More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0777 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0777  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 428 aa  881    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1966  extracellular solute-binding protein family 1  59.44 
 
 		 430 aa  537  1e-151  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.810983  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2197  extracellular solute-binding protein family 1  60.68 
 
 		 429 aa  536  1e-151  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.700843  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2037  extracellular solute-binding protein family 1  59.44 
 
 		 430 aa  536  1e-151  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1904  extracellular solute-binding protein family 1  59.95 
 
 		 429 aa  530  1e-149  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.172949  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2648  oligogalacturonide ABC transporter periplasmic oligogalacturonide-binding protein  59.53 
 
 		 430 aa  525  1e-148  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.316005  normal  0.159215 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1798  extracellular solute-binding protein  59.53 
 
 		 430 aa  526  1e-148  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.763472  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1688  oligogalacturonide ABC transporter, periplasmic oligogalacturonide-binding protein  59.53 
 
 		 430 aa  526  1e-148  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0550228  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3292  extracellular solute-binding protein  55.56 
 
 		 428 aa  504  1e-141  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.309737 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3369  extracellular solute-binding protein family 1  50.12 
 
 		 430 aa  439  9.999999999999999e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0825  extracellular solute-binding protein family 1  48.29 
 
 		 429 aa  417  9.999999999999999e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2102  extracellular solute-binding protein family 1  43.52 
 
 		 439 aa  384  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2395  extracellular solute-binding protein family 1  45.3 
 
 		 451 aa  381  1e-104  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0697  extracellular solute-binding protein family 1  38.54 
 
 		 433 aa  284  2.0000000000000002e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4040  extracellular solute-binding protein family 1  37.04 
 
 		 434 aa  274  2.0000000000000002e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4051  extracellular solute-binding protein family 1  34.39 
 
 		 434 aa  247  2e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3784  extracellular solute-binding protein family 1  33.25 
 
 		 430 aa  246  6e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4050  extracellular solute-binding protein family 1  34.32 
 
 		 433 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3128  extracellular solute-binding protein family 1  28.2 
 
 		 450 aa  147  3e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0477771 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2376  extracellular solute-binding protein family 1  27.25 
 
 		 438 aa  145  1e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0437  extracellular solute-binding protein family 1  27.08 
 
 		 424 aa  129  9.000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000010114  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0619  extracellular solute-binding protein  24.44 
 
 		 463 aa  126  6e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000037115  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3329  extracellular solute-binding protein  26.72 
 
 		 428 aa  125  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.955635  normal  0.757839 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3326  extracellular solute-binding protein  26.18 
 
 		 453 aa  124  2e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00000398294  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1049  extracellular solute-binding protein family 1  24.88 
 
 		 437 aa  124  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.340866 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0919  extracellular solute-binding protein family 1  24.14 
 
 		 441 aa  122  9.999999999999999e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2036  extracellular solute-binding protein family 1  23.31 
 
 		 439 aa  120  4.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.182591  normal  0.899466 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2460  extracellular solute-binding protein family 1  22.91 
 
 		 441 aa  117  3.9999999999999997e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.372805  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3119  extracellular solute-binding protein family 1  26.2 
 
 		 428 aa  114  3e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2081  extracellular solute-binding protein family 1  23.37 
 
 		 434 aa  114  3e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.159947  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1199  extracellular solute-binding protein family 1  26.54 
 
 		 432 aa  114  3e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000829014 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3578  extracellular solute-binding protein  25.18 
 
 		 428 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.608798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1126  extracellular solute-binding protein  26.65 
 
 		 432 aa  109  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.190587  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3402  extracellular solute-binding protein  26.12 
 
 		 451 aa  107  3e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000236647  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29730  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.94 
 
 		 434 aa  106  8e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0806  extracellular solute-binding protein family 1  25.76 
 
 		 437 aa  105  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0510551 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0895  extracellular solute-binding protein family 1  23.6 
 
 		 436 aa  105  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.441999 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1702  sugar-binding protein  21.55 
 
 		 442 aa  105  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.981171  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03450  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.77 
 
 		 416 aa  104  4e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.355174 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4335  extracellular solute-binding protein family 1  24.22 
 
 		 428 aa  102  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000444207 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4344  extracellular solute-binding protein family 1  23.43 
 
 		 428 aa  102  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0302279  hitchhiker  0.00000351134 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05420  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.66 
 
 		 438 aa  101  3e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0143899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5580  ABC transporter/Periplasmic pectin oligomer binding protein  24.24 
 
 		 427 aa  100  4e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0897  extracellular solute-binding protein family 1  26.39 
 
 		 446 aa  99.8  9e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0316444  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4015  extracellular solute-binding protein family 1  22.59 
 
 		 428 aa  99.8  9e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.946152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0499  extracellular solute-binding protein family 1  24.52 
 
