More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2459 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_1015  extracellular solute-binding protein family 1  79.86 
 
 
418 aa  694    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.706197  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2459  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 
419 aa  851    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.846254  normal  0.585846 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2348  extracellular solute-binding protein  47.32 
 
 
363 aa  335  1e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.585172 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 
411 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 
411 aa  216  5e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1820  extracellular solute-binding protein  33.41 
 
 
411 aa  216  8e-55  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.148067  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0450  extracellular solute-binding protein  32.38 
 
 
414 aa  206  9e-52  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.308403  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  31.19 
 
 
428 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0591  extracellular solute-binding protein  34.07 
 
 
421 aa  188  2e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0610101  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0027  extracellular solute-binding protein  30.42 
 
 
413 aa  183  5.0000000000000004e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000908101  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2090  extracellular solute-binding protein family 1  36.52 
 
 
423 aa  182  7e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000307561  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  28.78 
 
 
437 aa  181  2e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2310  extracellular solute-binding protein family 1  27.54 
 
 
425 aa  176  6e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000523246  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3329  extracellular solute-binding protein  32.77 
 
 
423 aa  174  1.9999999999999998e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20870  extracellular solute-binding protein family 1  31.18 
 
 
430 aa  171  2e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3146  extracellular solute-binding protein family 1  32.59 
 
 
439 aa  166  5.9999999999999996e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.654082  normal  0.268339 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0304  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  29.78 
 
 
421 aa  164  2.0000000000000002e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.367443  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2940  extracellular solute-binding protein  29.33 
 
 
421 aa  165  2.0000000000000002e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459152  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3812  extracellular solute-binding protein  31.78 
 
 
423 aa  162  9e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.353807  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0025  extracellular solute-binding protein  31.35 
 
 
422 aa  162  1e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.669897  normal  0.473652 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2237  extracellular solute-binding protein family 1  29.06 
 
 
466 aa  158  2e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0258  extracellular solute-binding protein  30.79 
 
 
419 aa  155  1e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0669  extracellular solute-binding protein  29.95 
 
 
439 aa  154  2e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2526  extracellular solute-binding protein  29.91 
 
 
421 aa  151  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1331  extracellular solute-binding protein family 1  28.61 
 
 
464 aa  147  4.0000000000000006e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0213  twin-arginine translocation pathway signal  29.72 
 
 
446 aa  146  7.0000000000000006e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0889  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  29.56 
 
 
424 aa  143  6e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.613044  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0413  extracellular solute-binding protein  27.46 
 
 
428 aa  143  6e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1697  extracellular solute-binding protein  29.53 
 
 
447 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00303465  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0762  extracellular solute-binding protein  29.61 
 
 
424 aa  141  3e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000277245  normal  0.855778 
 
 
 
NC_008148  Rxyl_1991  extracellular solute-binding protein  29.09 
 
 
455 aa  141  3e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.603432  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0062  extracellular solute-binding protein  28.92 
 
 
436 aa  137  4e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2244  extracellular solute-binding protein family 1  25.34 
 
 
440 aa  137  5e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0958946 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2797  extracellular solute-binding protein family 1  26.75 
 
 
426 aa  136  6.0000000000000005e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0870  extracellular solute-binding protein family 1  26.22 
 
 
419 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.649209  normal  0.121264 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4442  extracellular solute-binding protein  32.19 
 
 
425 aa  135  1.9999999999999998e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00539632  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3393  extracellular solute-binding protein family 1  27.06 
 
 
412 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.205631 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3687  extracellular solute-binding protein  26.27 
 
 
453 aa  130  5.0000000000000004e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0623  extracellular solute-binding protein family 1  26.33 
 
 
428 aa  129  9.000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.58509 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3121  extracellular solute-binding protein family 1  26 
 
 
412 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0397  extracellular solute-binding protein family 1  31.49 
 
 
522 aa  125  1e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1626  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  26.8 
 
 
418 aa  125  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.188232 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4395  extracellular solute-binding protein  26.91 
 
 
420 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.87283  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0138  extracellular solute-binding protein  23.36 
 
 
412 aa  121  3e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4557  extracellular solute-binding protein  26.86 
 
 
412 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302395  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4015  extracellular solute-binding protein family 1  26.18 
 
 
434 aa  119  9e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0770441 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15281  ABC transporter for sugars, solute-binding protein  28.11 
 
 
422 aa  111  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.493249 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1408  ABC transporter, likely sugar solute binding protein  25.59 
 
