More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3387 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_1750  extracellular solute-binding protein family 1  90.6 
 
 		 448 aa  768    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000348272 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3387  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 447 aa  912    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.278202  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1773  extracellular solute-binding protein family 1  53.44 
 
 		 465 aa  487  1e-136  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.504545  normal  0.290135 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2819  extracellular solute-binding protein family 1  48.18 
 
 		 461 aa  427  1e-118  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.491227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07450  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  43.56 
 
 		 464 aa  394  1e-108  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3240  extracellular solute-binding protein  48.07 
 
 		 434 aa  394  1e-108  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1639  extracellular solute-binding protein family 1  45.16 
 
 		 463 aa  381  1e-104  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.102178  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01900  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  38.84 
 
 		 442 aa  308  2.0000000000000002e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.867357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0795  extracellular solute-binding protein family 1  34.29 
 
 		 460 aa  233  7.000000000000001e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.215252  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0381  extracellular solute-binding protein family 1  32.97 
 
 		 421 aa  166  8e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7906  extracellular solute-binding protein family 1  30.27 
 
 		 420 aa  157  5.0000000000000005e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.819994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  29.43 
 
 		 427 aa  152  8.999999999999999e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1899  extracellular solute-binding protein, putative  31.44 
 
 		 416 aa  145  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.41529  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1634  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  31.44 
 
 		 416 aa  145  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2164  extracellular solute-binding protein family 1  26.81 
 
 		 435 aa  132  9e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4688  extracellular solute-binding protein family 1  29.21 
 
 		 418 aa  131  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12341  periplasmic sugar-binding lipoprotein uspC  26.11 
 
 		 440 aa  127  5e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0137  extracellular solute-binding protein family 1  25.69 
 
 		 453 aa  126  8.000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1655  extracellular solute-binding protein family 1  26.77 
 
 		 425 aa  123  7e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186521  normal  0.186231 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12078  sugar-binding lipoprotein  25.12 
 
 		 439 aa  117  5e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28390  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.32 
 
 		 453 aa  112  9e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  26.59 
 
 		 422 aa  106  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06270  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.6 
 
 		 426 aa  102  2e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  23.83 
 
 		 414 aa  100  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1152  extracellular solute-binding protein  28.65 
 
 		 393 aa  99.4  1e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0401617  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.41 
 
 		 430 aa  97.8  4e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2571  extracellular solute-binding protein  24.8 
 
 		 417 aa  96.7  7e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3566  extracellular solute-binding protein family 1  25.5 
 
 		 426 aa  95.9  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0203  extracellular solute-binding protein family 1  27.51 
 
 		 441 aa  94.7  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.346278  normal  0.123927 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  26.62 
 
 		 420 aa  92  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2731  extracellular solute-binding protein family 1  26.2 
 
 		 454 aa  90.1  7e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0399  extracellular solute-binding protein family 1  27.51 
 
 		 408 aa  89  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000195685  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4632  extracellular solute-binding protein  25.98 
 
 		 419 aa  86.7  9e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.448727  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0913  extracellular solute-binding protein family 1  27.35 
 
 		 421 aa  85.9  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29010  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.33 
 
 		 434 aa  85.1  0.000000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3538  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  26.28 
 
 		 406 aa  81.3  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.385239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2267  extracellular solute-binding protein family 1  36.5 
 
 		 445 aa  80.9  0.00000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00064551 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.15 
 
 		 407 aa  80.9  0.00000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0592  extracellular solute-binding protein  24.32 
 
 		 456 aa  80.5  0.00000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000165278  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2726  extracellular solute-binding protein  24.15 
 
 		 437 aa  80.1  0.00000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.290956  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2485  extracellular solute-binding protein  24.28 
 
 		 415 aa  80.1  0.00000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00421769  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05420  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  29.12 
 
 		 438 aa  79  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0143899  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2451  extracellular solute-binding protein family 1  23.63 
 
 		 449 aa  78.6  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.135643  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3674  ABC sugar transporter, periplasmic binding protein  23.03 
 
 		 404 aa  77  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3808  extracellular solute-binding protein family 1  26.71 
 
 		 427 aa  77  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.750227 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3409  extracellular solute-binding protein  23.31 
 
 		 404 aa  76.3  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.280364  normal  0.614723 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2403  extracellular solute-binding protein  22.69 
 
 		 441 aa  76.3  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2552  extracellular solute-binding protein  22.81 
 
 		 443 aa  76.3  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000382941 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2733  extracellular solute-binding protein family 1  26.48 
 
 		 434 aa  75.9  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0602915  normal  0.13145 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  23.42 
 
 		 414 aa  75.5  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11540  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  31.82 
 
 		 428 aa  75.5  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0159385 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1099  extracellular solute-binding protein  23.58 
 
