More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_0499 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_0499  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 434 aa  881    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000057577 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0793  extracellular solute-binding protein family 1  45.62 
 
 		 442 aa  381  1e-104  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0145438 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1702  sugar-binding protein  42.86 
 
 		 442 aa  296  6e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.981171  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2036  extracellular solute-binding protein family 1  38.32 
 
 		 439 aa  287  2.9999999999999996e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.182591  normal  0.899466 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1126  extracellular solute-binding protein  37.27 
 
 		 432 aa  284  2.0000000000000002e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.190587  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1199  extracellular solute-binding protein family 1  36.74 
 
 		 432 aa  275  9e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000829014 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3119  extracellular solute-binding protein family 1  36.59 
 
 		 428 aa  266  4e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05230  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  34.88 
 
 		 450 aa  260  3e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.808581  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1049  extracellular solute-binding protein family 1  37.99 
 
 		 437 aa  258  2e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.340866 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2537  extracellular solute-binding protein family 1  37.1 
 
 		 450 aa  254  2.0000000000000002e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.272028  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3326  extracellular solute-binding protein  37.41 
 
 		 453 aa  250  4e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00000398294  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3128  extracellular solute-binding protein family 1  36.82 
 
 		 450 aa  248  1e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0477771 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3329  extracellular solute-binding protein  33.73 
 
 		 431 aa  239  9e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0332045  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3131  extracellular solute-binding protein family 1  32.61 
 
 		 422 aa  233  7.000000000000001e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00803878 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0895  extracellular solute-binding protein family 1  33.68 
 
 		 436 aa  227  3e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.441999 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0780  extracellular solute-binding protein  32.24 
 
 		 436 aa  219  1e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29740  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  32.3 
 
 		 437 aa  194  3e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0970  extracellular solute-binding protein family 1  32.84 
 
 		 428 aa  190  5e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153801  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3329  extracellular solute-binding protein  30.3 
 
 		 428 aa  183  6e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.955635  normal  0.757839 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4335  extracellular solute-binding protein family 1  29.9 
 
 		 428 aa  180  4e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000444207 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29730  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  30.63 
 
 		 434 aa  180  5.999999999999999e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5580  ABC transporter/Periplasmic pectin oligomer binding protein  30.73 
 
 		 427 aa  177  3e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4006  extracellular solute-binding protein family 1  29.9 
 
 		 428 aa  176  7e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2647  extracellular solute-binding protein family 1  32.58 
 
 		 446 aa  174  3.9999999999999995e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.890591  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0919  extracellular solute-binding protein family 1  30.33 
 
 		 441 aa  171  2e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3578  extracellular solute-binding protein  30.07 
 
 		 428 aa  168  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.608798  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4344  extracellular solute-binding protein family 1  29.22 
 
 		 428 aa  168  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0302279  hitchhiker  0.00000351134 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0437  extracellular solute-binding protein family 1  27.83 
 
 		 424 aa  166  9e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000010114  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4015  extracellular solute-binding protein family 1  28.5 
 
 		 428 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.946152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3124  extracellular solute-binding protein family 1  27.59 
 
 		 429 aa  161  2e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0621948 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2460  extracellular solute-binding protein family 1  29.31 
 
 		 441 aa  160  3e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.372805  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1534  extracellular solute-binding protein family 1  28.89 
 
 		 436 aa  160  4e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.191711  decreased coverage  0.00957964 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2081  extracellular solute-binding protein family 1  28.89 
 
 		 434 aa  156  8e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.159947  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3557  extracellular solute-binding protein family 1  25.68 
 
 		 458 aa  156  8e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3324  extracellular solute-binding protein  29.26 
 
 		 427 aa  154  4e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000420771  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0589  extracellular solute-binding protein family 1  29.95 
 
 		 452 aa  152  8e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.289831  normal  0.0417818 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0897  extracellular solute-binding protein family 1  27.65 
 
 		 446 aa  144  2e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0316444  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03450  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.07 
 
 		 416 aa  139  1e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.355174 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3899  extracellular solute-binding protein family 1  27.42 
 
 		 435 aa  138  2e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05420  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.23 
 
 		 438 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0143899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2144  extracellular solute-binding protein family 1  25.25 
 
 		 432 aa  136  6.0000000000000005e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2228  extracellular solute-binding protein family 1  28.79 
 
 		 460 aa  133  6e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.754729 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0806  extracellular solute-binding protein family 1  23.49 
 
 		 437 aa  131  3e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0510551 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2102  extracellular solute-binding protein family 1  30.51 
 
 		 439 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2395  extracellular solute-binding protein family 1  29.91 
 
 		 451 aa  126  6e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3369  extracellular solute-binding protein family 1  27.61 
 
 		 430 aa  124  2e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3402  extracellular solute-binding protein  26.03 
 
 		 451 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000236647  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0697  extracellular solute-binding protein family 1  24.61 
 
