More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4883 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4883  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  100 
 
 		 417 aa  843    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.134037  normal  0.0630481 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.98 
 
 		 407 aa  112  1.0000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2574  extracellular solute-binding protein family 1  26.18 
 
 		 453 aa  102  9e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  29.18 
 
 		 422 aa  102  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  26.37 
 
 		 424 aa  101  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3422  ABC-type sugar transport systems permease component  23.86 
 
 		 410 aa  99.8  7e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3226  Transcriptional regulator  23.86 
 
 		 410 aa  99.8  7e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  26.3 
 
 		 420 aa  97.8  3e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0399  extracellular solute-binding protein family 1  27.16 
 
 		 408 aa  94.7  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000195685  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0514  extracellular solute-binding protein family 1  25.47 
 
 		 426 aa  94  5e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2267  extracellular solute-binding protein family 1  25.75 
 
 		 445 aa  89.7  9e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00064551 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1099  extracellular solute-binding protein  24.24 
 
 		 457 aa  89.4  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3042  extracellular solute-binding protein  27.33 
 
 		 406 aa  89  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0658677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0203  extracellular solute-binding protein family 1  25.06 
 
 		 441 aa  87.8  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.346278  normal  0.123927 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1484  extracellular solute-binding protein  26.44 
 
 		 444 aa  87  6e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000980441  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  27.9 
 
 		 414 aa  86.3  9e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1702  extracellular solute-binding protein  23.56 
 
 		 422 aa  86.3  9e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.57478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06340  maltose-binding periplasmic protein  30.33 
 
 		 409 aa  86.3  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.211092  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1296  extracellular solute-binding protein family 1  25.06 
 
 		 443 aa  84.7  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.190784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4159  extracellular solute-binding protein  29.38 
 
 		 421 aa  83.6  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.119299  normal  0.873951 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6732  extracellular solute-binding protein family 1  26.2 
 
 		 425 aa  81.6  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.255639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3622  extracellular solute-binding protein family 1  28.93 
 
 		 412 aa  81.3  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3983  extracellular solute-binding protein family 1  27.25 
 
 		 456 aa  80.1  0.00000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3910  extracellular solute-binding protein family 1  28.72 
 
 		 412 aa  79.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.198843 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  26.83 
 
 		 410 aa  78.6  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  23.8 
 
 		 424 aa  77.8  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  22.73 
 
 		 399 aa  78.2  0.0000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2146  extracellular solute-binding protein  25.37 
 
 		 414 aa  77.4  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0118  extracellular solute-binding protein  32.34 
 
 		 420 aa  77  0.0000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21150  carbohydrate-binding protein  25.12 
 
 		 428 aa  77.4  0.0000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.396929  normal  0.174783 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0116  extracellular solute-binding protein  32.34 
 
 		 420 aa  77  0.0000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  21.32 
 
 		 427 aa  76.3  0.0000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6156  extracellular solute-binding protein family 1  27.42 
 
 		 410 aa  76.3  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.889741  hitchhiker  0.000305646 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3465  extracellular solute-binding protein  27.71 
 
 		 411 aa  75.9  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6572  extracellular solute-binding protein family 1  27.94 
 
 		 410 aa  75.9  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00103217  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3393  extracellular solute-binding protein family 1  24.79 
 
 		 412 aa  76.3  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.205631 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1955  extracellular solute-binding protein family 1  28.63 
 
 		 419 aa  75.1  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.974693  hitchhiker  0.000475348 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3121  extracellular solute-binding protein family 1  27.27 
 
 		 445 aa  75.1  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116931 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3988  extracellular solute-binding protein family 1  23.58 
 
 		 422 aa  74.7  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3121  extracellular solute-binding protein family 1  24.79 
 
 		 412 aa  74.7  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4557  extracellular solute-binding protein  25.36 
 
 		 412 aa  74.3  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6751  extracellular solute-binding protein family 1  25.93 
 
 		 441 aa  73.9  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0420  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  27.06 
 
 		 410 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  25.08 
 
 		 414 aa  73.2  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1522  extracellular solute-binding protein family 1  26.95 
 
 		 421 aa  73.2  0.000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.569671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3944  extracellular solute-binding protein  28.76 
 
 		 464 aa  72.4  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.920276  normal  0.0416082 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1899  extracellular solute-binding protein, putative  24.14 
 
 		 416 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.41529  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1634  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  24.14 
 
 		 416 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1698  extracellular solute-binding protein family 1  26.67 
 
 		 447 aa  72.4  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  26.79 
 
 		 415 aa  71.2  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0224  extracellular solute-binding protein  28.89 
 
 		 431 aa  71.6  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5398  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  28.63 
 
