108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1468 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_1468  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 457 aa  924    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3793  extracellular solute-binding protein family 1  34.14 
 
 		 459 aa  245  9.999999999999999e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.46649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2218  extracellular solute-binding protein family 1  29.47 
 
 		 479 aa  178  2e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00910899  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0592  extracellular solute-binding protein  27.92 
 
 		 456 aa  164  4.0000000000000004e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000165278  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0795  extracellular solute-binding protein family 1  23.9 
 
 		 460 aa  100  7e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.215252  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2504  extracellular solute-binding protein family 1  29.52 
 
 		 442 aa  92.8  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4632  extracellular solute-binding protein  26.25 
 
 		 419 aa  91.7  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.448727  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0137  extracellular solute-binding protein family 1  29.71 
 
 		 453 aa  89.7  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28390  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.38 
 
 		 453 aa  88.2  3e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2513  extracellular solute-binding protein family 1  23.9 
 
 		 441 aa  78.6  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2603  extracellular solute-binding protein family 1  28.07 
 
 		 445 aa  77.4  0.0000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0144502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0427  extracellular solute-binding protein family 1  26.48 
 
 		 497 aa  73.2  0.000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12341  periplasmic sugar-binding lipoprotein uspC  26.85 
 
 		 440 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0513  extracellular solute-binding protein family 1  22.56 
 
 		 447 aa  71.6  0.00000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.000000038068  hitchhiker  0.000703825 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3566  extracellular solute-binding protein  23.5 
 
 		 454 aa  71.2  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.42847  normal  0.297516 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2524  extracellular solute-binding protein family 1  26.84 
 
 		 483 aa  67.4  0.0000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000000331289  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27690  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.35 
 
 		 431 aa  66.6  0.0000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.340884 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1359  extracellular solute-binding protein  25.71 
 
 		 458 aa  65.9  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3430  extracellular solute-binding protein family 1  22.38 
 
 		 415 aa  64.7  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11510  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.25 
 
 		 426 aa  64.7  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2726  extracellular solute-binding protein  23.79 
 
 		 437 aa  64.3  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.290956  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0656  extracellular solute-binding protein family 1  36.07 
 
 		 431 aa  63.2  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.31335 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0310  extracellular solute-binding protein family 1  27.01 
 
 		 443 aa  62.8  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  21.18 
 
 		 427 aa  62.4  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3619  extracellular solute-binding protein  27.51 
 
 		 488 aa  62  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5074  extracellular solute-binding protein family 1  25.82 
 
 		 447 aa  61.6  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2365  extracellular solute-binding protein family 1  24.59 
 
 		 416 aa  61.2  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.618021 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2451  extracellular solute-binding protein family 1  22.84 
 
 		 449 aa  61.2  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.135643  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0516  extracellular solute-binding protein  26.8 
 
 		 488 aa  60.5  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2731  extracellular solute-binding protein family 1  25.62 
 
 		 454 aa  60.1  0.00000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4697  extracellular solute-binding protein family 1  24.72 
 
 		 442 aa  60.1  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00367387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6240  ABC transporter substrate binding protein (maltose)  25.35 
 
 		 407 aa  60.1  0.00000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0994607  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0265  extracellular solute-binding protein family 1  29.53 
 
 		 510 aa  59.7  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0829  extracellular solute-binding protein family 1  24.62 
 
 		 504 aa  59.3  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0378  extracellular solute-binding protein family 1  23.83 
 
 		 420 aa  58.5  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4883  extracellular solute-binding protein family 1  20.66 
 
 		 436 aa  58.9  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.504344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0375  extracellular solute-binding protein family 1  23.61 
 
 		 421 aa  57.8  0.0000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  32.72 
 
 		 419 aa  57.8  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.033461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.53 
 
 		 430 aa  57.4  0.0000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4038  extracellular solute-binding protein family 1  20.92 
 
 		 405 aa  57.4  0.0000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0405  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  27.17 
 
 		 438 aa  57.4  0.0000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3957  extracellular solute-binding protein family 1  21.33 
 
 		 432 aa  57  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3538  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  22.99 
 
 		 406 aa  56.6  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.385239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0183  extracellular solute-binding protein family 1  24.84 
 
 		 429 aa  55.5  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3149  extracellular solute-binding protein  24.62 
 
 		 427 aa  55.1  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  21 
 
 		 411 aa  54.3  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0729  extracellular solute-binding protein family 1  22.86 
 
 		 443 aa  54.3  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000254304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0224  extracellular solute-binding protein  34.15 
 
 		 431 aa  53.5  0.000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1899  extracellular solute-binding protein, putative  25.24 
 
 		 416 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.41529  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1634  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  25.24 
 