 		 433 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2376  extracellular solute-binding protein family 1  27.09 
 
 		 438 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4050  extracellular solute-binding protein family 1  28.02 
 
 		 433 aa  116  7.999999999999999e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4040  extracellular solute-binding protein family 1  25.69 
 
 		 434 aa  114  3e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3784  extracellular solute-binding protein family 1  25.74 
 
 		 430 aa  112  9e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4051  extracellular solute-binding protein family 1  27.99 
 
 		 434 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0825  extracellular solute-binding protein family 1  27.49 
 
 		 429 aa  108  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0558  extracellular solute-binding protein family 1  21.14 
 
 		 444 aa  104  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0777  extracellular solute-binding protein  25.12 
 
 		 428 aa  102  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  28.07 
 
 		 427 aa  101  3e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2197  extracellular solute-binding protein family 1  24.52 
 
 		 429 aa  100  4e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.700843  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3292  extracellular solute-binding protein  27.25 
 
 		 428 aa  99.8  9e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.309737 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2037  extracellular solute-binding protein family 1  24.05 
 
 		 430 aa  98.6  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1904  extracellular solute-binding protein family 1  24.29 
 
 		 429 aa  97.8  3e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.172949  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1634  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  23.95 
 
 		 416 aa  91.7  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2731  extracellular solute-binding protein family 1  23.95 
 
 		 454 aa  91.3  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1899  extracellular solute-binding protein, putative  23.95 
 
 		 416 aa  90.9  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.41529  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1688  oligogalacturonide ABC transporter, periplasmic oligogalacturonide-binding protein  24.26 
 
 		 430 aa  90.9  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0550228  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2648  oligogalacturonide ABC transporter periplasmic oligogalacturonide-binding protein  24.26 
 
 		 430 aa  90.9  4e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.316005  normal  0.159215 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1798  extracellular solute-binding protein  24.26 
 
 		 430 aa  90.9  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.763472  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0192  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  27.71 
 
 		 463 aa  90.5  6e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.245721  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2218  extracellular solute-binding protein family 1  26.01 
 
 		 479 aa  87.8  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00910899  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2504  extracellular solute-binding protein family 1  25.42 
 
 		 442 aa  86.3  9e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1966  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 430 aa  85.9  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.810983  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  28.62 
 
 		 424 aa  85.1  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0183  extracellular solute-binding protein family 1  29.26 
 
 		 429 aa  84.3  0.000000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2165  extracellular solute-binding protein family 1  26.15 
 
 		 481 aa  83.2  0.000000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7906  extracellular solute-binding protein family 1  26.27 
 
 		 420 aa  82  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.819994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06270  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  29.29 
 
 		 426 aa  80.5  0.00000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  31.18 
 
 		 414 aa  80.1  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0719  extracellular solute-binding protein family 1  30.77 
 
 		 413 aa  79  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0236757  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15560  extracellular solute-binding protein family 1  25.23 
 
 		 418 aa  77.4  0.0000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2571  extracellular solute-binding protein  24.22 
 
 		 417 aa  77.8  0.0000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0381  extracellular solute-binding protein family 1  27.39 
 
 		 421 aa  77.4  0.0000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0529  extracellular solute-binding protein  22.22 
 
 		 464 aa  77  0.0000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.361956  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  28.28 
 
 		 422 aa  76.6  0.0000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  25.37 
 
 		 415 aa  76.3  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0238  extracellular solute-binding protein family 1  23.75 
 
 		 423 aa  75.5  0.000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29010  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.66 
 
 		 434 aa  74.7  0.000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4688  extracellular solute-binding protein family 1  33.13 
 
 		 418 aa  73.6  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16660  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  29.02 
 
 		 406 aa  72.8  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.613471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0513  extracellular solute-binding protein family 1  24.5 
 
 		 447 aa  72.4  0.00000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.000000038068  hitchhiker  0.000703825 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1999  extracellular solute-binding protein family 1  26.1 
 
 		 468 aa  71.2  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1672  extracellular solute-binding protein family 1  22.61 
 
 		 459 aa  70.1  0.00000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2164  extracellular solute-binding protein family 1  25.26 
 
 		 435 aa  69.7  0.00000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4984  extracellular solute-binding protein family 1  26.69 
 
 		 432 aa  69.3  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000108283  decreased coverage  0.000897425 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  26.04 
 
 		 423 aa  68.9  0.0000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6192  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  26.63 
 
 		 431 aa  68.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0222852  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 415 aa  68.2  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.48 
 
 		 419 aa  68.2  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.033461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2920  extracellular solute-binding protein family 1  29.28 
 
 		 424 aa  68.2  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04610  extracellular solute-binding protein family 1  25.44 
 
 		 431 aa  68.2  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0045  extracellular solute-binding protein family 1  25.29 
 
 		 414 aa  68.2  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.713374  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>