More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0475 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_0475  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 
397 aa  795    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0791  extracellular solute-binding protein family 1  73.68 
 
 
399 aa  605  9.999999999999999e-173  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.418273 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0476  extracellular solute-binding protein family 1  52.67 
 
 
401 aa  410  1e-113  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2730  extracellular solute-binding protein family 1  48.34 
 
 
399 aa  379  1e-104  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2791  extracellular solute-binding protein family 1  47.87 
 
 
402 aa  341  1e-92  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.448693  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0256  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  27.79 
 
 
439 aa  165  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5274  extracellular solute-binding protein family 1  30.39 
 
 
442 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3962  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  27.79 
 
 
439 aa  165  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3655  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  27.55 
 
 
439 aa  162  8.000000000000001e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0125  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  28.34 
 
 
444 aa  161  2e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0955  extracellular solute-binding protein family 1  28.85 
 
 
437 aa  161  2e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.152307 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2738  extracellular solute-binding protein  30.3 
 
 
438 aa  161  2e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.345118  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2659  extracellular solute-binding protein family 1  28.99 
 
 
431 aa  160  5e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00136924  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3306  extracellular solute-binding protein  28.74 
 
 
431 aa  157  3e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3856  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  27.95 
 
 
440 aa  157  3e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.64819 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4373  extracellular solute-binding protein  29.93 
 
 
437 aa  157  4e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.104197  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0604  extracellular solute-binding protein  29.47 
 
 
433 aa  157  4e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00010036 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2093  glycerol-3-phosphate ABC transporter extracellular solute-binding family 1 protein  29.81 
 
 
435 aa  155  8e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.107678  normal  0.487826 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0234  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  27.58 
 
 
439 aa  155  1e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.500336 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3748  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  27.71 
 
 
438 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3686  extracellular solute-binding protein  29.34 
 
 
460 aa  155  2e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3928  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  27.71 
 
 
438 aa  154  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0097  extracellular solute-binding protein  30.15 
 
 
434 aa  153  4e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3869  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  27.71 
 
 
438 aa  154  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3826  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  27.71 
 
 
438 aa  154  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3759  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  27.71 
 
 
438 aa  154  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0117  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  26.7 
 
 
444 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3732  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  27.61 
 
 
438 aa  153  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3861  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  26.75 
 
 
439 aa  152  8e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06396  ABC-type sugar transport system periplasmic protein  30.05 
 
 
435 aa  152  1e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03302  glycerol-3-phosphate transporter subunit  27.72 
 
 
438 aa  151  2e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0262  extracellular solute-binding protein family 1  27.72 
 
 
438 aa  151  2e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0263  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  27.72 
 
 
438 aa  151  2e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3650  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  27.72 
 
 
438 aa  151  2e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6751  extracellular solute-binding protein family 1  29.08 
 
 
441 aa  151  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03255  hypothetical protein  27.72 
 
 
438 aa  151  2e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4767  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  27.72 
 
 
438 aa  151  2e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.552805 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1696  extracellular solute-binding protein  28.64 
 
 
436 aa  151  2e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00506774  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4045  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  26.5 
 
 
439 aa  150  3e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.661181  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0314  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  27.62 
 
 
444 aa  150  3e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3650  extracellular solute-binding protein  29.63 
 
 
436 aa  150  3e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.144474  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3931  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  27.72 
 
 
438 aa  150  3e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4664  extracellular solute-binding protein  28.67 
 
 
448 aa  150  4e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.593429 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0323  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  27.38 
 
 
444 aa  150  4e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.839712 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3870  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  27.72 
 
 
438 aa  150  5e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0188  extracellular solute-binding protein  27.56 
 
 
420 aa  149  6e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3492  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  27.38 
 
 
444 aa  149  9e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2712  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  27.86 
 
 
443 aa  149  9e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.290307  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0374  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  27.86 
 
 
444 aa  149  9e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0395  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  27.86 
 
 
443 aa  149  9e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.954301  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0322  extracellular solute-binding protein  28.26 
 
 
419 aa  149  9e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0340  extracellular solute-binding protein  28.25 
 
 
419 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3697  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  27.14 
 
