More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_0399 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_0399  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 
408 aa  822    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000195685  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  52.87 
 
 
420 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0913  extracellular solute-binding protein family 1  38.9 
 
 
421 aa  260  4e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  40 
 
 
422 aa  254  3e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2267  extracellular solute-binding protein family 1  37.87 
 
 
445 aa  240  4e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00064551 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3042  extracellular solute-binding protein  35.37 
 
 
406 aa  220  3.9999999999999997e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0658677  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4083  extracellular solute-binding protein family 1  35.04 
 
 
417 aa  207  3e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1138  extracellular solute-binding protein family 1  32.29 
 
 
423 aa  186  5e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.443513  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00380  extracellular solute-binding protein family 1  34.16 
 
 
422 aa  177  3e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6732  extracellular solute-binding protein family 1  35.83 
 
 
425 aa  176  5e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.255639  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06340  maltose-binding periplasmic protein  31.67 
 
 
409 aa  175  9.999999999999999e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.211092  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1152  extracellular solute-binding protein  35.28 
 
 
393 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0401617  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0144  extracellular solute-binding protein  30.51 
 
 
403 aa  173  5e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.442205  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2714  extracellular solute-binding protein family 1  35.59 
 
 
414 aa  173  5.999999999999999e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.36636  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1955  extracellular solute-binding protein family 1  31.17 
 
 
419 aa  171  2e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.974693  hitchhiker  0.000475348 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3956  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  31.71 
 
 
416 aa  166  5.9999999999999996e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.282171  normal  0.0187852 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0630  extracellular solute-binding protein family 1  31.36 
 
 
410 aa  156  6e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.505283 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2792  extracellular solute-binding protein family 1  33.58 
 
 
411 aa  152  1e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.199618 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0751  extracellular solute-binding protein  31.32 
 
 
411 aa  151  3e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0314212  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1899  extracellular solute-binding protein, putative  28.84 
 
 
416 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.41529  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1634  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  28.84 
 
 
416 aa  134  3e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0381  extracellular solute-binding protein family 1  24.94 
 
 
421 aa  134  3.9999999999999996e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3149  extracellular solute-binding protein  28.34 
 
 
427 aa  131  3e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1099  extracellular solute-binding protein  28.44 
 
 
457 aa  130  6e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4688  extracellular solute-binding protein family 1  31.33 
 
 
418 aa  127  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  25.93 
 
 
414 aa  123  6e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  29.11 
 
 
427 aa  120  3.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1017  extracellular solute-binding protein  28.38 
 
 
417 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0416471  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2451  extracellular solute-binding protein family 1  27.65 
 
 
449 aa  119  7e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.135643  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  28.77 
 
 
414 aa  119  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06270  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.07 
 
 
426 aa  118  1.9999999999999998e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2571  extracellular solute-binding protein  27.1 
 
 
417 aa  117  3.9999999999999997e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0795  extracellular solute-binding protein family 1  26.26 
 
 
460 aa  115  2.0000000000000002e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.215252  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  28.92 
 
 
411 aa  114  3e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7906  extracellular solute-binding protein family 1  28.21 
 
 
420 aa  113  6e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.819994  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3465  extracellular solute-binding protein  29.79 
 
 
411 aa  112  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2164  extracellular solute-binding protein family 1  27.97 
 
 
435 aa  110  3e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0405  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  29.97 
 
 
438 aa  106  7e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3251  extracellular solute-binding protein family 1  30.36 
 
 
427 aa  105  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0253  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.36 
 
 
424 aa  105  2e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  27.69 
 
 
428 aa  104  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1229  extracellular solute-binding protein  24.66 
 
 
461 aa  104  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0257979  normal  0.868479 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4320  extracellular solute-binding protein family 1  26.88 
 
 
425 aa  104  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.811375  hitchhiker  0.00841489 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.55 
 
 
430 aa  103  6e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4621  extracellular solute-binding protein family 1  28.32 
 
 
413 aa  103  7e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  25.75 
 
 
429 aa  103  7e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  26.55 
 
 
431 aa  102  9e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6904  extracellular solute-binding protein family 1  26.8 
 
 
404 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000382644  hitchhiker  0.00751503 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2731  extracellular solute-binding protein family 1  28.57 
 
 
454 aa  101  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4289  extracellular solute-binding protein  23.81 
 
 
466 aa  100  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0378  extracellular solute-binding protein family 1  26.55 
 
 
420 aa  100  5e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0420  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  26.99 
 
