257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_28390 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_28390  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  100 
 
 		 453 aa  906    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0137  extracellular solute-binding protein family 1  47.7 
 
 		 453 aa  381  1e-104  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11510  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  44.96 
 
 		 426 aa  348  1e-94  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12341  periplasmic sugar-binding lipoprotein uspC  38.32 
 
 		 440 aa  256  8e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0795  extracellular solute-binding protein family 1  26.46 
 
 		 460 aa  168  2e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.215252  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06270  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.74 
 
 		 426 aa  134  5e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1899  extracellular solute-binding protein, putative  24.28 
 
 		 416 aa  119  9e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.41529  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2164  extracellular solute-binding protein family 1  29.16 
 
 		 435 aa  119  9.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1655  extracellular solute-binding protein family 1  27.16 
 
 		 425 aa  119  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186521  normal  0.186231 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1634  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  24.05 
 
 		 416 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1750  extracellular solute-binding protein family 1  26.93 
 
 		 448 aa  116  6.9999999999999995e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000348272 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2819  extracellular solute-binding protein family 1  27.68 
 
 		 461 aa  116  7.999999999999999e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.491227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3387  extracellular solute-binding protein  27.32 
 
 		 447 aa  111  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.278202  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1773  extracellular solute-binding protein family 1  25.07 
 
 		 465 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.504545  normal  0.290135 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7906  extracellular solute-binding protein family 1  26.75 
 
 		 420 aa  106  7e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.819994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2218  extracellular solute-binding protein family 1  24.74 
 
 		 479 aa  106  8e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00910899  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3240  extracellular solute-binding protein  23.7 
 
 		 434 aa  104  3e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.37 
 
 		 430 aa  104  4e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4688  extracellular solute-binding protein family 1  26.38 
 
 		 418 aa  99.8  8e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2731  extracellular solute-binding protein family 1  27.31 
 
 		 454 aa  99.8  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07450  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.46 
 
 		 464 aa  96.3  1e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  25.65 
 
 		 427 aa  94  5e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4632  extracellular solute-binding protein  27.47 
 
 		 419 aa  92.4  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.448727  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  25.06 
 
 		 422 aa  92  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0381  extracellular solute-binding protein family 1  25.84 
 
 		 421 aa  92  2e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1468  extracellular solute-binding protein family 1  27.68 
 
 		 457 aa  89  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  28.52 
 
 		 414 aa  88.2  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01900  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.99 
 
 		 442 aa  86.3  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.867357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0513  extracellular solute-binding protein family 1  24.84 
 
 		 447 aa  84.7  0.000000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.000000038068  hitchhiker  0.000703825 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2726  extracellular solute-binding protein  28.76 
 
 		 437 aa  83.2  0.000000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.290956  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1639  extracellular solute-binding protein family 1  23.83 
 
 		 463 aa  80.5  0.00000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.102178  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  22.47 
 
 		 420 aa  79.7  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2451  extracellular solute-binding protein family 1  26.33 
 
 		 449 aa  78.2  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.135643  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4930  extracellular solute-binding protein family 1  26.87 
 
 		 419 aa  77.8  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.265943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0592  extracellular solute-binding protein  23.01 
 
 		 456 aa  77.8  0.0000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000165278  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0427  extracellular solute-binding protein family 1  26.36 
 
 		 497 aa  74.3  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29320  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.61 
 
 		 443 aa  73.9  0.000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2513  extracellular solute-binding protein family 1  21.83 
 
 		 441 aa  73.9  0.000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3106  ABC transporter, substrate binding periplasmic component  22.76 
 
 		 408 aa  72.4  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3842  extracellular solute-binding protein family 1  26.7 
 
 		 429 aa  71.6  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0316121  normal  0.0422385 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  20.69 
 
 		 414 aa  71.6  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2571  extracellular solute-binding protein  23.65 
 
 		 417 aa  70.9  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0729  extracellular solute-binding protein family 1  25.37 
 
 		 443 aa  70.9  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000254304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12078  sugar-binding lipoprotein  26.71 
 
 		 439 aa  70.5  0.00000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2603  extracellular solute-binding protein family 1  25.27 
 
 		 445 aa  68.9  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0144502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0405  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  24.56 
 
 		 438 aa  67.8  0.0000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  25.57 
 
 		 415 aa  68.2  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4147  extracellular solute-binding protein family 1  27.67 
 
 		 441 aa  67.8  0.0000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.892231  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3430  extracellular solute-binding protein family 1  24 
 
 		 415 aa  67.4  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1511  extracellular solute-binding protein family 1  22.22 
 
 		 424 aa  67  0.0000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0203  extracellular solute-binding protein family 1  25.19 
 
 		 441 aa  64.7  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.346278  normal  0.123927 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3149  extracellular solute-binding protein  23.55 
 
