140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2144 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2144  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 432 aa  883    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0558  extracellular solute-binding protein family 1  51.17 
 
 		 444 aa  439  9.999999999999999e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2228  extracellular solute-binding protein family 1  31.55 
 
 		 460 aa  218  2e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.754729 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3557  extracellular solute-binding protein family 1  28.88 
 
 		 458 aa  144  4e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3326  extracellular solute-binding protein  25.24 
 
 		 453 aa  138  2e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00000398294  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0499  extracellular solute-binding protein family 1  26.46 
 
 		 434 aa  137  5e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000057577 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1199  extracellular solute-binding protein family 1  27.11 
 
 		 432 aa  133  6.999999999999999e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000829014 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0793  extracellular solute-binding protein family 1  27.52 
 
 		 442 aa  130  5.0000000000000004e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0145438 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3128  extracellular solute-binding protein family 1  25.6 
 
 		 450 aa  129  8.000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0477771 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1126  extracellular solute-binding protein  27.46 
 
 		 432 aa  128  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.190587  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3329  extracellular solute-binding protein  25.47 
 
 		 431 aa  123  6e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0332045  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3131  extracellular solute-binding protein family 1  25.72 
 
 		 422 aa  122  9e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00803878 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2036  extracellular solute-binding protein family 1  26.16 
 
 		 439 aa  122  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.182591  normal  0.899466 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05230  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.43 
 
 		 450 aa  120  6e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.808581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3119  extracellular solute-binding protein family 1  26.74 
 
 		 428 aa  119  9e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2537  extracellular solute-binding protein family 1  26.42 
 
 		 450 aa  117  3e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.272028  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1049  extracellular solute-binding protein family 1  25.18 
 
 		 437 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.340866 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29730  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.11 
 
 		 434 aa  111  2.0000000000000002e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3578  extracellular solute-binding protein  25.31 
 
 		 428 aa  111  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.608798  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4335  extracellular solute-binding protein family 1  25.14 
 
 		 428 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000444207 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4006  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 428 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3899  extracellular solute-binding protein family 1  27.7 
 
 		 435 aa  106  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3329  extracellular solute-binding protein  24.61 
 
 		 428 aa  102  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.955635  normal  0.757839 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0970  extracellular solute-binding protein family 1  26.07 
 
 		 428 aa  102  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153801  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0806  extracellular solute-binding protein family 1  27.69 
 
 		 437 aa  100  4e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0510551 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0919  extracellular solute-binding protein family 1  24.29 
 
 		 441 aa  100  5e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0780  extracellular solute-binding protein  23.8 
 
 		 436 aa  99.4  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03450  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.35 
 
 		 416 aa  97.8  3e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.355174 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1702  sugar-binding protein  23.43 
 
 		 442 aa  97.1  5e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.981171  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2460  extracellular solute-binding protein family 1  22.94 
 
 		 441 aa  94.4  3e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.372805  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0589  extracellular solute-binding protein family 1  25.18 
 
 		 452 aa  94.4  4e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.289831  normal  0.0417818 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3784  extracellular solute-binding protein family 1  22.62 
 
 		 430 aa  94  5e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1534  extracellular solute-binding protein family 1  24.75 
 
 		 436 aa  92  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.191711  decreased coverage  0.00957964 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29740  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.25 
 
 		 437 aa  92  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3124  extracellular solute-binding protein family 1  22.86 
 
 		 429 aa  90.1  8e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0621948 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0895  extracellular solute-binding protein family 1  21.84 
 
 		 436 aa  89.4  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.441999 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5580  ABC transporter/Periplasmic pectin oligomer binding protein  22.76 
 
 		 427 aa  88.2  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4344  extracellular solute-binding protein family 1  25.2 
 
 		 428 aa  88.2  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0302279  hitchhiker  0.00000351134 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0897  extracellular solute-binding protein family 1  25.2 
 
 		 446 aa  87.8  4e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0316444  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4051  extracellular solute-binding protein family 1  24.73 
 
 		 434 aa  87  6e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4040  extracellular solute-binding protein family 1  23.08 
 
 		 434 aa  85.1  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4015  extracellular solute-binding protein family 1  24 
 
 		 428 aa  84.3  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.946152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0437  extracellular solute-binding protein family 1  21.41 
 
 		 424 aa  82  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000010114  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2102  extracellular solute-binding protein family 1  29.83 
 
 		 439 aa  81.6  0.00000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06270  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.42 
 
 		 426 aa  81.3  0.00000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4050  extracellular solute-binding protein family 1  23.33 
 
 		 433 aa  81.3  0.00000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3292  extracellular solute-binding protein  30.77 
 
 		 428 aa  80.9  0.00000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.309737 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2395  extracellular solute-binding protein family 1  31.17 
 
 		 451 aa  79  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3324  extracellular solute-binding protein  23.34 
 
