More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0437 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011661  Dtur_0437  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 424 aa  872    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000010114  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2081  extracellular solute-binding protein family 1  41.09 
 
 		 434 aa  283  3.0000000000000004e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.159947  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3329  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 		 431 aa  238  2e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0332045  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3329  extracellular solute-binding protein  33.41 
 
 		 428 aa  236  6e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.955635  normal  0.757839 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3131  extracellular solute-binding protein family 1  32.35 
 
 		 422 aa  232  9e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00803878 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3119  extracellular solute-binding protein family 1  33.33 
 
 		 428 aa  231  2e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0895  extracellular solute-binding protein family 1  33.33 
 
 		 436 aa  225  9e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.441999 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05230  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  32.08 
 
 		 450 aa  223  6e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.808581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4006  extracellular solute-binding protein family 1  32.25 
 
 		 428 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3326  extracellular solute-binding protein  33.82 
 
 		 453 aa  222  9.999999999999999e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00000398294  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1702  sugar-binding protein  33.42 
 
 		 442 aa  220  3.9999999999999997e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.981171  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3128  extracellular solute-binding protein family 1  32.84 
 
 		 450 aa  219  8.999999999999998e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0477771 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4335  extracellular solute-binding protein family 1  31.98 
 
 		 428 aa  218  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000444207 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0780  extracellular solute-binding protein  31.67 
 
 		 436 aa  217  2.9999999999999998e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3402  extracellular solute-binding protein  34.34 
 
 		 451 aa  216  5e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000236647  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4344  extracellular solute-binding protein family 1  31.71 
 
 		 428 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0302279  hitchhiker  0.00000351134 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3578  extracellular solute-binding protein  31.2 
 
 		 428 aa  214  2.9999999999999995e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.608798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1126  extracellular solute-binding protein  32.13 
 
 		 432 aa  213  7e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.190587  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2036  extracellular solute-binding protein family 1  29.47 
 
 		 439 aa  212  9e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.182591  normal  0.899466 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4015  extracellular solute-binding protein family 1  31.71 
 
 		 428 aa  210  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.946152  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1049  extracellular solute-binding protein family 1  32.16 
 
 		 437 aa  210  4e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.340866 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1199  extracellular solute-binding protein family 1  32.58 
 
 		 432 aa  209  8e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000829014 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5580  ABC transporter/Periplasmic pectin oligomer binding protein  30.32 
 
 		 427 aa  205  1e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2460  extracellular solute-binding protein family 1  32.5 
 
 		 441 aa  202  7e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.372805  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2537  extracellular solute-binding protein family 1  29.24 
 
 		 450 aa  200  5e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.272028  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29730  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  31.25 
 
 		 434 aa  191  2e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0919  extracellular solute-binding protein family 1  26.57 
 
 		 441 aa  184  3e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3324  extracellular solute-binding protein  32.78 
 
 		 427 aa  182  1e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000420771  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0589  extracellular solute-binding protein family 1  29.58 
 
 		 452 aa  178  1e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.289831  normal  0.0417818 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0897  extracellular solute-binding protein family 1  29.41 
 
 		 446 aa  177  3e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0316444  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0806  extracellular solute-binding protein family 1  27.34 
 
 		 437 aa  177  3e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0510551 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0697  extracellular solute-binding protein family 1  30.2 
 
 		 433 aa  176  5e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3124  extracellular solute-binding protein family 1  30.03 
 
 		 429 aa  174  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0621948 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3899  extracellular solute-binding protein family 1  29.33 
 
 		 435 aa  174  3.9999999999999995e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0970  extracellular solute-binding protein family 1  27.57 
 
 		 428 aa  172  9e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153801  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3369  extracellular solute-binding protein family 1  29.37 
 
 		 430 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0499  extracellular solute-binding protein family 1  27.79 
 
 		 434 aa  164  3e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000057577 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03450  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.23 
 
 		 416 aa  164  3e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.355174 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4050  extracellular solute-binding protein family 1  28.92 
 
 		 433 aa  160  3e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4051  extracellular solute-binding protein family 1  27.93 
 
 		 434 aa  160  3e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2037  extracellular solute-binding protein family 1  29.13 
 
 		 430 aa  160  4e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05420  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.02 
 
 		 438 aa  158  2e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0143899  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1966  extracellular solute-binding protein family 1  28.96 
 
 		 430 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.810983  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4040  extracellular solute-binding protein family 1  29.08 
 
 		 434 aa  154  4e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1904  extracellular solute-binding protein family 1  27.96 
 
 		 429 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.172949  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2376  extracellular solute-binding protein family 1  29.93 
 
 		 438 aa  147  3e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29740  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.09 
 
 		 437 aa  146  6e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2648  oligogalacturonide ABC transporter periplasmic oligogalacturonide-binding protein  27.68 
 
 		 430 aa  143  5e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.316005  normal  0.159215 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1688  oligogalacturonide ABC transporter, periplasmic oligogalacturonide-binding protein  27.68 
 
