More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0378 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011661  Dtur_0375  extracellular solute-binding protein family 1  97.27 
 
 		 421 aa  809    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0378  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 420 aa  858    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1899  extracellular solute-binding protein, putative  30.39 
 
 		 416 aa  155  9e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.41529  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1634  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  30.39 
 
 		 416 aa  155  1e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7906  extracellular solute-binding protein family 1  29.6 
 
 		 420 aa  150  5e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.819994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2504  extracellular solute-binding protein family 1  28.82 
 
 		 442 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  27.44 
 
 		 427 aa  140  3e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3149  extracellular solute-binding protein  25.59 
 
 		 427 aa  140  4.999999999999999e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0795  extracellular solute-binding protein family 1  27.03 
 
 		 460 aa  138  2e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.215252  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0381  extracellular solute-binding protein family 1  29.62 
 
 		 421 aa  134  3.9999999999999996e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  27.79 
 
 		 414 aa  129  9.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06270  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.21 
 
 		 426 aa  126  7e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2731  extracellular solute-binding protein family 1  26.68 
 
 		 454 aa  120  3e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0513  extracellular solute-binding protein family 1  29 
 
 		 447 aa  110  3e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.000000038068  hitchhiker  0.000703825 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4688  extracellular solute-binding protein family 1  26.11 
 
 		 418 aa  111  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12078  sugar-binding lipoprotein  26.58 
 
 		 439 aa  110  6e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3394  ABC-type sugar transport systems permease component  23.85 
 
 		 411 aa  109  1e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.498756  normal  0.24931 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2451  extracellular solute-binding protein family 1  26.14 
 
 		 449 aa  105  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.135643  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1655  extracellular solute-binding protein family 1  24.45 
 
 		 425 aa  105  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186521  normal  0.186231 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2218  extracellular solute-binding protein family 1  25.75 
 
 		 479 aa  105  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00910899  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4621  extracellular solute-binding protein family 1  24.74 
 
 		 413 aa  105  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0183  extracellular solute-binding protein family 1  27.27 
 
 		 429 aa  105  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2403  extracellular solute-binding protein  24.07 
 
 		 441 aa  104  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0592  extracellular solute-binding protein  24.66 
 
 		 456 aa  103  4e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000165278  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2818  extracellular solute-binding protein  30.57 
 
 		 488 aa  102  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.179577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2524  extracellular solute-binding protein family 1  25.71 
 
 		 483 aa  100  3e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000000331289  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0399  extracellular solute-binding protein family 1  26.55 
 
 		 408 aa  100  4e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000195685  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2546  extracellular solute-binding protein  29.62 
 
 		 488 aa  100  6e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.39868  normal  0.139719 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12341  periplasmic sugar-binding lipoprotein uspC  26.68 
 
 		 440 aa  99.8  7e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2513  extracellular solute-binding protein family 1  26.63 
 
 		 441 aa  99.4  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29320  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.18 
 
 		 443 aa  98.6  2e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2552  extracellular solute-binding protein  23.33 
 
 		 443 aa  98.6  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000382941 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2315  extracellular solute-binding protein family 1  27.81 
 
 		 503 aa  98.2  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  25.41 
 
 		 415 aa  97.1  6e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  25.15 
 
 		 414 aa  96.7  6e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.84 
 
 		 419 aa  95.1  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.033461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0729  extracellular solute-binding protein family 1  26.76 
 
 		 443 aa  94.4  4e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000254304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3106  ABC transporter, substrate binding periplasmic component  27.53 
 
 		 408 aa  93.6  6e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3430  extracellular solute-binding protein family 1  27.03 
 
 		 415 aa  93.6  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04610  extracellular solute-binding protein family 1  25.5 
 
 		 431 aa  90.9  4e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  26.4 
 
 		 422 aa  89.7  8e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  25.89 
 
 		 437 aa  89.7  9e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01900  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.19 
 
 		 442 aa  88.6  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.867357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0144  extracellular solute-binding protein  24.94 
 
 		 403 aa  88.6  2e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.442205  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20470  extracellular solute-binding protein family 1  23.68 
 
 		 406 aa  87.8  3e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000403753  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  22.51 
 
 		 410 aa  87.4  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3121  extracellular solute-binding protein family 1  25.16 
 
 		 445 aa  86.7  7e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116931 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27690  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.06 
 
 		 431 aa  86.3  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.340884 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0274  extracellular solute-binding protein  26.04 
 
 		 439 aa  85.9  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.285114  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4632  extracellular solute-binding protein  27.81 
 
 		 419 aa  85.1  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.448727  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2164  extracellular solute-binding protein family 1  25.19 
 