 		 434 aa  99.8  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000057577 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0970  extracellular solute-binding protein family 1  23.39 
 
 		 428 aa  98.6  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153801  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0780  extracellular solute-binding protein  23.88 
 
 		 436 aa  97.4  4e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3131  extracellular solute-binding protein family 1  23.06 
 
 		 422 aa  96.3  9e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00803878 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3329  extracellular solute-binding protein  23.15 
 
 		 431 aa  94  4e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0332045  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3124  extracellular solute-binding protein family 1  24.67 
 
 		 429 aa  93.6  6e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0621948 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4006  extracellular solute-binding protein family 1  23 
 
 		 428 aa  93.2  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3324  extracellular solute-binding protein  22.66 
 
 		 427 aa  92.8  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000420771  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29740  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.95 
 
 		 437 aa  92  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1534  extracellular solute-binding protein family 1  24.25 
 
 		 436 aa  91.7  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.191711  decreased coverage  0.00957964 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2537  extracellular solute-binding protein family 1  24.85 
 
 		 450 aa  90.9  4e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.272028  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0793  extracellular solute-binding protein family 1  23.96 
 
 		 442 aa  89.4  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0145438 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05230  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.53 
 
 		 450 aa  87  6e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.808581  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3899  extracellular solute-binding protein family 1  23.26 
 
 		 435 aa  84  0.000000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2731  extracellular solute-binding protein family 1  24.07 
 
 		 454 aa  82  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2647  extracellular solute-binding protein family 1  24.65 
 
 		 446 aa  80.9  0.00000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.890591  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  27.91 
 
 		 411 aa  79.3  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  24.77 
 
 		 437 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  24.54 
 
 		 423 aa  78.6  0.0000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1634  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  22.63 
 
 		 416 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1899  extracellular solute-binding protein, putative  22.63 
 
 		 416 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.41529  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0045  extracellular solute-binding protein family 1  24.79 
 
 		 414 aa  75.1  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.713374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0420  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  27.03 
 
 		 410 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2571  extracellular solute-binding protein  24.84 
 
 		 417 aa  75.1  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  24.3 
 
 		 424 aa  74.7  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  26.2 
 
 		 411 aa  73.6  0.000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7208  extracellular solute-binding protein family 1  32.94 
 
 		 410 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  25.21 
 
 		 415 aa  73.6  0.000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  26.04 
 
 		 427 aa  71.6  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4057  extracellular solute-binding protein  34.11 
 
 		 410 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.63 
 
 		 407 aa  71.2  0.00000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3430  extracellular solute-binding protein family 1  32.86 
 
 		 415 aa  70.9  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06270  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.88 
 
 		 426 aa  70.5  0.00000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0698  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  26.71 
 
 		 366 aa  70.5  0.00000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436581  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  22.85 
 
 		 414 aa  70.5  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2310  extracellular solute-binding protein family 1  24.93 
 
 		 425 aa  70.5  0.00000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000523246  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3394  ABC-type sugar transport systems permease component  26.9 
 
 		 411 aa  70.1  0.00000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.498756  normal  0.24931 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  23.51 
 
 		 399 aa  70.1  0.00000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1941  sugar ABC transporter, sugar-binding protein, putative  22.45 
 
 		 434 aa  69.3  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0690  extracellular solute-binding protein  22.47 
 
 		 402 aa  69.3  0.0000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.678935  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2546  extracellular solute-binding protein  36.44 
 
 		 488 aa  69.3  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.39868  normal  0.139719 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2315  extracellular solute-binding protein family 1  35.09 
 
 		 503 aa  68.6  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2818  extracellular solute-binding protein  36.44 
 
 		 488 aa  68.9  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.179577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0144  extracellular solute-binding protein  22.32 
 
 		 403 aa  66.6  0.0000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.442205  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2683  extracellular solute-binding protein family 1  24.88 
 
 		 446 aa  66.2  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  30.5 
 
 		 422 aa  66.2  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  23.68 
 
 		 424 aa  65.5  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19770  extracellular solute-binding protein family 1  25.94 
 
 		 423 aa  65.1  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3730  extracellular solute-binding protein family 1  30.88 
 
 		 435 aa  65.5  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.163607  normal  0.040318 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00880  ABC transporter sugar binding protein  23.4 
 
 		 440 aa  64.7  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106592  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27690  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.82 
 
 		 431 aa  64.7  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.340884 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  26.25 
 
 		 415 aa  64.7  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4159  extracellular solute-binding protein  26.96 
 
 		 421 aa  64.7  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.119299  normal  0.873951 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0589  extracellular solute-binding protein family 1  20.17 
 
 		 452 aa  64.3  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.289831  normal  0.0417818 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0378  extracellular solute-binding protein family 1  25.6 
 
 		 420 aa  64.3  0.000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>