More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2418 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2418  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 447 aa  899    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2049  extracellular solute-binding protein family 1  29.95 
 
 		 438 aa  149  1.0000000000000001e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.266449  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0770  extracellular solute-binding protein family 1  28.46 
 
 		 444 aa  134  5e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0322  extracellular solute-binding protein  28.88 
 
 		 419 aa  133  5e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0340  extracellular solute-binding protein  28.61 
 
 		 419 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0270  extracellular solute-binding protein  28.49 
 
 		 419 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.562219  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0075  extracellular solute-binding protein family 1  30.17 
 
 		 441 aa  130  7.000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0791  extracellular solute-binding protein family 1  27.53 
 
 		 399 aa  124  3e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.418273 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0475  extracellular solute-binding protein family 1  26.7 
 
 		 397 aa  124  5e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0721  extracellular solute-binding protein  28.96 
 
 		 437 aa  123  5e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.540981  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2535  extracellular solute-binding protein family 1  28.72 
 
 		 418 aa  119  9.999999999999999e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.105932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0289  extracellular solute-binding protein  27.87 
 
 		 437 aa  118  1.9999999999999998e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.00000019091  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2057  extracellular solute-binding protein family 1  28.43 
 
 		 421 aa  117  6e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.112802  normal  0.296802 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1638  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  29.01 
 
 		 434 aa  114  3e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000325816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0188  extracellular solute-binding protein  26.55 
 
 		 420 aa  114  4.0000000000000004e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1068  extracellular solute-binding protein  27.87 
 
 		 429 aa  112  2.0000000000000002e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.501776  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2730  extracellular solute-binding protein family 1  23.24 
 
 		 399 aa  112  2.0000000000000002e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0322  extracellular solute-binding protein family 1  27.36 
 
 		 435 aa  108  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1846  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.76 
 
 		 442 aa  107  4e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000328949  hitchhiker  0.000299807 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0061  extracellular solute-binding protein family 1  25.85 
 
 		 462 aa  106  9e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0845  extracellular solute-binding protein family 1  31.5 
 
 		 435 aa  105  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0631  extracellular solute-binding protein family 1  27.27 
 
 		 435 aa  105  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0955  extracellular solute-binding protein family 1  27.12 
 
 		 437 aa  105  2e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.152307 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0656  extracellular solute-binding protein family 1  25.12 
 
 		 431 aa  103  7e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.31335 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1392  extracellular solute-binding protein family 1  25.49 
 
 		 445 aa  102  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6751  extracellular solute-binding protein family 1  25.25 
 
 		 441 aa  102  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0255  extracellular solute-binding protein family 1  24.87 
 
 		 439 aa  102  2e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0297  extracellular solute-binding protein family 1  25.44 
 
 		 453 aa  101  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0248346 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2845  extracellular solute-binding protein family 1  25.98 
 
 		 439 aa  100  4e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0476  extracellular solute-binding protein family 1  25.19 
 
 		 401 aa  100  8e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  26.56 
 
 		 414 aa  99.4  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2834  extracellular solute-binding protein  27.05 
 
 		 459 aa  99  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.873121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4566  extracellular solute-binding protein  26.57 
 
 		 453 aa  97.8  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3270  extracellular solute-binding protein family 1  25.6 
 
 		 435 aa  97.4  5e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.543416  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2252  extracellular solute-binding protein  31.92 
 
 		 469 aa  95.9  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00844632  hitchhiker  0.0063434 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3944  extracellular solute-binding protein  27.07 
 
 		 464 aa  96.3  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.920276  normal  0.0416082 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2791  extracellular solute-binding protein family 1  24.37 
 
 		 402 aa  95.5  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.448693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.91 
 
 		 407 aa  94.4  3e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0349  glycerol-3-phosphate ABC transporter, periplasmic glycerol-3-phosphate-binding protein  27.55 
 
 		 441 aa  94.4  3e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0224  extracellular solute-binding protein  23.15 
 
 		 431 aa  93.2  9e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3386  extracellular solute-binding protein family 1  25.33 
 
 		 440 aa  92.4  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0753  extracellular solute-binding protein  24.53 
 
 		 437 aa  92  2e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0606  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, glycerol-3-phosphate-binding protein  24.25 
 
 		 458 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2726  extracellular solute-binding protein  25.85 
 
 		 437 aa  90.9  4e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.290956  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1484  extracellular solute-binding protein  26.82 
 
 		 444 aa  90.9  5e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000980441  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4733  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, glycerol-3-phosphate-binding protein  24.03 
 
 		 458 aa  90.5  5e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0625  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, glycerol-3-phosphate-binding protein  24.25 
 
 		 458 aa  90.5  5e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0480  glycerol-3-phosphate ABC transporter, glycerol-3-phosphate-binding protein  24.25 
 
