More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2315 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2313  extracellular solute-binding protein  80.58 
 
 		 901 aa  1483    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.708196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2315  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 925 aa  1883    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3152  extracellular solute-binding protein  71.43 
 
 		 970 aa  1345    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0719  extracellular solute-binding protein family 1  23.8 
 
 		 413 aa  90.9  9e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0236757  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7906  extracellular solute-binding protein family 1  28.23 
 
 		 420 aa  88.6  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.819994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0729  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 443 aa  87.4  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000254304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  28.03 
 
 		 414 aa  86.3  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2267  extracellular solute-binding protein family 1  27.78 
 
 		 445 aa  85.5  0.000000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00064551 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12078  sugar-binding lipoprotein  27.45 
 
 		 439 aa  84.7  0.000000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4621  extracellular solute-binding protein family 1  28.19 
 
 		 413 aa  82.8  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3149  extracellular solute-binding protein  25.89 
 
 		 427 aa  81.6  0.00000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0656  extracellular solute-binding protein family 1  26.38 
 
 		 431 aa  79.3  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.31335 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  25.53 
 
 		 427 aa  79.3  0.0000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0795  extracellular solute-binding protein family 1  23.64 
 
 		 460 aa  79.3  0.0000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.215252  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2504  extracellular solute-binding protein family 1  24.92 
 
 		 442 aa  78.6  0.0000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  24.34 
 
 		 428 aa  78.6  0.0000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2315  extracellular solute-binding protein family 1  27.78 
 
 		 503 aa  78.6  0.0000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3619  extracellular solute-binding protein  25.72 
 
 		 488 aa  77.8  0.0000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4688  extracellular solute-binding protein family 1  31.76 
 
 		 418 aa  77  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0516  extracellular solute-binding protein  25.18 
 
 		 488 aa  77  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2524  extracellular solute-binding protein family 1  25.95 
 
 		 483 aa  74.7  0.000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000000331289  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0224  extracellular solute-binding protein  25.9 
 
 		 431 aa  74.3  0.000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27690  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  31.1 
 
 		 431 aa  74.3  0.000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.340884 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2731  extracellular solute-binding protein family 1  26.18 
 
 		 454 aa  74.3  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.57 
 
 		 407 aa  73.6  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1392  extracellular solute-binding protein family 1  21.47 
 
 		 445 aa  72.4  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3216  extracellular solute-binding protein  28.84 
 
 		 425 aa  70.9  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.949389 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4632  extracellular solute-binding protein  26.45 
 
 		 419 aa  70.1  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.448727  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0829  extracellular solute-binding protein family 1  25.32 
 
 		 504 aa  69.7  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0075  extracellular solute-binding protein family 1  24.2 
 
 		 441 aa  68.6  0.0000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  24.29 
 
 		 415 aa  68.6  0.0000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2513  extracellular solute-binding protein family 1  23.85 
 
 		 441 aa  68.6  0.0000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4083  extracellular solute-binding protein family 1  23.58 
 
 		 417 aa  67.8  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0687  extracellular solute-binding protein  26.51 
 
 		 407 aa  67  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.376534  normal  0.15795 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4733  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, glycerol-3-phosphate-binding protein  24.47 
 
 		 458 aa  65.9  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1899  extracellular solute-binding protein, putative  26.24 
 
 		 416 aa  65.9  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.41529  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1634  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  26.24 
 
 		 416 aa  65.9  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5802  extracellular solute-binding protein family 1  31.03 
 
 		 444 aa  66.2  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0809589 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5738  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  23.3 
 
 		 452 aa  65.5  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.599702  normal  0.0824986 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  25.8 
 
 		 424 aa  65.5  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9091  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  24.92 
 
 		 422 aa  65.1  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.306335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2640  extracellular solute-binding protein  22.6 
 
 		 436 aa  65.1  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.932575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0606  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, glycerol-3-phosphate-binding protein  24.82 
 
 		 458 aa  64.3  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3226  Transcriptional regulator  26.05 
 
 		 410 aa  64.3  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2218  extracellular solute-binding protein family 1  24.05 
 
 		 479 aa  64.3  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00910899  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3422  ABC-type sugar transport systems permease component  26.05 
 
 		 410 aa  64.3  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5349  extracellular solute-binding protein family 1  26.7 
 
 		 406 aa  63.9  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.535832 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2474  extracellular solute-binding protein family 1  23.44 
 
 		 484 aa  63.5  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000108946  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0062  extracellular solute-binding protein  23.32 
 
 		 436 aa  63.2  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1359  extracellular solute-binding protein  27.71 
 
 		 458 aa  63.2  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1820  extracellular solute-binding protein  23.57 
 
 		 411 aa  63.5  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.148067  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1696  extracellular solute-binding protein  27.67 
 
