152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0630 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0630  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 483 aa  959    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.679852 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6153  extracellular solute-binding protein  65.85 
 
 		 451 aa  581  1.0000000000000001e-165  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.916687 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0464  extracellular solute-binding protein  66.67 
 
 		 452 aa  559  1e-158  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.364922  normal  0.192606 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1484  extracellular solute-binding protein  24.18 
 
 		 444 aa  94.4  5e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000980441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2252  extracellular solute-binding protein  26.37 
 
 		 469 aa  87.4  5e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00844632  hitchhiker  0.0063434 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  25.89 
 
 		 411 aa  77.8  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7590  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  26.33 
 
 		 447 aa  75.1  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1895  extracellular solute-binding protein  25.46 
 
 		 445 aa  75.5  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.854658  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  25.07 
 
 		 411 aa  72  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0475  extracellular solute-binding protein family 1  26.92 
 
 		 397 aa  72  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0698  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  24.93 
 
 		 366 aa  71.6  0.00000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436581  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0420  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  26.68 
 
 		 410 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3944  extracellular solute-binding protein  26.93 
 
 		 464 aa  68.6  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.920276  normal  0.0416082 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2683  extracellular solute-binding protein family 1  25.21 
 
 		 446 aa  68.2  0.0000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7208  extracellular solute-binding protein family 1  26.55 
 
 		 410 aa  67  0.0000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5306  extracellular solute-binding protein  25.39 
 
 		 431 aa  65.9  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.457023 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0129  extracellular solute-binding protein family 1  21.25 
 
 		 426 aa  65.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.57996  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21150  carbohydrate-binding protein  27.83 
 
 		 428 aa  63.9  0.000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.396929  normal  0.174783 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0690  extracellular solute-binding protein  26.43 
 
 		 402 aa  63.2  0.00000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.678935  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3306  extracellular solute-binding protein  25.45 
 
 		 431 aa  62  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2834  extracellular solute-binding protein  23.92 
 
 		 459 aa  61.2  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.873121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4057  extracellular solute-binding protein  25.22 
 
 		 410 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3151  extracellular solute-binding protein  22.6 
 
 		 426 aa  60.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.345086 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2791  extracellular solute-binding protein family 1  24.67 
 
 		 402 aa  60.1  0.00000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.448693  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5331  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  23.68 
 
 		 431 aa  60.1  0.00000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.998389  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23010  extracellular solute-binding protein family 1  21.82 
 
 		 436 aa  59.3  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000978171  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2659  extracellular solute-binding protein family 1  24.94 
 
 		 431 aa  58.9  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00136924  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  27.33 
 
 		 427 aa  58.9  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0174  extracellular solute-binding protein  21.39 
 
 		 426 aa  58.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.396862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2418  extracellular solute-binding protein family 1  25.56 
 
 		 447 aa  58.5  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0476  extracellular solute-binding protein family 1  25.1 
 
 		 401 aa  57.4  0.0000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2730  extracellular solute-binding protein family 1  23.88 
 
 		 399 aa  57  0.0000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0224  extracellular solute-binding protein  23.3 
 
 		 431 aa  57  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1607  ABC transporter sugar-binding protein  25.23 
 
 		 430 aa  56.2  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1550  extracellular solute-binding protein  25.23 
 
 		 430 aa  56.2  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6584  ABC transporter sugar binding protein  22.49 
 
 		 437 aa  55.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6765  extracellular solute-binding protein family 1  22.83 
 
 		 419 aa  55.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.979933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5852  extracellular solute-binding protein family 1  22.83 
 
 		 419 aa  55.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0791  extracellular solute-binding protein family 1  25.78 
 
 		 399 aa  54.7  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.418273 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2662  extracellular solute-binding protein  26.27 
 
 		 433 aa  54.3  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.377519  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2846  extracellular solute-binding protein family 1  25.9 
 
 		 435 aa  53.9  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.687638 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0656  extracellular solute-binding protein family 1  23.1 
 
 		 431 aa  53.5  0.000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.31335 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1180  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  21.41 
 
 		 421 aa  52  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.409061  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0284  extracellular solute-binding protein family 1  26.47 
 
 		 410 aa  52.8  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0514987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3697  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  27.46 
 
 		 441 aa  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2552  extracellular solute-binding protein  30.1 
 
 		 443 aa  52.4  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000382941 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3216  extracellular solute-binding protein  22.28 
 
 		 425 aa  51.6  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.949389 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00880  ABC transporter sugar binding protein  24.76 
 
 		 440 aa  51.6  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106592  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0944  extracellular solute-binding protein family 1  22.75 
 
 		 433 aa  51.6  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.322748 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3149  extracellular solute-binding protein  29.32 
 
