More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_3106 on replicon NC_009939
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009939  Dgeo_3106  ABC transporter, substrate binding periplasmic component  100 
 
 		 408 aa  831    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3394  ABC-type sugar transport systems permease component  65.28 
 
 		 411 aa  538  9.999999999999999e-153  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.498756  normal  0.24931 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3430  extracellular solute-binding protein family 1  34.73 
 
 		 415 aa  257  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4984  extracellular solute-binding protein family 1  33.74 
 
 		 432 aa  227  3e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000108283  decreased coverage  0.000897425 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0192  extracellular solute-binding protein family 1  28.9 
 
 		 444 aa  171  2e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.25123  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0729  extracellular solute-binding protein family 1  27.5 
 
 		 443 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000254304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0183  extracellular solute-binding protein family 1  26.7 
 
 		 429 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.94 
 
 		 407 aa  106  9e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  30.88 
 
 		 435 aa  99.4  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0719  extracellular solute-binding protein family 1  27.84 
 
 		 413 aa  99  1e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0236757  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2513  extracellular solute-binding protein family 1  24.75 
 
 		 441 aa  99.4  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0375  extracellular solute-binding protein family 1  26.27 
 
 		 421 aa  96.3  1e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0795  extracellular solute-binding protein family 1  22.7 
 
 		 460 aa  94  4e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.215252  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0378  extracellular solute-binding protein family 1  27.53 
 
 		 420 aa  93.6  6e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2315  extracellular solute-binding protein family 1  24.33 
 
 		 503 aa  92.4  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3566  extracellular solute-binding protein  24.12 
 
 		 454 aa  92.4  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.42847  normal  0.297516 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4057  extracellular solute-binding protein  25.75 
 
 		 410 aa  91.7  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6156  extracellular solute-binding protein family 1  24.34 
 
 		 410 aa  91.3  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.889741  hitchhiker  0.000305646 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2504  extracellular solute-binding protein family 1  24.43 
 
 		 442 aa  90.9  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06270  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.16 
 
 		 426 aa  90.5  4e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6572  extracellular solute-binding protein family 1  24.11 
 
 		 410 aa  90.1  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00103217  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0420  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  24.94 
 
 		 410 aa  89.7  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  24.88 
 
 		 410 aa  90.1  7e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0508  extracellular solute-binding protein family 1  25.87 
 
 		 421 aa  89.7  8e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000506303  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5398  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  24.88 
 
 		 403 aa  89.4  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.14652  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1359  extracellular solute-binding protein  23.16 
 
 		 458 aa  89.4  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2524  extracellular solute-binding protein family 1  26.81 
 
 		 483 aa  89  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000000331289  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0381  extracellular solute-binding protein family 1  24.77 
 
 		 421 aa  88.2  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2451  extracellular solute-binding protein family 1  24.78 
 
 		 449 aa  88.6  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.135643  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1552  extracellular solute-binding protein  25.93 
 
 		 391 aa  88.2  2e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000398035  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3149  extracellular solute-binding protein  23.93 
 
 		 427 aa  88.2  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1484  extracellular solute-binding protein  30.72 
 
 		 444 aa  88.2  3e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000980441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  25.64 
 
 		 420 aa  87.8  3e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7208  extracellular solute-binding protein family 1  24.94 
 
 		 410 aa  87.8  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  26.16 
 
 		 414 aa  87.4  4e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  28.75 
 
 		 431 aa  87.4  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4621  extracellular solute-binding protein family 1  28.22 
 
 		 413 aa  87.4  4e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  23.29 
 
 		 411 aa  87  5e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1614  extracellular solute-binding protein  25.59 
 
 		 391 aa  86.7  6e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000159886  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2546  extracellular solute-binding protein  27.14 
 
 		 488 aa  87  6e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.39868  normal  0.139719 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2571  extracellular solute-binding protein  28.25 
 
 		 417 aa  86.7  7e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0854  extracellular solute-binding protein family 1  26.54 
 
 		 398 aa  84.7  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.124504  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2818  extracellular solute-binding protein  26.39 
 
 		 488 aa  85.5  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.179577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0829  extracellular solute-binding protein family 1  26.4 
 
 		 504 aa  84.3  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  24.61 
 
 		 414 aa  84  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7695  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  26.56 
 
 		 435 aa  84  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.397837  normal  0.53163 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4883  extracellular solute-binding protein family 1  23.16 
 
 		 436 aa  84  0.000000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.504344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2418  extracellular solute-binding protein family 1  28.73 
 
 		 447 aa  82.8  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  23.9 
 
 		 422 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4136  extracellular solute-binding protein  25.29 
 
 		 424 aa  81.6  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.518326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4632  extracellular solute-binding protein  26.03 
 
 		 419 aa  81.3  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.448727  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7906  extracellular solute-binding protein family 1  25.47 
 