 		 416 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  22.95 
 
 		 422 aa  53.1  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  27.5 
 
 		 415 aa  52  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29320  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  21.12 
 
 		 443 aa  52.4  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  23.82 
 
 		 424 aa  51.2  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  23.6 
 
 		 414 aa  51.6  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0192  extracellular solute-binding protein family 1  25.64 
 
 		 444 aa  50.8  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.25123  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5687  extracellular solute-binding protein family 1  24.22 
 
 		 401 aa  50.4  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.627079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3216  extracellular solute-binding protein  35.04 
 
 		 425 aa  50.4  0.00007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.949389 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6631  extracellular solute-binding protein family 1  24.71 
 
 		 410 aa  50.4  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.325237 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2474  extracellular solute-binding protein family 1  23.12 
 
 		 484 aa  50.1  0.00008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000108946  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3240  extracellular solute-binding protein  24.75 
 
 		 434 aa  49.7  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2977  extracellular solute-binding protein family 1  22.64 
 
 		 415 aa  49.7  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.576527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12078  sugar-binding lipoprotein  26.17 
 
 		 439 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2546  extracellular solute-binding protein  25.89 
 
 		 488 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.39868  normal  0.139719 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3394  ABC-type sugar transport systems permease component  23.39 
 
 		 411 aa  48.5  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.498756  normal  0.24931 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1773  extracellular solute-binding protein family 1  24.06 
 
 		 465 aa  48.9  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.504545  normal  0.290135 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  25.87 
 
 		 435 aa  48.5  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14790  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.48 
 
 		 424 aa  48.9  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.718562  normal  0.0502834 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  26.55 
 
 		 431 aa  49.3  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1484  extracellular solute-binding protein  23.89 
 
 		 444 aa  48.1  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000980441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2315  extracellular solute-binding protein family 1  24.14 
 
 		 503 aa  48.1  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1750  extracellular solute-binding protein family 1  22.33 
 
 		 448 aa  47.8  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000348272 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0719  extracellular solute-binding protein family 1  22.05 
 
 		 413 aa  47.8  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0236757  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3422  ABC-type sugar transport systems permease component  20.9 
 
 		 410 aa  47.4  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3226  Transcriptional regulator  20.9 
 
 		 410 aa  47.4  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2818  extracellular solute-binding protein  25.18 
 
 		 488 aa  47.4  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.179577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6664  extracellular solute-binding protein  23.38 
 
 		 452 aa  47  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0689323 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0083  extracellular solute-binding protein family 1  29.17 
 
 		 429 aa  47  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2267  extracellular solute-binding protein family 1  24.9 
 
 		 445 aa  47  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00064551 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3534  extracellular solute-binding protein family 1  27.37 
 
 		 445 aa  47  0.0008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.582574 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1126  extracellular solute-binding protein  25.31 
 
 		 432 aa  45.8  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.190587  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  25.14 
 
 		 424 aa  46.2  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0523  extracellular solute-binding protein  23.53 
 
 		 416 aa  46.6  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0192  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  25.09 
 
 		 463 aa  46.6  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.245721  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04610  extracellular solute-binding protein family 1  27.78 
 
 		 431 aa  45.8  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2819  extracellular solute-binding protein family 1  24.86 
 
 		 461 aa  46.2  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.491227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01900  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.32 
 
 		 442 aa  46.6  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.867357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2703  extracellular solute-binding protein family 1  23.58 
 
 		 450 aa  46.2  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263225  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  22.61 
 
 		 414 aa  46.6  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3121  extracellular solute-binding protein family 1  23.94 
 
 		 445 aa  45.8  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116931 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2574  extracellular solute-binding protein family 1  23.27 
 
 		 401 aa  45.1  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000602333  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4488  extracellular solute-binding protein family 1  22.6 
 
 		 434 aa  44.7  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.395657  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3106  ABC transporter, substrate binding periplasmic component  19.93 
 
 		 408 aa  44.3  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5349  extracellular solute-binding protein family 1  21.95 
 
 		 406 aa  44.7  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.535832 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6904  extracellular solute-binding protein family 1  23.67 
 
 		 404 aa  44.7  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000382644  hitchhiker  0.00751503 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1187  extracellular solute-binding protein  23.78 
 
 		 426 aa  43.9  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.118326  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21150  carbohydrate-binding protein  23.75 
 
 		 428 aa  43.9  0.006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.396929  normal  0.174783 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5306  extracellular solute-binding protein  25.61 
 
 		 431 aa  43.5  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.457023 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3988  extracellular solute-binding protein family 1  24.54 
 
 		 422 aa  43.5  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0126  extracellular solute-binding protein family 1  22.92 
 
 		 477 aa  43.9  0.007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>