More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0271 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_0271  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 387 aa  803    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3005  extracellular solute-binding protein  61.36 
 
 		 386 aa  493  9.999999999999999e-139  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0509574  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2119  extracellular solute-binding protein  44.03 
 
 		 382 aa  314  1.9999999999999998e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0309  extracellular solute-binding protein  27.39 
 
 		 438 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.242924  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0228  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  26.63 
 
 		 439 aa  172  9e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0235  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  26.63 
 
 		 439 aa  171  2e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.61248  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3399  extracellular solute-binding protein  27.48 
 
 		 440 aa  170  3e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0250918  normal  0.750741 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2278  extracellular solute-binding protein  29.15 
 
 		 448 aa  167  4e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4979  extracellular solute-binding protein  26.28 
 
 		 439 aa  161  1e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.336131  normal  0.060129 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2237  extracellular solute-binding protein family 1  27.61 
 
 		 466 aa  115  2.0000000000000002e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  27.19 
 
 		 428 aa  110  6e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0450  extracellular solute-binding protein  28.62 
 
 		 414 aa  101  2e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.308403  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0413  extracellular solute-binding protein  25.93 
 
 		 428 aa  99.4  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0623  extracellular solute-binding protein family 1  26.16 
 
 		 428 aa  97.1  4e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.58509 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  28.05 
 
 		 437 aa  96.7  6e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0939  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  25.99 
 
 		 496 aa  95.9  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4158  extracellular solute-binding protein  25.66 
 
 		 446 aa  94  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.214678  normal  0.791693 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1820  extracellular solute-binding protein  25.96 
 
 		 411 aa  93.2  7e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.148067  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3055  extracellular solute-binding protein family 1  24 
 
 		 449 aa  92.4  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0487  extracellular solute-binding protein family 1  25.46 
 
 		 433 aa  91.7  2e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4682  extracellular solute-binding protein  25.4 
 
 		 412 aa  92  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0252692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2090  extracellular solute-binding protein family 1  26.17 
 
 		 423 aa  90.9  4e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000307561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  28.89 
 
 		 411 aa  90.1  6e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1331  extracellular solute-binding protein family 1  25.06 
 
 		 464 aa  89.7  7e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 		 411 aa  89.7  8e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3592  extracellular solute-binding protein  25.14 
 
 		 439 aa  87  5e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4775  extracellular solute-binding protein  25.14 
 
 		 439 aa  87  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5508  extracellular solute-binding protein  25.14 
 
 		 412 aa  86.7  7e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2310  extracellular solute-binding protein family 1  23.3 
 
 		 425 aa  85.9  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000523246  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4015  extracellular solute-binding protein family 1  25.6 
 
 		 434 aa  85.5  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0770441 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15281  ABC transporter for sugars, solute-binding protein  24.92 
 
 		 422 aa  85.5  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.493249 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4758  extracellular solute-binding protein family 1  25.95 
 
 		 417 aa  84.7  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1756  ABC transporter substrate-binding protein  25.5 
 
 		 439 aa  85.5  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.887651  normal  0.574192 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2244  extracellular solute-binding protein family 1  25.26 
 
 		 440 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0958946 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5365  extracellular solute-binding protein family 1  24.86 
 
 		 418 aa  82  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.559287 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0062  extracellular solute-binding protein  28.68 
 
 		 436 aa  81.6  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3240  extracellular solute-binding protein family 1  25.07 
 
 		 431 aa  81.3  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3683  extracellular solute-binding protein  26.61 
 
 		 432 aa  80.9  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06490  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.78 
 
 		 402 aa  80.5  0.00000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0138  extracellular solute-binding protein  27.36 
 
 		 412 aa  80.1  0.00000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4090  twin-arginine translocation pathway signal  26.64 
 
 		 440 aa  79.7  0.00000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.25614 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2821  extracellular solute-binding protein  24.68 
 
 		 428 aa  79  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.858803  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3144  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  25.82 
 
 		 460 aa  78.6  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0547  ABC-type sugar / sn-glycerol 3-phosphate transport protein  23.12 
 
 		 447 aa  77.8  0.0000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0572  extracellular solute-binding protein family 1  23.96 
 
 		 470 aa  77.8  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0305  extracellular solute-binding protein  23.51 
 
 		 428 aa  77.8  0.0000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.937006  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4125  extracellular solute-binding protein  26.75 
 
 		 408 aa  77.4  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2526  extracellular solute-binding protein  27.31 
 
 		 421 aa  77  0.0000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0397  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 522 aa  76.6  0.0000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0870  extracellular solute-binding protein family 1  25.97 
 
 		 419 aa  76.6  0.0000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.649209  normal  0.121264 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  27.27 
 
 		 411 aa  76.3  0.0000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3812  extracellular solute-binding protein  23.97 
 
 		 423 aa  76.3  0.0000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.353807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4395  extracellular solute-binding protein  26.69 
 