 		 427 aa  50.8  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0795  extracellular solute-binding protein family 1  23.35 
 
 		 460 aa  50.4  0.00007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.215252  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3350  extracellular solute-binding protein family 1  25.17 
 
 		 461 aa  50.4  0.00007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2744  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  27.46 
 
 		 441 aa  50.1  0.00008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3726  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  27.46 
 
 		 441 aa  50.1  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.268589  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3021  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  27.46 
 
 		 441 aa  50.4  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3209  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  27.46 
 
 		 441 aa  50.1  0.00008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0248662  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1760  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  27.46 
 
 		 441 aa  50.1  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2794  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  27.46 
 
 		 441 aa  50.1  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3409  extracellular solute-binding protein  25.96 
 
 		 451 aa  50.4  0.00008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000553575  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4733  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, glycerol-3-phosphate-binding protein  25.18 
 
 		 458 aa  50.1  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3755  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  27.46 
 
 		 441 aa  50.1  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0637  extracellular solute-binding protein  24 
 
 		 425 aa  50.1  0.00009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0625  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, glycerol-3-phosphate-binding protein  25.45 
 
 		 458 aa  50.1  0.00009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0538  glycerol-3-phosphate ABC transporter glycerol-3-phosphate-binding protein  25.45 
 
 		 458 aa  49.7  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.406699  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0480  glycerol-3-phosphate ABC transporter, glycerol-3-phosphate-binding protein  25.45 
 
 		 458 aa  49.7  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0482  glycerol-3-phosphate ABC transporter, glycerol-3-phosphate-binding protein  25.45 
 
 		 458 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0569  glycerol-3-phosphate ABC transporter glycerol-3-phosphate-binding protein  25.45 
 
 		 458 aa  49.7  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1287  extracellular solute-binding protein  23.24 
 
 		 435 aa  49.7  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2726  extracellular solute-binding protein  30.72 
 
 		 437 aa  49.7  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.290956  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3527  extracellular solute-binding protein family 1  26.13 
 
 		 436 aa  49.7  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.38 
 
 		 407 aa  49.7  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0606  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, glycerol-3-phosphate-binding protein  25.18 
 
 		 458 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0632  glycerol-3-phosphate ABC transporter, glycerol-3-phosphate-binding protein, putative  25.45 
 
 		 458 aa  49.3  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3553  extracellular solute-binding protein  23.49 
 
 		 419 aa  49.3  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0857  extracellular solute-binding protein  26.21 
 
 		 437 aa  48.9  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.221606 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2055  extracellular solute-binding protein  25.35 
 
 		 436 aa  48.9  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.822621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0253  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  32.29 
 
 		 424 aa  49.3  0.0002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3553  hypothetical protein  22.52 
 
 		 427 aa  49.3  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4159  extracellular solute-binding protein  26.89 
 
 		 421 aa  48.9  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.119299  normal  0.873951 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4134  extracellular solute-binding protein family 1  25.2 
 
 		 437 aa  48.5  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  26.95 
 
 		 411 aa  49.3  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3492  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  25.21 
 
 		 444 aa  48.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6240  ABC transporter substrate binding protein (maltose)  25.24 
 
 		 407 aa  48.5  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0994607  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  30.28 
 
 		 415 aa  48.5  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1666  extracellular solute-binding protein  21.04 
 
 		 421 aa  48.1  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0314  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  26.07 
 
 		 444 aa  48.1  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  25.27 
 
 		 424 aa  48.1  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0770  extracellular solute-binding protein family 1  24.92 
 
 		 444 aa  47.8  0.0005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02930  carbohydrate-binding protein  29.32 
 
 		 426 aa  47.4  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1243  extracellular solute-binding protein  21.83 
 
 		 444 aa  47.4  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0374  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  25.64 
 
 		 444 aa  47.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0323  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  25.64 
 
 		 444 aa  47.8  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.839712 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2712  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  25.64 
 
 		 443 aa  47.4  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.290307  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3430  extracellular solute-binding protein family 1  23.9 
 
 		 415 aa  47.4  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0395  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  25.64 
 
 		 443 aa  47.4  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.954301  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1126  extracellular solute-binding protein family 1  24.03 
 
 		 433 aa  47.4  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.162135  hitchhiker  0.000581091 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2574  extracellular solute-binding protein family 1  27.23 
 
 		 453 aa  47.4  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0483  extracellular solute-binding protein  25.9 
 
 		 458 aa  47  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2504  extracellular solute-binding protein family 1  30.43 
 
 		 442 aa  46.6  0.0009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2622  extracellular solute-binding protein family 1  45.1 
 
 		 437 aa  46.6  0.0009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0574924  normal  0.833644 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>