More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4988 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 414 aa  846    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4688  extracellular solute-binding protein family 1  46.25 
 
 		 418 aa  356  3.9999999999999996e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7906  extracellular solute-binding protein family 1  43.48 
 
 		 420 aa  300  2e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.819994  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1899  extracellular solute-binding protein, putative  37.35 
 
 		 416 aa  294  2e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.41529  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1634  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  37.35 
 
 		 416 aa  294  2e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1655  extracellular solute-binding protein family 1  39.24 
 
 		 425 aa  280  3e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186521  normal  0.186231 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  34.76 
 
 		 427 aa  269  7e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2164  extracellular solute-binding protein family 1  37.38 
 
 		 435 aa  259  6e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06270  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  32.17 
 
 		 426 aa  238  1e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  32.41 
 
 		 430 aa  231  1e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2571  extracellular solute-binding protein  35.37 
 
 		 417 aa  203  5e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4632  extracellular solute-binding protein  29.71 
 
 		 419 aa  159  9e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.448727  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0795  extracellular solute-binding protein family 1  28.12 
 
 		 460 aa  159  1e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.215252  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0381  extracellular solute-binding protein family 1  30.64 
 
 		 421 aa  151  2e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2267  extracellular solute-binding protein family 1  28.83 
 
 		 445 aa  144  3e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00064551 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0183  extracellular solute-binding protein family 1  31.31 
 
 		 429 aa  130  3e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  26.71 
 
 		 420 aa  130  6e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0378  extracellular solute-binding protein family 1  27.79 
 
 		 420 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2731  extracellular solute-binding protein family 1  28.9 
 
 		 454 aa  124  4e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0375  extracellular solute-binding protein family 1  26.55 
 
 		 421 aa  122  9.999999999999999e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2504  extracellular solute-binding protein family 1  31.03 
 
 		 442 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4883  extracellular solute-binding protein family 1  33.33 
 
 		 436 aa  120  6e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.504344  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0399  extracellular solute-binding protein family 1  26.28 
 
 		 408 aa  119  9e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000195685  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0137  extracellular solute-binding protein family 1  25.97 
 
 		 453 aa  119  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0729  extracellular solute-binding protein family 1  31.33 
 
 		 443 aa  117  3e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000254304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3983  extracellular solute-binding protein family 1  26.41 
 
 		 456 aa  117  5e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0437  extracellular solute-binding protein family 1  25.4 
 
 		 424 aa  116  8.999999999999998e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000010114  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5349  extracellular solute-binding protein family 1  25.94 
 
 		 406 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.535832 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  26.81 
 
 		 424 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27690  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.08 
 
 		 431 aa  114  3e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.340884 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2315  extracellular solute-binding protein family 1  32.67 
 
 		 503 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  26.03 
 
 		 411 aa  113  7.000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 422 aa  109  7.000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3149  extracellular solute-binding protein  25.57 
 
 		 427 aa  109  8.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1099  extracellular solute-binding protein  27.49 
 
 		 457 aa  109  8.000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4697  extracellular solute-binding protein family 1  33.73 
 
 		 442 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00367387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  26.79 
 
 		 415 aa  109  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3566  extracellular solute-binding protein  29.41 
 
 		 454 aa  109  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.42847  normal  0.297516 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0719  extracellular solute-binding protein family 1  27.27 
 
 		 413 aa  108  2e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0236757  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  28.85 
 
 		 424 aa  108  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2818  extracellular solute-binding protein  27.48 
 
 		 488 aa  108  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.179577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12341  periplasmic sugar-binding lipoprotein uspC  27.2 
 
 		 440 aa  108  2e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2524  extracellular solute-binding protein family 1  27.52 
 
 		 483 aa  108  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000000331289  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2546  extracellular solute-binding protein  27.8 
 
 		 488 aa  107  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.39868  normal  0.139719 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0513  extracellular solute-binding protein family 1  26.54 
 
 		 447 aa  107  3e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.000000038068  hitchhiker  0.000703825 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4320  extracellular solute-binding protein family 1  28.66 
 
 		 425 aa  106  6e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.811375  hitchhiker  0.00841489 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0829  extracellular solute-binding protein family 1  28.53 
 
 		 504 aa  106  6e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2714  extracellular solute-binding protein family 1  26.73 
 
 		 414 aa  106  7e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.36636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  26.35 
 
 		 414 aa  105  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1680  extracellular solute-binding protein family 1  28.72 
 