 		 420 aa  75.9  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.87283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0027  extracellular solute-binding protein  26.33 
 
 		 413 aa  75.1  0.000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000908101  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3348  extracellular solute-binding protein family 1  25.22 
 
 		 443 aa  74.7  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0975891  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3168  extracellular solute-binding protein family 1  24.28 
 
 		 419 aa  74.7  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1991  extracellular solute-binding protein  27.27 
 
 		 455 aa  73.6  0.000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.603432  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0669  extracellular solute-binding protein  24.94 
 
 		 439 aa  73.2  0.000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1262  extracellular solute-binding protein  24.92 
 
 		 408 aa  73.2  0.000000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.953049  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0762  extracellular solute-binding protein  24.43 
 
 		 424 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000277245  normal  0.855778 
 
 
 
NC_008025  Dgeo_0591  extracellular solute-binding protein  26.55 
 
 		 421 aa  72.4  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0610101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19900  extracellular solute-binding protein family 1  22.56 
 
 		 415 aa  72  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1094  extracellular solute-binding protein  26.22 
 
 		 439 aa  71.6  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.962008  normal  0.028756 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0807  extracellular solute-binding protein family 1  27.55 
 
 		 420 aa  70.9  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20870  extracellular solute-binding protein family 1  24.83 
 
 		 430 aa  70.5  0.00000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5198  extracellular solute-binding protein family 1  25.45 
 
 		 442 aa  70.1  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.06332 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  27.12 
 
 		 410 aa  69.3  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2940  extracellular solute-binding protein  24.03 
 
 		 421 aa  68.9  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459152  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1846  extracellular solute-binding protein family 1  26.48 
 
 		 425 aa  68.9  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.169612  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3121  extracellular solute-binding protein family 1  23.41 
 
 		 412 aa  68.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4557  extracellular solute-binding protein  24.65 
 
 		 412 aa  68.6  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302395  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0323  family 1 extracellular solute-binding protein  25.08 
 
 		 432 aa  68.2  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6156  extracellular solute-binding protein family 1  26.47 
 
 		 410 aa  68.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.889741  hitchhiker  0.000305646 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0304  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  23.68 
 
 		 421 aa  67.8  0.0000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.367443  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5398  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  25.52 
 
 		 403 aa  67.8  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.14652  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4442  extracellular solute-binding protein  25.37 
 
 		 425 aa  67.8  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00539632  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1090  extracellular solute-binding protein family 1  23.56 
 
 		 436 aa  68.2  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.667729  normal  0.0232634 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1626  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  27.27 
 
 		 418 aa  67.8  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.188232 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5468  extracellular solute-binding protein family 1  25.15 
 
 		 442 aa  67.8  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.303073 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1078  ABC transporter, likely sugar solute binding protein  26.17 
 
 		 433 aa  67.4  0.0000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0889  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  23.78 
 
 		 424 aa  67  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.613044  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2707  mannitol ABC transporter, periplasmic mannitol-binding protein  23.68 
 
 		 440 aa  67  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.069342  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0950  putative multiple sugar transport system substrate-binding protein  27.17 
 
 		 438 aa  67.4  0.0000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3712  extracellular solute-binding protein family 1  29.41 
 
 		 421 aa  67  0.0000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.411366 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3393  extracellular solute-binding protein family 1  23.74 
 
 		 412 aa  66.6  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.205631 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0025  extracellular solute-binding protein  24.44 
 
 		 422 aa  66.6  0.0000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.669897  normal  0.473652 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  24.4 
 
 		 435 aa  66.2  0.0000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4181  extracellular solute-binding protein  23.41 
 
 		 435 aa  65.9  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.000770865  normal  0.668736 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3983  extracellular solute-binding protein family 1  25.9 
 
 		 456 aa  65.5  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1614  extracellular solute-binding protein  23.32 
 
 		 391 aa  65.5  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000159886  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1321  extracellular solute-binding protein family 1  22.11 
 
 		 410 aa  65.1  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  26.54 
 
 		 420 aa  65.1  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0361  extracellular solute-binding protein  23.67 
 
 		 444 aa  65.1  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.678366  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6572  extracellular solute-binding protein family 1  25.33 
 
 		 410 aa  65.1  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00103217  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1041  extracellular solute-binding protein family 1  28.02 
 
 		 416 aa  64.7  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.172945  normal  0.776305 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6904  extracellular solute-binding protein family 1  27.18 
 
 		 404 aa  64.7  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000382644  hitchhiker  0.00751503 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1697  extracellular solute-binding protein  24.62 
 
 		 447 aa  64.7  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00303465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2845  extracellular solute-binding protein  23.62 
 
 		 424 aa  64.3  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.35811  normal  0.0339661 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0869  extracellular solute-binding protein  20.82 
 
 		 444 aa  64.7  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.509231  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0213  twin-arginine translocation pathway signal  26.22 
 
 		 446 aa  63.9  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>