More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0274 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0274  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 439 aa  888    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.285114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0263  extracellular solute-binding protein  76.56 
 
 		 439 aa  586  1e-166  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.962251  hitchhiker  0.00117926 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2451  extracellular solute-binding protein family 1  24.58 
 
 		 449 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.135643  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2474  extracellular solute-binding protein family 1  23.53 
 
 		 484 aa  102  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000108946  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2731  extracellular solute-binding protein family 1  24.47 
 
 		 454 aa  100  4e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2504  extracellular solute-binding protein family 1  26.15 
 
 		 442 aa  99  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3149  extracellular solute-binding protein  26.99 
 
 		 427 aa  99  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0729  extracellular solute-binding protein family 1  24.26 
 
 		 443 aa  96.7  8e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000254304  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0310  extracellular solute-binding protein family 1  26.96 
 
 		 443 aa  96.3  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2267  extracellular solute-binding protein family 1  23.59 
 
 		 445 aa  93.2  8e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00064551 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1020  extracellular solute-binding protein  23.15 
 
 		 459 aa  87  6e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000124434  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3430  extracellular solute-binding protein family 1  23.16 
 
 		 415 aa  86.7  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2524  extracellular solute-binding protein family 1  27.59 
 
 		 483 aa  85.9  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000000331289  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0183  extracellular solute-binding protein family 1  26.34 
 
 		 429 aa  85.1  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0375  extracellular solute-binding protein family 1  25.69 
 
 		 421 aa  85.1  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0378  extracellular solute-binding protein family 1  25.75 
 
 		 420 aa  85.1  0.000000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2303  extracellular solute-binding protein family 1  22.41 
 
 		 480 aa  84.7  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.316955  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  20.18 
 
 		 427 aa  84  0.000000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7906  extracellular solute-binding protein family 1  24.6 
 
 		 420 aa  84  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.819994  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1899  extracellular solute-binding protein, putative  21.56 
 
 		 416 aa  83.6  0.000000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.41529  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1634  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  21.56 
 
 		 416 aa  83.6  0.000000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  23.5 
 
 		 411 aa  80.9  0.00000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0354  extracellular solute-binding protein  24.41 
 
 		 419 aa  80.1  0.00000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.188589  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2218  extracellular solute-binding protein family 1  25.36 
 
 		 479 aa  79.3  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00910899  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0192  extracellular solute-binding protein family 1  26.43 
 
 		 444 aa  79  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.25123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12078  sugar-binding lipoprotein  25.69 
 
 		 439 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0513  extracellular solute-binding protein family 1  22.66 
 
 		 447 aa  77.8  0.0000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.000000038068  hitchhiker  0.000703825 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5398  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  24.75 
 
 		 403 aa  77.4  0.0000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.14652  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0829  extracellular solute-binding protein family 1  22.96 
 
 		 504 aa  77  0.0000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5802  extracellular solute-binding protein family 1  27.73 
 
 		 444 aa  76.3  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0809589 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3422  ABC-type sugar transport systems permease component  25.3 
 
 		 410 aa  75.9  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2403  extracellular solute-binding protein  22.16 
 
 		 441 aa  76.3  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3226  Transcriptional regulator  25.3 
 
 		 410 aa  75.9  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1655  extracellular solute-binding protein family 1  24.72 
 
 		 425 aa  75.1  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186521  normal  0.186231 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2315  extracellular solute-binding protein family 1  24.09 
 
 		 503 aa  74.7  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3106  ABC transporter, substrate binding periplasmic component  23.64 
 
 		 408 aa  74.7  0.000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00380  extracellular solute-binding protein family 1  21.77 
 
 		 422 aa  74.3  0.000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2313  extracellular solute-binding protein  24.37 
 
 		 901 aa  73.6  0.000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.708196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0795  extracellular solute-binding protein family 1  21.58 
 
 		 460 aa  73.2  0.000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.215252  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  22.7 
 
 		 414 aa  72.8  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2420  extracellular solute-binding protein  25.21 
 
 		 420 aa  72.8  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.228974 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  21.03 
 
 		 422 aa  72.8  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3394  ABC-type sugar transport systems permease component  24.31 
 
 		 411 aa  72  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.498756  normal  0.24931 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15560  extracellular solute-binding protein family 1  23.86 
 
 		 418 aa  72  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.94 
 
 		 407 aa  71.2  0.00000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2818  extracellular solute-binding protein  22.61 
 
 		 488 aa  70.9  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.179577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2546  extracellular solute-binding protein  22.61 
 
 		 488 aa  70.9  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.39868  normal  0.139719 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29320  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.73 
 
 		 443 aa  70.5  0.00000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4984  extracellular solute-binding protein family 1  24.37 
 
 		 432 aa  70.1  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000108283  decreased coverage  0.000897425 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3271  extracellular solute-binding protein family 1  24.26 
 