 		 430 aa  105  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.173253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3566  extracellular solute-binding protein family 1  25.98 
 
 		 426 aa  105  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.09 
 
 		 407 aa  105  1e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1152  extracellular solute-binding protein  28.53 
 
 		 393 aa  105  2e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0401617  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0118  extracellular solute-binding protein  27.54 
 
 		 420 aa  105  2e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0116  extracellular solute-binding protein  27.54 
 
 		 420 aa  105  2e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0592  extracellular solute-binding protein  26.53 
 
 		 456 aa  105  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000165278  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07450  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.44 
 
 		 464 aa  104  3e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  24.08 
 
 		 428 aa  103  4e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2460  extracellular solute-binding protein family 1  26.65 
 
 		 441 aa  103  6e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.372805  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4621  extracellular solute-binding protein family 1  27.25 
 
 		 413 aa  103  7e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3712  extracellular solute-binding protein family 1  29.39 
 
 		 421 aa  102  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.411366 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  26.69 
 
 		 423 aa  102  1e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1522  extracellular solute-binding protein family 1  26.85 
 
 		 421 aa  102  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.569671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1359  extracellular solute-binding protein  30.45 
 
 		 458 aa  100  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3131  extracellular solute-binding protein family 1  26.53 
 
 		 422 aa  101  3e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00803878 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2513  extracellular solute-binding protein family 1  28.07 
 
 		 441 aa  100  4e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4057  extracellular solute-binding protein  31.85 
 
 		 410 aa  100  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5802  extracellular solute-binding protein family 1  28.35 
 
 		 444 aa  100  5e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0809589 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  28.19 
 
 		 411 aa  100  6e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3450  extracellular solute-binding protein family 1  26.93 
 
 		 436 aa  99  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  28.28 
 
 		 431 aa  99.4  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2703  extracellular solute-binding protein family 1  23.64 
 
 		 450 aa  99.4  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263225  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3957  extracellular solute-binding protein family 1  27.74 
 
 		 432 aa  99.4  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3329  extracellular solute-binding protein  26.12 
 
 		 431 aa  98.2  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0332045  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3538  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  30.51 
 
 		 406 aa  98.2  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.385239  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2036  extracellular solute-binding protein family 1  24.79 
 
 		 439 aa  97.4  4e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.182591  normal  0.899466 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4083  extracellular solute-binding protein family 1  24.93 
 
 		 417 aa  96.7  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3042  extracellular solute-binding protein  27.04 
 
 		 406 aa  96.7  7e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0658677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  27.85 
 
 		 411 aa  96.7  7e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3121  extracellular solute-binding protein family 1  29.3 
 
 		 445 aa  96.3  9e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116931 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3128  extracellular solute-binding protein family 1  26.73 
 
 		 450 aa  96.3  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0477771 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5331  extracellular solute-binding protein family 1  27.12 
 
 		 424 aa  95.9  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0913  extracellular solute-binding protein family 1  24.08 
 
 		 421 aa  95.9  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7208  extracellular solute-binding protein family 1  30.65 
 
 		 410 aa  95.5  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3808  extracellular solute-binding protein family 1  28 
 
 		 427 aa  95.1  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.750227 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.55 
 
 		 419 aa  95.5  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.033461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0420  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  26.05 
 
 		 410 aa  94.7  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3387  extracellular solute-binding protein  23.53 
 
 		 447 aa  94.7  3e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.278202  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  24.3 
 
 		 429 aa  94.7  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3752  extracellular solute-binding protein family 1  26.07 
 
 		 436 aa  94  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.561914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2315  extracellular solute-binding protein  28.47 
 
 		 455 aa  94  5e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.271919 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1750  extracellular solute-binding protein family 1  24.58 
 
 		 448 aa  93.6  6e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000348272 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05230  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  29.83 
 
 		 450 aa  93.2  8e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.808581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0045  extracellular solute-binding protein family 1  25.39 
 
 		 414 aa  92.8  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.713374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0698  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  29.92 
 
 		 366 aa  92.4  1e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436581  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3567  ABC transporter substrate binding protein (sorbitol)  25.73 
 
 		 439 aa  92.8  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  26.95 
 
 		 415 aa  91.7  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3119  extracellular solute-binding protein family 1  26.01 
 
 		 428 aa  91.3  3e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1090  extracellular solute-binding protein family 1  25.85 
 
 		 436 aa  91.3  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.667729  normal  0.0232634 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7695  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  27.39 
 
 		 435 aa  90.9  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.397837  normal  0.53163 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>