 		 403 aa  71.6  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.14652  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0289  extracellular solute-binding protein  24.05 
 
 		 437 aa  70.5  0.00000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.00000019091  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3000  extracellular solute-binding protein family 1  23.49 
 
 		 450 aa  70.1  0.00000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6904  extracellular solute-binding protein family 1  24.69 
 
 		 404 aa  69.7  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000382644  hitchhiker  0.00751503 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4083  extracellular solute-binding protein family 1  26.35 
 
 		 417 aa  70.1  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  23.61 
 
 		 423 aa  69.3  0.0000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7208  extracellular solute-binding protein family 1  26.74 
 
 		 410 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0690  extracellular solute-binding protein  26.34 
 
 		 402 aa  68.9  0.0000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.678935  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0427  extracellular solute-binding protein family 1  26.7 
 
 		 497 aa  69.3  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3712  extracellular solute-binding protein family 1  25.14 
 
 		 421 aa  68.6  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.411366 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0523  extracellular solute-binding protein  28.72 
 
 		 416 aa  68.6  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4057  extracellular solute-binding protein  27.11 
 
 		 410 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1711  extracellular solute-binding protein family 1  23.29 
 
 		 454 aa  68.2  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.795485  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0310  extracellular solute-binding protein family 1  25.66 
 
 		 443 aa  67.8  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2714  extracellular solute-binding protein family 1  25.1 
 
 		 414 aa  68.2  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.36636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0349  glycerol-3-phosphate ABC transporter, periplasmic glycerol-3-phosphate-binding protein  27.68 
 
 		 441 aa  68.2  0.0000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2731  extracellular solute-binding protein family 1  24.43 
 
 		 454 aa  68.2  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1846  extracellular solute-binding protein family 1  26.03 
 
 		 425 aa  68.2  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.169612  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2683  extracellular solute-binding protein family 1  23.29 
 
 		 446 aa  67.8  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.77 
 
 		 430 aa  68.2  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2834  extracellular solute-binding protein  27.27 
 
 		 459 aa  67.4  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.873121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0144  extracellular solute-binding protein  23.26 
 
 		 403 aa  67.4  0.0000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.442205  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.31 
 
 		 419 aa  67.4  0.0000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.033461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2582  extracellular solute-binding protein family 1  27.04 
 
 		 416 aa  67.4  0.0000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3216  extracellular solute-binding protein  27.83 
 
 		 425 aa  67  0.0000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.949389 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0513  extracellular solute-binding protein family 1  23.91 
 
 		 447 aa  67  0.0000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.000000038068  hitchhiker  0.000703825 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2297  extracellular solute-binding protein  24.03 
 
 		 416 aa  67  0.0000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.33558  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0721  extracellular solute-binding protein  27.47 
 
 		 437 aa  67  0.0000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.540981  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  24.2 
 
 		 411 aa  66.6  0.0000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15380  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23 
 
 		 465 aa  66.6  0.0000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.479356  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1895  extracellular solute-binding protein  27.16 
 
 		 445 aa  66.6  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.854658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0751  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 411 aa  66.2  0.0000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0314212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2832  extracellular solute-binding protein family 1  23.48 
 
 		 417 aa  65.9  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6528  extracellular solute-binding protein family 1  25.37 
 
 		 415 aa  66.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0147922 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0889  extracellular solute-binding protein  26.49 
 
 		 435 aa  65.9  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4993  extracellular solute-binding protein family 1  26.14 
 
 		 432 aa  65.5  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0450999  normal  0.012477 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3538  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  25.74 
 
 		 406 aa  65.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.385239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0117  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  27.61 
 
 		 444 aa  65.1  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1696  extracellular solute-binding protein  26.09 
 
 		 436 aa  65.5  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00506774  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4468  extracellular solute-binding protein  24.26 
 
 		 436 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.68 
 
 		 426 aa  65.1  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1494  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  29.11 
 
 		 438 aa  65.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0303  extracellular solute-binding protein family 1  28.22 
 
 		 478 aa  65.1  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.105454 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2164  extracellular solute-binding protein family 1  26.67 
 
 		 435 aa  65.1  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1138  extracellular solute-binding protein family 1  24.03 
 
 		 423 aa  65.1  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.443513  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1331  extracellular solute-binding protein family 1  24.92 
 
 		 464 aa  65.5  0.000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4148  extracellular solute-binding protein  24.91 
 
 		 426 aa  64.3  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0472509  normal  0.106363 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0297  extracellular solute-binding protein family 1  27.62 
 
 		 453 aa  65.1  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0248346 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1708  extracellular solute-binding protein family 1  25.14 
 
 		 458 aa  64.3  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.190784  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>