 		 427 aa  79  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000420771  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0697  extracellular solute-binding protein family 1  20.78 
 
 		 433 aa  78.6  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05420  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.72 
 
 		 438 aa  79  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0143899  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  26.18 
 
 		 414 aa  75.1  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2081  extracellular solute-binding protein family 1  25.6 
 
 		 434 aa  74.3  0.000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.159947  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2376  extracellular solute-binding protein family 1  22.37 
 
 		 438 aa  74.3  0.000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  27.66 
 
 		 427 aa  72.8  0.00000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2164  extracellular solute-binding protein family 1  24.53 
 
 		 435 aa  71.2  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1655  extracellular solute-binding protein family 1  22.17 
 
 		 425 aa  71.6  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186521  normal  0.186231 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1688  oligogalacturonide ABC transporter, periplasmic oligogalacturonide-binding protein  26.67 
 
 		 430 aa  68.9  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0550228  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2197  extracellular solute-binding protein family 1  26.35 
 
 		 429 aa  69.3  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.700843  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1798  extracellular solute-binding protein  26.67 
 
 		 430 aa  68.9  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.763472  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1904  extracellular solute-binding protein family 1  25.75 
 
 		 429 aa  69.7  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.172949  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2648  oligogalacturonide ABC transporter periplasmic oligogalacturonide-binding protein  26.67 
 
 		 430 aa  68.9  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.316005  normal  0.159215 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1899  extracellular solute-binding protein, putative  23.32 
 
 		 416 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.41529  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1634  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  22.42 
 
 		 416 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  29.38 
 
 		 422 aa  67.4  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4632  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 		 419 aa  66.6  0.0000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.448727  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3983  extracellular solute-binding protein family 1  27.18 
 
 		 456 aa  65.9  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4688  extracellular solute-binding protein family 1  25.93 
 
 		 418 aa  65.1  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2818  extracellular solute-binding protein  26.34 
 
 		 488 aa  63.9  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.179577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0729  extracellular solute-binding protein family 1  26.99 
 
 		 443 aa  63.9  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000254304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0913  extracellular solute-binding protein family 1  26.54 
 
 		 421 aa  63.2  0.000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2546  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 488 aa  63.2  0.000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.39868  normal  0.139719 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3369  extracellular solute-binding protein family 1  27.21 
 
 		 430 aa  62.4  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3430  extracellular solute-binding protein family 1  22.62 
 
 		 415 aa  62  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2037  extracellular solute-binding protein family 1  25.6 
 
 		 430 aa  61.6  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3712  extracellular solute-binding protein family 1  25.12 
 
 		 421 aa  61.2  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.411366 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.27 
 
 		 430 aa  60.8  0.00000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30840  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.86 
 
 		 463 aa  60.8  0.00000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1152  extracellular solute-binding protein  30.56 
 
 		 393 aa  60.5  0.00000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0401617  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  21.52 
 
 		 420 aa  60.5  0.00000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1966  extracellular solute-binding protein family 1  25.44 
 
 		 430 aa  60.5  0.00000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.810983  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2647  extracellular solute-binding protein family 1  24.16 
 
 		 446 aa  60.1  0.00000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.890591  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2571  extracellular solute-binding protein  23.32 
 
 		 417 aa  59.7  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7906  extracellular solute-binding protein family 1  26.5 
 
 		 420 aa  58.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.819994  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0825  extracellular solute-binding protein family 1  27.89 
 
 		 429 aa  58.2  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0777  extracellular solute-binding protein  25.88 
 
 		 428 aa  56.2  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2403  extracellular solute-binding protein  26.04 
 
 		 441 aa  55.8  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0513  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 447 aa  55.5  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.000000038068  hitchhiker  0.000703825 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0795  extracellular solute-binding protein family 1  23.6 
 
 		 460 aa  55.1  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.215252  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0297  extracellular solute-binding protein family 1  29.12 
 
 		 453 aa  53.5  0.000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0248346 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3106  ABC transporter, substrate binding periplasmic component  29.19 
 
 		 408 aa  53.1  0.000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0183  extracellular solute-binding protein family 1  26.55 
 
 		 429 aa  53.1  0.000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2267  extracellular solute-binding protein family 1  25.72 
 
 		 445 aa  53.1  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00064551 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0512  extracellular solute-binding protein  24.83 
 
 		 423 aa  51.2  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00024476  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2513  extracellular solute-binding protein family 1  25.79 
 
 		 441 aa  50.8  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  24.74 
 
 		 415 aa  50.8  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0381  extracellular solute-binding protein family 1  21.56 
 
 		 421 aa  50.4  0.00006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3988  extracellular solute-binding protein family 1  24.32 
 
 		 422 aa  50.4  0.00006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0061  extracellular solute-binding protein family 1  25.69 
 
 		 462 aa  50.4  0.00006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4083  extracellular solute-binding protein family 1  22.3 
 
 		 417 aa  50.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>