More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0591 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0591  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
421 aa  862    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0610101  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2090  extracellular solute-binding protein family 1  54.74 
 
 
423 aa  469  1.0000000000000001e-131  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000307561  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3329  extracellular solute-binding protein  58.37 
 
 
423 aa  467  9.999999999999999e-131  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3146  extracellular solute-binding protein family 1  56.58 
 
 
439 aa  457  1e-127  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.654082  normal  0.268339 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0258  extracellular solute-binding protein  52.85 
 
 
419 aa  445  1.0000000000000001e-124  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0889  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  48.1 
 
 
424 aa  414  1e-114  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.613044  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0762  extracellular solute-binding protein  49.52 
 
 
424 aa  414  1e-114  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000277245  normal  0.855778 
 
 
 
NC_011899  Hore_20870  extracellular solute-binding protein family 1  49.41 
 
 
430 aa  400  9.999999999999999e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3812  extracellular solute-binding protein  47.04 
 
 
423 aa  371  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.353807  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0025  extracellular solute-binding protein  45.39 
 
 
422 aa  367  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.669897  normal  0.473652 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4395  extracellular solute-binding protein  43.3 
 
 
420 aa  364  1e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.87283  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2940  extracellular solute-binding protein  43.97 
 
 
421 aa  360  2e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459152  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2526  extracellular solute-binding protein  42.52 
 
 
421 aa  352  5e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0304  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  45.76 
 
 
421 aa  349  5e-95  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.367443  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4442  extracellular solute-binding protein  44.18 
 
 
425 aa  342  5e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00539632  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  43.14 
 
 
411 aa  324  2e-87  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  43.14 
 
 
411 aa  323  3e-87  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0397  extracellular solute-binding protein family 1  42.22 
 
 
522 aa  318  1e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1820  extracellular solute-binding protein  42.18 
 
 
411 aa  316  4e-85  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.148067  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0450  extracellular solute-binding protein  42.54 
 
 
414 aa  312  6.999999999999999e-84  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.308403  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0027  extracellular solute-binding protein  40.05 
 
 
413 aa  302  7.000000000000001e-81  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000908101  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  38.85 
 
 
428 aa  258  1e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  37.38 
 
 
437 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1991  extracellular solute-binding protein  36.19 
 
 
455 aa  235  9e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.603432  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0213  twin-arginine translocation pathway signal  35.04 
 
 
446 aa  229  5e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0669  extracellular solute-binding protein  35.41 
 
 
439 aa  221  9.999999999999999e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0062  extracellular solute-binding protein  36.68 
 
 
436 aa  219  8.999999999999998e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1331  extracellular solute-binding protein family 1  37.13 
 
 
464 aa  209  9e-53  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2310  extracellular solute-binding protein family 1  32.12 
 
 
425 aa  207  3e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000523246  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2244  extracellular solute-binding protein family 1  30.98 
 
 
440 aa  201  3e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0958946 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1408  ABC transporter, likely sugar solute binding protein  33.24 
 
 
421 aa  193  6e-48  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.590186  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1015  extracellular solute-binding protein family 1  34.8 
 
 
418 aa  193  6e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.706197  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2459  extracellular solute-binding protein family 1  33.18 
 
 
419 aa  192  1e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.846254  normal  0.585846 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2797  extracellular solute-binding protein family 1  33.33 
 
 
426 aa  191  2e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0870  extracellular solute-binding protein family 1  32.98 
 
 
419 aa  191  2e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.649209  normal  0.121264 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0950  putative multiple sugar transport system substrate-binding protein  32.59 
 
 
438 aa  187  3e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15281  ABC transporter for sugars, solute-binding protein  31.23 
 
 
422 aa  187  4e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.493249 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0138  extracellular solute-binding protein  31.21 
 
 
412 aa  184  2.0000000000000003e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2237  extracellular solute-binding protein family 1  35.92 
 
 
466 aa  185  2.0000000000000003e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1697  extracellular solute-binding protein  31.94 
 
 
447 aa  184  3e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00303465  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3687  extracellular solute-binding protein  30.97 
 
 
453 aa  181  2.9999999999999997e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1078  ABC transporter, likely sugar solute binding protein  30.25 
 
 
433 aa  175  9.999999999999999e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1626  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  32.37 
 
 
418 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.188232 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0623  extracellular solute-binding protein family 1  34.28 
 
 
428 aa  174  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.58509 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0413  extracellular solute-binding protein  34.46 
 
 
428 aa  172  6.999999999999999e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4015  extracellular solute-binding protein family 1  30.71 
 
 
434 aa  166  1.0000000000000001e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0770441 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2348  extracellular solute-binding protein  34.24 
 
 
363 aa  150  3e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.585172 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3121  extracellular solute-binding protein family 1  30.27 
 