 
410 aa  100  6e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.67 
 
 
426 aa  100  6e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2546  extracellular solute-binding protein  28.02 
 
 
488 aa  99.8  7e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.39868  normal  0.139719 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7208  extracellular solute-binding protein family 1  28.05 
 
 
410 aa  99.8  8e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2818  extracellular solute-binding protein  27.27 
 
 
488 aa  99.8  8e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.179577  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0719  extracellular solute-binding protein family 1  29.85 
 
 
413 aa  99.4  9e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0236757  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  29.56 
 
 
430 aa  99  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0385  extracellular solute-binding protein family 1  32.74 
 
 
410 aa  98.6  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0390662 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0829  extracellular solute-binding protein family 1  23.86 
 
 
465 aa  97.1  5e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.308126 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3240  extracellular solute-binding protein  27.19 
 
 
434 aa  97.1  5e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3983  extracellular solute-binding protein family 1  27.53 
 
 
456 aa  97.1  6e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2552  extracellular solute-binding protein  23.76 
 
 
443 aa  96.3  8e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000382941 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0348  extracellular solute-binding protein family 1  30.67 
 
 
419 aa  95.9  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  27.86 
 
 
411 aa  95.5  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0375  extracellular solute-binding protein family 1  27.01 
 
 
421 aa  96.3  1e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2504  extracellular solute-binding protein family 1  25.63 
 
 
442 aa  95.1  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  27.86 
 
 
435 aa  95.5  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  28.29 
 
 
411 aa  94.7  3e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0698  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  28.29 
 
 
366 aa  94.4  3e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436581  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4883  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  27.16 
 
 
417 aa  94.4  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.134037  normal  0.0630481 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1655  extracellular solute-binding protein family 1  22.84 
 
 
425 aa  94.4  4e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186521  normal  0.186231 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  29.27 
 
 
415 aa  93.6  6e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2218  extracellular solute-binding protein family 1  26.02 
 
 
479 aa  93.2  7e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00910899  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3988  extracellular solute-binding protein family 1  26.56 
 
 
422 aa  93.2  7e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3143  extracellular solute-binding protein  22.96 
 
 
473 aa  92.8  9e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.536467  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4057  extracellular solute-binding protein  26.67 
 
 
410 aa  92  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0690  extracellular solute-binding protein  25.65 
 
 
402 aa  91.7  2e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.678935  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27690  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.78 
 
 
431 aa  91.3  3e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.340884 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2758  extracellular solute-binding protein family 1  28.19 
 
 
423 aa  90.9  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.736779  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4644  extracellular solute-binding protein  28.63 
 
 
409 aa  90.9  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0265502  normal  0.0904039 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2582  extracellular solute-binding protein family 1  25.83 
 
 
416 aa  90.9  4e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2403  extracellular solute-binding protein  23.41 
 
 
441 aa  90.1  6e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0224  extracellular solute-binding protein  24.58 
 
 
431 aa  89.7  8e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4632  extracellular solute-binding protein  27.68 
 
 
419 aa  89.4  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.448727  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0803  extracellular solute-binding protein  28.75 
 
 
433 aa  89  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.437157  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19770  extracellular solute-binding protein family 1  30.84 
 
 
423 aa  89.4  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3271  extracellular solute-binding protein family 1  22.66 
 
 
473 aa  88.2  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1999  extracellular solute-binding protein family 1  26.2 
 
 
468 aa  88.6  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21150  carbohydrate-binding protein  27.42 
 
 
428 aa  88.6  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.396929  normal  0.174783 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2315  extracellular solute-binding protein family 1  25.61 
 
 
503 aa  88.6  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0747  extracellular solute-binding protein  26.72 
 
 
433 aa  88.6  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3387  extracellular solute-binding protein  27.51 
 
 
447 aa  88.2  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.278202  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0434  extracellular solute-binding protein  27.59 
 
 
452 aa  87.8  3e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.396307 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3538  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  26.63 
 
 
406 aa  87.8  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.385239  normal 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  29.39 
 
 
407 aa  87.8  3e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1262  extracellular solute-binding protein  26.51 
 
 
408 aa  87.4  4e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.953049  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2730  extracellular solute-binding protein family 1  23.31 
 
 
399 aa  87.4  4e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0291  extracellular solute-binding protein  26.23 
 
 
449 aa  87  5e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1291  extracellular solute-binding protein  29.26 
 
 
461 aa  86.7  7e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>