 		 420 aa  81.3  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.819994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0698  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  23.01 
 
 		 366 aa  80.9  0.00000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436581  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  25.88 
 
 		 415 aa  80.5  0.00000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2663  extracellular solute-binding protein family 1  27.88 
 
 		 468 aa  80.5  0.00000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1899  extracellular solute-binding protein, putative  24.44 
 
 		 416 aa  80.1  0.00000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.41529  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1634  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  24.44 
 
 		 416 aa  80.1  0.00000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  23.48 
 
 		 411 aa  79.3  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2552  extracellular solute-binding protein  23.54 
 
 		 443 aa  78.6  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000382941 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0966  extracellular solute-binding protein  25.95 
 
 		 392 aa  78.2  0.0000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000011003  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0984  extracellular solute-binding protein  25.95 
 
 		 392 aa  77.8  0.0000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000118485  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4320  extracellular solute-binding protein family 1  24.64 
 
 		 425 aa  77.4  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.811375  hitchhiker  0.00841489 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0075  extracellular solute-binding protein family 1  25.45 
 
 		 441 aa  77.4  0.0000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2049  extracellular solute-binding protein family 1  24.57 
 
 		 438 aa  77.4  0.0000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.266449  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12341  periplasmic sugar-binding lipoprotein uspC  24.84 
 
 		 440 aa  77.4  0.0000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0828  extracellular solute-binding protein  25.43 
 
 		 424 aa  76.6  0.0000000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.142269  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  27.97 
 
 		 424 aa  76.6  0.0000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2057  extracellular solute-binding protein family 1  27.22 
 
 		 421 aa  76.6  0.0000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.112802  normal  0.296802 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5349  extracellular solute-binding protein family 1  26.47 
 
 		 406 aa  76.6  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.535832 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3553  extracellular solute-binding protein  22.69 
 
 		 419 aa  75.9  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2821  extracellular solute-binding protein  23.67 
 
 		 428 aa  75.9  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.858803  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0399  extracellular solute-binding protein family 1  24.58 
 
 		 408 aa  75.9  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000195685  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0045  extracellular solute-binding protein family 1  27.78 
 
 		 414 aa  76.3  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.713374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3538  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  24.86 
 
 		 406 aa  76.3  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.385239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2164  extracellular solute-binding protein family 1  24.03 
 
 		 435 aa  76.3  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  25.08 
 
 		 427 aa  75.1  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0265  extracellular solute-binding protein family 1  25.61 
 
 		 510 aa  75.5  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1152  extracellular solute-binding protein  25.44 
 
 		 393 aa  74.7  0.000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0401617  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4644  extracellular solute-binding protein  28.12 
 
 		 409 aa  75.5  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0265502  normal  0.0904039 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0274  extracellular solute-binding protein  23.64 
 
 		 439 aa  75.5  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.285114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0803  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 		 433 aa  74.7  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.437157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0781  extracellular solute-binding protein  27.27 
 
 		 395 aa  74.7  0.000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000729506  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3619  extracellular solute-binding protein  26.07 
 
 		 488 aa  73.9  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6631  extracellular solute-binding protein family 1  26.43 
 
 		 410 aa  73.9  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.325237 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16190  extracellular solute-binding protein family 1  22.52 
 
 		 401 aa  73.6  0.000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00305219  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28390  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.76 
 
 		 453 aa  73.2  0.000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2535  extracellular solute-binding protein family 1  27.46 
 
 		 418 aa  73.2  0.000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.105932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2403  extracellular solute-binding protein  22.87 
 
 		 441 aa  72.4  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0137  extracellular solute-binding protein family 1  23.1 
 
 		 453 aa  72  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0944  extracellular solute-binding protein family 1  22.09 
 
 		 433 aa  71.6  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.322748 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2267  extracellular solute-binding protein family 1  26.38 
 
 		 445 aa  71.6  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00064551 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2870  extracellular solute-binding protein  26.24 
 
 		 447 aa  72.4  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2731  extracellular solute-binding protein family 1  25.75 
 
 		 454 aa  71.6  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3957  extracellular solute-binding protein family 1  22.29 
 
 		 432 aa  71.6  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12848  sn-glycerol-3-phosphate-binding lipoprotein ugpB  26.49 
 
 		 436 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000142723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1595  extracellular solute-binding protein family 1  25.76 
 
 		 440 aa  72  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.780174  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0297  extracellular solute-binding protein family 1  28.72 
 
 		 453 aa  71.6  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0248346 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5687  extracellular solute-binding protein family 1  26.05 
 
 		 401 aa  71.2  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.627079  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4038  extracellular solute-binding protein family 1  23.61 
 
 		 405 aa  71.6  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3422  ABC-type sugar transport systems permease component  22.75 
 
 		 410 aa  71.2  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>