 		 473 aa  70.1  0.00000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4697  extracellular solute-binding protein family 1  23.01 
 
 		 442 aa  69.7  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00367387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3143  extracellular solute-binding protein  22.77 
 
 		 473 aa  69.3  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.536467  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0399  extracellular solute-binding protein family 1  20.7 
 
 		 408 aa  69.3  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000195685  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0656  extracellular solute-binding protein family 1  23.25 
 
 		 431 aa  68.9  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.31335 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3216  extracellular solute-binding protein  24.21 
 
 		 425 aa  68.6  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.949389 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0144  extracellular solute-binding protein  22.32 
 
 		 403 aa  68.9  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.442205  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  23.51 
 
 		 415 aa  67.8  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4621  extracellular solute-binding protein family 1  24.09 
 
 		 413 aa  68.2  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2552  extracellular solute-binding protein  21.87 
 
 		 443 aa  68.2  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000382941 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1359  extracellular solute-binding protein  21.91 
 
 		 458 aa  67.4  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3619  extracellular solute-binding protein  26.22 
 
 		 488 aa  67.4  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3566  extracellular solute-binding protein  21.34 
 
 		 454 aa  67  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.42847  normal  0.297516 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1152  extracellular solute-binding protein  20.65 
 
 		 393 aa  66.6  0.0000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0401617  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4159  extracellular solute-binding protein  23.42 
 
 		 421 aa  66.6  0.0000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.119299  normal  0.873951 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0630  extracellular solute-binding protein family 1  21.32 
 
 		 410 aa  66.2  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.505283 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  25.49 
 
 		 427 aa  66.2  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  23.11 
 
 		 429 aa  65.1  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4688  extracellular solute-binding protein family 1  24.55 
 
 		 418 aa  65.5  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6765  extracellular solute-binding protein family 1  23.01 
 
 		 419 aa  65.1  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.979933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0224  extracellular solute-binding protein  23.08 
 
 		 431 aa  65.5  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.21 
 
 		 430 aa  65.1  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1773  extracellular solute-binding protein family 1  23.05 
 
 		 421 aa  65.1  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0165592 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5852  extracellular solute-binding protein family 1  24.05 
 
 		 419 aa  64.7  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0381  extracellular solute-binding protein family 1  23.57 
 
 		 421 aa  64.7  0.000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6572  extracellular solute-binding protein family 1  23.71 
 
 		 410 aa  64.7  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00103217  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0516  extracellular solute-binding protein  25.75 
 
 		 488 aa  64.7  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6112  extracellular solute-binding protein family 1  25.08 
 
 		 424 aa  64.7  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.521338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27690  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.5 
 
 		 431 aa  64.7  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.340884 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6156  extracellular solute-binding protein family 1  23.71 
 
 		 410 aa  64.3  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.889741  hitchhiker  0.000305646 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0719  extracellular solute-binding protein family 1  21.9 
 
 		 413 aa  63.9  0.000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0236757  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0297  extracellular solute-binding protein family 1  25.5 
 
 		 453 aa  63.9  0.000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0248346 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6524  extracellular solute-binding protein family 1  23.69 
 
 		 424 aa  63.5  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.514278  normal  0.451088 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4148  extracellular solute-binding protein  26.04 
 
 		 426 aa  63.5  0.000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0472509  normal  0.106363 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4038  extracellular solute-binding protein family 1  23.55 
 
 		 405 aa  63.2  0.000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3553  hypothetical protein  25.89 
 
 		 427 aa  62.8  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2418  extracellular solute-binding protein family 1  23.29 
 
 		 447 aa  63.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  24.33 
 
 		 410 aa  62.8  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21150  carbohydrate-binding protein  24.85 
 
 		 428 aa  62.4  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.396929  normal  0.174783 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2146  extracellular solute-binding protein  21.19 
 
 		 414 aa  62  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0322  extracellular solute-binding protein family 1  23.17 
 
 		 435 aa  62  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2571  extracellular solute-binding protein  20.93 
 
 		 417 aa  62  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3910  extracellular solute-binding protein family 1  21.29 
 
 		 412 aa  61.6  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.198843 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4883  extracellular solute-binding protein family 1  25.12 
 
 		 436 aa  61.6  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.504344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2513  extracellular solute-binding protein family 1  21.99 
 
 		 441 aa  61.2  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0955  extracellular solute-binding protein family 1  21.09 
 
 		 437 aa  60.8  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.152307 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0129  extracellular solute-binding protein family 1  19.93 
 
 		 426 aa  61.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.57996  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06270  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.15 
 
 		 426 aa  60.8  0.00000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0592  extracellular solute-binding protein  21.16 
 
 		 456 aa  60.8  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000165278  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6794  extracellular solute-binding protein family 1  24.32 
 
 		 430 aa  60.5  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2315  extracellular solute-binding protein  23.33 
 
 		 925 aa  60.8  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>