More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5002 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5002  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  100 
 
 		 426 aa  874    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.287585  normal  0.158884 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1080  extracellular solute-binding protein  64.95 
 
 		 426 aa  570  1e-161  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00103993 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1187  extracellular solute-binding protein  60.98 
 
 		 426 aa  542  1e-153  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.118326  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2013  extracellular solute-binding protein family 1  58.22 
 
 		 423 aa  504  1e-141  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.991542  normal  0.0817819 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2114  extracellular solute-binding protein family 1  52.29 
 
 		 428 aa  447  1.0000000000000001e-124  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2254  extracellular solute-binding protein family 1  49.54 
 
 		 432 aa  415  9.999999999999999e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.534892  hitchhiker  0.00235651 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14790  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  48.95 
 
 		 424 aa  409  1e-113  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.718562  normal  0.0502834 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10950  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  38.59 
 
 		 423 aa  282  1e-74  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.575293  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0192  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  34.43 
 
 		 463 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.245721  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2553  extracellular solute-binding protein family 1  31.36 
 
 		 432 aa  189  5.999999999999999e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.964139  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0323  family 1 extracellular solute-binding protein  29.56 
 
 		 432 aa  188  2e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2417  transcriptional regulator, ABC transporter  28.57 
 
 		 421 aa  178  1e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0335393 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3685  extracellular solute-binding protein  28.68 
 
 		 432 aa  176  6e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4174  extracellular solute-binding protein family 1  29.1 
 
 		 426 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4213  extracellular solute-binding protein family 1  29.1 
 
 		 426 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.215316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0687  extracellular solute-binding protein  30.38 
 
 		 407 aa  164  4.0000000000000004e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.376534  normal  0.15795 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0523  extracellular solute-binding protein  33.23 
 
 		 416 aa  161  2e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1604  extracellular solute-binding protein  27.66 
 
 		 425 aa  159  1e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0116  extracellular solute-binding protein  28.2 
 
 		 420 aa  153  7e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0118  extracellular solute-binding protein  28.2 
 
 		 420 aa  153  7e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3075  sugar ABC transporter periplasmic sugar-binding protein  30.99 
 
 		 431 aa  152  8e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.111769 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01821  solute-binding family 1 protein  26.68 
 
 		 434 aa  139  7.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0108  twin-arginine translocation pathway signal  26.45 
 
 		 435 aa  136  8e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.77402 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0152  putative sugar-binding protein  27.3 
 
 		 436 aa  129  1.0000000000000001e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0284  extracellular solute-binding protein family 1  29.68 
 
 		 414 aa  129  1.0000000000000001e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  28.29 
 
 		 427 aa  108  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  27.25 
 
 		 424 aa  107  5e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  23.37 
 
 		 429 aa  80.9  0.00000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0942  extracellular solute-binding protein  24.82 
 
 		 418 aa  80.9  0.00000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.254009  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2031  extracellular solute-binding protein family 1  23.82 
 
 		 442 aa  79  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.298737 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1708  extracellular solute-binding protein family 1  24.12 
 
 		 458 aa  77  0.0000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.190784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21150  carbohydrate-binding protein  24.94 
 
 		 428 aa  76.3  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.396929  normal  0.174783 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2683  extracellular solute-binding protein family 1  26.25 
 
 		 446 aa  76.3  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1941  sugar ABC transporter, sugar-binding protein, putative  23.77 
 
 		 434 aa  75.5  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1484  extracellular solute-binding protein  25.55 
 
 		 444 aa  75.1  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000980441  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  25.82 
 
 		 415 aa  75.1  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  25.36 
 
 		 435 aa  74.7  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  24.73 
 
 		 423 aa  73.6  0.000000000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  26.43 
 
 		 422 aa  72.8  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  23.72 
 
 		 410 aa  72.4  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02930  carbohydrate-binding protein  23.93 
 
 		 426 aa  72  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3622  extracellular solute-binding protein family 1  24.83 
 
 		 412 aa  72.4  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3216  extracellular solute-binding protein  25.93 
 
 		 425 aa  71.2  0.00000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.949389 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1696  extracellular solute-binding protein  24.53 
 
 		 436 aa  71.2  0.00000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00506774  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3910  extracellular solute-binding protein family 1  24.17 
 
 		 412 aa  70.5  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.198843 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2524  extracellular solute-binding protein family 1  24.18 
 
 		 483 aa  70.5  0.00000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000000331289  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6572  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 410 aa  70.1  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00103217  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1099  extracellular solute-binding protein  27.23 
 
 		 457 aa  69.7  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  22.61 
 
 		 415 aa  69.7  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3538  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  25.87 
 
