More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3000 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3000  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 450 aa  912    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01220  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  46.93 
 
 		 466 aa  447  1.0000000000000001e-124  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1017  extracellular solute-binding protein  31.55 
 
 		 417 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0416471  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1099  extracellular solute-binding protein  29.64 
 
 		 457 aa  188  2e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2042  extracellular solute-binding protein family 1  27.21 
 
 		 483 aa  109  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000305417  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  28.29 
 
 		 415 aa  98.6  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0508  extracellular solute-binding protein family 1  27.21 
 
 		 514 aa  98.6  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1453  extracellular solute-binding protein  24.01 
 
 		 415 aa  92.4  1e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0104666  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3988  extracellular solute-binding protein family 1  26.04 
 
 		 422 aa  92.4  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3538  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  25.23 
 
 		 406 aa  87.8  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.385239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3216  extracellular solute-binding protein  26.22 
 
 		 425 aa  86.7  7e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.949389 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1748  extracellular solute-binding protein  25.88 
 
 		 481 aa  86.7  9e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.922527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.37 
 
 		 407 aa  83.6  0.000000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  25.38 
 
 		 429 aa  82.4  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  23.8 
 
 		 431 aa  80.9  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3121  extracellular solute-binding protein family 1  22.15 
 
 		 445 aa  79.3  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116931 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  24.6 
 
 		 422 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.84 
 
 		 426 aa  78.6  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2552  extracellular solute-binding protein  25.87 
 
 		 443 aa  77.8  0.0000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000382941 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0203  extracellular solute-binding protein family 1  24.94 
 
 		 441 aa  77  0.0000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.346278  normal  0.123927 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3910  extracellular solute-binding protein family 1  24.93 
 
 		 412 aa  77  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.198843 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00880  ABC transporter sugar binding protein  23.29 
 
 		 440 aa  76.6  0.0000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106592  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1680  extracellular solute-binding protein family 1  25.68 
 
 		 430 aa  75.9  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.173253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0348  extracellular solute-binding protein family 1  25.28 
 
 		 419 aa  75.1  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2683  extracellular solute-binding protein family 1  24.89 
 
 		 446 aa  75.5  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  25.19 
 
 		 430 aa  75.9  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2137  extracellular solute-binding protein family 1  22.48 
 
 		 467 aa  75.1  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5820  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  25.26 
 
 		 447 aa  75.1  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3422  ABC-type sugar transport systems permease component  24.32 
 
 		 410 aa  74.7  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3226  Transcriptional regulator  24.32 
 
 		 410 aa  74.7  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0753  extracellular solute-binding protein  28.18 
 
 		 437 aa  74.3  0.000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1696  extracellular solute-binding protein  26.92 
 
 		 436 aa  73.6  0.000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00506774  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1229  extracellular solute-binding protein  21.77 
 
 		 461 aa  73.6  0.000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0257979  normal  0.868479 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2485  extracellular solute-binding protein  23.27 
 
 		 415 aa  73.2  0.000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00421769  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3622  extracellular solute-binding protein family 1  24.93 
 
 		 412 aa  72.8  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  22.49 
 
 		 399 aa  72  0.00000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0192  extracellular solute-binding protein family 1  28.79 
 
 		 444 aa  70.9  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.25123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0690  extracellular solute-binding protein  21.85 
 
 		 402 aa  71.2  0.00000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.678935  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1702  extracellular solute-binding protein  21.41 
 
 		 422 aa  70.5  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.57478  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1085  extracellular solute-binding protein family 1  26.49 
 
 		 451 aa  70.5  0.00000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.474529 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2614  extracellular solute-binding protein family 1  21.14 
 
 		 461 aa  70.1  0.00000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000017055  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  23.54 
 
 		 420 aa  69.7  0.00000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0427  extracellular solute-binding protein family 1  30.06 
 
 		 497 aa  69.7  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4083  extracellular solute-binding protein family 1  24.79 
 
 		 417 aa  69.7  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2403  extracellular solute-binding protein  25.13 
 
 		 441 aa  69.7  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2504  extracellular solute-binding protein family 1  23.84 
 
 		 442 aa  69.7  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0648  extracellular solute-binding protein family 1  25.7 
 
 		 447 aa  69.7  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15380  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  30.37 
 
 		 465 aa  69.3  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.479356  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3042  extracellular solute-binding protein  23.64 
 
 		 406 aa  68.6  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0658677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20470  extracellular solute-binding protein family 1  22.86 
 
 		 406 aa  68.9  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000403753  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4883  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  23.8 
 
