685  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0870  extracellular solute-binding protein family 1  24.05 
 
 
419 aa  64.3  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.649209  normal  0.121264 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  25.64 
 
 
399 aa  64.3  0.000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9091  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  26.52 
 
 
422 aa  63.9  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.306335  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4993  extracellular solute-binding protein family 1  26.58 
 
 
432 aa  63.9  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0450999  normal  0.012477 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0690  extracellular solute-binding protein  22.08 
 
 
402 aa  63.5  0.000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.678935  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0200  extracellular solute-binding protein family 1  25.82 
 
 
441 aa  63.5  0.000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0298  extracellular solute-binding protein  23.22 
 
 
486 aa  63.2  0.000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1711  extracellular solute-binding protein family 1  24.8 
 
 
454 aa  63.2  0.000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.795485  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3538  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  26.58 
 
 
406 aa  62.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.385239  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3553  hypothetical protein  31.21 
 
 
427 aa  62.8  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06270  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.78 
 
 
426 aa  62.8  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2364  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  24.56 
 
 
416 aa  62.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128582  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4059  extracellular solute-binding protein family 1  26.15 
 
 
440 aa  61.6  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  23.42 
 
 
428 aa  62  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1607  ABC transporter sugar-binding protein  24.2 
 
 
430 aa  61.6  0.00000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1626  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  25 
 
 
418 aa  60.8  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.188232 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3944  extracellular solute-binding protein  27.95 
 
 
464 aa  60.5  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.920276  normal  0.0416082 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0203  extracellular solute-binding protein family 1  27.39 
 
 
441 aa  60.5  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.346278  normal  0.123927 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5213  extracellular solute-binding protein family 1  23.64 
 
 
415 aa  60.1  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.506772 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1550  extracellular solute-binding protein  23.65 
 
 
430 aa  59.7  0.00000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  21.01 
 
 
437 aa  59.3  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2152  extracellular solute-binding protein family 1  28.26 
 
 
415 aa  58.9  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.410183  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  23.77 
 
 
414 aa  58.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0904  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  23.76 
 
 
439 aa  58.5  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00221898  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  23.19 
 
 
423 aa  58.9  0.0000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4557  extracellular solute-binding protein  24.81 
 
 
412 aa  58.5  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302395  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2832  extracellular solute-binding protein family 1  28.34 
 
 
417 aa  57.8  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3422  ABC-type sugar transport systems permease component  24.01 
 
 
410 aa  57.8  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3226  Transcriptional regulator  24.01 
 
 
410 aa  57.8  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.101031  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3842  extracellular solute-binding protein family 1  26.52 
 
 
429 aa  57.4  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0316121  normal  0.0422385 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0224  extracellular solute-binding protein  23.18 
 
 
431 aa  57  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1099  extracellular solute-binding protein  26.95 
 
 
457 aa  56.6  0.0000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  24.41 
 
 
415 aa  56.6  0.0000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  27.66 
 
 
422 aa  56.2  0.0000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1529  extracellular solute-binding protein  23.78 
 
 
439 aa  56.6  0.0000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1283  extracellular solute-binding lipoprotein, putative  26.62 
 
 
436 aa  55.8  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  26.84 
 
 
420 aa  56.2  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  23.22 
 
 
411 aa  56.2  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09490  extracellular solute-binding protein family 1  25.64 
 
 
424 aa  55.1  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.48456e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2726  extracellular solute-binding protein  22.17 
 
 
437 aa  55.1  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.290956  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0062  extracellular solute-binding protein  23.28 
 
 
436 aa  55.5  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  25 
 
 
411 aa  55.1  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2420  extracellular solute-binding protein  24.61 
 
 
420 aa  55.5  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.228974 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2622  extracellular solute-binding protein family 1  22.85 
 
 
437 aa  55.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0574924  normal  0.833644 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  25 
 
 
411 aa  55.1  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0869  extracellular solute-binding protein  24.3 
 
 
444 aa  54.7  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.509231  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25450  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  29.13 
 
 
430 aa  54.7  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0772443  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5476  extracellular solute-binding protein family 1  23.48 
 
 
415 aa  54.7  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.487316 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2057  extracellular solute-binding protein family 1  26.37 
 
 
421 aa  55.1  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.112802  normal  0.296802 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>