 
421 aa  111  3e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.590186  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3355  extracellular solute-binding protein family 1  27.54 
 
 
436 aa  110  5e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1078  ABC transporter, likely sugar solute binding protein  27.16 
 
 
433 aa  109  1e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3240  extracellular solute-binding protein family 1  25.78 
 
 
431 aa  107  5e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3168  extracellular solute-binding protein family 1  26.27 
 
 
419 aa  105  1e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0950  putative multiple sugar transport system substrate-binding protein  23.56 
 
 
438 aa  103  8e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0282  extracellular solute-binding protein  28.86 
 
 
423 aa  100  3e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23010  extracellular solute-binding protein family 1  21.98 
 
 
436 aa  99.8  9e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000978171  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19900  extracellular solute-binding protein family 1  21.58 
 
 
415 aa  98.6  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4617  extracellular solute-binding protein  26.99 
 
 
433 aa  98.6  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0699008  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  26.89 
 
 
415 aa  97.8  4e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4158  extracellular solute-binding protein  24.66 
 
 
446 aa  95.1  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.214678  normal  0.791693 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0807  extracellular solute-binding protein family 1  24.46 
 
 
420 aa  95.1  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0939  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  26.62 
 
 
496 aa  94  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  23.21 
 
 
411 aa  94  5e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15040  extracellular solute-binding protein family 1  23.1 
 
 
458 aa  92.4  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.751229  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0904  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  23.14 
 
 
439 aa  91.7  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00221898  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4682  extracellular solute-binding protein  26.26 
 
 
412 aa  92  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0252692  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5508  extracellular solute-binding protein  26.26 
 
 
412 aa  91.3  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3592  extracellular solute-binding protein  25 
 
 
439 aa  90.9  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4775  extracellular solute-binding protein  25 
 
 
439 aa  90.9  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2622  extracellular solute-binding protein family 1  25.63 
 
 
437 aa  89.7  8e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0574924  normal  0.833644 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0487  extracellular solute-binding protein family 1  25.16 
 
 
433 aa  89.4  1e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4125  extracellular solute-binding protein  27.24 
 
 
408 aa  88.6  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  21.8 
 
 
399 aa  86.3  9e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3567  ABC transporter substrate binding protein (sorbitol)  24.72 
 
 
439 aa  85.9  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1550  extracellular solute-binding protein  23.13 
 
 
430 aa  85.5  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1607  ABC transporter sugar-binding protein  23.13 
 
 
430 aa  85.5  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2753  extracellular solute-binding protein family 1  26.45 
 
 
410 aa  84.7  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.501272  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1041  extracellular solute-binding protein family 1  23.22 
 
 
416 aa  84.3  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.172945  normal  0.776305 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2683  extracellular solute-binding protein family 1  22.64 
 
 
446 aa  83.6  0.000000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  23.13 
 
 
431 aa  83.6  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06490  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.3 
 
 
402 aa  82.4  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0869  extracellular solute-binding protein  24.86 
 
 
444 aa  82.8  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.509231  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  24.2 
 
 
411 aa  81.6  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2297  extracellular solute-binding protein  22.1 
 
 
416 aa  82  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.33558  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3055  extracellular solute-binding protein family 1  22.66 
 
 
449 aa  81.6  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2082  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  22.03 
 
 
422 aa  81.3  0.00000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.890991  normal  0.0137332 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.33 
 
 
426 aa  81.3  0.00000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0228  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  25.97 
 
 
439 aa  81.6  0.00000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2463  extracellular solute-binding protein  24.71 
 
 
437 aa  80.9  0.00000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.493581 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2172  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  22.03 
 
 
422 aa  80.5  0.00000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00849198  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  24.44 
 
 
411 aa  80.1  0.00000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0235  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  25.65 
 
 
439 aa  79.7  0.00000000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.61248  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2280  extracellular solute-binding protein  21.79 
 
 
422 aa  79  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  27.37 
 
 
423 aa  79.3  0.0000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  23.47 
 
 
435 aa  79  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1020  extracellular solute-binding protein  26.32 
 
 
459 aa  79.3  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000124434  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1262  extracellular solute-binding protein  22.54 
 
 
424 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00529057  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3450  extracellular solute-binding protein family 1  25.21 
 
 
436 aa  79  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0069  twin-arginine translocation pathway signal  25.97 
 
 
432 aa  79  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0915  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  24.61 
 
 
443 aa  78.6  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.779259 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3752  extracellular solute-binding protein family 1  24.93 
 
 
436 aa  78.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.561914  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>