200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6153 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0464  extracellular solute-binding protein  74.12 
 
 		 452 aa  654    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.364922  normal  0.192606 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6153  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 451 aa  899    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.916687 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0630  extracellular solute-binding protein  67.62 
 
 		 483 aa  566  1e-160  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.679852 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7590  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  27.96 
 
 		 447 aa  90.1  7e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1484  extracellular solute-binding protein  24.67 
 
 		 444 aa  90.1  7e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000980441  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0475  extracellular solute-binding protein family 1  27.43 
 
 		 397 aa  80.1  0.00000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1180  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  24.27 
 
 		 421 aa  80.1  0.00000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.409061  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3944  extracellular solute-binding protein  28.35 
 
 		 464 aa  79.3  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.920276  normal  0.0416082 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0637  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 425 aa  78.2  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0129  extracellular solute-binding protein family 1  23.61 
 
 		 426 aa  77.4  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.57996  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0174  extracellular solute-binding protein  22.99 
 
 		 426 aa  75.1  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.396862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3151  extracellular solute-binding protein  23.47 
 
 		 426 aa  75.1  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.345086 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1773  extracellular solute-binding protein family 1  22.6 
 
 		 421 aa  75.5  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0165592 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1666  extracellular solute-binding protein  23.79 
 
 		 421 aa  74.3  0.000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5331  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  24.08 
 
 		 431 aa  74.3  0.000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.998389  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5306  extracellular solute-binding protein  25.36 
 
 		 431 aa  67.4  0.0000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.457023 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  24.86 
 
 		 411 aa  67.4  0.0000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0791  extracellular solute-binding protein family 1  24.33 
 
 		 399 aa  66.6  0.0000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.418273 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0690  extracellular solute-binding protein  26.44 
 
 		 402 aa  66.6  0.0000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.678935  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2418  extracellular solute-binding protein family 1  24.08 
 
 		 447 aa  65.1  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  24.79 
 
 		 411 aa  63.9  0.000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23010  extracellular solute-binding protein family 1  25.49 
 
 		 436 aa  63.9  0.000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000978171  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2834  extracellular solute-binding protein  25.32 
 
 		 459 aa  63.5  0.000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.873121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2662  extracellular solute-binding protein  24.21 
 
 		 433 aa  63.5  0.000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.377519  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  26.32 
 
 		 427 aa  63.2  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2252  extracellular solute-binding protein  25.46 
 
 		 469 aa  63.2  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00844632  hitchhiker  0.0063434 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4057  extracellular solute-binding protein  26.53 
 
 		 410 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0698  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  24.29 
 
 		 366 aa  62.8  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436581  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0770  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 444 aa  62  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0476  extracellular solute-binding protein family 1  24.69 
 
 		 401 aa  61.6  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0403  extracellular solute-binding protein family 1  25.59 
 
 		 426 aa  61.2  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.512139  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3697  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  28.63 
 
 		 441 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7208  extracellular solute-binding protein family 1  26.04 
 
 		 410 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0224  extracellular solute-binding protein  25.08 
 
 		 431 aa  60.5  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3021  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  29.96 
 
 		 441 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0284  extracellular solute-binding protein family 1  27.27 
 
 		 410 aa  59.7  0.00000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0514987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0420  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  25.95 
 
 		 410 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  22.83 
 
 		 424 aa  59.7  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3306  extracellular solute-binding protein  23.66 
 
 		 431 aa  59.3  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16660  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.51 
 
 		 406 aa  59.7  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.613471  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2846  extracellular solute-binding protein family 1  24.6 
 
 		 435 aa  58.5  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.687638 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2744  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  28.98 
 
 		 441 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3726  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  28.98 
 
 		 441 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.268589  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3209  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  28.98 
 
 		 441 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0248662  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1760  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  28.98 
 
 		 441 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2794  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  28.98 
 
 		 441 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2294  extracellular solute-binding protein family 1  24.44 
 
 		 448 aa  58.9  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1185  extracellular solute-binding protein family 1  27.09 
 
 		 438 aa  58.9  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.276437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6751  extracellular solute-binding protein family 1  24.43 
 
 		 441 aa  58.2  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3755  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  28.98 
 
 		 441 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2709  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  27.02 
 
 		 441 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1092  extracellular solute-binding protein family 1  26.69 
 
 		 438 aa  57.8  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0503452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3595  extracellular solute-binding protein family 1  28.51 
 
 		 428 aa  57.8  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.931004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0270  extracellular solute-binding protein  25.14 
 