 		 458 aa  90.1  7e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  28.57 
 
 		 415 aa  90.1  7e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0632  glycerol-3-phosphate ABC transporter, glycerol-3-phosphate-binding protein, putative  23.82 
 
 		 458 aa  89.7  8e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0849  extracellular solute-binding protein  24.78 
 
 		 434 aa  89.7  8e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0177782  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0482  glycerol-3-phosphate ABC transporter, glycerol-3-phosphate-binding protein  24.25 
 
 		 458 aa  89.7  9e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3527  extracellular solute-binding protein family 1  27.89 
 
 		 436 aa  89.7  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  25.29 
 
 		 427 aa  89.4  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3285  hypothetical protein  26.06 
 
 		 431 aa  89.4  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.339711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6664  extracellular solute-binding protein  24.5 
 
 		 452 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0689323 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0538  glycerol-3-phosphate ABC transporter glycerol-3-phosphate-binding protein  24.03 
 
 		 458 aa  88.6  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.406699  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0569  glycerol-3-phosphate ABC transporter glycerol-3-phosphate-binding protein  24.03 
 
 		 458 aa  88.6  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  25.4 
 
 		 424 aa  88.6  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  26.9 
 
 		 424 aa  89  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1696  extracellular solute-binding protein  24.18 
 
 		 436 aa  89  2e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00506774  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  25.53 
 
 		 437 aa  88.6  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0113  extracellular solute-binding protein  24.57 
 
 		 455 aa  88.2  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.270734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2659  extracellular solute-binding protein family 1  25.28 
 
 		 431 aa  87.8  3e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00136924  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4022  extracellular solute-binding protein  26.06 
 
 		 431 aa  88.2  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3290  ABC glycerol-3-phosphate transporter, periplasmic binding protein, UgpB  26.06 
 
 		 431 aa  87.4  4e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1090  extracellular solute-binding protein family 1  27.36 
 
 		 436 aa  87.4  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.667729  normal  0.0232634 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3216  extracellular solute-binding protein  24.57 
 
 		 425 aa  87.4  4e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.949389 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18880  carbohydrate-binding protein  25.15 
 
 		 460 aa  87.8  4e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.141989  normal  0.173455 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5306  extracellular solute-binding protein  26.77 
 
 		 431 aa  86.7  8e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.457023 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  27.97 
 
 		 420 aa  85.9  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0405  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  27.58 
 
 		 438 aa  85.9  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3306  extracellular solute-binding protein  24.75 
 
 		 431 aa  86.3  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2173  extracellular solute-binding protein family 1  27.63 
 
 		 445 aa  85.5  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00822083  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0111  putative glycerol 3-phosphate transport protein, ugpB-like protein  27.43 
 
 		 438 aa  85.1  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.877787 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1453  extracellular solute-binding protein  25.31 
 
 		 415 aa  84.7  0.000000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0104666  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0700  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, glycerol-3-phosphate-binding protein  23.82 
 
 		 458 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1895  extracellular solute-binding protein  30.06 
 
 		 445 aa  84  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.854658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4289  extracellular solute-binding protein  24.5 
 
 		 466 aa  83.6  0.000000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2846  extracellular solute-binding protein family 1  23.12 
 
 		 435 aa  84  0.000000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.687638 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1494  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  25.98 
 
 		 438 aa  83.6  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21150  carbohydrate-binding protein  24.94 
 
 		 428 aa  83.2  0.000000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.396929  normal  0.174783 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3106  ABC transporter, substrate binding periplasmic component  29.13 
 
 		 408 aa  82.8  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  26.99 
 
 		 429 aa  83.2  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3226  Transcriptional regulator  25 
 
 		 410 aa  82.8  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0483  extracellular solute-binding protein  23.54 
 
 		 458 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3422  ABC-type sugar transport systems permease component  25 
 
 		 410 aa  82.8  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3870  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  26.05 
 
 		 438 aa  81.6  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0420  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  25.69 
 
 		 410 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0604  extracellular solute-binding protein  28.75 
 
 		 433 aa  82  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010036 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03302  glycerol-3-phosphate transporter subunit  26.05 
 
 		 438 aa  81.6  0.00000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0262  extracellular solute-binding protein family 1  26.05 
 
 		 438 aa  81.6  0.00000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3732  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  26.05 
 
 		 438 aa  81.3  0.00000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3650  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  26.05 
 
 		 438 aa  81.6  0.00000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0263  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  26.05 
 
 		 438 aa  81.6  0.00000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2244  extracellular solute-binding protein family 1  24.63 
 
 		 455 aa  81.6  0.00000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.846858 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03255  hypothetical protein  26.05 
 
 		 438 aa  81.6  0.00000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4767  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  26.05 
 
 		 438 aa  81.6  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.552805 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1881  extracellular solute-binding protein family 1  26.39 
 
 		 445 aa  80.9  0.00000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000340671  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2738  extracellular solute-binding protein  24.41 
 
 		 438 aa  80.9  0.00000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.345118  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>