 		 435 aa  85.1  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  28.12 
 
 		 420 aa  85.5  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1099  extracellular solute-binding protein  25.83 
 
 		 457 aa  84.7  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0188  extracellular solute-binding protein  25.22 
 
 		 420 aa  84.3  0.000000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3566  extracellular solute-binding protein  24.48 
 
 		 454 aa  83.6  0.000000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.42847  normal  0.297516 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5738  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  25.93 
 
 		 452 aa  82.4  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.599702  normal  0.0824986 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1359  extracellular solute-binding protein  22.97 
 
 		 458 aa  81.6  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2267  extracellular solute-binding protein family 1  24.38 
 
 		 445 aa  82  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00064551 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2703  extracellular solute-binding protein family 1  24.33 
 
 		 450 aa  81.3  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263225  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0719  extracellular solute-binding protein family 1  25.75 
 
 		 413 aa  80.9  0.00000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0236757  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2571  extracellular solute-binding protein  23.68 
 
 		 417 aa  80.9  0.00000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  22.25 
 
 		 411 aa  80.5  0.00000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  23.53 
 
 		 429 aa  80.1  0.00000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.62 
 
 		 430 aa  79.7  0.00000000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6156  extracellular solute-binding protein family 1  22.48 
 
 		 410 aa  79.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.889741  hitchhiker  0.000305646 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1152  extracellular solute-binding protein  24.1 
 
 		 393 aa  79.3  0.0000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0401617  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0265  extracellular solute-binding protein family 1  27.91 
 
 		 510 aa  78.6  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4984  extracellular solute-binding protein family 1  24.25 
 
 		 432 aa  77  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000108283  decreased coverage  0.000897425 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0137  extracellular solute-binding protein family 1  22.84 
 
 		 453 aa  76.6  0.0000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3121  extracellular solute-binding protein family 1  23.91 
 
 		 412 aa  76.6  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0270  extracellular solute-binding protein  24.21 
 
 		 419 aa  75.9  0.000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.562219  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0829  extracellular solute-binding protein family 1  23.71 
 
 		 504 aa  75.9  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6572  extracellular solute-binding protein family 1  23.22 
 
 		 410 aa  76.3  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00103217  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3393  extracellular solute-binding protein family 1  24.03 
 
 		 412 aa  75.1  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.205631 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2683  extracellular solute-binding protein family 1  23.04 
 
 		 446 aa  75.1  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0944  extracellular solute-binding protein family 1  22.5 
 
 		 433 aa  75.5  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.322748 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00380  extracellular solute-binding protein family 1  24.37 
 
 		 422 aa  74.7  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  22.62 
 
 		 424 aa  74.7  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2420  extracellular solute-binding protein  21.61 
 
 		 420 aa  74.7  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.228974 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4038  extracellular solute-binding protein family 1  25.54 
 
 		 405 aa  74.3  0.000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0322  extracellular solute-binding protein  23.29 
 
 		 419 aa  74.3  0.000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0263  extracellular solute-binding protein  25.52 
 
 		 439 aa  74.3  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.962251  hitchhiker  0.00117926 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3793  extracellular solute-binding protein family 1  25.32 
 
 		 459 aa  74.3  0.000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.46649  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6794  extracellular solute-binding protein family 1  23.72 
 
 		 430 aa  73.6  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2293  extracellular solute-binding protein family 1  24.35 
 
 		 425 aa  73.2  0.000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0656119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4557  extracellular solute-binding protein  24.11 
 
 		 412 aa  73.2  0.000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7208  extracellular solute-binding protein family 1  21.47 
 
 		 410 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  25.07 
 
 		 411 aa  72.4  0.00000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4083  extracellular solute-binding protein family 1  24.31 
 
 		 417 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  25.07 
 
 		 411 aa  72.4  0.00000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2726  extracellular solute-binding protein  22.36 
 
 		 437 aa  71.6  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.290956  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5331  extracellular solute-binding protein family 1  24.64 
 
 		 424 aa  71.6  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1020  extracellular solute-binding protein  23.96 
 
 		 459 aa  71.6  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000124434  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0698  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  25.87 
 
 		 366 aa  71.6  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436581  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1017  extracellular solute-binding protein  25.57 
 
 		 417 aa  72  0.00000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0416471  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29730  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.37 
 
 		 434 aa  72  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5048  extracellular solute-binding protein family 1  25.23 
 
 		 424 aa  71.2  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.133709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0354  extracellular solute-binding protein  21.91 
 
 		 419 aa  71.6  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.188589  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4320  extracellular solute-binding protein family 1  22.63 
 
 		 425 aa  71.6  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.811375  hitchhiker  0.00841489 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3674  ABC sugar transporter, periplasmic binding protein  24.03 
 
 		 404 aa  70.9  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>