 		 419 aa  57.8  0.0000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.562219  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1895  extracellular solute-binding protein  23.75 
 
 		 445 aa  57.8  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.854658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2055  extracellular solute-binding protein  25.6 
 
 		 436 aa  57.4  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.822621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2712  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  27.02 
 
 		 443 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.290307  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0395  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  27.02 
 
 		 443 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.954301  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3527  extracellular solute-binding protein family 1  22.49 
 
 		 436 aa  57.4  0.0000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6664  extracellular solute-binding protein  24.49 
 
 		 452 aa  57.4  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0689323 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0374  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  27.02 
 
 		 444 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2659  extracellular solute-binding protein family 1  24.68 
 
 		 431 aa  57  0.0000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00136924  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4134  extracellular solute-binding protein family 1  27.24 
 
 		 437 aa  57.4  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1607  ABC transporter sugar-binding protein  26.01 
 
 		 430 aa  57  0.0000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1550  extracellular solute-binding protein  26.01 
 
 		 430 aa  57.4  0.0000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2052  extracellular solute-binding protein  27.87 
 
 		 438 aa  57  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0656  extracellular solute-binding protein family 1  24.45 
 
 		 431 aa  57  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.31335 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3216  extracellular solute-binding protein  24.44 
 
 		 425 aa  56.2  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.949389 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2730  extracellular solute-binding protein family 1  24.48 
 
 		 399 aa  56.2  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1264  glycerol-3-phosphate-binding periplasmic lipoprotein signal peptide  28.05 
 
 		 438 aa  55.5  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.400828  normal  0.517414 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2683  extracellular solute-binding protein family 1  24.62 
 
 		 446 aa  55.8  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  21.85 
 
 		 423 aa  55.5  0.000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3290  ABC glycerol-3-phosphate transporter, periplasmic binding protein, UgpB  26.35 
 
 		 431 aa  55.1  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0894  extracellular solute-binding protein family 1  21.63 
 
 		 470 aa  55.1  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.444762  normal  0.144357 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7906  extracellular solute-binding protein family 1  26.46 
 
 		 420 aa  54.3  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.819994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3650  extracellular solute-binding protein  25.91 
 
 		 436 aa  53.9  0.000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.144474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4022  extracellular solute-binding protein  26.35 
 
 		 431 aa  54.3  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3492  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  28.34 
 
 		 444 aa  53.9  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3553  hypothetical protein  21.71 
 
 		 427 aa  53.9  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0284  extracellular solute-binding protein family 1  27.75 
 
 		 414 aa  53.9  0.000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0448  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  26.61 
 
 		 441 aa  53.5  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.98 
 
 		 407 aa  53.1  0.000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1091  extracellular solute-binding protein  29.45 
 
 		 433 aa  53.1  0.000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3226  Transcriptional regulator  25.48 
 
 		 410 aa  52.8  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0791  extracellular solute-binding protein family 1  27.82 
 
 		 437 aa  53.1  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.721808  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2093  glycerol-3-phosphate ABC transporter extracellular solute-binding family 1 protein  26.8 
 
 		 435 aa  52.8  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.107678  normal  0.487826 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0862  extracellular solute-binding protein  27.35 
 
 		 437 aa  52.8  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.597127 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2762  extracellular solute-binding protein  30.84 
 
 		 431 aa  52.8  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3430  extracellular solute-binding protein family 1  26.21 
 
 		 415 aa  53.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3422  ABC-type sugar transport systems permease component  25.48 
 
 		 410 aa  52.8  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06560  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  30.67 
 
 		 453 aa  52.4  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2791  extracellular solute-binding protein family 1  23.11 
 
 		 402 aa  52  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.448693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0314  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  27.02 
 
 		 444 aa  52.4  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0955  extracellular solute-binding protein family 1  24.53 
 
 		 437 aa  52.4  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.152307 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2365  extracellular solute-binding protein family 1  25.27 
 
 		 416 aa  52  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.618021 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5465  extracellular solute-binding protein  26.86 
 
 		 434 aa  52  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.355429  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2057  extracellular solute-binding protein family 1  30.22 
 
 		 421 aa  52.4  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.112802  normal  0.296802 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5852  extracellular solute-binding protein family 1  23.29 
 
 		 419 aa  51.6  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0323  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  26.61 
 
 		 444 aa  51.6  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.839712 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2014  sn-glycerol-3-phosphate-binding periplasmic protein ugpB precursor  24.18 
 
 		 433 aa  51.6  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.167012  hitchhiker  0.0071297 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>