More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_1966 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_2037  extracellular solute-binding protein family 1  91.16 
 
 		 430 aa  825    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2197  extracellular solute-binding protein family 1  84.38 
 
 		 429 aa  760    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.700843  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3292  extracellular solute-binding protein  75.99 
 
 		 428 aa  687    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.309737 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1904  extracellular solute-binding protein family 1  83.45 
 
 		 429 aa  756    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.172949  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1688  oligogalacturonide ABC transporter, periplasmic oligogalacturonide-binding protein  81.16 
 
 		 430 aa  741    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0550228  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1966  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 430 aa  888    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.810983  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2648  oligogalacturonide ABC transporter periplasmic oligogalacturonide-binding protein  80.93 
 
 		 430 aa  738    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.316005  normal  0.159215 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1798  extracellular solute-binding protein  81.16 
 
 		 430 aa  741    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.763472  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0777  extracellular solute-binding protein  59.44 
 
 		 428 aa  537  1e-151  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3369  extracellular solute-binding protein family 1  56.31 
 
 		 430 aa  512  1e-144  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0825  extracellular solute-binding protein family 1  54.83 
 
 		 429 aa  485  1e-136  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2102  extracellular solute-binding protein family 1  47.31 
 
 		 439 aa  412  1e-114  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2395  extracellular solute-binding protein family 1  48.19 
 
 		 451 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4040  extracellular solute-binding protein family 1  40.69 
 
 		 434 aa  310  2e-83  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0697  extracellular solute-binding protein family 1  38.92 
 
 		 433 aa  303  5.000000000000001e-81  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4051  extracellular solute-binding protein family 1  35.88 
 
 		 434 aa  282  8.000000000000001e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3784  extracellular solute-binding protein family 1  36.27 
 
 		 430 aa  273  5.000000000000001e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4050  extracellular solute-binding protein family 1  35.7 
 
 		 433 aa  264  2e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2376  extracellular solute-binding protein family 1  32.67 
 
 		 438 aa  172  1e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0437  extracellular solute-binding protein family 1  28.96 
 
 		 424 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000010114  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2460  extracellular solute-binding protein family 1  24.57 
 
 		 441 aa  144  2e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.372805  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0619  extracellular solute-binding protein  26.72 
 
 		 463 aa  143  6e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000037115  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3329  extracellular solute-binding protein  23.6 
 
 		 428 aa  122  8e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.955635  normal  0.757839 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3329  extracellular solute-binding protein  26.91 
 
 		 431 aa  121  3e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0332045  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2036  extracellular solute-binding protein family 1  25.7 
 
 		 439 aa  120  4.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.182591  normal  0.899466 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3128  extracellular solute-binding protein family 1  28.1 
 
 		 450 aa  120  4.9999999999999996e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0477771 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1199  extracellular solute-binding protein family 1  28.22 
 
 		 432 aa  118  3e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000829014 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3131  extracellular solute-binding protein family 1  27.96 
 
 		 422 aa  117  3e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00803878 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3326  extracellular solute-binding protein  26.85 
 
 		 453 aa  117  5e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00000398294  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3119  extracellular solute-binding protein family 1  26.33 
 
 		 428 aa  116  6.9999999999999995e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3578  extracellular solute-binding protein  26.05 
 
 		 428 aa  116  7.999999999999999e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.608798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1126  extracellular solute-binding protein  27.6 
 
 		 432 aa  115  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.190587  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0806  extracellular solute-binding protein family 1  24.51 
 
 		 437 aa  115  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0510551 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0895  extracellular solute-binding protein family 1  26.73 
 
 		 436 aa  114  3e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.441999 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03450  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.88 
 
 		 416 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.355174 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4335  extracellular solute-binding protein family 1  27.11 
 
 		 428 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000444207 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2081  extracellular solute-binding protein family 1  24.31 
 
 		 434 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.159947  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1049  extracellular solute-binding protein family 1  25.39 
 
 		 437 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.340866 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0780  extracellular solute-binding protein  25.17 
 
 		 436 aa  110  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29730  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.31 
 
 		 434 aa  109  8.000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0919  extracellular solute-binding protein family 1  24.88 
 
 		 441 aa  108  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05420  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.79 
 
 		 438 aa  108  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0143899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5580  ABC transporter/Periplasmic pectin oligomer binding protein  24.45 
 
 		 427 aa  107  3e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3402  extracellular solute-binding protein  24.35 
 
 		 451 aa  107  3e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000236647  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4006  extracellular solute-binding protein family 1  26.2 
 
 		 428 aa  107  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1702  sugar-binding protein  24.7 
 
 		 442 aa  105  1e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.981171  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3324  extracellular solute-binding protein  25.82 
 
