More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2090 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_2090  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 423 aa  867    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000307561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0591  extracellular solute-binding protein  55.5 
 
 		 421 aa  463  1e-129  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0610101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3146  extracellular solute-binding protein family 1  52.87 
 
 		 439 aa  426  1e-118  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.654082  normal  0.268339 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3329  extracellular solute-binding protein  50.24 
 
 		 423 aa  419  1e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20870  extracellular solute-binding protein family 1  50.36 
 
 		 430 aa  402  1e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0889  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  44.79 
 
 		 424 aa  378  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.613044  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0762  extracellular solute-binding protein  44.31 
 
 		 424 aa  375  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000277245  normal  0.855778 
 
 
 
NC_007963  Csal_0258  extracellular solute-binding protein  47.91 
 
 		 419 aa  377  1e-103  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3812  extracellular solute-binding protein  46.08 
 
 		 423 aa  374  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.353807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0025  extracellular solute-binding protein  49.61 
 
 		 422 aa  372  1e-102  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.669897  normal  0.473652 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2940  extracellular solute-binding protein  44.84 
 
 		 421 aa  363  3e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459152  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0304  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  46.94 
 
 		 421 aa  361  1e-98  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.367443  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4442  extracellular solute-binding protein  45.89 
 
 		 425 aa  352  1e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00539632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2526  extracellular solute-binding protein  41.71 
 
 		 421 aa  348  1e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4395  extracellular solute-binding protein  45.5 
 
 		 420 aa  341  1e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.87283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0397  extracellular solute-binding protein family 1  45.14 
 
 		 522 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1820  extracellular solute-binding protein  40.48 
 
 		 411 aa  306  5.0000000000000004e-82  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.148067  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  40.74 
 
 		 411 aa  300  4e-80  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  40.74 
 
 		 411 aa  299  6e-80  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0027  extracellular solute-binding protein  39.44 
 
 		 413 aa  287  2e-76  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000908101  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0450  extracellular solute-binding protein  40.66 
 
 		 414 aa  278  2e-73  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.308403  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  39.46 
 
 		 428 aa  246  4.9999999999999997e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  35.47 
 
 		 437 aa  211  2e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2244  extracellular solute-binding protein family 1  31.95 
 
 		 440 aa  205  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0958946 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0062  extracellular solute-binding protein  35.45 
 
 		 436 aa  202  9e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2310  extracellular solute-binding protein family 1  31.43 
 
 		 425 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000523246  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1991  extracellular solute-binding protein  34.38 
 
 		 455 aa  196  5.000000000000001e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.603432  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0950  putative multiple sugar transport system substrate-binding protein  33.65 
 
 		 438 aa  194  2e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0669  extracellular solute-binding protein  34.75 
 
 		 439 aa  194  3e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0138  extracellular solute-binding protein  31.4 
 
 		 412 aa  193  4e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1331  extracellular solute-binding protein family 1  34.69 
 
 		 464 aa  193  4e-48  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0213  twin-arginine translocation pathway signal  38.34 
 
 		 446 aa  192  7e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1015  extracellular solute-binding protein family 1  35.25 
 
 		 418 aa  187  2e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.706197  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0413  extracellular solute-binding protein  34.7 
 
 		 428 aa  184  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2459  extracellular solute-binding protein family 1  36.52 
 
 		 419 aa  182  7e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.846254  normal  0.585846 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0870  extracellular solute-binding protein family 1  31.54 
 
 		 419 aa  182  8.000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.649209  normal  0.121264 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0623  extracellular solute-binding protein family 1  34.7 
 
 		 428 aa  182  1e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.58509 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2237  extracellular solute-binding protein family 1  33.87 
 
 		 466 aa  181  2e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3687  extracellular solute-binding protein  32.59 
 
 		 453 aa  177  4e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15281  ABC transporter for sugars, solute-binding protein  32.75 
 
 		 422 aa  174  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.493249 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1697  extracellular solute-binding protein  34.11 
 
 		 447 aa  172  1e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00303465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2797  extracellular solute-binding protein family 1  32.64 
 
 		 426 aa  171  2e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1626  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  32.64 
 
 		 418 aa  170  6e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.188232 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4015  extracellular solute-binding protein family 1  34.75 
 
 		 434 aa  169  1e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0770441 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1408  ABC transporter, likely sugar solute binding protein  30.75 
 
 		 421 aa  167  2.9999999999999998e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.590186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1078  ABC transporter, likely sugar solute binding protein  30.03 
 
 		 433 aa  148  2.0000000000000003e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2348  extracellular solute-binding protein  33.07 
 
 		 363 aa  144  3e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.585172 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5744  extracellular solute-binding protein family 1  28.22 
 