 		 417 aa  68.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.134037  normal  0.0630481 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0803  extracellular solute-binding protein  26.16 
 
 		 433 aa  68.6  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.437157  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  23.1 
 
 		 411 aa  68.2  0.0000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2876  extracellular solute-binding protein family 1  26.65 
 
 		 451 aa  68.6  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00736508 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1392  extracellular solute-binding protein family 1  22.81 
 
 		 445 aa  67.8  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6572  extracellular solute-binding protein family 1  21.09 
 
 		 410 aa  67.8  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00103217  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4488  extracellular solute-binding protein family 1  22.95 
 
 		 434 aa  67.4  0.0000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.395657  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  22.96 
 
 		 435 aa  67  0.0000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1152  extracellular solute-binding protein  30.77 
 
 		 393 aa  67  0.0000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0401617  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  22.38 
 
 		 411 aa  66.6  0.0000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6528  extracellular solute-binding protein family 1  22.08 
 
 		 415 aa  66.6  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0147922 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5852  extracellular solute-binding protein family 1  25.43 
 
 		 419 aa  66.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0747  extracellular solute-binding protein  25.97 
 
 		 433 aa  66.2  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6156  extracellular solute-binding protein family 1  21.09 
 
 		 410 aa  65.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.889741  hitchhiker  0.000305646 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3276  extracellular solute-binding protein family 1  22.99 
 
 		 420 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.147153  normal  0.336546 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0514  extracellular solute-binding protein family 1  24.62 
 
 		 426 aa  65.5  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4289  extracellular solute-binding protein  23.16 
 
 		 466 aa  64.7  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0289  extracellular solute-binding protein  25.93 
 
 		 437 aa  65.1  0.000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.00000019091  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0721  extracellular solute-binding protein  25.93 
 
 		 437 aa  64.7  0.000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.540981  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1454  extracellular solute-binding protein family 1  23.44 
 
 		 445 aa  64.7  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.71759  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1698  extracellular solute-binding protein family 1  26.88 
 
 		 447 aa  64.7  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3430  extracellular solute-binding protein family 1  25.31 
 
 		 415 aa  64.3  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4147  extracellular solute-binding protein family 1  33.82 
 
 		 441 aa  64.3  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.892231  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  22.49 
 
 		 415 aa  63.9  0.000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2274  extracellular solute-binding protein family 1  25.99 
 
 		 428 aa  63.9  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.837023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2267  extracellular solute-binding protein family 1  31.39 
 
 		 445 aa  64.3  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00064551 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6765  extracellular solute-binding protein family 1  24.69 
 
 		 419 aa  63.9  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.979933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2451  extracellular solute-binding protein family 1  27.04 
 
 		 449 aa  63.5  0.000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.135643  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7695  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  23.48 
 
 		 435 aa  63.2  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.397837  normal  0.53163 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0698  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  23.14 
 
 		 366 aa  63.2  0.000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436581  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4159  extracellular solute-binding protein  24.3 
 
 		 421 aa  63.2  0.000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.119299  normal  0.873951 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  20.94 
 
 		 423 aa  62.8  0.00000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0310  extracellular solute-binding protein family 1  24.41 
 
 		 443 aa  62.8  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0719  extracellular solute-binding protein family 1  24.48 
 
 		 413 aa  62.8  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0236757  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  22.45 
 
 		 428 aa  62.8  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7208  extracellular solute-binding protein family 1  24.72 
 
 		 410 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5398  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  21.76 
 
 		 403 aa  62  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.14652  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16660  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.72 
 
 		 406 aa  62  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.613471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2303  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 480 aa  62.4  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.316955  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1020  extracellular solute-binding protein  23.26 
 
 		 459 aa  61.6  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000124434  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  22.43 
 
 		 427 aa  62  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2571  extracellular solute-binding protein  30.89 
 
 		 417 aa  62.4  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4863  extracellular solute-binding protein family 1  28.32 
 
 		 492 aa  61.6  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.426159 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1484  extracellular solute-binding protein  23.89 
 
 		 444 aa  61.2  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000980441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  27.44 
 
 		 414 aa  61.6  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  20.92 
 
 		 414 aa  61.6  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3329  extracellular solute-binding protein  21.36 
 
 		 431 aa  61.6  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0332045  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  24.53 
 
 		 424 aa  61.2  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3553  hypothetical protein  23.65 
 
 		 427 aa  61.6  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4057  extracellular solute-binding protein  23.35 
 
 		 410 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>