More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA1180 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004311  BRA1180  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  100 
 
 		 421 aa  858    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.409061  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1666  extracellular solute-binding protein  95.72 
 
 		 421 aa  786    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1773  extracellular solute-binding protein family 1  77.62 
 
 		 421 aa  642    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0165592 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0174  extracellular solute-binding protein  43.6 
 
 		 426 aa  349  4e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.396862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3151  extracellular solute-binding protein  43.03 
 
 		 426 aa  348  1e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.345086 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0129  extracellular solute-binding protein family 1  42.08 
 
 		 426 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.57996  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5331  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  40.38 
 
 		 431 aa  288  1e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.998389  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3553  hypothetical protein  37.59 
 
 		 427 aa  280  3e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0637  extracellular solute-binding protein  36.38 
 
 		 425 aa  262  8e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7590  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  32.23 
 
 		 447 aa  225  1e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1484  extracellular solute-binding protein  32.07 
 
 		 444 aa  201  1.9999999999999998e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000980441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3944  extracellular solute-binding protein  28.22 
 
 		 464 aa  165  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.920276  normal  0.0416082 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2834  extracellular solute-binding protein  28.25 
 
 		 459 aa  155  1e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.873121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1895  extracellular solute-binding protein  28.12 
 
 		 445 aa  138  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.854658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2252  extracellular solute-binding protein  27.44 
 
 		 469 aa  127  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00844632  hitchhiker  0.0063434 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1696  extracellular solute-binding protein  26.38 
 
 		 436 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00506774  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0721  extracellular solute-binding protein  25.11 
 
 		 437 aa  123  7e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.540981  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0753  extracellular solute-binding protein  26.41 
 
 		 437 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0289  extracellular solute-binding protein  24.26 
 
 		 437 aa  121  3e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.00000019091  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.78 
 
 		 407 aa  117  3e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0656  extracellular solute-binding protein family 1  25.06 
 
 		 431 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.31335 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0224  extracellular solute-binding protein  25.8 
 
 		 431 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0955  extracellular solute-binding protein family 1  30.7 
 
 		 437 aa  113  6e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.152307 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0894  extracellular solute-binding protein family 1  27.83 
 
 		 470 aa  111  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.444762  normal  0.144357 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  26.27 
 
 		 423 aa  110  4.0000000000000004e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6751  extracellular solute-binding protein family 1  27.66 
 
 		 441 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2294  extracellular solute-binding protein family 1  25.62 
 
 		 448 aa  109  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1392  extracellular solute-binding protein family 1  24.81 
 
 		 445 aa  108  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0298  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  25.68 
 
 		 444 aa  104  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0323  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  26.14 
 
 		 444 aa  103  5e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.839712 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0314  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  26.14 
 
 		 444 aa  103  6e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2712  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  25.68 
 
 		 443 aa  103  7e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.290307  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0395  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  25.68 
 
 		 443 aa  103  7e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.954301  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0374  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  25.68 
 
 		 444 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0297  extracellular solute-binding protein family 1  27.54 
 
 		 453 aa  102  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0248346 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3492  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  25.68 
 
 		 444 aa  100  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5306  extracellular solute-binding protein  26.01 
 
 		 431 aa  100  7e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.457023 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3216  extracellular solute-binding protein  23.47 
 
 		 425 aa  99.8  9e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.949389 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0845  extracellular solute-binding protein family 1  26.63 
 
 		 435 aa  99  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2948  extracellular solute-binding protein  29.48 
 
 		 448 aa  97.8  3e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0631  extracellular solute-binding protein family 1  26.89 
 
 		 435 aa  97.1  6e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3732  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  26.11 
 
 		 438 aa  96.7  6e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3386  extracellular solute-binding protein family 1  26.49 
 
 		 440 aa  97.1  6e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03302  glycerol-3-phosphate transporter subunit  26.22 
 
 		 438 aa  96.7  7e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0262  extracellular solute-binding protein family 1  26.22 
 
 		 438 aa  96.7  7e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18880  carbohydrate-binding protein  26.83 
 
 		 460 aa  96.7  7e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.141989  normal  0.173455 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3931  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  26.22 
 
 		 438 aa  96.7  7e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2057  extracellular solute-binding protein family 1  31.31 
 
