More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_4090 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_4090  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 440 aa  895    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.25614 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3144  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  79.82 
 
 		 460 aa  707    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2082  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  25.96 
 
 		 422 aa  108  3e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.890991  normal  0.0137332 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2280  extracellular solute-binding protein  25.06 
 
 		 422 aa  106  7e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2172  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  25.72 
 
 		 422 aa  105  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00849198  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4557  extracellular solute-binding protein  28.2 
 
 		 412 aa  103  9e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2796  extracellular solute-binding protein family 1  25.6 
 
 		 468 aa  99.8  8e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1711  extracellular solute-binding protein family 1  28.07 
 
 		 450 aa  97.8  3e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.827618 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  24.38 
 
 		 437 aa  95.1  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3121  extracellular solute-binding protein family 1  24.83 
 
 		 412 aa  93.2  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1015  extracellular solute-binding protein family 1  26.03 
 
 		 418 aa  93.6  7e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.706197  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3393  extracellular solute-binding protein family 1  25.07 
 
 		 412 aa  92.8  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.205631 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  23.81 
 
 		 428 aa  90.9  4e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19900  extracellular solute-binding protein family 1  22.34 
 
 		 415 aa  90.5  5e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4940  extracellular solute-binding protein family 1  25.9 
 
 		 484 aa  90.5  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3055  extracellular solute-binding protein family 1  22.01 
 
 		 449 aa  87.4  4e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0062  extracellular solute-binding protein  26.24 
 
 		 436 aa  87.4  4e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5309  extracellular solute-binding protein family 1  25.12 
 
 		 447 aa  85.9  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.574903  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0303  extracellular solute-binding protein family 1  25.31 
 
 		 478 aa  85.9  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.105454 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0974  extracellular solute-binding protein family 1  27.74 
 
 		 435 aa  84  0.000000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.606433  normal  0.163223 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0271  extracellular solute-binding protein family 1  24.61 
 
 		 387 aa  82.4  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0305  extracellular solute-binding protein  24.7 
 
 		 428 aa  82.4  0.00000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.937006  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1756  ABC transporter substrate-binding protein  23.7 
 
 		 439 aa  82  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.887651  normal  0.574192 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2297  extracellular solute-binding protein  23.94 
 
 		 416 aa  81.3  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.33558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2696  extracellular solute-binding protein  23.43 
 
 		 498 aa  81.3  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3999  extracellular solute-binding protein family 1  25.57 
 
 		 452 aa  81.3  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.220113  normal  0.250177 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5744  extracellular solute-binding protein family 1  28.38 
 
 		 419 aa  80.5  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.593109 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  27.61 
 
 		 411 aa  79.3  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  21.92 
 
 		 407 aa  79.7  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1658  extracellular solute-binding protein  22.19 
 
 		 449 aa  79.3  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.521221  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0413  extracellular solute-binding protein  23.38 
 
 		 428 aa  78.6  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3683  extracellular solute-binding protein  25.37 
 
 		 432 aa  78.6  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4400  extracellular solute-binding protein family 1  27.83 
 
 		 433 aa  78.2  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2310  extracellular solute-binding protein family 1  20.47 
 
 		 425 aa  78.2  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000523246  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  22.62 
 
 		 411 aa  77  0.0000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1390  extracellular solute-binding protein  23.77 
 
 		 444 aa  76.6  0.0000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00129811  normal  0.103249 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0869  extracellular solute-binding protein  23.31 
 
 		 444 aa  75.9  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.509231  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3355  extracellular solute-binding protein family 1  29.25 
 
 		 436 aa  75.9  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  23.45 
 
 		 411 aa  75.5  0.000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3812  extracellular solute-binding protein  25.13 
 
 		 423 aa  75.5  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.353807  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0572  extracellular solute-binding protein family 1  26.35 
 
 		 470 aa  75.9  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  23.13 
 
 		 411 aa  75.1  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4707  extracellular solute-binding protein family 1  26.54 
 
 		 419 aa  74.7  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3005  extracellular solute-binding protein  24.01 
 
 		 386 aa  74.7  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0509574  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2753  extracellular solute-binding protein family 1  19.93 
 
 		 410 aa  74.7  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.501272  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  26.94 
 
 		 411 aa  74.3  0.000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0698  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  26.94 
 
 		 366 aa  73.2  0.000000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436581  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0671  extracellular solute-binding protein  22.79 
 
 		 436 aa  73.2  0.000000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.687145  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0127  extracellular solute-binding protein family 1  28.9 
 
 		 442 aa  72.4  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0623  extracellular solute-binding protein family 1  23.21 
 
 		 428 aa  73.2  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.58509 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2119  extracellular solute-binding protein  22 
 