 		 457 aa  75.5  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  24.54 
 
 		 424 aa  74.7  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1020  extracellular solute-binding protein  24.94 
 
 		 459 aa  74.7  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000124434  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3329  extracellular solute-binding protein  30.77 
 
 		 431 aa  74.7  0.000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0332045  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0719  extracellular solute-binding protein family 1  26.36 
 
 		 413 aa  74.3  0.000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0236757  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4083  extracellular solute-binding protein family 1  24.8 
 
 		 417 aa  73.9  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1120  putative maltosaccharide ABC transporter, maltosaccharide-binding protein  26.29 
 
 		 419 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000383609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3149  extracellular solute-binding protein  24.19 
 
 		 427 aa  73.6  0.000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1218  extracellular solute-binding protein family 1  27.22 
 
 		 444 aa  73.6  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1126  extracellular solute-binding protein family 1  23.29 
 
 		 433 aa  73.2  0.000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.162135  hitchhiker  0.000581091 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15060  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.64 
 
 		 457 aa  72.4  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.138683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00380  extracellular solute-binding protein family 1  25.79 
 
 		 422 aa  72.8  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0751  extracellular solute-binding protein  26.06 
 
 		 411 aa  72  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0314212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2218  extracellular solute-binding protein family 1  26.18 
 
 		 479 aa  72  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00910899  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1229  extracellular solute-binding protein  22.38 
 
 		 461 aa  71.2  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0257979  normal  0.868479 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3271  extracellular solute-binding protein family 1  22.54 
 
 		 473 aa  71.2  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  23.86 
 
 		 415 aa  71.2  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2524  extracellular solute-binding protein family 1  24.34 
 
 		 483 aa  70.9  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000000331289  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.95 
 
 		 419 aa  70.9  0.00000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.033461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  26.29 
 
 		 410 aa  70.1  0.00000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3988  extracellular solute-binding protein family 1  21.71 
 
 		 422 aa  69.7  0.00000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0385  extracellular solute-binding protein family 1  26.1 
 
 		 410 aa  70.1  0.00000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0390662 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0513  extracellular solute-binding protein family 1  24.74 
 
 		 447 aa  69.3  0.0000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.000000038068  hitchhiker  0.000703825 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0021  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.01 
 
 		 428 aa  69.3  0.0000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1371  extracellular solute-binding protein family 1  27.91 
 
 		 438 aa  69.7  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5349  extracellular solute-binding protein family 1  24.26 
 
 		 406 aa  69.7  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.535832 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1702  sugar-binding protein  24.93 
 
 		 442 aa  68.6  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.981171  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2714  extracellular solute-binding protein family 1  24.12 
 
 		 414 aa  68.9  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.36636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5099  extracellular solute-binding protein family 1  32.78 
 
 		 444 aa  68.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.291523  normal  0.0224239 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1017  extracellular solute-binding protein  25.36 
 
 		 417 aa  68.9  0.0000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0416471  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0747  extracellular solute-binding protein  25.82 
 
 		 433 aa  68.9  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03450  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.07 
 
 		 416 aa  68.2  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.355174 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0291  extracellular solute-binding protein  24.34 
 
 		 449 aa  67.8  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0144  extracellular solute-binding protein  29.37 
 
 		 403 aa  68.2  0.0000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.442205  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5711  sugar uptake ABC transporter periplasmic solute-binding protein precursor  22.79 
 
 		 448 aa  67.8  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.188634  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3143  extracellular solute-binding protein  21.97 
 
 		 473 aa  67.4  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.536467  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0375  extracellular solute-binding protein family 1  24.79 
 
 		 421 aa  67.4  0.0000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0829  extracellular solute-binding protein family 1  23.05 
 
 		 465 aa  67.4  0.0000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.308126 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1846  extracellular solute-binding protein family 1  25.22 
 
 		 425 aa  67.4  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.169612  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0803  extracellular solute-binding protein  26.5 
 
 		 433 aa  67  0.0000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.437157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4241  extracellular solute-binding protein family 1  24.86 
 
 		 422 aa  65.9  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0922  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  28.99 
 
 		 447 aa  66.2  0.000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.755265  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  24.76 
 
 		 427 aa  66.2  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1511  extracellular solute-binding protein family 1  24.13 
 
 		 424 aa  65.9  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0921  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  29.94 
 
 		 458 aa  66.2  0.000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4320  extracellular solute-binding protein family 1  22.9 
 
 		 425 aa  65.9  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.811375  hitchhiker  0.00841489 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  22.03 
 
 		 423 aa  66.2  0.000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1494  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  25.28 
 
 		 438 aa  65.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06340  maltose-binding periplasmic protein  26.14 
 
 		 409 aa  65.5  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.211092  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>