181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3793 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3793  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 459 aa  935    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.46649  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1468  extracellular solute-binding protein family 1  36.96 
 
 		 457 aa  258  2e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0592  extracellular solute-binding protein  31.85 
 
 		 456 aa  191  2.9999999999999997e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000165278  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2218  extracellular solute-binding protein family 1  27.63 
 
 		 479 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00910899  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0795  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 460 aa  103  8e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.215252  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0513  extracellular solute-binding protein family 1  27.9 
 
 		 447 aa  102  1e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.000000038068  hitchhiker  0.000703825 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2731  extracellular solute-binding protein family 1  28.17 
 
 		 454 aa  101  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2513  extracellular solute-binding protein family 1  23.03 
 
 		 441 aa  94  5e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2524  extracellular solute-binding protein family 1  29.56 
 
 		 483 aa  83.6  0.000000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000000331289  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3566  extracellular solute-binding protein  23.62 
 
 		 454 aa  78.6  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.42847  normal  0.297516 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0719  extracellular solute-binding protein family 1  25.93 
 
 		 413 aa  77.4  0.0000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0236757  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1359  extracellular solute-binding protein  23.88 
 
 		 458 aa  77  0.0000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0378  extracellular solute-binding protein family 1  23.01 
 
 		 420 aa  76.6  0.0000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27690  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.65 
 
 		 431 aa  75.9  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.340884 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0375  extracellular solute-binding protein family 1  22.7 
 
 		 421 aa  75.1  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  24.01 
 
 		 427 aa  74.7  0.000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3106  ABC transporter, substrate binding periplasmic component  23.51 
 
 		 408 aa  73.2  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7906  extracellular solute-binding protein family 1  25.62 
 
 		 420 aa  71.6  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.819994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21150  carbohydrate-binding protein  25.81 
 
 		 428 aa  70.1  0.00000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.396929  normal  0.174783 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2451  extracellular solute-binding protein family 1  29.08 
 
 		 449 aa  70.5  0.00000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.135643  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3983  extracellular solute-binding protein family 1  27.96 
 
 		 456 aa  70.1  0.00000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  27.73 
 
 		 420 aa  69.3  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4621  extracellular solute-binding protein family 1  25.43 
 
 		 413 aa  68.2  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  28.01 
 
 		 411 aa  68.2  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3394  ABC-type sugar transport systems permease component  24 
 
 		 411 aa  67.8  0.0000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.498756  normal  0.24931 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0310  extracellular solute-binding protein family 1  28.3 
 
 		 443 aa  67.8  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  26.18 
 
 		 410 aa  67.4  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1634  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  22.94 
 
 		 416 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2504  extracellular solute-binding protein family 1  24.41 
 
 		 442 aa  66.2  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6572  extracellular solute-binding protein family 1  25.42 
 
 		 410 aa  66.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00103217  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0137  extracellular solute-binding protein family 1  24.38 
 
 		 453 aa  65.9  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4883  extracellular solute-binding protein family 1  23.58 
 
 		 436 aa  65.1  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.504344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2315  extracellular solute-binding protein family 1  24.88 
 
 		 503 aa  65.5  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0729  extracellular solute-binding protein family 1  24.43 
 
 		 443 aa  64.7  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000254304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29320  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.84 
 
 		 443 aa  65.1  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6156  extracellular solute-binding protein family 1  25.41 
 
 		 410 aa  64.7  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.889741  hitchhiker  0.000305646 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1899  extracellular solute-binding protein, putative  22.76 
 
 		 416 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.41529  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28390  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.5 
 
 		 453 aa  64.3  0.000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5398  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  23.46 
 
 		 403 aa  64.3  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.14652  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.33 
 
 		 419 aa  63.5  0.000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.033461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0427  extracellular solute-binding protein family 1  23.83 
 
 		 497 aa  63.5  0.000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0224  extracellular solute-binding protein  23.89 
 
 		 431 aa  63.5  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2267  extracellular solute-binding protein family 1  26.81 
 
 		 445 aa  63.5  0.000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00064551 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3957  extracellular solute-binding protein family 1  26.54 
 
 		 432 aa  63.2  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3386  extracellular solute-binding protein family 1  24.32 
 
 		 440 aa  62.8  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3216  extracellular solute-binding protein  28.76 
 
 		 425 aa  62.4  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.949389 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  22.88 
 
 		 424 aa  62  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0631  extracellular solute-binding protein family 1  26.35 
 
 		 435 aa  62.4  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2703  extracellular solute-binding protein family 1  24.43 
 
 		 450 aa  62.4  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263225  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0183  extracellular solute-binding protein family 1  24.45 
 
 		 429 aa  61.6  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0144  extracellular solute-binding protein  25.22 
 
 		 403 aa  60.8  0.00000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.442205  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0656  extracellular solute-binding protein family 1  28.18 
 