 
412 aa  139  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0282  extracellular solute-binding protein  29.6 
 
 
423 aa  138  2e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3393  extracellular solute-binding protein family 1  29.54 
 
 
412 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.205631 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0807  extracellular solute-binding protein family 1  30.18 
 
 
420 aa  136  7.000000000000001e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4617  extracellular solute-binding protein  29.36 
 
 
433 aa  135  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0699008  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2297  extracellular solute-binding protein  30.03 
 
 
416 aa  133  5e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.33558  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4557  extracellular solute-binding protein  30.4 
 
 
412 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302395  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4682  extracellular solute-binding protein  28.44 
 
 
412 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0252692  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5508  extracellular solute-binding protein  27.97 
 
 
412 aa  126  6e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3055  extracellular solute-binding protein family 1  30.73 
 
 
449 aa  126  7e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3592  extracellular solute-binding protein  27.97 
 
 
439 aa  126  7e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4775  extracellular solute-binding protein  27.97 
 
 
439 aa  126  7e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1331  extracellular solute-binding protein family 1  29.09 
 
 
448 aa  122  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000205805  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0869  extracellular solute-binding protein  28.53 
 
 
444 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.509231  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0939  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  27.48 
 
 
496 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3355  extracellular solute-binding protein family 1  28.89 
 
 
436 aa  119  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4158  extracellular solute-binding protein  26.7 
 
 
446 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.214678  normal  0.791693 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7049  extracellular solute-binding protein  27.9 
 
 
439 aa  115  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0982583  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4707  extracellular solute-binding protein family 1  28.32 
 
 
419 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1855  extracellular solute-binding protein family 1  26.17 
 
 
441 aa  110  5e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4644  extracellular solute-binding protein family 1  26.76 
 
 
400 aa  107  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0101413 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5744  extracellular solute-binding protein family 1  27.75 
 
 
419 aa  107  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.593109 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3168  extracellular solute-binding protein family 1  26.69 
 
 
419 aa  106  8e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1041  extracellular solute-binding protein family 1  26.39 
 
 
416 aa  105  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.172945  normal  0.776305 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3240  extracellular solute-binding protein family 1  24.34 
 
 
431 aa  103  7e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3683  extracellular solute-binding protein  27.96 
 
 
432 aa  103  8e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2622  extracellular solute-binding protein family 1  27 
 
 
437 aa  102  9e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0574924  normal  0.833644 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2119  extracellular solute-binding protein  25.31 
 
 
382 aa  102  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2264  extracellular solute-binding protein family 1  24.23 
 
 
514 aa  100  6e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.337461  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3610  extracellular solute-binding protein family 1  27.79 
 
 
724 aa  98.6  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06490  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.09 
 
 
402 aa  97.8  3e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  25.15 
 
 
411 aa  97.8  3e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3983  extracellular solute-binding protein  26.27 
 
 
465 aa  97.8  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4057  extracellular solute-binding protein  26.27 
 
 
465 aa  97.8  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.755308 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3997  extracellular solute-binding protein  26.27 
 
 
465 aa  97.8  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.110997  normal  0.433481 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0013  extracellular solute-binding protein family 1  24.38 
 
 
511 aa  97.4  4e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.957035  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  29.6 
 
 
430 aa  97.1  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19900  extracellular solute-binding protein family 1  24.55 
 
 
415 aa  97.1  6e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0487  extracellular solute-binding protein family 1  28.1 
 
 
433 aa  96.3  9e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6631  extracellular solute-binding protein family 1  27.97 
 
 
410 aa  94.4  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.325237 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3934  extracellular solute-binding protein family 1  25.93 
 
 
447 aa  94.7  3e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.486973  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5687  extracellular solute-binding protein family 1  27.01 
 
 
401 aa  94  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.627079  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  26.86 
 
 
431 aa  92.8  9e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1658  extracellular solute-binding protein  25.42 
 
 
449 aa  93.2  9e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.521221  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  27.86 
 
 
429 aa  92.4  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11260  lipoprotein (sugar-binding) lpqY  26.05 
 
 
468 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00432408 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  24.57 
 
 
399 aa  92  2e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2482  extracellular solute-binding protein family 1  28.86 
 
 
400 aa  92  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0758562  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4989  extracellular solute-binding protein family 1  25.24 
 
 
436 aa  90.9  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.192631  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1113  extracellular solute-binding protein family 1  25.49 
 
 
437 aa  90.9  4e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.056534  normal  0.199649 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0228  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  27.67 
 
 
439 aa  90.9  4e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4125  extracellular solute-binding protein  25 
 
 
408 aa  90.1  6e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0235  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  27.67 
 
 
439 aa  90.1  7e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.61248  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>