 		 427 aa  102  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000420771  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4344  extracellular solute-binding protein family 1  23.38 
 
 		 428 aa  101  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0302279  hitchhiker  0.00000351134 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0970  extracellular solute-binding protein family 1  25.07 
 
 		 428 aa  100  5e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153801  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4015  extracellular solute-binding protein family 1  22.63 
 
 		 428 aa  100  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.946152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2647  extracellular solute-binding protein family 1  25.89 
 
 		 446 aa  98.2  2e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.890591  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0897  extracellular solute-binding protein family 1  23.48 
 
 		 446 aa  96.7  8e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0316444  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05230  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.15 
 
 		 450 aa  94.4  3e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.808581  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0793  extracellular solute-binding protein family 1  23.74 
 
 		 442 aa  93.6  7e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0145438 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3124  extracellular solute-binding protein family 1  24.28 
 
 		 429 aa  88.6  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0621948 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29740  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25 
 
 		 437 aa  87.8  3e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3899  extracellular solute-binding protein family 1  22.13 
 
 		 435 aa  85.5  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  27.01 
 
 		 422 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0499  extracellular solute-binding protein family 1  24.92 
 
 		 434 aa  85.1  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000057577 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1534  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 436 aa  84.7  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.191711  decreased coverage  0.00957964 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  24.2 
 
 		 399 aa  84.3  0.000000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  20.56 
 
 		 423 aa  82.8  0.00000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  28.49 
 
 		 424 aa  82  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0118  extracellular solute-binding protein  23.92 
 
 		 420 aa  78.2  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0116  extracellular solute-binding protein  23.92 
 
 		 420 aa  78.6  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0589  extracellular solute-binding protein family 1  25.42 
 
 		 452 aa  77.8  0.0000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.289831  normal  0.0417818 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0523  extracellular solute-binding protein  28.31 
 
 		 416 aa  75.1  0.000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5711  sugar uptake ABC transporter periplasmic solute-binding protein precursor  24.23 
 
 		 448 aa  74.7  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.188634  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  28.8 
 
 		 415 aa  75.1  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  35.04 
 
 		 429 aa  74.7  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  25.37 
 
 		 415 aa  72.8  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2537  extracellular solute-binding protein family 1  28.06 
 
 		 450 aa  71.6  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.272028  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2571  extracellular solute-binding protein  22.19 
 
 		 417 aa  72.4  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  20.37 
 
 		 407 aa  72  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0348  extracellular solute-binding protein family 1  24.93 
 
 		 419 aa  71.6  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2696  extracellular solute-binding protein  25.55 
 
 		 420 aa  70.9  0.00000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.240659  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0224  extracellular solute-binding protein  24.31 
 
 		 431 aa  70.5  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0690  extracellular solute-binding protein  23.96 
 
 		 402 aa  70.9  0.00000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.678935  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  27.36 
 
 		 411 aa  70.5  0.00000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  23.49 
 
 		 414 aa  70.1  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  25.57 
 
 		 437 aa  70.1  0.00000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19770  extracellular solute-binding protein family 1  30.33 
 
 		 423 aa  69.3  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0698  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  27.36 
 
 		 366 aa  69.3  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436581  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0200  extracellular solute-binding protein family 1  25.09 
 
 		 441 aa  69.3  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  24.88 
 
 		 427 aa  69.3  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2310  extracellular solute-binding protein family 1  23.54 
 
 		 425 aa  68.6  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000523246  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0558  extracellular solute-binding protein family 1  23.4 
 
 		 444 aa  68.9  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0944  extracellular solute-binding protein  24.94 
 
 		 422 aa  68.9  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.544942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3304  extracellular solute-binding protein family 1  24.17 
 
 		 431 aa  67.4  0.0000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0552  extracellular solute-binding protein  33.58 
 
 		 445 aa  67  0.0000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.764632 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0045  extracellular solute-binding protein family 1  24.89 
 
 		 414 aa  66.6  0.0000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.713374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  28.16 
 
 		 414 aa  66.6  0.0000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  27.99 
 
 		 428 aa  67  0.0000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0420  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  24.1 
 
 		 410 aa  66.6  0.0000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1060  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  26.71 
 
 		 408 aa  65.9  0.000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.065415  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0591  extracellular solute-binding protein  26.14 
 
 		 421 aa  65.9  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0610101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0284  extracellular solute-binding protein family 1  24.13 
 
 		 410 aa  66.2  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0514987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2170  extracellular solute-binding protein family 1  28.06 
 
 		 428 aa  65.9  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0514  extracellular solute-binding protein family 1  24.37 
 
 		 426 aa  66.2  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2659  extracellular solute-binding protein family 1  25.41 
 
 		 495 aa  66.2  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>