 		 430 aa  143  7e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0550228  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1798  extracellular solute-binding protein  27.68 
 
 		 430 aa  143  7e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.763472  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2197  extracellular solute-binding protein family 1  27.56 
 
 		 429 aa  142  9.999999999999999e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.700843  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0825  extracellular solute-binding protein family 1  27.82 
 
 		 429 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3784  extracellular solute-binding protein family 1  29.09 
 
 		 430 aa  139  1e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3557  extracellular solute-binding protein family 1  28.03 
 
 		 458 aa  137  4e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2647  extracellular solute-binding protein family 1  25.85 
 
 		 446 aa  135  9.999999999999999e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.890591  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3292  extracellular solute-binding protein  30 
 
 		 428 aa  134  1.9999999999999998e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.309737 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0777  extracellular solute-binding protein  27.08 
 
 		 428 aa  129  9.000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2102  extracellular solute-binding protein family 1  28.97 
 
 		 439 aa  127  5e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0793  extracellular solute-binding protein family 1  23.88 
 
 		 442 aa  125  2e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0145438 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2395  extracellular solute-binding protein family 1  28.96 
 
 		 451 aa  122  9.999999999999999e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  25.4 
 
 		 414 aa  116  8.999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0183  extracellular solute-binding protein family 1  28.22 
 
 		 429 aa  116  8.999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  27.25 
 
 		 427 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1534  extracellular solute-binding protein family 1  23.06 
 
 		 436 aa  109  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.191711  decreased coverage  0.00957964 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2571  extracellular solute-binding protein  26.46 
 
 		 417 aa  108  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1899  extracellular solute-binding protein, putative  25.8 
 
 		 416 aa  107  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.41529  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1634  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  25.8 
 
 		 416 aa  107  4e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.55 
 
 		 430 aa  101  2e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2228  extracellular solute-binding protein family 1  24.48 
 
 		 460 aa  98.6  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.754729 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06270  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.15 
 
 		 426 aa  87.8  3e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0381  extracellular solute-binding protein family 1  24.82 
 
 		 421 aa  86.7  8e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2267  extracellular solute-binding protein family 1  25.64 
 
 		 445 aa  86.7  8e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00064551 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0619  extracellular solute-binding protein  23.13 
 
 		 463 aa  86.3  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000037115  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6192  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  25 
 
 		 431 aa  86.3  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0222852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2164  extracellular solute-binding protein family 1  31.21 
 
 		 435 aa  84  0.000000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4688  extracellular solute-binding protein family 1  30.11 
 
 		 418 aa  84.3  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2731  extracellular solute-binding protein family 1  23.52 
 
 		 454 aa  84  0.000000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2315  extracellular solute-binding protein family 1  32.09 
 
 		 503 aa  83.6  0.000000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  24.47 
 
 		 411 aa  83.2  0.000000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  26.93 
 
 		 435 aa  82.8  0.000000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2144  extracellular solute-binding protein family 1  21.61 
 
 		 432 aa  82.8  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1655  extracellular solute-binding protein family 1  24.53 
 
 		 425 aa  82  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186521  normal  0.186231 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5802  extracellular solute-binding protein family 1  28.5 
 
 		 444 aa  82  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0809589 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04610  extracellular solute-binding protein family 1  22.75 
 
 		 431 aa  80.9  0.00000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2546  extracellular solute-binding protein  27.8 
 
 		 488 aa  80.9  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.39868  normal  0.139719 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2818  extracellular solute-binding protein  27.8 
 
 		 488 aa  80.5  0.00000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.179577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0529  extracellular solute-binding protein  25.96 
 
 		 464 aa  79.3  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.361956  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2303  extracellular solute-binding protein family 1  24.14 
 
 		 480 aa  78.6  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.316955  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0558  extracellular solute-binding protein family 1  22.85 
 
 		 444 aa  77.4  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4632  extracellular solute-binding protein  26.4 
 
 		 419 aa  76.6  0.0000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.448727  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3957  extracellular solute-binding protein family 1  24.1 
 
 		 432 aa  75.9  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  29.05 
 
 		 415 aa  75.5  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0829  extracellular solute-binding protein family 1  28.11 
 
 		 504 aa  73.2  0.000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7906  extracellular solute-binding protein family 1  26.54 
 
 		 420 aa  73.2  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.819994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.78 
 
 		 407 aa  72.4  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0913  extracellular solute-binding protein family 1  23.84 
 
 		 421 aa  72.8  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1522  extracellular solute-binding protein family 1  21.17 
 
 		 421 aa  71.6  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.569671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5349  extracellular solute-binding protein family 1  26.09 
 
 		 406 aa  72.4  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.535832 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0045  extracellular solute-binding protein family 1  25.46 
 
 		 414 aa  71.2  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.713374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  25.37 
 
 		 420 aa  70.9  0.00000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>