 		 421 aa  96.7  7e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.112802  normal  0.296802 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3650  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  26.22 
 
 		 438 aa  96.7  7e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0263  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  26.22 
 
 		 438 aa  96.7  7e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4767  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  26.22 
 
 		 438 aa  96.7  7e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.552805 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03255  hypothetical protein  26.22 
 
 		 438 aa  96.7  7e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3306  extracellular solute-binding protein  25.75 
 
 		 431 aa  96.3  8e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3748  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  25.62 
 
 		 438 aa  96.3  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3826  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  25.62 
 
 		 438 aa  95.9  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3869  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  25.62 
 
 		 438 aa  95.9  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3759  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  25.62 
 
 		 438 aa  95.9  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3870  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  26.22 
 
 		 438 aa  95.9  1e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3928  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  25.62 
 
 		 438 aa  95.5  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2659  extracellular solute-binding protein family 1  25.5 
 
 		 431 aa  95.1  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00136924  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2845  extracellular solute-binding protein family 1  24.19 
 
 		 439 aa  94.4  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0075  extracellular solute-binding protein family 1  23.56 
 
 		 441 aa  94.4  4e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2663  extracellular solute-binding protein family 1  27.3 
 
 		 468 aa  94.4  4e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6664  extracellular solute-binding protein  26.96 
 
 		 452 aa  94.4  4e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0689323 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2744  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  26.14 
 
 		 441 aa  93.6  6e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3726  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  26.14 
 
 		 441 aa  93.6  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.268589  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3209  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  26.14 
 
 		 441 aa  93.6  6e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0248662  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1760  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  26.14 
 
 		 441 aa  93.6  6e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2794  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  26.14 
 
 		 441 aa  93.6  6e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3755  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  26.14 
 
 		 441 aa  93.2  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0448  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  24.89 
 
 		 441 aa  92  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3509  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  25.28 
 
 		 441 aa  91.7  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.839022  normal  0.0272066 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2709  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  25.28 
 
 		 441 aa  91.7  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0125  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  25.56 
 
 		 444 aa  90.9  3e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2846  extracellular solute-binding protein family 1  27.27 
 
 		 435 aa  91.3  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.687638 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3021  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  29.39 
 
 		 441 aa  90.5  5e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3856  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  25.79 
 
 		 440 aa  90.1  6e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.64819 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3697  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  29.07 
 
 		 441 aa  90.1  7e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  22.22 
 
 		 399 aa  90.1  7e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0770  extracellular solute-binding protein family 1  23.27 
 
 		 444 aa  88.6  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29870  carbohydrate-binding protein  25.57 
 
 		 448 aa  88.2  2e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0791  extracellular solute-binding protein family 1  27.06 
 
 		 399 aa  87  5e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.418273 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  30.25 
 
 		 411 aa  87  6e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  25.77 
 
 		 415 aa  85.5  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  29.94 
 
 		 411 aa  85.5  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0698  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  30.03 
 
 		 366 aa  84.7  0.000000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436581  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3422  ABC-type sugar transport systems permease component  26.21 
 
 		 410 aa  84  0.000000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3226  Transcriptional regulator  26.21 
 
 		 410 aa  84  0.000000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0234  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  24.6 
 
 		 439 aa  83.6  0.000000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.500336 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0483  extracellular solute-binding protein  23.7 
 
 		 458 aa  83.6  0.000000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  25.13 
 
 		 414 aa  83.6  0.000000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3527  extracellular solute-binding protein family 1  26.02 
 
 		 436 aa  83.2  0.000000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2535  extracellular solute-binding protein family 1  29.63 
 
 		 418 aa  82.8  0.000000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.105932  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4045  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  28.88 
 
 		 439 aa  82.4  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.661181  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0829  extracellular solute-binding protein family 1  23.18 
 
 		 504 aa  82  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1508  extracellular solute-binding protein family 1  23.8 
 
 		 451 aa  81.6  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.55774  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3861  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  25.23 
 
 		 439 aa  81.6  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3270  extracellular solute-binding protein family 1  24.39 
 
 		 435 aa  81.6  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.543416  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3703  extracellular solute-binding protein family 1  27.39 
 
 		 466 aa  81.3  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0104923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6153  extracellular solute-binding protein  24.27 
 
 		 451 aa  81.6  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.916687 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>