More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_0253 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008528  OEOE_0253  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  100 
 
 
424 aa  853    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  29.72 
 
 
422 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3042  extracellular solute-binding protein  30.43 
 
 
406 aa  154  4e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0658677  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4083  extracellular solute-binding protein family 1  30 
 
 
417 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6732  extracellular solute-binding protein family 1  32.37 
 
 
425 aa  136  8e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.255639  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2714  extracellular solute-binding protein family 1  31.19 
 
 
414 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.36636  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3956  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  29.84 
 
 
416 aa  127  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.282171  normal  0.0187852 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06340  maltose-binding periplasmic protein  26.3 
 
 
409 aa  124  2e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.211092  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1955  extracellular solute-binding protein family 1  27.07 
 
 
419 aa  121  1.9999999999999998e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.974693  hitchhiker  0.000475348 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  32.29 
 
 
420 aa  117  3e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0913  extracellular solute-binding protein family 1  28.16 
 
 
421 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00380  extracellular solute-binding protein family 1  28.26 
 
 
422 aa  109  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1138  extracellular solute-binding protein family 1  25.8 
 
 
423 aa  107  3e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.443513  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0144  extracellular solute-binding protein  24.5 
 
 
403 aa  107  3e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.442205  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2792  extracellular solute-binding protein family 1  33.44 
 
 
411 aa  103  6e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.199618 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0399  extracellular solute-binding protein family 1  29.41 
 
 
408 aa  103  8e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000195685  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1152  extracellular solute-binding protein  25.38 
 
 
393 aa  103  8e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0401617  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2267  extracellular solute-binding protein family 1  26.98 
 
 
445 aa  102  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00064551 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0751  extracellular solute-binding protein  28.48 
 
 
411 aa  99  1e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0314212  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0630  extracellular solute-binding protein family 1  30.77 
 
 
410 aa  99.4  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.505283 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  23.04 
 
 
410 aa  86.3  9e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6156  extracellular solute-binding protein family 1  22.38 
 
 
410 aa  83.2  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.889741  hitchhiker  0.000305646 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6572  extracellular solute-binding protein family 1  22.38 
 
 
410 aa  83.2  0.000000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00103217  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2485  extracellular solute-binding protein  26.47 
 
 
415 aa  82.4  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00421769  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5398  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  24 
 
 
403 aa  80.9  0.00000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.14652  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  24.74 
 
 
415 aa  78.2  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4472  maltose ABC transporter periplasmic protein  28.57 
 
 
397 aa  77  0.0000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3240  extracellular solute-binding protein  26.32 
 
 
434 aa  75.9  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7906  extracellular solute-binding protein family 1  27.54 
 
 
420 aa  75.5  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.819994  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0381  extracellular solute-binding protein family 1  22.66 
 
 
421 aa  74.3  0.000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2164  extracellular solute-binding protein family 1  24.28 
 
 
435 aa  74.3  0.000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0348  extracellular solute-binding protein family 1  22.84 
 
 
419 aa  69.7  0.00000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2614  extracellular solute-binding protein family 1  22.4 
 
 
461 aa  69.3  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000017055  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06270  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  21.01 
 
 
426 aa  69.3  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0045  extracellular solute-binding protein family 1  23.15 
 
 
414 aa  68.6  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.713374  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2726  extracellular solute-binding protein  22.81 
 
 
437 aa  68.6  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.290956  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3995  maltose ABC transporter periplasmic protein  27.1 
 
 
396 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0495972  normal  0.57528 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6631  extracellular solute-binding protein family 1  28.32 
 
 
410 aa  68.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.325237 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0378  maltose ABC transporter periplasmic protein  27.76 
 
 
403 aa  68.2  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3914  maltose ABC transporter periplasmic protein  27.76 
 
 
403 aa  68.2  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0306  maltose ABC transporter periplasmic protein  27.76 
 
 
403 aa  68.2  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000110695  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0781  extracellular solute-binding protein  28.66 
 
 
395 aa  68.2  0.0000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000729506  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6240  ABC transporter substrate binding protein (maltose)  25.73 
 
 
407 aa  67.4  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0994607  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4644  extracellular solute-binding protein  29.63 
 
 
409 aa  67.8  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0265502  normal  0.0904039 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5687  extracellular solute-binding protein family 1  27.24 
 
 
401 aa  67.4  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.627079  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03906  maltose ABC transporter periplasmic protein  26.79 
 
 
396 aa  67  0.0000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3962  extracellular solute-binding protein family 1  26.79 
 
 
396 aa  67  0.0000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03866  hypothetical protein  26.79 
 
 
396 aa  67  0.0000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4274  maltose ABC transporter periplasmic protein  26.79 
 
 
396 aa  67  0.0000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4586  maltose ABC transporter periplasmic protein  26.79 
 
 
396 aa  67  0.0000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4496  maltose ABC transporter periplasmic protein  26.79 
 