 		 436 aa  63.2  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00506774  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0289  extracellular solute-binding protein  22.07 
 
 		 437 aa  63.2  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.00000019091  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0632  glycerol-3-phosphate ABC transporter, glycerol-3-phosphate-binding protein, putative  24.82 
 
 		 458 aa  62.8  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  25.95 
 
 		 420 aa  62.8  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.54 
 
 		 426 aa  63.2  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2571  extracellular solute-binding protein  19.94 
 
 		 417 aa  62.8  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2703  extracellular solute-binding protein family 1  24.86 
 
 		 450 aa  62.4  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263225  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1685  extracellular solute-binding protein family 1  27.67 
 
 		 434 aa  62.4  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0265  extracellular solute-binding protein family 1  25.66 
 
 		 510 aa  62.4  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0700  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, glycerol-3-phosphate-binding protein  24.47 
 
 		 458 aa  62.4  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0381  extracellular solute-binding protein family 1  30.05 
 
 		 421 aa  62  0.00000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2209  extracellular solute-binding protein family 1  21.13 
 
 		 487 aa  61.2  0.00000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1866  extracellular solute-binding protein family 1  26.8 
 
 		 434 aa  61.2  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0538  glycerol-3-phosphate ABC transporter glycerol-3-phosphate-binding protein  24.11 
 
 		 458 aa  61.2  0.00000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.406699  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0569  glycerol-3-phosphate ABC transporter glycerol-3-phosphate-binding protein  24.11 
 
 		 458 aa  61.2  0.00000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0895  extracellular solute-binding protein family 1  27.54 
 
 		 436 aa  60.5  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.441999 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0480  glycerol-3-phosphate ABC transporter, glycerol-3-phosphate-binding protein  24.11 
 
 		 458 aa  60.8  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0482  glycerol-3-phosphate ABC transporter, glycerol-3-phosphate-binding protein  24.11 
 
 		 458 aa  60.8  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6794  extracellular solute-binding protein family 1  25.5 
 
 		 430 aa  60.5  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0625  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, glycerol-3-phosphate-binding protein  24.11 
 
 		 458 aa  60.8  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0770  extracellular solute-binding protein family 1  25.1 
 
 		 444 aa  60.5  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2310  extracellular solute-binding protein family 1  20.63 
 
 		 425 aa  60.8  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000523246  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2297  extracellular solute-binding protein  23.08 
 
 		 416 aa  60.5  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.33558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0375  extracellular solute-binding protein family 1  24.18 
 
 		 421 aa  60.1  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06270  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.16 
 
 		 426 aa  60.1  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0137  extracellular solute-binding protein family 1  25.26 
 
 		 453 aa  59.7  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2403  extracellular solute-binding protein  23.15 
 
 		 441 aa  60.1  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3566  extracellular solute-binding protein  27.66 
 
 		 454 aa  60.1  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.42847  normal  0.297516 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0721  extracellular solute-binding protein  21.81 
 
 		 437 aa  59.7  0.0000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.540981  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2417  transcriptional regulator, ABC transporter  25.42 
 
 		 421 aa  59.7  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0335393 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0378  extracellular solute-binding protein family 1  23.1 
 
 		 420 aa  59.3  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2552  extracellular solute-binding protein  25.82 
 
 		 443 aa  59.3  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000382941 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0753  extracellular solute-binding protein  29.33 
 
 		 437 aa  59.3  0.0000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0274  extracellular solute-binding protein  21.64 
 
 		 439 aa  59.3  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.285114  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  21.47 
 
 		 411 aa  59.3  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  23.18 
 
 		 422 aa  59.3  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6751  extracellular solute-binding protein family 1  24.88 
 
 		 441 aa  58.9  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2294  extracellular solute-binding protein family 1  27.62 
 
 		 448 aa  58.5  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0483  extracellular solute-binding protein  23.76 
 
 		 458 aa  58.9  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0183  extracellular solute-binding protein family 1  21.72 
 
 		 429 aa  58.5  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  22.07 
 
 		 431 aa  58.2  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1099  extracellular solute-binding protein  26.7 
 
 		 457 aa  58.2  0.0000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5409  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  23.47 
 
 		 457 aa  58.2  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07450  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.16 
 
 		 464 aa  57.8  0.0000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0849  extracellular solute-binding protein  27.78 
 
 		 434 aa  57.4  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0177782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3983  extracellular solute-binding protein family 1  23.85 
 
 		 456 aa  57  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3106  ABC transporter, substrate binding periplasmic component  24.21 
 
 		 408 aa  57  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3459  extracellular solute-binding protein family 1  25.91 
 
 		 458 aa  57.4  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.725469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2546  extracellular solute-binding protein  28.71 
 
 		 488 aa  57.8  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.39868  normal  0.139719 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>