 		 419 aa  124  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.593109 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2264  extracellular solute-binding protein family 1  28.82 
 
 		 514 aa  120  3.9999999999999996e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.337461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3005  extracellular solute-binding protein  29.24 
 
 		 386 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0509574  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4707  extracellular solute-binding protein family 1  26.47 
 
 		 419 aa  117  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3055  extracellular solute-binding protein family 1  25.84 
 
 		 449 aa  112  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0282  extracellular solute-binding protein  30.4 
 
 		 423 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3355  extracellular solute-binding protein family 1  29.3 
 
 		 436 aa  110  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4557  extracellular solute-binding protein  28.4 
 
 		 412 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7049  extracellular solute-binding protein  28.15 
 
 		 439 aa  110  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0982583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0807  extracellular solute-binding protein family 1  28.03 
 
 		 420 aa  107  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1331  extracellular solute-binding protein family 1  31.66 
 
 		 448 aa  107  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000205805  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2297  extracellular solute-binding protein  29.59 
 
 		 416 aa  107  4e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.33558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0869  extracellular solute-binding protein  28.78 
 
 		 444 aa  107  4e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.509231  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3121  extracellular solute-binding protein family 1  27.03 
 
 		 412 aa  107  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1855  extracellular solute-binding protein family 1  28.53 
 
 		 441 aa  106  9e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3393  extracellular solute-binding protein family 1  26.43 
 
 		 412 aa  106  9e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.205631 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0228  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  27.89 
 
 		 439 aa  105  1e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  28.34 
 
 		 430 aa  103  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4979  extracellular solute-binding protein  29.14 
 
 		 439 aa  103  7e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.336131  normal  0.060129 
 
 
-
 
NC_004310  BR0235  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  27.6 
 
 		 439 aa  103  8e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.61248  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3240  extracellular solute-binding protein family 1  24.3 
 
 		 431 aa  102  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  26.12 
 
 		 431 aa  99.8  8e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4617  extracellular solute-binding protein  27.47 
 
 		 433 aa  99.8  8e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0699008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06490  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  29.97 
 
 		 402 aa  98.6  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1113  extracellular solute-binding protein family 1  27.81 
 
 		 437 aa  97.8  3e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.056534  normal  0.199649 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0309  extracellular solute-binding protein  27.51 
 
 		 438 aa  97.8  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.242924  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1658  extracellular solute-binding protein  24.65 
 
 		 449 aa  98.2  3e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.521221  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3168  extracellular solute-binding protein family 1  27.04 
 
 		 419 aa  96.7  7e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2119  extracellular solute-binding protein  25.52 
 
 		 382 aa  93.6  5e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0013  extracellular solute-binding protein family 1  24.11 
 
 		 511 aa  93.6  6e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.957035  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2622  extracellular solute-binding protein family 1  26.82 
 
 		 437 aa  93.2  8e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0574924  normal  0.833644 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7208  extracellular solute-binding protein family 1  26.79 
 
 		 410 aa  92.4  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  28.12 
 
 		 411 aa  92  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0487  extracellular solute-binding protein family 1  26.8 
 
 		 433 aa  90.9  4e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0271  extracellular solute-binding protein family 1  26.17 
 
 		 387 aa  90.9  4e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5508  extracellular solute-binding protein  26.83 
 
 		 412 aa  90.5  5e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3592  extracellular solute-binding protein  26.83 
 
 		 439 aa  89.7  8e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4775  extracellular solute-binding protein  26.83 
 
 		 439 aa  89.7  8e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  25.94 
 
 		 411 aa  88.2  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0939  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  26.55 
 
 		 496 aa  88.6  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0420  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  26.53 
 
 		 410 aa  88.6  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  24.12 
 
 		 411 aa  87.8  3e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  25.15 
 
 		 399 aa  87.4  5e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5687  extracellular solute-binding protein family 1  25.93 
 
 		 401 aa  86.3  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.627079  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0364  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  25.45 
 
 		 438 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2707  mannitol ABC transporter, periplasmic mannitol-binding protein  27.13 
 
 		 440 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.069342  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0698  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  27.41 
 
 		 366 aa  85.9  0.000000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436581  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6631  extracellular solute-binding protein family 1  26.04 
 
 		 410 aa  85.5  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.325237 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  26.33 
 
 		 435 aa  85.9  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2482  extracellular solute-binding protein family 1  27.45 
 
 		 400 aa  84.3  0.000000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0758562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4158  extracellular solute-binding protein  26.13 
 
 		 446 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.214678  normal  0.791693 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4682  extracellular solute-binding protein  26.13 
 
 		 412 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0252692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6240  ABC transporter substrate binding protein (maltose)  24.22 
 
 		 407 aa  84  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0994607  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>