More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_2395 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_2102  extracellular solute-binding protein family 1  95.67 
 
 		 439 aa  872    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2395  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 451 aa  932    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1688  oligogalacturonide ABC transporter, periplasmic oligogalacturonide-binding protein  47.82 
 
 		 430 aa  426  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0550228  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1798  extracellular solute-binding protein  47.82 
 
 		 430 aa  426  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.763472  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1904  extracellular solute-binding protein family 1  48.71 
 
 		 429 aa  423  1e-117  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.172949  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2037  extracellular solute-binding protein family 1  48.71 
 
 		 430 aa  423  1e-117  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3292  extracellular solute-binding protein  48.03 
 
 		 428 aa  422  1e-117  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.309737 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2197  extracellular solute-binding protein family 1  48.95 
 
 		 429 aa  424  1e-117  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.700843  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2648  oligogalacturonide ABC transporter periplasmic oligogalacturonide-binding protein  47.82 
 
 		 430 aa  424  1e-117  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.316005  normal  0.159215 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3369  extracellular solute-binding protein family 1  46.96 
 
 		 430 aa  419  1e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0825  extracellular solute-binding protein family 1  49.28 
 
 		 429 aa  414  1e-114  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1966  extracellular solute-binding protein family 1  47.54 
 
 		 430 aa  411  1e-113  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.810983  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0777  extracellular solute-binding protein  44.76 
 
 		 428 aa  387  1e-106  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0697  extracellular solute-binding protein family 1  34.93 
 
 		 433 aa  280  4e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4040  extracellular solute-binding protein family 1  36.27 
 
 		 434 aa  278  2e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3784  extracellular solute-binding protein family 1  34.12 
 
 		 430 aa  275  9e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4051  extracellular solute-binding protein family 1  34.1 
 
 		 434 aa  259  5.0000000000000005e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4050  extracellular solute-binding protein family 1  34.17 
 
 		 433 aa  255  1.0000000000000001e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2376  extracellular solute-binding protein family 1  30.22 
 
 		 438 aa  163  7e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0619  extracellular solute-binding protein  25.6 
 
 		 463 aa  133  6.999999999999999e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000037115  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0919  extracellular solute-binding protein family 1  27.59 
 
 		 441 aa  129  1.0000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0499  extracellular solute-binding protein family 1  29.91 
 
 		 434 aa  126  7e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000057577 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2460  extracellular solute-binding protein family 1  23.96 
 
 		 441 aa  125  1e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.372805  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0437  extracellular solute-binding protein family 1  28.65 
 
 		 424 aa  124  4e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000010114  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3329  extracellular solute-binding protein  26.54 
 
 		 428 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.955635  normal  0.757839 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3131  extracellular solute-binding protein family 1  26.22 
 
 		 422 aa  113  6e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00803878 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1126  extracellular solute-binding protein  26.81 
 
 		 432 aa  112  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.190587  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1199  extracellular solute-binding protein family 1  26.06 
 
 		 432 aa  111  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000829014 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2036  extracellular solute-binding protein family 1  24.4 
 
 		 439 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.182591  normal  0.899466 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03450  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.42 
 
 		 416 aa  109  8.000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.355174 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3329  extracellular solute-binding protein  25.49 
 
 		 431 aa  107  3e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0332045  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5580  ABC transporter/Periplasmic pectin oligomer binding protein  24.93 
 
 		 427 aa  105  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3899  extracellular solute-binding protein family 1  26.38 
 
 		 435 aa  103  7e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29730  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.01 
 
 		 434 aa  103  7e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4335  extracellular solute-binding protein family 1  24.57 
 
 		 428 aa  103  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000444207 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0806  extracellular solute-binding protein family 1  21.39 
 
 		 437 aa  102  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0510551 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1702  sugar-binding protein  23.4 
 
 		 442 aa  101  3e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.981171  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3326  extracellular solute-binding protein  27.3 
 
 		 453 aa  101  3e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00000398294  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3119  extracellular solute-binding protein family 1  25.53 
 
 		 428 aa  101  3e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29740  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.12 
 
 		 437 aa  100  5e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2081  extracellular solute-binding protein family 1  22.97 
 
 		 434 aa  99.8  9e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.159947  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3124  extracellular solute-binding protein family 1  24.07 
 
 		 429 aa  99.8  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0621948 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3128  extracellular solute-binding protein family 1  23.43 
 
 		 450 aa  97.8  4e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0477771 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4015  extracellular solute-binding protein family 1  25.92 
 
 		 428 aa  97.1  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.946152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05230  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  32.62 
 
 		 450 aa  96.3  1e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.808581  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4344  extracellular solute-binding protein family 1  25.63 
 
 		 428 aa  93.6  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0302279  hitchhiker  0.00000351134 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1049  extracellular solute-binding protein family 1  25.51 
 
