298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3152 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2313  extracellular solute-binding protein  65.31 
 
 		 901 aa  1208    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.708196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2315  extracellular solute-binding protein  71.32 
 
 		 925 aa  1345    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3152  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 970 aa  1969    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0719  extracellular solute-binding protein family 1  24.86 
 
 		 413 aa  97.4  1e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0236757  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2267  extracellular solute-binding protein family 1  28.91 
 
 		 445 aa  96.3  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00064551 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7906  extracellular solute-binding protein family 1  28.57 
 
 		 420 aa  93.2  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.819994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  25.3 
 
 		 414 aa  88.2  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0729  extracellular solute-binding protein family 1  25.88 
 
 		 443 aa  79.7  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000254304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12078  sugar-binding lipoprotein  27.57 
 
 		 439 aa  79.3  0.0000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4621  extracellular solute-binding protein family 1  27.23 
 
 		 413 aa  78.6  0.0000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  23.53 
 
 		 427 aa  78.2  0.0000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3619  extracellular solute-binding protein  25.7 
 
 		 488 aa  77  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4688  extracellular solute-binding protein family 1  28.51 
 
 		 418 aa  75.1  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2504  extracellular solute-binding protein family 1  26.84 
 
 		 442 aa  75.1  0.000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0516  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 488 aa  73.9  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0183  extracellular solute-binding protein family 1  23.58 
 
 		 429 aa  72  0.00000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2571  extracellular solute-binding protein  22.31 
 
 		 417 aa  72  0.00000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27690  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  30.23 
 
 		 431 aa  71.6  0.00000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.340884 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3149  extracellular solute-binding protein  25.51 
 
 		 427 aa  71.2  0.00000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2513  extracellular solute-binding protein family 1  26.67 
 
 		 441 aa  71.2  0.00000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  22.04 
 
 		 422 aa  70.5  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0137  extracellular solute-binding protein family 1  26.97 
 
 		 453 aa  70.1  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2524  extracellular solute-binding protein family 1  26.12 
 
 		 483 aa  70.5  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000000331289  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1392  extracellular solute-binding protein family 1  21.41 
 
 		 445 aa  70.5  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4083  extracellular solute-binding protein family 1  23.56 
 
 		 417 aa  70.1  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6794  extracellular solute-binding protein family 1  25.85 
 
 		 430 aa  69.3  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2731  extracellular solute-binding protein family 1  25.38 
 
 		 454 aa  69.3  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5349  extracellular solute-binding protein family 1  27.33 
 
 		 406 aa  69.3  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.535832 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2696  extracellular solute-binding protein  23.6 
 
 		 420 aa  68.6  0.0000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.240659  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2315  extracellular solute-binding protein family 1  25.74 
 
 		 503 aa  68.2  0.0000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0632  glycerol-3-phosphate ABC transporter, glycerol-3-phosphate-binding protein, putative  24.91 
 
 		 458 aa  67.4  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0700  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, glycerol-3-phosphate-binding protein  24.54 
 
 		 458 aa  66.6  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0829  extracellular solute-binding protein family 1  24.15 
 
 		 504 aa  66.2  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5738  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  23.84 
 
 		 452 aa  66.2  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.599702  normal  0.0824986 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0381  extracellular solute-binding protein family 1  26.51 
 
 		 421 aa  66.2  0.000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1899  extracellular solute-binding protein, putative  24.12 
 
 		 416 aa  65.9  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.41529  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1634  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  24.12 
 
 		 416 aa  65.5  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  23.53 
 
 		 428 aa  65.9  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  23.92 
 
 		 424 aa  65.5  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0538  glycerol-3-phosphate ABC transporter glycerol-3-phosphate-binding protein  24.18 
 
 		 458 aa  65.1  0.000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.406699  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0480  glycerol-3-phosphate ABC transporter, glycerol-3-phosphate-binding protein  24.18 
 
 		 458 aa  65.1  0.000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0569  glycerol-3-phosphate ABC transporter glycerol-3-phosphate-binding protein  24.18 
 
 		 458 aa  65.1  0.000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4733  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, glycerol-3-phosphate-binding protein  24.18 
 
 		 458 aa  65.1  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0483  extracellular solute-binding protein  24.18 
 
 		 458 aa  65.1  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0482  glycerol-3-phosphate ABC transporter, glycerol-3-phosphate-binding protein  24.18 
 
 		 458 aa  65.1  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0606  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, glycerol-3-phosphate-binding protein  24.18 
 
 		 458 aa  65.1  0.000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2474  extracellular solute-binding protein family 1  24.26 
 
 		 484 aa  64.7  0.000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000108946  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0625  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, glycerol-3-phosphate-binding protein  24.18 
 