 		 406 aa  68.9  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.385239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  24.27 
 
 		 431 aa  68.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0354  extracellular solute-binding protein  22.6 
 
 		 419 aa  68.2  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.188589  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  23.13 
 
 		 437 aa  68.9  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6156  extracellular solute-binding protein family 1  25.43 
 
 		 410 aa  68.2  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.889741  hitchhiker  0.000305646 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4159  extracellular solute-binding protein  23.56 
 
 		 421 aa  67.8  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.119299  normal  0.873951 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0690  extracellular solute-binding protein  22.54 
 
 		 402 aa  67.4  0.0000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.678935  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.9 
 
 		 426 aa  66.6  0.0000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0296  hypothetical protein  23.2 
 
 		 439 aa  65.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2244  extracellular solute-binding protein family 1  22.86 
 
 		 440 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0958946 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5409  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  27.53 
 
 		 457 aa  64.7  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0224  extracellular solute-binding protein  25.06 
 
 		 431 aa  64.7  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1711  extracellular solute-binding protein family 1  24.49 
 
 		 454 aa  64.3  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.795485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6664  extracellular solute-binding protein  23.74 
 
 		 452 aa  64.3  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0689323 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0045  extracellular solute-binding protein family 1  24.63 
 
 		 414 aa  63.9  0.000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.713374  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3422  ABC-type sugar transport systems permease component  24.42 
 
 		 410 aa  63.5  0.000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3553  hypothetical protein  22.28 
 
 		 427 aa  63.5  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0399  extracellular solute-binding protein family 1  25.6 
 
 		 408 aa  63.5  0.000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000195685  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3226  Transcriptional regulator  24.42 
 
 		 410 aa  63.5  0.000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06270  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24 
 
 		 426 aa  63.2  0.000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0795  extracellular solute-binding protein family 1  24.67 
 
 		 460 aa  62.4  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.215252  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.88 
 
 		 407 aa  62.4  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6732  extracellular solute-binding protein family 1  23.64 
 
 		 425 aa  62  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.255639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2716  extracellular solute-binding protein family 1  26.7 
 
 		 441 aa  62.4  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1550  extracellular solute-binding protein  21.62 
 
 		 430 aa  61.6  0.00000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1607  ABC transporter sugar-binding protein  21.62 
 
 		 430 aa  61.2  0.00000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2485  extracellular solute-binding protein  22.67 
 
 		 415 aa  61.2  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00421769  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2297  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 416 aa  61.2  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.33558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0944  extracellular solute-binding protein family 1  21.05 
 
 		 433 aa  60.8  0.00000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.322748 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0213  twin-arginine translocation pathway signal  25 
 
 		 446 aa  60.8  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1152  extracellular solute-binding protein  23.21 
 
 		 393 aa  60.8  0.00000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0401617  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2733  extracellular solute-binding protein family 1  23.14 
 
 		 434 aa  60.8  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0602915  normal  0.13145 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5687  extracellular solute-binding protein family 1  24.4 
 
 		 401 aa  60.5  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.627079  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  24.07 
 
 		 430 aa  60.5  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  19.78 
 
 		 399 aa  60.5  0.00000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0075  extracellular solute-binding protein family 1  22.72 
 
 		 441 aa  60.5  0.00000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1180  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  25.76 
 
 		 421 aa  60.1  0.00000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.409061  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19770  extracellular solute-binding protein family 1  22.52 
 
 		 423 aa  60.1  0.00000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  23.1 
 
 		 414 aa  60.1  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0514  extracellular solute-binding protein family 1  23.4 
 
 		 426 aa  60.1  0.00000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2274  extracellular solute-binding protein family 1  26.76 
 
 		 428 aa  59.7  0.00000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.837023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  21.79 
 
 		 428 aa  59.7  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0358  extracellular solute-binding protein family 1  24.36 
 
 		 441 aa  59.3  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2364  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  24.48 
 
 		 416 aa  59.3  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4557  extracellular solute-binding protein  26.25 
 
 		 412 aa  59.7  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302395  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4059  extracellular solute-binding protein family 1  23.84 
 
 		 440 aa  59.3  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2834  extracellular solute-binding protein  31.19 
 
 		 459 aa  58.9  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.873121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4993  extracellular solute-binding protein family 1  26.92 
 
 		 432 aa  58.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0450999  normal  0.012477 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3775  extracellular solute-binding protein family 1  23.91 
 
 		 459 aa  58.9  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.137854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2237  extracellular solute-binding protein family 1  24.3 
 
 		 466 aa  58.9  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  23.1 
 
 		 411 aa  58.5  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>