 		 382 aa  72.4  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0807  extracellular solute-binding protein family 1  24.47 
 
 		 420 aa  72.4  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0459  extracellular solute-binding protein  22.66 
 
 		 436 aa  72  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.420805  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03700  carbohydrate-binding protein  26.92 
 
 		 464 aa  71.6  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.720711 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2459  extracellular solute-binding protein family 1  22.54 
 
 		 419 aa  70.5  0.00000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.846254  normal  0.585846 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0450  extracellular solute-binding protein  21.66 
 
 		 414 aa  70.5  0.00000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.308403  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2821  extracellular solute-binding protein  22.14 
 
 		 428 aa  70.5  0.00000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.858803  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1626  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  26.07 
 
 		 418 aa  70.5  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.188232 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2797  extracellular solute-binding protein family 1  24.26 
 
 		 426 aa  70.1  0.00000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0646  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  23.81 
 
 		 326 aa  70.1  0.00000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0353327  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2610  extracellular solute-binding protein  22.93 
 
 		 477 aa  70.1  0.00000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5703  extracellular solute-binding protein family 1  24.25 
 
 		 455 aa  69.7  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4395  extracellular solute-binding protein  28.12 
 
 		 420 aa  69.3  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.87283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1991  extracellular solute-binding protein  23.08 
 
 		 455 aa  69.3  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.603432  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5365  extracellular solute-binding protein family 1  23 
 
 		 418 aa  69.3  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.559287 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4125  extracellular solute-binding protein  20.13 
 
 		 408 aa  69.3  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2267  extracellular solute-binding protein family 1  28.63 
 
 		 445 aa  68.6  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00064551 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4158  extracellular solute-binding protein  24.05 
 
 		 446 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.214678  normal  0.791693 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3988  extracellular solute-binding protein family 1  24.87 
 
 		 422 aa  67.8  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2090  extracellular solute-binding protein family 1  24.72 
 
 		 423 aa  68.2  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000307561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0669  extracellular solute-binding protein  22.83 
 
 		 439 aa  68.2  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4015  extracellular solute-binding protein family 1  26.77 
 
 		 434 aa  67.8  0.0000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0770441 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  21.75 
 
 		 424 aa  67.4  0.0000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0547  ABC-type sugar / sn-glycerol 3-phosphate transport protein  24.27 
 
 		 447 aa  67  0.0000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2058  extracellular solute-binding protein family 1  24.31 
 
 		 435 aa  67  0.0000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.617385 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2274  extracellular solute-binding protein  26.89 
 
 		 1012 aa  67  0.0000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3495  extracellular solute-binding protein, family 1  23.55 
 
 		 487 aa  66.6  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.413396  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1522  extracellular solute-binding protein family 1  25.74 
 
 		 421 aa  66.2  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.569671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0420  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  28.04 
 
 		 410 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0829  extracellular solute-binding protein family 1  23.5 
 
 		 504 aa  66.2  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7049  extracellular solute-binding protein  26.17 
 
 		 439 aa  65.5  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0982583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0939  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  23.51 
 
 		 496 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1179  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  22.31 
 
 		 423 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0916647  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4644  extracellular solute-binding protein family 1  23.08 
 
 		 400 aa  65.9  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0101413 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0048  extracellular solute-binding protein  23.64 
 
 		 513 aa  65.1  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4682  extracellular solute-binding protein  24.05 
 
 		 412 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0252692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1820  extracellular solute-binding protein  20.29 
 
 		 411 aa  65.5  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.148067  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3065  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  22.41 
 
 		 421 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2358  extracellular solute-binding protein  23.62 
 
 		 441 aa  64.7  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7208  extracellular solute-binding protein family 1  28.37 
 
 		 410 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0091  ABC sorbitol/mannitol transporter, periplasmic binding protein  25.53 
 
 		 436 aa  64.3  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.126585  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1181  extracellular solute-binding protein  23.74 
 
 		 413 aa  63.9  0.000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000595288  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5468  extracellular solute-binding protein family 1  24.61 
 
 		 442 aa  63.9  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.303073 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1727  extracellular solute-binding protein  25.53 
 
 		 436 aa  63.9  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3567  ABC transporter substrate binding protein (sorbitol)  25 
 
 		 439 aa  63.9  0.000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0915  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  23.71 
 
 		 443 aa  63.9  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.779259 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03340  extracellular solute-binding protein family 1  21.68 
 
 		 439 aa  63.9  0.000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  24.35 
 
 		 415 aa  63.5  0.000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  25.93 
 
 		 424 aa  63.9  0.000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4775  extracellular solute-binding protein  22.06 
 
 		 439 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.872591 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>