More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0516 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3619  extracellular solute-binding protein  95.08 
 
 		 488 aa  947    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0516  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 488 aa  1004    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0265  extracellular solute-binding protein family 1  58.08 
 
 		 510 aa  587  1e-166  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1359  extracellular solute-binding protein  30.7 
 
 		 458 aa  108  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0729  extracellular solute-binding protein family 1  27.75 
 
 		 443 aa  100  4e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000254304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12078  sugar-binding lipoprotein  29.14 
 
 		 439 aa  96.7  8e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3149  extracellular solute-binding protein  28.31 
 
 		 427 aa  95.5  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2218  extracellular solute-binding protein family 1  28.32 
 
 		 479 aa  93.6  6e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00910899  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3566  extracellular solute-binding protein  27.76 
 
 		 454 aa  92  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.42847  normal  0.297516 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2524  extracellular solute-binding protein family 1  27.6 
 
 		 483 aa  91.7  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000000331289  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1686  extracellular solute-binding protein family 1  24.08 
 
 		 493 aa  91.3  4e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2513  extracellular solute-binding protein family 1  24.3 
 
 		 441 aa  91.3  4e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7906  extracellular solute-binding protein family 1  33.59 
 
 		 420 aa  89  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.819994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0719  extracellular solute-binding protein family 1  30.8 
 
 		 413 aa  87.8  4e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0236757  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3957  extracellular solute-binding protein family 1  31.34 
 
 		 432 aa  86.7  9e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3430  extracellular solute-binding protein family 1  27.37 
 
 		 415 aa  86.3  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0829  extracellular solute-binding protein family 1  26.73 
 
 		 504 aa  85.1  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1696  extracellular solute-binding protein  26.78 
 
 		 436 aa  84.3  0.000000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00506774  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0381  extracellular solute-binding protein family 1  26.38 
 
 		 421 aa  82.8  0.00000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  31.08 
 
 		 427 aa  82  0.00000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2504  extracellular solute-binding protein family 1  24.75 
 
 		 442 aa  82  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5349  extracellular solute-binding protein family 1  28.92 
 
 		 406 aa  81.6  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.535832 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1680  extracellular solute-binding protein family 1  28.04 
 
 		 430 aa  81.3  0.00000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.173253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2920  extracellular solute-binding protein family 1  25.63 
 
 		 424 aa  79.3  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0289  extracellular solute-binding protein  27.44 
 
 		 437 aa  78.6  0.0000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.00000019091  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2403  extracellular solute-binding protein  27.61 
 
 		 441 aa  76.6  0.0000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2315  extracellular solute-binding protein  25.18 
 
 		 925 aa  76.6  0.0000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0310  extracellular solute-binding protein family 1  25.83 
 
 		 443 aa  76.3  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04610  extracellular solute-binding protein family 1  30.56 
 
 		 431 aa  75.9  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0721  extracellular solute-binding protein  26.13 
 
 		 437 aa  75.1  0.000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.540981  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4883  extracellular solute-binding protein family 1  28.62 
 
 		 436 aa  75.5  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.504344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2552  extracellular solute-binding protein  27.41 
 
 		 443 aa  75.5  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000382941 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0291  extracellular solute-binding protein  26.71 
 
 		 449 aa  74.7  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2313  extracellular solute-binding protein  26.86 
 
 		 901 aa  74.7  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.708196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3152  extracellular solute-binding protein  25.11 
 
 		 970 aa  74.7  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1634  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  31.62 
 
 		 416 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1899  extracellular solute-binding protein, putative  31.62 
 
 		 416 aa  73.9  0.000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.41529  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0183  extracellular solute-binding protein family 1  27.61 
 
 		 429 aa  73.9  0.000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2818  extracellular solute-binding protein  26.38 
 
 		 488 aa  73.9  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.179577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  26.37 
 
 		 411 aa  73.6  0.000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  26.37 
 
 		 411 aa  73.6  0.000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5802  extracellular solute-binding protein family 1  27.55 
 
 		 444 aa  72.8  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0809589 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  25.64 
 
 		 411 aa  73.2  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2267  extracellular solute-binding protein family 1  29.94 
 
 		 445 aa  72.8  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00064551 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  25.23 
 
 		 414 aa  72.4  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0348  extracellular solute-binding protein family 1  27.43 
 
 		 419 aa  71.6  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3106  ABC transporter, substrate binding periplasmic component  24.62 
 
 		 408 aa  71.2  0.00000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4697  extracellular solute-binding protein family 1  28.88 
 
 		 442 aa  70.9  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00367387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29320  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.51 
 
 		 443 aa  70.5  0.00000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0955  extracellular solute-binding protein family 1  24.62 
 
 		 437 aa  70.1  0.00000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.152307 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  26.56 
 
 		 415 aa  70.1  0.00000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0406  extracellular solute-binding protein family 1  24.46 
 