 		 437 aa  93.6  7e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.340866 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2647  extracellular solute-binding protein family 1  26.22 
 
 		 446 aa  92  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.890591  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4006  extracellular solute-binding protein family 1  22.83 
 
 		 428 aa  90.5  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0793  extracellular solute-binding protein family 1  24.3 
 
 		 442 aa  89  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0145438 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3402  extracellular solute-binding protein  23.74 
 
 		 451 aa  89.7  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000236647  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0895  extracellular solute-binding protein family 1  23.42 
 
 		 436 aa  88.6  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.441999 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05420  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.71 
 
 		 438 aa  88.2  3e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0143899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3324  extracellular solute-binding protein  24.94 
 
 		 427 aa  87.8  4e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000420771  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  27.63 
 
 		 411 aa  87.8  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  26.89 
 
 		 411 aa  86.3  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0780  extracellular solute-binding protein  24.03 
 
 		 436 aa  85.1  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0970  extracellular solute-binding protein family 1  31.82 
 
 		 428 aa  83.6  0.000000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153801  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0897  extracellular solute-binding protein family 1  23.25 
 
 		 446 aa  82.4  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0316444  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  30.32 
 
 		 415 aa  82  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  26.23 
 
 		 437 aa  82  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  30.54 
 
 		 422 aa  80.1  0.00000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0698  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  26.98 
 
 		 366 aa  78.6  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436581  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0589  extracellular solute-binding protein family 1  22.71 
 
 		 452 aa  79  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.289831  normal  0.0417818 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  26.37 
 
 		 424 aa  78.2  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3578  extracellular solute-binding protein  31.03 
 
 		 428 aa  77.8  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.608798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2144  extracellular solute-binding protein family 1  30.14 
 
 		 432 aa  77.8  0.0000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  24.42 
 
 		 427 aa  77  0.0000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2537  extracellular solute-binding protein family 1  23.39 
 
 		 450 aa  75.9  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.272028  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  29.51 
 
 		 424 aa  75.1  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0381  extracellular solute-binding protein family 1  30.17 
 
 		 421 aa  75.1  0.000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0690  extracellular solute-binding protein  22.82 
 
 		 402 aa  73.9  0.000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.678935  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2016  extracellular solute-binding protein  26.72 
 
 		 408 aa  73.9  0.000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2310  extracellular solute-binding protein family 1  24.28 
 
 		 425 aa  73.9  0.000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000523246  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  30.22 
 
 		 415 aa  73.6  0.000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  33.53 
 
 		 414 aa  73.2  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0348  extracellular solute-binding protein family 1  31.41 
 
 		 419 aa  72.8  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2818  extracellular solute-binding protein  23.55 
 
 		 488 aa  72  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.179577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2571  extracellular solute-binding protein  25.5 
 
 		 417 aa  72  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0045  extracellular solute-binding protein family 1  26.67 
 
 		 414 aa  71.2  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.713374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2546  extracellular solute-binding protein  23.55 
 
 		 488 aa  70.9  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.39868  normal  0.139719 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0558  extracellular solute-binding protein family 1  24.28 
 
 		 444 aa  70.1  0.00000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1534  extracellular solute-binding protein family 1  22.36 
 
 		 436 aa  69.7  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.191711  decreased coverage  0.00957964 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7208  extracellular solute-binding protein family 1  29.17 
 
 		 410 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  26.47 
 
 		 429 aa  68.6  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20520  extracellular solute-binding protein family 1  24.44 
 
 		 417 aa  68.2  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.561553  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4557  extracellular solute-binding protein  25.97 
 
 		 412 aa  68.2  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4057  extracellular solute-binding protein  27.96 
 
 		 410 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0323  family 1 extracellular solute-binding protein  23.32 
 
 		 432 aa  67  0.0000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0420  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  28.57 
 
 		 410 aa  67  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0144  extracellular solute-binding protein  24.79 
 
 		 403 aa  66.6  0.0000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.442205  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2267  extracellular solute-binding protein family 1  33.11 
 
 		 445 aa  66.6  0.0000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00064551 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3685  extracellular solute-binding protein  23.4 
 
 		 432 aa  65.9  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3622  extracellular solute-binding protein family 1  22.8 
 
 		 412 aa  66.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  25.83 
 
 		 411 aa  64.7  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6584  ABC transporter sugar binding protein  24.73 
 
 		 437 aa  64.7  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3988  extracellular solute-binding protein family 1  26.67 
 
 		 422 aa  65.1  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5365  extracellular solute-binding protein family 1  32.16 
 
 		 418 aa  64.7  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.559287 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4758  extracellular solute-binding protein family 1  34.25 
 
 		 417 aa  64.3  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  25.88 
 
 		 414 aa  64.3  0.000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>