 
396 aa  67  0.0000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5515  maltose ABC transporter periplasmic protein  26.79 
 
 
396 aa  67  0.0000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.241432  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  27.86 
 
 
435 aa  67  0.0000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  27.03 
 
 
431 aa  66.6  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3226  Transcriptional regulator  24.61 
 
 
410 aa  66.6  0.0000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.101031  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3422  ABC-type sugar transport systems permease component  24.61 
 
 
410 aa  66.6  0.0000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1655  extracellular solute-binding protein family 1  22.66 
 
 
425 aa  65.5  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186521  normal  0.186231 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4486  maltose ABC transporter periplasmic protein  27.68 
 
 
396 aa  65.1  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4421  maltose ABC transporter periplasmic protein  27.68 
 
 
396 aa  65.1  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100315 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4572  maltose ABC transporter periplasmic protein  27.68 
 
 
396 aa  65.1  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0168981 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4623  maltose ABC transporter periplasmic protein  27.68 
 
 
396 aa  65.1  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.108824 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0238  maltose ABC transporter periplasmic protein  26.64 
 
 
396 aa  65.1  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.941451 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4571  maltose ABC transporter periplasmic protein  27.68 
 
 
396 aa  65.1  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.552535  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19770  extracellular solute-binding protein family 1  22.58 
 
 
423 aa  65.9  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.31 
 
 
430 aa  64.7  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0795  extracellular solute-binding protein family 1  24.46 
 
 
460 aa  64.3  0.000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.215252  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1899  extracellular solute-binding protein, putative  24.63 
 
 
416 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.41529  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1634  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  24.63 
 
 
416 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2351  extracellular solute-binding protein family 1  26.42 
 
 
435 aa  63.9  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0456809  normal  0.0969201 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3121  extracellular solute-binding protein family 1  24.57 
 
 
445 aa  63.9  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116931 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2237  extracellular solute-binding protein family 1  24.5 
 
 
466 aa  63.5  0.000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4688  extracellular solute-binding protein family 1  25.51 
 
 
418 aa  63.9  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001328  maltose/maltodextrin ABC transporter substrate binding periplasmic protein MalE  25.86 
 
 
392 aa  63.2  0.000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2733  extracellular solute-binding protein family 1  26.16 
 
 
434 aa  63.2  0.000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0602915  normal  0.13145 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.62 
 
 
407 aa  63.2  0.000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2958  extracellular solute-binding protein family 1  25.54 
 
 
410 aa  62.8  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.347864  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2662  extracellular solute-binding protein  27.35 
 
 
433 aa  62.4  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.377519  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0598  extracellular solute-binding protein family 1  25.62 
 
 
446 aa  63.2  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.764573  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2546  extracellular solute-binding protein  24.16 
 
 
488 aa  62.8  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.39868  normal  0.139719 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1321  extracellular solute-binding protein family 1  25.54 
 
 
410 aa  62.4  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3465  extracellular solute-binding protein  25.55 
 
 
411 aa  62  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2832  extracellular solute-binding protein family 1  23.53 
 
 
417 aa  62  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  21.43 
 
 
414 aa  62.4  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3106  ABC transporter, substrate binding periplasmic component  23.15 
 
 
408 aa  62  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2308  extracellular solute-binding protein  23.71 
 
 
440 aa  61.6  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000253431  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3622  extracellular solute-binding protein family 1  22.83 
 
 
412 aa  61.2  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4148  extracellular solute-binding protein  20.25 
 
 
426 aa  61.6  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0472509  normal  0.106363 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2818  extracellular solute-binding protein  24.16 
 
 
488 aa  61.6  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.179577  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0803  extracellular solute-binding protein  26.6 
 
 
433 aa  60.8  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.437157  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7516  extracellular solute-binding protein family 1  26.98 
 
 
452 aa  61.2  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6528  extracellular solute-binding protein family 1  24.4 
 
 
415 aa  61.2  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0147922 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1150  extracellular solute-binding protein  23.98 
 
 
441 aa  60.8  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.344094  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16190  extracellular solute-binding protein family 1  23.08 
 
 
401 aa  60.5  0.00000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00305219  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05214  maltose ABC transporter periplasmic protein  26.21 
 
 
416 aa  60.5  0.00000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0729  extracellular solute-binding protein family 1  23.87 
 
 
443 aa  60.1  0.00000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000254304  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1484  extracellular solute-binding protein  24.54 
 
 
444 aa  59.7  0.00000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000980441  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0914  maltose/maltodextrin ABC transporter, periplasmic maltose/maltodextrin-binding protein  27.27 
 
 
411 aa  60.1  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.459005  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3394  ABC-type sugar transport systems permease component  24.3 
 
 
411 aa  59.7  0.00000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.498756  normal  0.24931 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0984  extracellular solute-binding protein  23.45 
 
 
392 aa  59.3  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000118485  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0966  extracellular solute-binding protein  24.66 
 
 
392 aa  58.9  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000011003  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>