 		 428 aa  69.7  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00219397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3459  extracellular solute-binding protein family 1  28.98 
 
 		 458 aa  70.1  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.725469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2546  extracellular solute-binding protein  26.6 
 
 		 488 aa  69.3  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.39868  normal  0.139719 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1392  extracellular solute-binding protein family 1  22.39 
 
 		 445 aa  68.6  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.84 
 
 		 407 aa  68.9  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1229  extracellular solute-binding protein  25.68 
 
 		 461 aa  68.6  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0257979  normal  0.868479 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0592  extracellular solute-binding protein  29.07 
 
 		 456 aa  68.6  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000165278  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3226  Transcriptional regulator  25.38 
 
 		 410 aa  68.2  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3422  ABC-type sugar transport systems permease component  25.38 
 
 		 410 aa  68.2  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4289  extracellular solute-binding protein  26.44 
 
 		 466 aa  67.8  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0255  extracellular solute-binding protein family 1  25.47 
 
 		 439 aa  67.8  0.0000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3168  extracellular solute-binding protein family 1  24.18 
 
 		 419 aa  67  0.0000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2474  extracellular solute-binding protein family 1  23.36 
 
 		 484 aa  67  0.0000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000108946  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3386  extracellular solute-binding protein family 1  27.73 
 
 		 440 aa  67  0.0000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0753  extracellular solute-binding protein  27.17 
 
 		 437 aa  67  0.0000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0385  extracellular solute-binding protein family 1  26.46 
 
 		 410 aa  67  0.0000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0390662 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4621  extracellular solute-binding protein family 1  29.64 
 
 		 413 aa  66.6  0.0000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3240  extracellular solute-binding protein family 1  24.18 
 
 		 431 aa  66.6  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3394  ABC-type sugar transport systems permease component  24.69 
 
 		 411 aa  66.6  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.498756  normal  0.24931 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20470  extracellular solute-binding protein family 1  22.85 
 
 		 406 aa  66.2  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000403753  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2451  extracellular solute-binding protein family 1  27.64 
 
 		 449 aa  66.6  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.135643  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  26.12 
 
 		 414 aa  66.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0700  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, glycerol-3-phosphate-binding protein  24.95 
 
 		 458 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2365  extracellular solute-binding protein family 1  31.11 
 
 		 416 aa  65.9  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.618021 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.76 
 
 		 419 aa  65.9  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.033461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2146  extracellular solute-binding protein  25.09 
 
 		 414 aa  65.5  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3895  extracellular solute-binding protein  26.72 
 
 		 433 aa  65.1  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0378  extracellular solute-binding protein family 1  26.27 
 
 		 420 aa  64.7  0.000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3712  extracellular solute-binding protein family 1  25.7 
 
 		 421 aa  64.3  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.411366 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2315  extracellular solute-binding protein family 1  24.89 
 
 		 503 aa  64.3  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2731  extracellular solute-binding protein family 1  26.84 
 
 		 454 aa  64.3  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3240  extracellular solute-binding protein  26.36 
 
 		 434 aa  63.9  0.000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4688  extracellular solute-binding protein family 1  29.03 
 
 		 418 aa  63.5  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5048  extracellular solute-binding protein family 1  26.71 
 
 		 424 aa  63.5  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.133709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0358  extracellular solute-binding protein family 1  27.25 
 
 		 441 aa  63.5  0.000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0144  extracellular solute-binding protein  25.15 
 
 		 403 aa  63.2  0.00000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.442205  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0322  extracellular solute-binding protein family 1  23.43 
 
 		 435 aa  62.8  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1655  extracellular solute-binding protein family 1  26.8 
 
 		 425 aa  62.8  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186521  normal  0.186231 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0126  extracellular solute-binding protein family 1  25.12 
 
 		 477 aa  63.2  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2659  extracellular solute-binding protein family 1  25.73 
 
 		 495 aa  62.8  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0274  extracellular solute-binding protein  25.53 
 
 		 439 aa  62.8  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.285114  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0480  glycerol-3-phosphate ABC transporter, glycerol-3-phosphate-binding protein  26.45 
 
 		 458 aa  62  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0482  glycerol-3-phosphate ABC transporter, glycerol-3-phosphate-binding protein  26.45 
 
 		 458 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5738  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  22.91 
 
 		 452 aa  62.4  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.599702  normal  0.0824986 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0062  extracellular solute-binding protein  24.19 
 
 		 436 aa  62.4  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0483  extracellular solute-binding protein  25.6 
 
 		 458 aa  62.4  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0770  extracellular solute-binding protein family 1  26.89 
 
 		 444 aa  62  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2762  extracellular solute-binding protein  27.5 
 
 		 431 aa  62.4  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0569  glycerol-3-phosphate ABC transporter glycerol-3-phosphate-binding protein  26.45 
 
 		 458 aa  61.6  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>