 		 427 aa  65.1  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3394  ABC-type sugar transport systems permease component  23.51 
 
 		 411 aa  65.1  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.498756  normal  0.24931 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  24.92 
 
 		 424 aa  64.7  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5687  extracellular solute-binding protein family 1  23.01 
 
 		 401 aa  64.3  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.627079  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0399  extracellular solute-binding protein family 1  21.88 
 
 		 408 aa  64.3  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000195685  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2267  extracellular solute-binding protein family 1  24.67 
 
 		 445 aa  64.3  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00064551 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4883  extracellular solute-binding protein family 1  23.81 
 
 		 436 aa  64.3  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.504344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4320  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 425 aa  63.9  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.811375  hitchhiker  0.00841489 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3685  extracellular solute-binding protein  22.86 
 
 		 432 aa  63.5  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4644  extracellular solute-binding protein  23.75 
 
 		 409 aa  63.5  0.000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0265502  normal  0.0904039 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1680  extracellular solute-binding protein family 1  25.22 
 
 		 430 aa  63.5  0.000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.173253  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6631  extracellular solute-binding protein family 1  23.01 
 
 		 410 aa  63.2  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.325237 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3793  extracellular solute-binding protein family 1  26.45 
 
 		 459 aa  63.2  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.46649  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1296  extracellular solute-binding protein family 1  30.94 
 
 		 443 aa  63.2  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.190784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5349  extracellular solute-binding protein family 1  22.61 
 
 		 406 aa  62.8  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.535832 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0348  extracellular solute-binding protein family 1  23.75 
 
 		 419 aa  61.6  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6904  extracellular solute-binding protein family 1  23.01 
 
 		 404 aa  62.4  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000382644  hitchhiker  0.00751503 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16660  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.93 
 
 		 406 aa  60.8  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.613471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  23.39 
 
 		 411 aa  60.5  0.00000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0192  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  21.82 
 
 		 463 aa  60.1  0.00000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.245721  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2364  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  22.65 
 
 		 416 aa  59.3  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0687  extracellular solute-binding protein  26.03 
 
 		 407 aa  58.5  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.376534  normal  0.15795 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2703  extracellular solute-binding protein family 1  22.18 
 
 		 450 aa  58.5  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263225  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  25.25 
 
 		 424 aa  58.5  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1895  extracellular solute-binding protein  23.66 
 
 		 445 aa  58.9  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.854658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  21.62 
 
 		 411 aa  58.2  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3566  extracellular solute-binding protein  21.34 
 
 		 454 aa  58.2  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.42847  normal  0.297516 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5698  extracellular solute-binding protein family 1  22.19 
 
 		 412 aa  57.8  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.145305  normal  0.141272 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  22.6 
 
 		 411 aa  57.4  0.0000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  23.44 
 
 		 415 aa  57  0.0000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3246  extracellular solute-binding protein family 1  27.36 
 
 		 443 aa  57  0.0000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0508  extracellular solute-binding protein family 1  27.22 
 
 		 514 aa  57.4  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1392  extracellular solute-binding protein family 1  25.31 
 
 		 445 aa  57  0.0000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2680  extracellular solute-binding protein family 1  24.62 
 
 		 458 aa  56.6  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2582  extracellular solute-binding protein family 1  22.43 
 
 		 416 aa  56.6  0.0000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5074  extracellular solute-binding protein family 1  25.2 
 
 		 447 aa  56.6  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1371  extracellular solute-binding protein family 1  25.86 
 
 		 438 aa  55.8  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6240  ABC transporter substrate binding protein (maltose)  22.58 
 
 		 407 aa  55.8  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0994607  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3957  extracellular solute-binding protein family 1  24.56 
 
 		 432 aa  55.8  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1105  extracellular solute-binding protein family 1  23.34 
 
 		 443 aa  55.8  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.698754  normal  0.0706181 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0183  extracellular solute-binding protein family 1  23.19 
 
 		 429 aa  55.1  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0265  extracellular solute-binding protein family 1  24.16 
 
 		 510 aa  54.7  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2552  extracellular solute-binding protein  22.2 
 
 		 443 aa  55.1  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000382941 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2553  extracellular solute-binding protein family 1  22.3 
 
 		 432 aa  54.7  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.964139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05420  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.42 
 
 		 438 aa  53.9  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0143899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19770  extracellular solute-binding protein family 1  22.94 
 
 		 423 aa  54.3  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0744  extracellular solute-binding protein  25.09 
 
 		 432 aa  53.9  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0587531  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2315  extracellular solute-binding protein  23.94 
 
 		 455 aa  53.9  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.271919 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3730  extracellular solute-binding protein family 1  27.74 
 
 		 435 aa  53.9  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.163607  normal  0.040318 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>