 
441 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0714  ABC transporter substrate-binding protein  28.5 
 
 
429 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2744  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  27.14 
 
 
441 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3726  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  27.14 
 
 
441 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.268589  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0656  extracellular solute-binding protein family 1  26.36 
 
 
431 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.31335 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0448  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  27.38 
 
 
441 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3209  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  27.14 
 
 
441 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0248662  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1760  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  27.14 
 
 
441 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2794  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  27.14 
 
 
441 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0298  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  27.71 
 
 
444 aa  147  3e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0849  extracellular solute-binding protein  28.75 
 
 
434 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0177782  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3509  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  26.9 
 
 
441 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.839022  normal  0.0272066 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3755  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  27.14 
 
 
441 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2709  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  27.62 
 
 
441 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3021  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  27.03 
 
 
441 aa  145  9e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4134  extracellular solute-binding protein family 1  28.81 
 
 
437 aa  145  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3282  extracellular solute-binding protein  30.39 
 
 
435 aa  144  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0075  extracellular solute-binding protein family 1  25.83 
 
 
441 aa  144  4e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2662  extracellular solute-binding protein  30.95 
 
 
433 aa  143  5e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.377519  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1185  extracellular solute-binding protein family 1  27.49 
 
 
438 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.276437  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0322  extracellular solute-binding protein family 1  29.01 
 
 
435 aa  141  1.9999999999999998e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1092  extracellular solute-binding protein family 1  27.49 
 
 
438 aa  140  3e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0503452  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1287  extracellular solute-binding protein  28.47 
 
 
435 aa  140  3e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3216  extracellular solute-binding protein  27.43 
 
 
425 aa  140  3e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.949389 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2052  extracellular solute-binding protein  28.22 
 
 
438 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1264  glycerol-3-phosphate-binding periplasmic lipoprotein signal peptide  27.44 
 
 
438 aa  140  6e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.400828  normal  0.517414 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5306  extracellular solute-binding protein  27.32 
 
 
431 aa  140  6e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.457023 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0111  putative glycerol 3-phosphate transport protein, ugpB-like protein  27.05 
 
 
438 aa  139  6e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.877787 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3270  extracellular solute-binding protein family 1  29.65 
 
 
435 aa  139  1e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.543416  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2055  extracellular solute-binding protein  27.59 
 
 
436 aa  139  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.822621  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0270  extracellular solute-binding protein  27.5 
 
 
419 aa  139  1e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.562219  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0857  extracellular solute-binding protein  27.9 
 
 
437 aa  138  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.221606 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0289  extracellular solute-binding protein  26.81 
 
 
437 aa  137  3.0000000000000003e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.00000019091  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0753  extracellular solute-binding protein  28.07 
 
 
437 aa  137  4e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3386  extracellular solute-binding protein family 1  28.27 
 
 
440 aa  135  9e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0721  extracellular solute-binding protein  27.04 
 
 
437 aa  135  9.999999999999999e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.540981  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5204  extracellular solute-binding protein family 1  26.73 
 
 
440 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.306263 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5465  extracellular solute-binding protein  26.91 
 
 
434 aa  135  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.355429  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2057  extracellular solute-binding protein family 1  29.36 
 
 
421 aa  134  3e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.112802  normal  0.296802 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2173  extracellular solute-binding protein family 1  27.71 
 
 
445 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00822083  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6664  extracellular solute-binding protein  27.27 
 
 
452 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0689323 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1155  glycerol-3-phosphate ABC transporter, periplasmic glycerol-3-phosphate-binding protein  27.21 
 
 
434 aa  133  5e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1459  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.55 
 
 
457 aa  133  6e-30  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1265  extracellular solute-binding protein family 1  28.23 
 
 
446 aa  133  6.999999999999999e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1881  extracellular solute-binding protein family 1  26.63 
 
 
445 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000340671  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0655  glycerol-3-phosphate ABC transporter, periplasmic glycerol-3-phosphate-binding protein  26.94 
 
 
433 aa  130  3e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.454035  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3710  extracellular solute-binding protein  26.81 
 
 
431 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00279907  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0224  extracellular solute-binding protein  23.93 
 
 
431 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>