 		 458 aa  64.7  0.000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3430  extracellular solute-binding protein family 1  21.15 
 
 		 415 aa  64.3  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1655  extracellular solute-binding protein family 1  26.45 
 
 		 425 aa  64.3  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186521  normal  0.186231 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3216  extracellular solute-binding protein  24.6 
 
 		 425 aa  64.3  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.949389 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  26.91 
 
 		 415 aa  64.3  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4632  extracellular solute-binding protein  24.33 
 
 		 419 aa  64.3  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.448727  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0045  extracellular solute-binding protein family 1  28.57 
 
 		 414 aa  63.9  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.713374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5802  extracellular solute-binding protein family 1  43.37 
 
 		 444 aa  63.2  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0809589 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2218  extracellular solute-binding protein family 1  23.34 
 
 		 479 aa  63.2  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00910899  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0795  extracellular solute-binding protein family 1  23.48 
 
 		 460 aa  62.8  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.215252  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0075  extracellular solute-binding protein family 1  24.79 
 
 		 441 aa  62.4  0.00000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  22.08 
 
 		 411 aa  62  0.00000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  22.08 
 
 		 411 aa  62  0.00000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2546  extracellular solute-binding protein  30.43 
 
 		 488 aa  62  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.39868  normal  0.139719 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2209  extracellular solute-binding protein family 1  22.65 
 
 		 487 aa  61.6  0.00000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0895  extracellular solute-binding protein family 1  28 
 
 		 436 aa  62  0.00000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.441999 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2818  extracellular solute-binding protein  30.43 
 
 		 488 aa  61.6  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.179577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3459  extracellular solute-binding protein family 1  31.14 
 
 		 458 aa  60.8  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.725469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0508  extracellular solute-binding protein family 1  28.22 
 
 		 514 aa  60.1  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0497  extracellular solute-binding protein family 1  24.23 
 
 		 459 aa  59.7  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.128275 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0552  extracellular solute-binding protein  25.53 
 
 		 445 aa  60.1  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.764632 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1392  extracellular solute-binding protein  21.6 
 
 		 449 aa  60.1  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000859872  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4697  extracellular solute-binding protein family 1  26.56 
 
 		 442 aa  59.7  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00367387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2703  extracellular solute-binding protein family 1  23.99 
 
 		 450 aa  59.3  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263225  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  22.15 
 
 		 430 aa  59.3  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1099  extracellular solute-binding protein  22.38 
 
 		 457 aa  59.3  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0687  extracellular solute-binding protein  23.14 
 
 		 407 aa  58.9  0.0000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.376534  normal  0.15795 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2640  extracellular solute-binding protein  29.63 
 
 		 436 aa  58.9  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.932575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0224  extracellular solute-binding protein  28.4 
 
 		 431 aa  58.9  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0656  extracellular solute-binding protein family 1  26.54 
 
 		 431 aa  58.5  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.31335 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3121  extracellular solute-binding protein family 1  23.08 
 
 		 412 aa  58.2  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  26.52 
 
 		 420 aa  57.8  0.0000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.45 
 
 		 407 aa  57.8  0.0000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06270  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.09 
 
 		 426 aa  57.4  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1359  extracellular solute-binding protein  26.04 
 
 		 458 aa  57.4  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1820  extracellular solute-binding protein  21.99 
 
 		 411 aa  57.4  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.148067  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2614  extracellular solute-binding protein family 1  24.05 
 
 		 461 aa  57.4  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000017055  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  24.17 
 
 		 435 aa  56.6  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  21.54 
 
 		 431 aa  57  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0405  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  21.2 
 
 		 438 aa  56.2  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  22.35 
 
 		 424 aa  56.2  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1152  extracellular solute-binding protein  29.7 
 
 		 393 aa  56.2  0.000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0401617  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5331  extracellular solute-binding protein family 1  21.76 
 
 		 424 aa  56.2  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2195  extracellular solute-binding protein family 1  24.04 
 
 		 450 aa  55.5  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2545  extracellular solute-binding protein family 1  25.32 
 
 		 442 aa  55.8  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0375  extracellular solute-binding protein family 1  23.9 
 
 		 421 aa  55.8  0.000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6751  extracellular solute-binding protein family 1  30.4 
 
 		 441 aa  55.1  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4883  extracellular solute-binding protein family 1  22.89 
 
 		 436 aa  55.1  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.504344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0265  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 510 aa  55.1  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0591  extracellular solute-binding protein  21.94 
 
 		 421 aa  55.1  0.000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0610101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  21.56 
 
 		 423 aa  55.1  0.000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1866  extracellular solute-binding protein family 1  28.76 
 
 		 434 aa  54.7  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0274  extracellular solute-binding protein  22.48 
 
 		 439 aa  54.7  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.285114  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>