 		 431 aa  60.8  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.31335 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  22.22 
 
 		 414 aa  61.2  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3430  extracellular solute-binding protein family 1  21.14 
 
 		 415 aa  61.2  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0829  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 504 aa  60.5  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01900  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.78 
 
 		 442 aa  60.8  0.00000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.867357  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3712  extracellular solute-binding protein family 1  24.87 
 
 		 421 aa  60.8  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.411366 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0904  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  24.86 
 
 		 439 aa  60.5  0.00000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00221898  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2571  extracellular solute-binding protein  23 
 
 		 417 aa  60.5  0.00000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4984  extracellular solute-binding protein family 1  20.75 
 
 		 432 aa  60.1  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000108283  decreased coverage  0.000897425 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3149  extracellular solute-binding protein  25.28 
 
 		 427 aa  59.7  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6664  extracellular solute-binding protein  26.16 
 
 		 452 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0689323 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3121  extracellular solute-binding protein family 1  26.98 
 
 		 445 aa  59.7  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116931 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0845  extracellular solute-binding protein family 1  25.57 
 
 		 435 aa  59.7  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2603  extracellular solute-binding protein family 1  22.28 
 
 		 445 aa  59.3  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0144502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2546  extracellular solute-binding protein  26.19 
 
 		 488 aa  58.5  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.39868  normal  0.139719 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4488  extracellular solute-binding protein family 1  23.42 
 
 		 434 aa  58.5  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.395657  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1229  extracellular solute-binding protein  26.17 
 
 		 461 aa  57.8  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0257979  normal  0.868479 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2818  extracellular solute-binding protein  26.19 
 
 		 488 aa  57.8  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.179577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12341  periplasmic sugar-binding lipoprotein uspC  23.1 
 
 		 440 aa  57.8  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1296  extracellular solute-binding protein family 1  29.75 
 
 		 443 aa  57.8  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.190784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  23.64 
 
 		 424 aa  57.4  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2474  extracellular solute-binding protein family 1  22.67 
 
 		 484 aa  57  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000108946  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2726  extracellular solute-binding protein  22.41 
 
 		 437 aa  56.6  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.290956  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4632  extracellular solute-binding protein  26.57 
 
 		 419 aa  56.6  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.448727  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3270  extracellular solute-binding protein family 1  23.77 
 
 		 435 aa  56.6  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.543416  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5687  extracellular solute-binding protein family 1  23.1 
 
 		 401 aa  55.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.627079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0499  extracellular solute-binding protein family 1  27.94 
 
 		 434 aa  55.5  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000057577 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06270  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.61 
 
 		 426 aa  55.5  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4038  extracellular solute-binding protein family 1  22.05 
 
 		 405 aa  55.1  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6751  extracellular solute-binding protein family 1  24.54 
 
 		 441 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2294  extracellular solute-binding protein family 1  24.53 
 
 		 448 aa  54.3  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4148  extracellular solute-binding protein  24.2 
 
 		 426 aa  54.3  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0472509  normal  0.106363 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2819  extracellular solute-binding protein family 1  25.33 
 
 		 461 aa  53.5  0.000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.491227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4289  extracellular solute-binding protein  26.26 
 
 		 466 aa  53.1  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1105  extracellular solute-binding protein family 1  22.35 
 
 		 443 aa  53.5  0.000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.698754  normal  0.0706181 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2164  extracellular solute-binding protein family 1  26.79 
 
 		 435 aa  52.8  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4688  extracellular solute-binding protein family 1  25.17 
 
 		 418 aa  53.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3042  extracellular solute-binding protein  27 
 
 		 406 aa  52.4  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0658677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0780  extracellular solute-binding protein  26.29 
 
 		 436 aa  52.4  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4133  extracellular solute-binding protein family 1  22.87 
 
 		 426 aa  52  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5802  extracellular solute-binding protein family 1  24.01 
 
 		 444 aa  52.4  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0809589 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2574  extracellular solute-binding protein family 1  24.56 
 
 		 401 aa  52  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000602333  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0265  extracellular solute-binding protein family 1  27.78 
 
 		 510 aa  52  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  21.36 
 
 		 427 aa  52.4  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4993  extracellular solute-binding protein family 1  23.43 
 
 		 432 aa  51.6  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0450999  normal  0.012477 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4320  extracellular solute-binding protein family 1  27.18 
 
 		 425 aa  51.6  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.811375  hitchhiker  0.00841489 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5349  extracellular solute-binding protein family 1  24.11 
 
 		 406 aa  51.2  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.535832 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2365  extracellular solute-binding protein family 1  28.23 
 
 		 416 aa  51.2  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.618021 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0659  extracellular solute-binding protein family 1  22.94 
 
 		 425 aa  50.8  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.579585  normal  0.728331 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>